Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q418

Protein Details
Accession A0A5C3Q418    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-61EDASTGKQDKKRKKDVSTAKASSSTPTKAEKRKKTKAARPEVVLEHydrophilic
201-221GDDKKEKEKEKKTGREHDKERBasic
519-540ADAERVQRRLAKKKVKNAMVLDHydrophilic
543-562REDAKDRPRIRVRKEPASSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-55DKKRKKDVSTAKASSSTPTKAEKRKKTKAAR
204-215KKEKEKEKKTGR
510-584KEDRKEAKKADAERVQRRLAKKKVKNAMVLDKGREDAKDRPRIRVRKEPASSSKGGPKGRTGFAKGKKVVRKGRS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKQKHTSSTVNAEKQIEDASTGKQDKKRKKDVSTAKASSSTPTKAEKRKKTKAARPEVVLESDDDDDDVENAYNSKASNSKEISPPDTTTESAPPDSDEDEDDNAPYVPPAHEASNPSASTSATPKLKKTAHVPSSETPAQRDTRTLFIGNAPIAVAQKRPLLKALHRHILSHLPAGVRIESSRVRSVAFQAPTAKLPEEGDDKKEKEKEKKTGREHDKERTQAWRDQRDQYPEGDNTKDAKQFLTSGQKKRIAFIHGEFHAEADRANVYMVLGFPNPDARGAAKPTTTTTEDAMDEDEETGAPTMLTPYEAAVLAKEKCDGTTFMDRVIRVDVVGQPVSSSGAGKDAGHTDPKLSVFVGNLDFAVKDEDLRAFMESILRAELGVRDVKEVEEEGAKHGGWVDRVRIVRDRETLVGKGFAYVQFVARECVDELFSMDAEKLNLGKRTLRIQRCKSLPNAQQKRASQATIAGGGTESTRGESARRPFSIPIPTSIPRGDPALGEKLAGLSKEDRKEAKKADAERVQRRLAKKKVKNAMVLDKGREDAKDRPRIRVRKEPASSSKGGPKGRTGFAKGKKVVRKGRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.31
4 0.24
5 0.2
6 0.19
7 0.25
8 0.3
9 0.36
10 0.41
11 0.5
12 0.58
13 0.67
14 0.75
15 0.76
16 0.79
17 0.83
18 0.87
19 0.87
20 0.87
21 0.81
22 0.73
23 0.68
24 0.61
25 0.55
26 0.5
27 0.42
28 0.36
29 0.4
30 0.46
31 0.52
32 0.62
33 0.68
34 0.73
35 0.8
36 0.87
37 0.89
38 0.9
39 0.9
40 0.91
41 0.87
42 0.81
43 0.77
44 0.7
45 0.62
46 0.53
47 0.43
48 0.34
49 0.28
50 0.23
51 0.16
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.08
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.11
63 0.15
64 0.17
65 0.25
66 0.28
67 0.32
68 0.37
69 0.42
70 0.44
71 0.43
72 0.42
73 0.39
74 0.38
75 0.34
76 0.31
77 0.31
78 0.29
79 0.26
80 0.25
81 0.21
82 0.21
83 0.21
84 0.19
85 0.17
86 0.16
87 0.18
88 0.18
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.11
95 0.08
96 0.11
97 0.12
98 0.14
99 0.16
100 0.2
101 0.24
102 0.29
103 0.28
104 0.26
105 0.25
106 0.23
107 0.22
108 0.23
109 0.25
110 0.25
111 0.28
112 0.29
113 0.37
114 0.39
115 0.42
116 0.46
117 0.5
118 0.49
119 0.52
120 0.55
121 0.49
122 0.54
123 0.55
124 0.48
125 0.4
126 0.38
127 0.37
128 0.32
129 0.34
130 0.28
131 0.27
132 0.29
133 0.27
134 0.23
135 0.22
136 0.24
137 0.2
138 0.18
139 0.14
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.15
146 0.17
147 0.18
148 0.21
149 0.25
150 0.3
151 0.39
152 0.43
153 0.48
154 0.46
155 0.46
156 0.44
157 0.46
158 0.42
159 0.34
160 0.3
161 0.21
162 0.21
163 0.22
164 0.2
165 0.14
166 0.12
167 0.14
168 0.14
169 0.18
170 0.2
171 0.19
172 0.19
173 0.19
174 0.24
175 0.27
176 0.26
177 0.24
178 0.25
179 0.26
180 0.27
181 0.28
182 0.23
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.2
187 0.21
188 0.24
189 0.28
190 0.29
