FuNGI

A0A5C3Q0W7

Protein Details

Accession

A0A5C3Q0W7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1033-1052	TCELKSTKRNTGPKKKAVTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 22, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MIPRRARSLLTSRQGLPRPARLYSAPTKPIQSPAASVATAPTPVVYPPPMVQDYRSPSAVEMHHFLRRKTSFTVLPTPLPDDTSSQVNDMFYTDSPTQDTLAIISACLHGLHDVPRAKEVFNRLRSERPHDPVLEPRLYNSMLEAYVGMACTKGADGKDVWLQDTANLYNSMENGKERVQPTEGTYAVMLMAWHRFRSVGADSGTAALPTPEQLLAPLVERALSVSSIITDRAFTSSEEVAGIIKSLSQAAVALSMSHIVSELGRSEVIGQYSADPLEGVPEALPVRRGSPQKPSLGDEAEVASQQAEVPFNLENLRKHLAQVLLAKRVLPEDVASRQKLLEESVYDVALERLRHQIDTLAQLGLGSAALNKSSDLQKWMWDWHCKLKVRLQTEIESIIRQEENKRKDGYIPLGPFLSLVQPERLSLIAILEVMRLQGSGGVAEGMKTTRALISIGKAVENEYKARMCKKNNIQIPSSLLPRGTNNQAFSGKMGSSLFSQAGYTDLHERRLVARKYMEDAEQWTTSWTQGTRAKVGSILVECLMDMAEVTRVGKDKVTGEKVSEVQPAFFHSYEYVRGQKLGVIRLNPIVSERIAKDSVKETVHPRHLPMLVRPKPWVSHNQGGYLFNPSSVMRFKDSQEQLSYLKRASDMGNMELVYAGLDVLGVTPWRVNRAIFDVVLAVWNSGEKLGKLPPVVLDYPEPERPDNYETDMKARSVYLHRQKAYNQAKANNHSDRCSVNYKIEIARAFLGDEFYQPHNIDFRGRAYPIPPHLNHMGDDLSRGLLKFAESKPLGERGLRWLKIHLANLYGYDKASFDERVQWVMDRLDDIRDSADHPLDGRGWWKRADDPWQCLATCMELKNALARPDPEAFESCLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDAQGAAQVNLAAADRPSDVYTHVGNMVQKMVAADAEKGVKEAQLLLDKITRKVVKQTVMTTVYGVTFIGAREQIERQLKERGDIPEESCWDASAYLAKQVLFCIGDLFSGAKAIQNWLNISARLVARSIPAERLQQATCELKSTKRNTGPKKKAVTTSKSTLRMGKELMTSVIWTTPLGLPVVQPYRKAKRKQIMTSLQTIFISDPASHSEVNSIKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTAIECRNQGITFASVHDSYWTHACDIDDMSGIIRDTFIALHSSDVLQKVQEEFLERYRGYKVPLHFLTSGNLSKALVSAGSQVIATRDQAQSLTALGKLVTIDDDAENSTVDEAAVESADLKKLVDILNESSGSISDSDALATSADESHSEKGSALDLETEEDTEPKVTKRKVAPGIGLEQVALLGKFVDFTALLPPLPKKGDFKVDEIKQSQYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.64
3	0.61
4	0.61
5	0.57
6	0.54
7	0.54
8	0.48
9	0.5
10	0.5
11	0.53
12	0.49
13	0.48
14	0.5
15	0.49
16	0.52
17	0.49
18	0.42
19	0.36
20	0.35
21	0.35
22	0.31
23	0.28
24	0.24
25	0.21
26	0.2
27	0.17
28	0.13
29	0.1
30	0.11
31	0.14
32	0.14
33	0.15
34	0.16
35	0.23
36	0.26
37	0.26
38	0.28
39	0.33
40	0.39
41	0.41
42	0.4
43	0.34
44	0.32
45	0.37
46	0.37
47	0.32
48	0.29
49	0.29
50	0.35
51	0.38
52	0.37
53	0.41
54	0.41
55	0.42
56	0.42
57	0.45
58	0.43
59	0.46
60	0.55
61	0.48
62	0.49
63	0.47
64	0.47
65	0.41
66	0.37
67	0.32
68	0.26
69	0.25
70	0.26
71	0.24
72	0.22
73	0.23
74	0.21
75	0.2
76	0.18
77	0.18
78	0.13
79	0.19
80	0.18
81	0.18
82	0.2
83	0.2
84	0.2
85	0.18
86	0.18
87	0.13
88	0.15
89	0.14
90	0.12
91	0.12
92	0.12
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.08
97	0.1
98	0.13
99	0.19
100	0.23
101	0.24
102	0.29
103	0.3
104	0.3
105	0.33
106	0.4
107	0.42
108	0.46
109	0.51
110	0.5
111	0.57
112	0.62
113	0.66
114	0.65
115	0.61
116	0.59
117	0.56
118	0.56
119	0.56
120	0.58
121	0.55
122	0.46
123	0.42
124	0.4
125	0.37
