FuNGI

A0A5C3QLQ2

Protein Details

Accession

A0A5C3QLQ2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1156-1180	AQSRPGSRPNSPRPNSPRPRPVIGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

MDSTPSSPTPSRPGTPLGELPNVPNATPRPFRFTWDPTASRRQGPGSVSATTEGRGDYFAQPPTLDLLASGPVQAGSLPREWSASTDGFHAISTVLNNPHKTQAPPKAHSSLPSITPADLPRVRRKDFDPYLRAITAEWSRYEKNASLGKEGVAQLDGPMSPQRPVFSFSPDPDGSRTPRPLTPVPGRSIPLLSSVPDVFFEDDFELGDARTFALVTEQPEHAESAFASSSDPASLSRSLPLLEKFSHYADTVEQHLVKEISLRSTSFFAALTNLHDLQAESEQCLTRTTKLRKLLVDVDDKGAKKGLELVRKQFKRQNLGKVQEGLKVVSTVVEMTSVARNLVTAGQWDEALDAIEEMDHLWGYTEAAKPELSDSRPRSNGISSIAEADEPSSSSVFSTASSSSSTPSISISSLNAFAALPTHLRTLTAEITSSLISELLQSLNDDLQDRIAQRTPKQSLNRTLRERLQPLLGSLSRTKGVKEAMRNWSEEVLQSTKEVVKSSLPMFDEADEPPPGTSDSSGPRPGLGNHLRSLTSSDFRDLMRSLYRQFLNGIEGIQLQTTICLEILQSSAPSDLDIDSLREDLSDTIASVAELTNSQAGHIVNLRFLDLYIFTAKIEPSPSALSLVEFDAFFKDCWDFVVKCEVLCRRMVVGLRGVAVGQAKAFLQAFHQDKIGKSAKAVEEEQWAPVEVGRAHQRVVDVLVEAAMSDAPELRLSSPFSEPTPSSPAANATSSKQLQIEERPFFVVKASLEVLGMIHGYLQVIVNLPTLTTETMSRVIEFLKAFNSRTCQVVLGAGAMRSAGLKNITAKHLALASQSLSIMTALIPYIREAFRRHLSSKQTVILVEFDKLKRDYQEHQNEIHSKLIAIMGDRLTAHIKTLQSVDWTPEEVSSDVNSYMTLLVKETVMLHKVLTRYLAQPIVEYVMTQVFAAITHRLSEEYGSIDLPHQAAKTRLSADAHYLHQSLSALKGVSLQNSMLEMVISEKRISSSPISTPQAQSSQKPTMASMVSRASTIGSANQRLKGLLSGRSSASTTNLALEKPLPAPTSPSMLNASPTPPAEFSRGPSPPVPMKSPLNGTSPLLPPSELQELQDHLRSPDPLPVLGPRRTSSYGFREVYADAESPRAEERVMSPVLNGNSSLRSDMPSGLSSPAQSRPGSRPNSPRPNSPRPRPVIGEDGGIPLGEYDAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.45
3	0.47
4	0.44
5	0.43
6	0.41
7	0.4
8	0.43
9	0.39
10	0.34
11	0.33
12	0.31
13	0.34
14	0.41
15	0.42
16	0.42
17	0.42
18	0.49
19	0.52
20	0.54
21	0.56
22	0.57
23	0.59
24	0.58
25	0.68
26	0.65
27	0.62
28	0.6
29	0.54
30	0.5
31	0.47
32	0.48
33	0.41
34	0.38
35	0.34
36	0.33
37	0.3
38	0.26
39	0.24
40	0.17
41	0.14
42	0.14
43	0.16
44	0.17
45	0.21
46	0.22
47	0.23
48	0.22
49	0.22
50	0.24
51	0.21
52	0.17
53	0.13
54	0.12
55	0.13
56	0.13
57	0.13
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.1
63	0.11
64	0.14
65	0.15
66	0.16
67	0.17
68	0.18
69	0.2
70	0.23
71	0.21
72	0.2
73	0.2
74	0.21
75	0.2
76	0.19
77	0.17
78	0.12
79	0.11
80	0.12
81	0.14
82	0.2
83	0.25
84	0.28
85	0.29
86	0.35
87	0.38
88	0.4
89	0.45
90	0.48
91	0.53
92	0.55
93	0.59
94	0.58
95	0.56
96	0.55
97	0.51
98	0.45
99	0.38
100	0.39
101	0.34
102	0.3
103	0.33
104	0.31
105	0.33
106	0.33
107	0.37
108	0.42
109	0.49
110	0.51
111	0.52
112	0.54
113	0.57
114	0.62
115	0.65
116	0.6
117	0.57
118	0.59
119	0.55
120	0.52
121	0.41
122	0.38
123	0.32
124	0.3
125	0.27
126	0.27
127	0.28
128	0.29
129	0.33
130	0.29
131	0.31
132	0.34
133	0.34
134	0.33
135	0.33
136	0.32
137	0.33
138	0.31
139	0.25
140	0.2
141	0.18
142	0.14
143	0.14
144	0.13
145	0.1
146	0.14
147	0.14
148	0.15
149	0.16
150	0.18
151	0.18
152	0.23
153	0.23
154	0.27
155	0.31
156	0.31
157	0.37
158	0.36
159	0.37
160	0.36
161	0.39
162	0.36
163	0.38
164	0.41
165	0.37
166	0.39
167	0.43
168	0.44
169	0.48
170	0.52
171	0.51
172	0.51
173	0.5
174	0.5
175	0.45
176	0.42
177	0.34
178	0.29
179	0.24