191 0.34
192 0.39
193 0.43
194 0.46
195 0.53
196 0.59
197 0.63
198 0.71
199 0.74
200 0.8
201 0.82
202 0.82
203 0.8
204 0.79
205 0.76
206 0.7
207 0.64
208 0.61
209 0.56
210 0.52
211 0.55
212 0.54
213 0.51
214 0.54
215 0.56
216 0.55
217 0.52
218 0.49
219 0.45
220 0.38
221 0.37
222 0.31
223 0.28
224 0.24
225 0.25
226 0.25
227 0.21
228 0.19
229 0.17
230 0.17
231 0.19
232 0.28
233 0.31
234 0.35
235 0.42
236 0.47
237 0.46
238 0.47
239 0.46
240 0.38
241 0.34
242 0.31
243 0.3
244 0.25
245 0.26
246 0.24
247 0.21
248 0.19
249 0.16
250 0.13
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.07
264 0.08
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.1
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.17
275 0.17
276 0.16
277 0.14
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.19
311 0.19
312 0.21
313 0.23
314 0.22
315 0.22
316 0.22
317 0.18
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.09
328 0.07
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.11
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.13
340 0.14
341 0.13
342 0.11
343 0.11
344 0.09
345 0.11
346 0.11
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.1
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.13
383 0.12
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.15
389 0.15
390 0.19
391 0.2
392 0.23
393 0.27
394 0.3
395 0.31
396 0.33
397 0.33
398 0.31
399 0.33
400 0.32
401 0.27
402 0.25
403 0.2
404 0.18
405 0.17
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.14
414 0.15
415 0.12
416 0.13
417 0.12
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.12
429 0.15
430 0.16
431 0.2
432 0.22
433 0.31
434 0.4
435 0.47
436 0.54
437 0.59
438 0.66
439 0.68
440 0.7
441 0.67
442 0.68
443 0.66
444 0.68
445 0.7
446 0.68
447 0.7
448 0.67
449 0.68
450 0.61
451 0.54
452 0.44
453 0.38
454 0.33
455 0.28
456 0.26
457 0.18
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.11
462 0.09
463 0.07
464 0.08
465 0.08
466 0.11
467 0.17
468 0.24
469 0.31
470 0.33
471 0.34
472 0.36
473 0.41
474 0.48
475 0.43
476 0.4
477 0.39
478 0.39
479 0.39
480 0.38
481 0.34
482 0.26
483 0.27
484 0.24
485 0.19
486 0.21
487 0.23
488 0.22
489 0.2
490 0.19
491 0.18
492 0.19
493 0.18
494 0.17
495 0.17
496 0.25
497 0.29
498 0.34
499 0.38
500 0.41
501 0.49
502 0.52
503 0.55
504 0.55
505 0.56
506 0.61
507 0.63
508 0.69
509 0.7
510 0.71
511 0.69
512 0.68
513 0.71
514 0.71
515 0.73
516 0.74
517 0.74
518 0.78
519 0.81
520 0.82
521 0.81
522 0.79
523 0.79
524 0.77
525 0.73
526 0.67
527 0.59
528 0.53
529 0.47
530 0.41
531 0.35
532 0.35
533 0.4
534 0.47
535 0.47
536 0.55
537 0.64
538 0.72
539 0.75
540 0.77
541 0.76
542 0.76
543 0.8
544 0.79
545 0.78
546 0.76
547 0.72
548 0.66
549 0.66
550 0.63
551 0.63
552 0.56
553 0.56
554 0.55
555 0.57
556 0.59
557 0.57
558 0.59
559 0.63
560 0.7
561 0.68
562 0.71
563 0.73
564 0.77