126	0.33
127	0.26
128	0.22
129	0.16
130	0.16
131	0.14
132	0.1
133	0.1
134	0.11
135	0.09
136	0.07
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.09
141	0.09
142	0.12
143	0.12
144	0.16
145	0.21
146	0.21
147	0.22
148	0.2
149	0.2
150	0.19
151	0.22
152	0.2
153	0.18
154	0.18
155	0.17
156	0.16
157	0.17
158	0.17
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.18
163	0.24
164	0.24
165	0.27
166	0.28
167	0.28
168	0.31
169	0.34
170	0.31
171	0.26
172	0.24
173	0.21
174	0.18
175	0.17
176	0.13
177	0.08
178	0.14
179	0.14
180	0.14
181	0.15
182	0.15
183	0.15
184	0.2
185	0.21
186	0.2
187	0.2
188	0.21
189	0.21
190	0.22
191	0.22
192	0.17
193	0.14
194	0.09
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.11
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.1
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.11
220	0.12
221	0.11
222	0.14
223	0.14
224	0.14
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.1
229	0.1
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.11
255	0.12
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.12
260	0.12
261	0.1
262	0.08
263	0.07
264	0.09
265	0.08
266	0.08
267	0.06
268	0.08
269	0.09
270	0.1
271	0.12
272	0.11
273	0.13
274	0.19
275	0.24
276	0.25
277	0.34
278	0.4
279	0.44
280	0.46
281	0.47
282	0.46
283	0.43
284	0.4
285	0.31
286	0.26
287	0.21
288	0.18
289	0.15
290	0.1
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.09
297	0.09
298	0.1
299	0.13
300	0.16
301	0.16
302	0.2
303	0.24
304	0.23
305	0.23
306	0.27
307	0.24
308	0.25
309	0.32
310	0.31
311	0.33
312	0.33
313	0.32
314	0.28
315	0.28
316	0.24
317	0.17
318	0.14
319	0.13
320	0.19
321	0.24
322	0.24
323	0.24
324	0.24
325	0.25
326	0.24
327	0.21
328	0.17
329	0.13
330	0.16
331	0.16
332	0.16
333	0.15
334	0.14
335	0.14
336	0.14
337	0.13
338	0.11
339	0.16
340	0.17
341	0.18
342	0.18
343	0.19
344	0.19
345	0.22
346	0.21
347	0.16
348	0.14
349	0.14
350	0.14
351	0.11
352	0.08
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.08
360	0.11
361	0.12
362	0.15
363	0.16
364	0.19
365	0.21
366	0.27
367	0.3
368	0.34
369	0.36
370	0.42
371	0.49
372	0.5
373	0.52
374	0.52
375	0.54
376	0.51
377	0.55
378	0.48
379	0.44
380	0.41
381	0.42
382	0.35
383	0.28
384	0.25
385	0.2
386	0.18
387	0.16
388	0.23
389	0.27
390	0.31
391	0.36
392	0.38
393	0.36
394	0.39
395	0.43
396	0.4
397	0.4
398	0.37
399	0.33
400	0.31
401	0.3
402	0.26
403	0.21
404	0.17
405	0.11
406	0.11
407	0.12
408	0.12
409	0.12
410	0.13
411	0.13
412	0.11
413	0.09
414	0.08
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.09
441	0.12
442	0.13
443	0.13
444	0.12
445	0.14
446	0.16
447	0.17
448	0.16
449	0.15
450	0.18
451	0.2
452	0.27
453	0.32
454	0.33
455	0.41
456	0.49
457	0.56
458	0.6
459	0.61
460	0.56
461	0.51
462	0.53
463	0.46
464	0.39
465	0.31
466	0.24
467	0.21
