Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3QJ97

Protein Details
Accession A0A5C3QJ97    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57KLKFVPTLPQRKKKATEVKEHydrophilic
195-221MAPESLRREKKKRIKAKKIKVKEDPANBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-52RKKKA
66-94PADSGRGRGRGDGRGRGAGEGRGRGRGAP
201-216RREKKKRIKAKKIKVK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSGEPSGSSGAGAGTPGPSKGIGNLAKRPETTRQGTQKLKFVPTLPQRKKKATEVKEEAPAPTLPPADSGRGRGRGDGRGRGAGEGRGRGRGAPRQEVEMTASGPFALGPALAGRSGSSRPAPKSNFAIPTPGGTGPSTIGQRAPHVKKEPTAGSLEKGKGKEKEEPQDDEEVYSDADEGVEIIDMDQVRHTDWMAPESLRREKKKRIKAKKIKVKEDPANSEKPLDSLAEVEVDVDAAVASGELDLANAIDLSEEEEEEEMEDIIDDFSQNAFDMATDIRQEKIYLFQFPSPFPAFTSPSVEASADVEPTEPKPLSKKVSFSADTKSATPDASGTPSEPPPAKPVDGSIGQLEIYESGAVKMRLANNILLDVTSGTQSSFLQQATFVDMDQHRLVVLGEVTKRFVVSPDVDNLLQMMEEAEQKSSGGIGGEGGLISMDVDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.13
8 0.21
9 0.25
10 0.3
11 0.37
12 0.43
13 0.46
14 0.48
15 0.51
16 0.5
17 0.52
18 0.53
19 0.56
20 0.59
21 0.64
22 0.71
23 0.71
24 0.7
25 0.68
26 0.66
27 0.59
28 0.52
29 0.53
30 0.54
31 0.61
32 0.63
33 0.67
34 0.7
35 0.75
36 0.8
37 0.8
38 0.8
39 0.77
40 0.78
41 0.76
42 0.74
43 0.73
44 0.68
45 0.59
46 0.51
47 0.43
48 0.33
49 0.28
50 0.24
51 0.17
52 0.19
53 0.2
54 0.23
55 0.24
56 0.28
57 0.32
58 0.37
59 0.38
60 0.4
61 0.41
62 0.44
63 0.48
64 0.5
65 0.46
66 0.44
67 0.44
68 0.41
69 0.39
70 0.35
71 0.33
72 0.32
73 0.3
74 0.29
75 0.28
76 0.29
77 0.32
78 0.34
79 0.37
80 0.39
81 0.38
82 0.4
83 0.4
84 0.39
85 0.37
86 0.32
87 0.26
88 0.18
89 0.17
90 0.12
91 0.11
92 0.09
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.03
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.08
103 0.09
104 0.12
105 0.16
106 0.21
107 0.24
108 0.33
109 0.35
110 0.37
111 0.42
112 0.45
113 0.45
114 0.4
115 0.4
116 0.32
117 0.31
118 0.3
119 0.25
120 0.21
121 0.16
122 0.16
123 0.13
124 0.15
125 0.14
126 0.12
127 0.14
128 0.13
129 0.17
130 0.26
131 0.29
132 0.33
133 0.38
134 0.4
135 0.4
136 0.45
137 0.43
138 0.36
139 0.37
140 0.3
141 0.27
142 0.31
143 0.31
144 0.3
145 0.3
146 0.32
147 0.32
148 0.34
149 0.4
150 0.41
151 0.47
152 0.48
153 0.5
154 0.47
155 0.47
156 0.44
157 0.37
158 0.3
159 0.22
160 0.17
161 0.13
162 0.1
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.17
186 0.25
187 0.29
188 0.35
189 0.39
190 0.49
191 0.58
192 0.67
193 0.73
194 0.77
195 0.81
196 0.86
197 0.91
198 0.91
199 0.9
200 0.89
201 0.86
202 0.83
203 0.78
204 0.73
205 0.69
206 0.63
207 0.57
208 0.49
209 0.43
210 0.34
211 0.27
212 0.22
213 0.15
214 0.11
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.15
272 0.16
273 0.18
274 0.19
275 0.22
276 0.23
277 0.23
278 0.29
279 0.25
280 0.23
281 0.21
282 0.23
283 0.22
284 0.22
285 0.27
286 0.23
287 0.22
288 0.23
289 0.21
290 0.18
291 0.17
292 0.16
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.14
299 0.12
300 0.13
301 0.17
302 0.23
303 0.29
304 0.32
305 0.35
306 0.34
307 0.42
308 0.43
309 0.41
310 0.41
311 0.39
312 0.38
313 0.35
314 0.34
315 0.27
316 0.24
317 0.22
318 0.18
319 0.14
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.16
324 0.17
325 0.21
326 0.21
327 0.21
328 0.22
329 0.25
330 0.25
331 0.21
332 0.22
333 0.23
334 0.23
335 0.23
336 0.2
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.14
350 0.16
351 0.19
352 0.21
353 0.22
354 0.2
355 0.21
356 0.2
357 0.16
358 0.14
359 0.11
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.1
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.16
373 0.16
374 0.14
375 0.18
376 0.18
377 0.23
378 0.22
379 0.22
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.17
387 0.18
388 0.2
389 0.2
390 0.2
391 0.19
392 0.19
393 0.19
394 0.19
395 0.22
396 0.24
397 0.28
398 0.27
399 0.27
400 0.26
401 0.2
402 0.16
403 0.13
404 0.09
405 0.07
406 0.11
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.05