Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q5D5

Protein Details
Accession A0A5C3Q5D5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-349QELQKLKTKSAKRSKPSEPVEEHydrophilic
357-376VDEEQEKPVKVKKRKKSKAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
364-376PVKVKKRKKSKAE
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, cyto 8, cyto_mito 4.833, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR039328  WDR89  
Pfam View protein in Pfam  
PF11715  Nup160  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MALTSSYLLACLHLPAANLYAVSTSTPENAVLLLNDETRRIQKSLQHPNVITRLRLARNFLGGQERLLTSCKDGSVRVWDIQSGDCIRTFSTSPRRAILSFDISQDKSTIAAGTELAQQEAHIIFFSTDPESTDAHPGWVHTSTHSDDVTCLNFLGSSSQILSASTDGCLCISDASVKDEEEAVLSTSNWGCSIAQAGVIDDELIWAGSDMETFSVWSIELDKIADINIKSDPENPSIPSSAKSDYLVTVSSQPRGLIVGSYEGQISLLSLPKNSSSPLKLLHAPTSPLTGPPHATETVVRCALLVPEKDRVVTGAEDGMICVWPWPQELQKLKTKSAKRSKPSEPVEEVAEDRMDVDEEQEKPVKVKKRKKSKAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.14
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.1
19 0.12
20 0.12
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.18
25 0.22
26 0.25
27 0.24
28 0.27
29 0.31
30 0.41
31 0.51
32 0.56
33 0.6
34 0.57
35 0.61
36 0.66
37 0.61
38 0.51
39 0.45
40 0.45
41 0.43
42 0.45
43 0.44
44 0.38
45 0.4
46 0.4
47 0.37
48 0.37
49 0.31
50 0.29
51 0.27
52 0.25
53 0.21
54 0.22
55 0.2
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.16
60 0.17
61 0.18
62 0.24
63 0.26
64 0.26
65 0.25
66 0.25
67 0.25
68 0.24
69 0.26
70 0.21
71 0.18
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.21
78 0.3
79 0.35
80 0.36
81 0.38
82 0.4
83 0.38
84 0.41
85 0.38
86 0.34
87 0.29
88 0.3
89 0.32
90 0.3
91 0.3
92 0.26
93 0.22
94 0.15
95 0.14
96 0.12
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.16
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.15
130 0.15
131 0.18
132 0.17
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.12
138 0.1
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.06
161 0.07
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.09
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.15
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.19
223 0.2
224 0.21
225 0.21
226 0.19
227 0.19
228 0.18
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.12
236 0.17
237 0.17
238 0.18
239 0.18
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.15
244 0.09
245 0.08
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.06
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.17
263 0.16
264 0.19
265 0.21
266 0.24
267 0.28
268 0.29
269 0.32
270 0.3
271 0.3
272 0.28
273 0.29
274 0.26
275 0.24
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.21
280 0.24
281 0.2
282 0.21
283 0.21
284 0.23
285 0.26
286 0.25
287 0.23
288 0.19
289 0.19
290 0.21
291 0.23
292 0.23
293 0.2
294 0.25
295 0.25
296 0.26
297 0.25
298 0.24
299 0.2
300 0.18
301 0.16
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.13
314 0.16
315 0.25
316 0.33
317 0.38
318 0.46
319 0.5
320 0.55
321 0.61
322 0.65
323 0.67
324 0.71
325 0.75
326 0.74
327 0.79
328 0.8
329 0.82
330 0.81
331 0.79
332 0.73
333 0.65
334 0.6
335 0.54
336 0.46
337 0.38
338 0.31
339 0.22
340 0.17
341 0.15
342 0.13
343 0.11
344 0.13
345 0.16
346 0.17
347 0.21
348 0.25
349 0.25
350 0.28
351 0.35
352 0.43
353 0.48
354 0.57
355 0.63
356 0.7