180	0.2
181	0.2
182	0.19
183	0.17
184	0.17
185	0.18
186	0.15
187	0.14
188	0.15
189	0.12
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.05
201	0.08
202	0.1
203	0.13
204	0.16
205	0.16
206	0.17
207	0.18
208	0.19
209	0.15
210	0.14
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.08
221	0.11
222	0.12
223	0.13
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.17
228	0.19
229	0.2
230	0.19
231	0.22
232	0.22
233	0.23
234	0.24
235	0.21
236	0.2
237	0.18
238	0.19
239	0.19
240	0.2
241	0.19
242	0.17
243	0.2
244	0.19
245	0.17
246	0.19
247	0.17
248	0.17
249	0.18
250	0.18
251	0.18
252	0.19
253	0.2
254	0.16
255	0.15
256	0.12
257	0.12
258	0.12
259	0.12
260	0.15
261	0.15
262	0.14
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.18
267	0.16
268	0.13
269	0.15
270	0.15
271	0.15
272	0.18
273	0.18
274	0.19
275	0.28
276	0.33
277	0.38
278	0.45
279	0.5
280	0.49
281	0.53
282	0.54
283	0.5
284	0.51
285	0.45
286	0.41
287	0.41
288	0.4
289	0.35
290	0.31
291	0.25
292	0.18
293	0.25
294	0.27
295	0.31
296	0.35
297	0.43
298	0.51
299	0.54
300	0.59
301	0.56
302	0.57
303	0.58
304	0.61
305	0.63
306	0.62
307	0.64
308	0.63
309	0.63
310	0.58
311	0.52
312	0.47
313	0.36
314	0.28
315	0.23
316	0.19
317	0.13
318	0.12
319	0.08
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.07
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.09
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.06
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.03
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.08
353	0.1
354	0.1
355	0.11
356	0.12
357	0.11
358	0.14
359	0.17
360	0.17
361	0.24
362	0.28
363	0.34
364	0.36
365	0.37
366	0.37
367	0.34
368	0.34
369	0.29
370	0.26
371	0.2
372	0.2
373	0.19
374	0.17
375	0.15
376	0.13
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.11
393	0.11
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.09
404	0.08
405	0.07
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.09
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.12
415	0.13
416	0.12
417	0.11
418	0.11
419	0.12
420	0.11
421	0.11
422	0.08
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.08
434	0.07
435	0.08
436	0.1
437	0.1
438	0.12
439	0.16
440	0.18
441	0.2
442	0.29
443	0.31
444	0.37
445	0.42
446	0.46
447	0.53
448	0.59
449	0.64
450	0.61
451	0.62
452	0.61
453	0.61
454	0.56
455	0.48
456	0.42
457	0.34
458	0.29
459	0.29
460	0.24
461	0.2
462	0.19
463	0.19
464	0.18
465	0.18
466	0.18
467	0.15
468	0.19
469	0.2
470	0.25
471	0.31
472	0.37
473	0.38
474	0.39
475	0.37
476	0.35
477	0.3
478	0.26
479	0.21
480	0.15
481	0.13
482	0.12
483	0.13
484	0.13
485	0.14
486	0.14
487	0.12
488	0.11
489	0.13
490	0.14
491	0.16
492	0.15
493	0.15
494	0.15
495	0.15
496	0.15
497	0.13
498	0.15
499	0.12
500	0.11
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.08
505	0.09
506	0.09
507	0.12
508	0.15
509	0.17
510	0.16
511	0.17
512	0.17
513	0.17
514	0.23
515	0.24
516	0.23
517	0.23
518	0.24
519	0.23
520	0.23
521	0.26
522	0.19
523	0.18
524	0.16
525	0.16
526	0.16
527	0.16
528	0.18
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.15
533	0.15
534	0.19
535	0.2
536	0.18
537	0.19
538	0.17
539	0.16
540	0.15
541	0.13
542	0.09
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.05
548	0.05
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.05
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.1
591	0.1
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.05
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.08
604	0.08
605	0.08
606	0.09
607	0.07
608	0.08
609	0.09
610	0.09
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.08
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.08
626	0.12
627	0.11
628	0.11
629	0.19
630	0.18
631	0.17
632	0.21
633	0.22
634	0.2
635	0.2
636	0.2
637	0.13
638	0.16
639	0.16
640	0.14
641	0.14
642	0.13
643	0.13
644	0.12
645	0.11
646	0.1
647	0.09
648	0.08
649	0.06
650	0.06
651	0.05
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.06
656	0.13
657	0.15
658	0.15
659	0.17
660	0.17
661	0.17
662	0.24
663	0.27
664	0.21
665	0.19
666	0.24
667	0.23
668	0.25
669	0.26
670	0.2
671	0.21
672	0.22
673	0.22
674	0.17
675	0.16
676	0.12
677	0.12
678	0.12
679	0.08
680	0.11
681	0.15
682	0.16
683	0.15
684	0.16
685	0.16
686	0.14
687	0.15
688	0.13
689	0.08
690	0.07
691	0.07
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.04
696	0.03
697	0.03
698	0.03
699	0.04
700	0.04
701	0.05
702	0.06
703	0.07
704	0.09
705	0.11
706	0.12
707	0.13
708	0.14
709	0.16
710	0.16
711	0.17
712	0.21
713	0.2
714	0.19
715	0.18
716	0.19
717	0.18
718	0.19
719	0.17
720	0.14
721	0.19
722	0.19
723	0.2
724	0.19
725	0.18
726	0.19
727	0.25
728	0.3
729	0.26
730	0.26
731	0.27
732	0.27
733	0.25
734	0.23
735	0.19
736	0.12
737	0.13
738	0.13
739	0.1
740	0.1
741	0.1
742	0.09
743	0.07
744	0.07
745	0.04
746	0.03
747	0.03
748	0.03
749	0.04
750	0.04
751	0.04
752	0.05
753	0.05
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.06
758	0.07
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.08
763	0.11
764	0.11
765	0.11
766	0.11
767	0.11
768	0.13
769	0.13
770	0.12
771	0.13
772	0.15
773	0.16
774	0.17
775	0.21
776	0.19
777	0.2
778	0.2
779	0.17
780	0.15
781	0.15
782	0.13
783	0.11
784	0.1
785	0.09
786	0.08
787	0.07
788	0.07
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.08
794	0.11
795	0.14
796	0.16
797	0.17
798	0.17
799	0.17
800	0.17
801	0.16
802	0.13
803	0.12
804	0.11
805	0.1
806	0.09
807	0.08
808	0.08
809	0.07
810	0.06
811	0.05
812	0.05
813	0.04
814	0.05
815	0.05
816	0.05
817	0.09
818	0.09
819	0.12
820	0.15
821	0.2
822	0.26
823	0.32
824	0.34
825	0.37
826	0.43
827	0.46
828	0.47
829	0.44
830	0.39
831	0.34
832	0.32
833	0.29
834	0.23
835	0.19
836	0.2
837	0.18
838	0.21
839	0.22
840	0.23
841	0.23
842	0.26
843	0.31
844	0.37
845	0.47
846	0.46
847	0.47
848	0.51
849	0.51
850	0.49
851	0.45
852	0.35
853	0.24
854	0.22
855	0.21
856	0.15
857	0.12
858	0.12
859	0.1
860	0.11
861	0.11
862	0.12
863	0.13
864	0.12
865	0.13
866	0.14
867	0.14
868	0.15
869	0.16
870	0.16
871	0.17
872	0.18
873	0.19
874	0.17
875	0.18
876	0.17
877	0.16
878	0.17
879	0.13
880	0.14
881	0.12
882	0.12
883	0.11
884	0.1
885	0.1
886	0.08
887	0.09
888	0.09
889	0.08
890	0.08
891	0.08
892	0.08
893	0.09
894	0.1
895	0.11
896	0.12
897	0.12
898	0.11
899	0.14
900	0.15
901	0.15
902	0.16
903	0.16
904	0.16
905	0.2
906	0.22
907	0.19
908	0.19
909	0.19
910	0.19
911	0.16
912	0.14
913	0.12
914	0.1
915	0.1
916	0.09
917	0.08
918	0.06
919	0.06
920	0.08
921	0.08
922	0.08
923	0.09
924	0.09
925	0.1
926	0.1
927	0.11
928	0.1
929	0.11
930	0.11
931	0.11
932	0.11
933	0.11
934	0.12
935	0.12
936	0.13
937	0.11
938	0.13
939	0.15
940	0.16
941	0.19
942	0.2
943	0.23
944	0.23
945	0.24
946	0.26
947	0.28
948	0.28
949	0.27
950	0.26
951	0.22
952	0.21
953	0.21
954	0.17
955	0.15
956	0.14
957	0.11
958	0.11
959	0.16
960	0.16
961	0.17
962	0.18
963	0.16
964	0.15
965	0.15
966	0.15
967	0.1
968	0.09
969	0.07
970	0.09
971	0.11
972	0.12
973	0.12
974	0.12
975	0.13
976	0.14
977	0.18
978	0.18
979	0.19
980	0.23
981	0.3
982	0.34
983	0.36
984	0.38
985	0.38
986	0.43
987	0.42
988	0.41
989	0.4
990	0.42
991	0.41
992	0.4
993	0.37
994	0.33
995	0.32
996	0.29
997	0.26
998	0.24
999	0.22
1000	0.21
1001	0.2
1002	0.17
1003	0.15
1004	0.15
1005	0.18
1006	0.19
1007	0.26
1008	0.29
1009	0.32
1010	0.32
1011	0.31
1012	0.31
1013	0.3
1014	0.28
1015	0.27
1016	0.27
1017	0.27
1018	0.27
1019	0.29
1020	0.29
1021	0.25
1022	0.24
1023	0.2
1024	0.17
1025	0.19
1026	0.19
1027	0.17
1028	0.18
1029	0.18
1030	0.18
1031	0.17
1032	0.21
1033	0.18
1034	0.17
1035	0.22
1036	0.23
1037	0.26
1038	0.24
1039	0.25
1040	0.25
1041	0.24
1042	0.26
1043	0.23
1044	0.23
1045	0.22
1046	0.22
1047	0.22
1048	0.21
1049	0.22
1050	0.25
1051	0.25
1052	0.27
1053	0.33
1054	0.33
1055	0.34
1056	0.34
1057	0.38
1058	0.4
1059	0.43
1060	0.43
1061	0.4
1062	0.42
1063	0.44
1064	0.48
1065	0.45
1066	0.42
1067	0.4
1068	0.38
1069	0.38
1070	0.36
1071	0.34
1072	0.29
1073	0.26
1074	0.22
1075	0.24
1076	0.29
1077	0.24
1078	0.23
1079	0.24
1080	0.26
1081	0.28
1082	0.32
1083	0.28
1084	0.23
1085	0.27
1086	0.27
1087	0.25
1088	0.28
1089	0.27
1090	0.24
1091	0.25
1092	0.31
1093	0.34
1094	0.36
1095	0.39
1096	0.35
1097	0.39
1098	0.42
1099	0.44
1100	0.43
1101	0.44
1102	0.49
1103	0.46
1104	0.45
1105	0.41
1106	0.38
1107	0.36
1108	0.32
1109	0.25
1110	0.17
1111	0.18
1112	0.17
1113	0.17
1114	0.18
1115	0.17
1116	0.14
1117	0.14
1118	0.16
1119	0.19
1120	0.21
1121	0.2
1122	0.19
1123	0.24
1124	0.26
1125	0.25
1126	0.24
1127	0.2
1128	0.21
1129	0.22
1130	0.23
1131	0.18
1132	0.19
1133	0.2
1134	0.21
1135	0.22
1136	0.21
1137	0.21
1138	0.22
1139	0.22
1140	0.21
1141	0.23
1142	0.26
1143	0.27
1144	0.27
1145	0.3
1146	0.36
1147	0.44
1148	0.48
1149	0.53
1150	0.58
1151	0.65
1152	0.75
1153	0.74
1154	0.77
1155	0.77
1156	0.82
1157	0.84
1158	0.84
1159	0.83
1160	0.79
1161	0.82
1162	0.77
1163	0.73
1164	0.69
1165	0.6
1166	0.53
1167	0.44
1168	0.39
1169	0.32
1170	0.27
1171	0.21
1172	0.13

A0A5C3QLQ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer