Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q942

Protein Details
Accession A0A5C3Q942    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-59AQELRKQKELQQRKQNEERDRKEREREVERRKAHFBasic
340-380ASGFPAVIKKRKRNPSRSPSPPPPVKRRRDKERARHADYSDHydrophilic
438-459EAAAREQKRHEDEKRRRKMMKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-79RKQNEERDRKEREREVERRKAHFEREKQEKEAAQLKEKARQAK
343-374FPAVIKKRKRNPSRSPSPPPPVKRRRDKERAR
442-459REQKRHEDEKRRRKMMKA
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MPSFEELMALSASQTKKSESKVQQAQELRKQKELQQRKQNEERDRKEREREVERRKAHFEREKQEKEAAQLKEKARQAKEEAAQRRLDEQKNALLYGPKKAKTVSATPSGSSSPKWPTKKQQNDDDADGVFIGSTLTREEKRQQKLDRELNRSYGSAKRTSRAGGYGKAGRRLPGGAVDIVTSASDRSGPDLSSMSVKERIASAPMGLQRLNVVKRDTRTIDEYHRDMKAKKAQVIQGDEARNFNDWFSSKKKDAPPIKPSPTVSISPSPPRTSSPSLASSSSIPASAPAKSKLSISSTPGSRKPAPSSLTASSSKPSNKSAPSSSKQAPSKPTPLRPTASGFPAVIKKRKRNPSRSPSPPPPVKRRRDKERARHADYSDDEPQEDLGSTIWGLFGKDRNKYMSRSAYSDDESDMEADAGAMEREEKRSAREARQEDEAAAREQKRHEDEKRRRKMMKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.22
3 0.27
4 0.32
5 0.42
6 0.44
7 0.54
8 0.59
9 0.61
10 0.66
11 0.69
12 0.73
13 0.72
14 0.74
15 0.68
16 0.66
17 0.66
18 0.66
19 0.68
20 0.71
21 0.71
22 0.72
23 0.78
24 0.79
25 0.86
26 0.87
27 0.86
28 0.86
29 0.85
30 0.84
31 0.84
32 0.82
33 0.82
34 0.81
35 0.79
36 0.78
37 0.79
38 0.8
39 0.81
40 0.81
41 0.78
42 0.78
43 0.75
44 0.75
45 0.74
46 0.73
47 0.72
48 0.76
49 0.75
50 0.71
51 0.71
52 0.63
53 0.59
54 0.58
55 0.52
56 0.49
57 0.51
58 0.5
59 0.51
60 0.54
61 0.57
62 0.51
63 0.53
64 0.51
65 0.52
66 0.55
67 0.57
68 0.58
69 0.55
70 0.55
71 0.5
72 0.52
73 0.52
74 0.49
75 0.45
76 0.41
77 0.41
78 0.41
79 0.4
80 0.34
81 0.32
82 0.3
83 0.34
84 0.38
85 0.34
86 0.34
87 0.34
88 0.37
89 0.36
90 0.41
91 0.37
92 0.39
93 0.38
94 0.37
95 0.39
96 0.36
97 0.33
98 0.27
99 0.26
100 0.26
101 0.33
102 0.39
103 0.44
104 0.52
105 0.62
106 0.72
107 0.75
108 0.76
109 0.76
110 0.75
111 0.72
112 0.63
113 0.52
114 0.41
115 0.33
116 0.23
117 0.14
118 0.09
119 0.06
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.09
124 0.1
125 0.13
126 0.21
127 0.3
128 0.37
129 0.46
130 0.51
131 0.57
132 0.65
133 0.72
134 0.73
135 0.72
136 0.67
137 0.63
138 0.58
139 0.49
140 0.42
141 0.38
142 0.32
143 0.33
144 0.32
145 0.29
146 0.3
147 0.31
148 0.29
149 0.3
150 0.29
151 0.24
152 0.27
153 0.32
154 0.33
155 0.36
156 0.36
157 0.31
158 0.29
159 0.27
160 0.22
161 0.19
162 0.18
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.16
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.19
202 0.2
203 0.25
204 0.25
205 0.24
206 0.25
207 0.26
208 0.29
209 0.3
210 0.31
211 0.3
212 0.3
213 0.3
214 0.27
215 0.31
216 0.33
217 0.32
218 0.35
219 0.36
220 0.37
221 0.39
222 0.42
223 0.38
224 0.36
225 0.34
226 0.3
227 0.26
228 0.24
229 0.2
230 0.17
231 0.15
232 0.11
233 0.1
234 0.13
235 0.17
236 0.22
237 0.22
238 0.28
239 0.33
240 0.4
241 0.48
242 0.53
243 0.57
244 0.61
245 0.64
246 0.62
247 0.58
248 0.54
249 0.48
250 0.42
251 0.36
252 0.31
253 0.29
254 0.32
255 0.34
256 0.32
257 0.3
258 0.3
259 0.33
260 0.33
261 0.33
262 0.31
263 0.31
264 0.31
265 0.31
266 0.29
267 0.24
268 0.21
269 0.18
270 0.14
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.14
276 0.15
277 0.16
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.23
282 0.22
283 0.24
284 0.27
285 0.29
286 0.33
287 0.36
288 0.39
289 0.37
290 0.39
291 0.39
292 0.4
293 0.38
294 0.37
295 0.39
296 0.36
297 0.37
298 0.35
299 0.32
300 0.27
301 0.3
302 0.3
303 0.28
304 0.29
305 0.3
306 0.32
307 0.36
308 0.41
309 0.45
310 0.45
311 0.5
312 0.5
313 0.52
314 0.53
315 0.54
316 0.53
317 0.51
318 0.57
319 0.57
320 0.61
321 0.59
322 0.6
323 0.58
324 0.53
325 0.53
326 0.47
327 0.42
328 0.36
329 0.3
330 0.28
331 0.33
332 0.36
333 0.39
334 0.43
335 0.5
336 0.58
337 0.68
338 0.75
339 0.78
340 0.83
341 0.86
342 0.89
343 0.89
344 0.89
345 0.88
346 0.87
347 0.86
348 0.84
349 0.84
350 0.84
351 0.84
352 0.86
353 0.86
354 0.87
355 0.89
356 0.91
357 0.91
358 0.92
359 0.92
360 0.88
361 0.85
362 0.76
363 0.73
364 0.65
365 0.61
366 0.56
367 0.47
368 0.39
369 0.32
370 0.31
371 0.24
372 0.21
373 0.14
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.1
382 0.16
383 0.21
384 0.26
385 0.29
386 0.35
387 0.39
388 0.42
389 0.47
390 0.51
391 0.49
392 0.48
393 0.49
394 0.47
395 0.45
396 0.43
397 0.36
398 0.27
399 0.25
400 0.21
401 0.17
402 0.13
403 0.1
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.05
409 0.08
410 0.1
411 0.13
412 0.18
413 0.19
414 0.23
415 0.32
416 0.39
417 0.45
418 0.53
419 0.55
420 0.55
421 0.6
422 0.57
423 0.5
424 0.48
425 0.41
426 0.35
427 0.38
428 0.37
429 0.34
430 0.37
431 0.44
432 0.46
433 0.53
434 0.59
435 0.63
436 0.72
437 0.78
438 0.86
439 0.87