Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q8I1

Protein Details
Accession A0A5C3Q8I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-142AAEKAQKKSRPRTKRAPASSAHydrophilic
154-177GAGGRKPAAKRRRKKAVPADVKEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-169KAQKKSRPRTKRAPASSAGAGADGEEEGAGAGGRKPAAKRRRKKA
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MSKAASKNKSKQTKFPVARIKKIMQKDEEVGKVAQATPIVICMSLTRSLIPLGELAKALELFLGLLVQESSKVTSARGSKKVEAYHLKHAVDTTEILDFLKEIVQAVPDPSAGGTIDLEAEAAEKAQKKSRPRTKRAPASSAGAGADGEEEGAGAGGRKPAAKRRRKKAVPADVKEGVDTPMVDVQGMDQGGAGTDPEDTMDDGTGGGRRTADDEDDYDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.78
3 0.79
4 0.76
5 0.8
6 0.77
7 0.74
8 0.71
9 0.73
10 0.71
11 0.65
12 0.62
13 0.58
14 0.58
15 0.53
16 0.48
17 0.4
18 0.33
19 0.29
20 0.25
21 0.21
22 0.14
23 0.12
24 0.09
25 0.11
26 0.1
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.1
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.06
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.04
56 0.05
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.13
62 0.19
63 0.26
64 0.32
65 0.35
66 0.36
67 0.41
68 0.42
69 0.44
70 0.46
71 0.44
72 0.46
73 0.47
74 0.44
75 0.4
76 0.38
77 0.32
78 0.24
79 0.21
80 0.13
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.03
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.05
111 0.08
112 0.1
113 0.16
114 0.21
115 0.28
116 0.38
117 0.49
118 0.57
119 0.63
120 0.72
121 0.77
122 0.83
123 0.82
124 0.76
125 0.68
126 0.62
127 0.55
128 0.45
129 0.34
130 0.24
131 0.18
132 0.13
133 0.1
134 0.06
135 0.05
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.11
147 0.21
148 0.31
149 0.41
150 0.51
151 0.6
152 0.71
153 0.75
154 0.83
155 0.85
156 0.86
157 0.86
158 0.82
159 0.79
160 0.72
161 0.65
162 0.56
163 0.45
164 0.35
165 0.26
166 0.2
167 0.15
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.14
198 0.16
199 0.19
200 0.19
201 0.19