468	0.22
469	0.23
470	0.24
471	0.24
472	0.23
473	0.25
474	0.26
475	0.25
476	0.24
477	0.22
478	0.16
479	0.14
480	0.13
481	0.11
482	0.1
483	0.12
484	0.11
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.09
489	0.08
490	0.09
491	0.15
492	0.15
493	0.17
494	0.18
495	0.18
496	0.22
497	0.31
498	0.31
499	0.27
500	0.29
501	0.28
502	0.32
503	0.33
504	0.29
505	0.21
506	0.23
507	0.22
508	0.2
509	0.18
510	0.16
511	0.14
512	0.14
513	0.14
514	0.12
515	0.14
516	0.17
517	0.2
518	0.21
519	0.21
520	0.21
521	0.21
522	0.21
523	0.17
524	0.14
525	0.12
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.04
532	0.04
533	0.03
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.05
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.09
542	0.12
543	0.17
544	0.22
545	0.21
546	0.22
547	0.24
548	0.25
549	0.25
550	0.26
551	0.21
552	0.16
553	0.16
554	0.18
555	0.18
556	0.17
557	0.15
558	0.12
559	0.13
560	0.15
561	0.17
562	0.17
563	0.15
564	0.15
565	0.15
566	0.16
567	0.17
568	0.19
569	0.19
570	0.17
571	0.18
572	0.19
573	0.19
574	0.17
575	0.16
576	0.13
577	0.11
578	0.12
579	0.12
580	0.13
581	0.15
582	0.15
583	0.15
584	0.16
585	0.2
586	0.18
587	0.2
588	0.21
589	0.27
590	0.34
591	0.33
592	0.32
593	0.32
594	0.34
595	0.33
596	0.34
597	0.38
598	0.36
599	0.37
600	0.37
601	0.34
602	0.33
603	0.35
604	0.37
605	0.33
606	0.35
607	0.34
608	0.37
609	0.37
610	0.36
611	0.34
612	0.3
613	0.23
614	0.16
615	0.16
616	0.12
617	0.12
618	0.13
619	0.14
620	0.13
621	0.14
622	0.16
623	0.24
624	0.25
625	0.26
626	0.25
627	0.26
628	0.25
629	0.26
630	0.26
631	0.18
632	0.17
633	0.14
634	0.14
635	0.13
636	0.15
637	0.14
638	0.13
639	0.14
640	0.14
641	0.13
642	0.12
643	0.11
644	0.07
645	0.05
646	0.04
647	0.02
648	0.02
649	0.02
650	0.02
651	0.03
652	0.02
653	0.03
654	0.04
655	0.04
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.13
661	0.14
662	0.13
663	0.13
664	0.11
665	0.1
666	0.11
667	0.1
668	0.06
669	0.04
670	0.04
671	0.04
672	0.05
673	0.05
674	0.04
675	0.06
676	0.07
677	0.09
678	0.09
679	0.1
680	0.1
681	0.13
682	0.13
683	0.13
684	0.12
685	0.12
686	0.15
687	0.17
688	0.18
689	0.15
690	0.15
691	0.17
692	0.18
693	0.17
694	0.19
695	0.2
696	0.19
697	0.22
698	0.22
699	0.2
700	0.18
701	0.17
702	0.16
703	0.16
704	0.24
705	0.3
706	0.36
707	0.37
708	0.38
709	0.4
710	0.48
711	0.51
712	0.49
713	0.44
714	0.44
715	0.47
716	0.5
717	0.56
718	0.51
719	0.46
720	0.4
721	0.39
722	0.33
723	0.32
724	0.32
725	0.26
726	0.22
727	0.22
728	0.22
729	0.22
730	0.23
731	0.2
732	0.17
733	0.16
734	0.14
735	0.13
736	0.11
737	0.11
738	0.08
739	0.08
740	0.1
741	0.1
742	0.12
743	0.12
744	0.12
745	0.13
746	0.13
747	0.14
748	0.13
749	0.15
750	0.15
751	0.16
752	0.16
753	0.16
754	0.2
755	0.23
756	0.28
757	0.26
758	0.27
759	0.29
760	0.29
761	0.28
762	0.25
763	0.21
764	0.15
765	0.15
766	0.11
767	0.09
768	0.08
769	0.08
770	0.07
771	0.06
772	0.07
773	0.11
774	0.11
775	0.18
776	0.18
777	0.19
778	0.21
779	0.24
780	0.24
781	0.2
782	0.2
783	0.21
784	0.29
785	0.3
786	0.28
787	0.26
788	0.3
789	0.33
790	0.35
791	0.27
792	0.2
793	0.19
794	0.21
795	0.2
796	0.16
797	0.12
798	0.11
799	0.1
800	0.09
801	0.1
802	0.09
803	0.09
804	0.14
805	0.15
806	0.16
807	0.17
808	0.17
809	0.17
810	0.16
811	0.16
812	0.11
813	0.11
814	0.1
815	0.1
816	0.1
817	0.09
818	0.09
819	0.1
820	0.11
821	0.11
822	0.09
823	0.1
824	0.11
825	0.11
826	0.11
827	0.14
828	0.16
829	0.17
830	0.19
831	0.19
832	0.22
833	0.25
834	0.34
835	0.35
836	0.36
837	0.39
838	0.4
839	0.38
840	0.36
841	0.32
842	0.26
843	0.23
844	0.18
845	0.14
846	0.13
847	0.13
848	0.17
849	0.19
850	0.18
851	0.17
852	0.17
853	0.2
854	0.21
855	0.22
856	0.2
857	0.19
858	0.19
859	0.18
860	0.19
861	0.16
862	0.15
863	0.16
864	0.15
865	0.14
866	0.12
867	0.14
868	0.13
869	0.17
870	0.16
871	0.16
872	0.15
873	0.15
874	0.14
875	0.12
876	0.12
877	0.08
878	0.07
879	0.06
880	0.06
881	0.05
882	0.05
883	0.05
884	0.04
885	0.04
886	0.05
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.05
893	0.04
894	0.04
895	0.05
896	0.05
897	0.07
898	0.07
899	0.07
900	0.08
901	0.1
902	0.11
903	0.11
904	0.11
905	0.12
906	0.13
907	0.13
908	0.13
909	0.1
910	0.1
911	0.09
912	0.08
913	0.07
914	0.07
915	0.07
916	0.08
917	0.09
918	0.09
919	0.1
920	0.1
921	0.09
922	0.09
923	0.09
924	0.1
925	0.13
926	0.14
927	0.14
928	0.19
929	0.2
930	0.21
931	0.27
932	0.26
933	0.22
934	0.3
935	0.34
936	0.35
937	0.37
938	0.38
939	0.38
940	0.39
941	0.38
942	0.31
943	0.26
944	0.21
945	0.17
946	0.15
947	0.08
948	0.06
949	0.06
950	0.07
951	0.07
952	0.08
953	0.1
954	0.11
955	0.18
956	0.24
957	0.25
958	0.26
959	0.33
960	0.33
961	0.32
962	0.36
963	0.33
964	0.3
965	0.31
966	0.31
967	0.28
968	0.3
969	0.3
970	0.25
971	0.22
972	0.18
973	0.16
974	0.14
975	0.13
976	0.12
977	0.13
978	0.14
979	0.14
980	0.14
981	0.14
982	0.16
983	0.12
984	0.12
985	0.1
986	0.09
987	0.08
988	0.09
989	0.09
990	0.07
991	0.07
992	0.07
993	0.07
994	0.08
995	0.11
996	0.12
997	0.14
998	0.15
999	0.17
1000	0.19
1001	0.17
1002	0.18
1003	0.2
1004	0.18
1005	0.17
1006	0.17
1007	0.14
1008	0.14
1009	0.17
1010	0.17
1011	0.16
1012	0.18
1013	0.21
1014	0.22
1015	0.25
1016	0.24
1017	0.22
1018	0.25
1019	0.25
1020	0.23
1021	0.24
1022	0.24
1023	0.26
1024	0.35
1025	0.39
1026	0.44
1027	0.49
1028	0.58
1029	0.65
1030	0.75
1031	0.79
1032	0.79
1033	0.82
1034	0.78
1035	0.79
1036	0.78
1037	0.75
1038	0.7
1039	0.69
1040	0.67
1041	0.64
1042	0.61
1043	0.57
1044	0.52
1045	0.47
1046	0.42
1047	0.37
1048	0.31
1049	0.27
1050	0.26
1051	0.21
1052	0.18
1053	0.15
1054	0.15
1055	0.12
1056	0.1
1057	0.11
1058	0.11
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.1
1063	0.16
1064	0.24
1065	0.23
1066	0.26
1067	0.33
1068	0.43
1069	0.52
1070	0.59
1071	0.63
1072	0.65
1073	0.73
1074	0.77
1075	0.8
1076	0.79
1077	0.75
1078	0.76
1079	0.67
1080	0.6
1081	0.5
1082	0.42
1083	0.32
1084	0.23
1085	0.21
1086	0.12
1087	0.12
1088	0.13
1089	0.16
1090	0.15
1091	0.15
1092	0.2
1093	0.2
1094	0.22
1095	0.25
1096	0.22
1097	0.2
1098	0.21
1099	0.23
1100	0.2
1101	0.27
1102	0.26
1103	0.24
1104	0.26
1105	0.28
1106	0.28
1107	0.27
1108	0.26
1109	0.17
1110	0.18
1111	0.18
1112	0.18
1113	0.16
1114	0.14
1115	0.14
1116	0.12
1117	0.12
1118	0.1
1119	0.14
1120	0.13
1121	0.14
1122	0.15
1123	0.15
1124	0.17
1125	0.17
1126	0.17
1127	0.14
1128	0.14
1129	0.13
1130	0.14
1131	0.17
1132	0.15
1133	0.15
1134	0.17
1135	0.15
1136	0.15
1137	0.18
1138	0.18
1139	0.15
1140	0.17
1141	0.17
1142	0.17
1143	0.17
1144	0.16
1145	0.13
1146	0.12
1147	0.12
1148	0.12
1149	0.12
1150	0.1
1151	0.08
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.07
1155	0.08
1156	0.08
1157	0.08
1158	0.09
1159	0.1
1160	0.11
1161	0.13
1162	0.15
1163	0.15
1164	0.13
1165	0.15
1166	0.16
1167	0.16
1168	0.16
1169	0.18
1170	0.19
1171	0.23
1172	0.29
1173	0.27
1174	0.28
1175	0.31
1176	0.31
1177	0.31
1178	0.34
1179	0.33
1180	0.35
1181	0.37
1182	0.41
1183	0.38
1184	0.38
1185	0.36
1186	0.36
1187	0.35
1188	0.27
1189	0.25
1190	0.2
1191	0.19
1192	0.18
1193	0.16
1194	0.1
1195	0.09
1196	0.1
1197	0.1
1198	0.1
1199	0.1
1200	0.1
1201	0.12
1202	0.13
1203	0.13
1204	0.15
1205	0.15
1206	0.15
1207	0.16
1208	0.16
1209	0.15
1210	0.15
1211	0.15
1212	0.11
1213	0.11
1214	0.1
1215	0.1
1216	0.09
1217	0.09
1218	0.09
1219	0.08
1220	0.09
1221	0.09
1222	0.1
1223	0.11
1224	0.11
1225	0.11
1226	0.1
1227	0.1
1228	0.08
1229	0.08
1230	0.07
1231	0.06
1232	0.06
1233	0.06
1234	0.05
1235	0.06
1236	0.08
1237	0.09
1238	0.1
1239	0.09
1240	0.09
1241	0.12
1242	0.14
1243	0.15
1244	0.17
1245	0.19
1246	0.24
1247	0.24
1248	0.24
1249	0.21
1250	0.2
1251	0.18
1252	0.15
1253	0.12
1254	0.08
1255	0.08
1256	0.09
1257	0.09
1258	0.09
1259	0.08
1260	0.07
1261	0.08
1262	0.08
1263	0.08
1264	0.09
1265	0.12
1266	0.14
1267	0.16
1268	0.16
1269	0.15
1270	0.15
1271	0.17
1272	0.16
1273	0.14
1274	0.14
1275	0.13
1276	0.15
1277	0.15
1278	0.16
1279	0.14
1280	0.14
1281	0.14
1282	0.14
1283	0.16
1284	0.18
1285	0.26
1286	0.28
1287	0.35
1288	0.42
1289	0.51
1290	0.58
1291	0.62
1292	0.63
1293	0.59
1294	0.61
1295	0.56
1296	0.49
1297	0.38
1298	0.3
1299	0.24
1300	0.19
1301	0.13
1302	0.09
1303	0.07
1304	0.06
1305	0.07
1306	0.07
1307	0.08
1308	0.07
1309	0.08
1310	0.13
1311	0.14
1312	0.14
1313	0.17
1314	0.19
1315	0.23
1316	0.27
1317	0.3
1318	0.3
1319	0.34
1320	0.44
1321	0.44
1322	0.49
1323	0.54
1324	0.56
1325	0.61
1326	0.59
1327	0.59
1328	0.52

A0A5C3Q0W7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer