FuNGI

A0A5C3QL53

Protein Details

Accession

A0A5C3QL53

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
554-641	SDSERAREKREKEKDERMKERRKEREREEREKEKEKEREKETLREKEREREKMERQKEKEKEREEEKEREAREKKTRSRTENERRIGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
357-378	RGITSKEAKEKAKAAGTAKAPR
558-638	RAREKREKEKDERMKERRKEREREEREKEKEKEREKETLREKEREREKMERQKEKEKEREEEKEREAREKKTRSRTENERR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042065 E3_ELL-like IPR019464 ELL_N IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0008023 C:transcription elongation factor complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF10390 ELL

Amino Acid Sequences

MPLPNSGILALHGPSKPGEMGQSKPKQAMIVRMSEQTLKALTAMQANPQIQIEFGAAPGIHIGETFYPMAARKEDIPHDLYLRAAPANKPTAPLKLYANVTGKFFVEQKLASDNAHLKKLRERTAQATEAKQETRTMMLDAPPVTASQSTAGTSKKRKAPGTGIFRKPLPASSSATASLGVGGSSAGGRKASPNPAAPGPSASGSGSASGSASGSSAPSGNTASHPARPRLIHCLALAPRSADEVVRLVGGSRCDSSTRADLLNLLSDVAEPAEQKSSGGTWRLRQRSWLEVRPFEWPKISEQERISMARSARLAFGALRIPENDPAWANVKFRTTVQHDGSPAPGGNGSDAPSPRRGITSKEAKEKAKAAGTAKAPRVRAGSTTAPSVPSSSSAATRHDTSRTASTSVSASTSLSSATSTSTPAQRPRPAALNLAKDVGDAERDRARAASPLSATSSTQATRRAPPGSGYKSTNRGSTPVNVPATSKTTPVPSTSTSTSNLQTPTDAPKRMKNVAGLPPKPPPQSQTQKATPASVAPSGSGSARRAATSTQDSDSERAREKREKEKDERMKERRKEREREEREKEKEKEREKETLREKEREREKMERQKEKEKEREEEKEREAREKKTRSRTENERRIGSAVNDASGKENRSPRTSGNGRRIPALPPP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.18
3	0.18
4	0.17
5	0.24
6	0.22
7	0.28
8	0.37
9	0.45
10	0.46
11	0.48
12	0.48
13	0.46
14	0.45
15	0.5
16	0.44
17	0.42
18	0.42
19	0.42
20	0.43
21	0.4
22	0.38
23	0.31
24	0.27
25	0.2
26	0.18
27	0.17
28	0.17
29	0.2
30	0.2
31	0.23
32	0.28
33	0.28
34	0.29
35	0.28
36	0.26
37	0.2
38	0.2
39	0.17
40	0.11
41	0.1
42	0.11
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.07
48	0.07
49	0.08
50	0.07
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.11
55	0.13
56	0.16
57	0.16
58	0.17
59	0.18
60	0.24
61	0.28
62	0.31
63	0.32
64	0.32
65	0.32
66	0.31
67	0.28
68	0.23
69	0.22
70	0.19
71	0.19
72	0.19
73	0.23
74	0.28
75	0.28
76	0.3
77	0.31
78	0.34
79	0.33
80	0.33
81	0.31
82	0.31
83	0.33
84	0.36
85	0.4
86	0.35
87	0.35
88	0.34
89	0.31
90	0.27
91	0.26
92	0.21
93	0.19
94	0.18
95	0.18
96	0.2
97	0.21
98	0.19
99	0.22
100	0.28
101	0.28
102	0.35
103	0.36
104	0.34
105	0.4
106	0.48
107	0.52
108	0.52
109	0.53
110	0.53
111	0.58
112	0.63
113	0.59
114	0.54
115	0.51
116	0.48
117	0.45
118	0.38
119	0.32
120	0.27
121	0.25
122	0.23
123	0.2
124	0.17
125	0.18
126	0.2
127	0.19
128	0.19
129	0.16
130	0.16
131	0.15
132	0.13
133	0.12
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.13
138	0.16
139	0.22
140	0.28
141	0.35
142	0.4
143	0.46
144	0.49
145	0.52
146	0.58
147	0.61
148	0.65
149	0.68
150	0.66
151	0.63
152	0.6
153	0.57
154	0.49
155	0.43
156	0.35
157	0.29
158	0.28
159	0.26
160	0.28
161	0.25
162	0.25
163	0.21
164	0.17
165	0.14
166	0.1
167	0.08
168	0.05
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.09
177	0.14
178	0.2
179	0.23
180	0.25
181	0.28
182	0.3
183	0.32
184	0.29
185	0.26
186	0.22
187	0.19
188	0.17
189	0.14
190	0.13
191	0.11
192	0.11
193	0.09
194	0.08
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.07
207	0.08
208	0.09
209	0.14
210	0.16
211	0.21
212	0.25
213	0.26
214	0.29
215	0.3
216	0.31
217	0.34
218	0.35
219	0.32
220	0.28
221	0.32
222	0.29
223	0.29
224	0.28
225	0.2
226	0.18
227	0.17
228	0.17
229	0.1
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.08
237	0.09
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.13
243	0.14
244	0.16
245	0.17
246	0.16
247	0.15
248	0.15
249	0.15
250	0.15
251	0.12
252	0.09
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.09
266	0.14
267	0.15
268	0.2
269	0.28
270	0.33
271	0.33
272	0.37
273	0.38
274	0.42
275	0.47
276	0.49
277	0.44
278	0.42
279	0.43
280	0.46
281	0.45
282	0.37
283	0.33
284	0.26
285	0.24
286	0.3
287	0.31
288	0.28
289	0.27
290	0.29
291	0.29
292	0.29
293	0.28
294	0.24
295	0.22
296	0.19
297	0.19
298	0.17
299	0.15
300	0.14
301	0.13
302	0.09
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.11
309	0.13
310	0.13
311	0.12
312	0.1
313	0.11
314	0.14
315	0.14
316	0.14
317	0.14
318	0.15
319	0.14
320	0.14
321	0.18
322	0.2
323	0.25
324	0.26
325	0.27
326	0.28
327	0.27
328	0.28
329	0.23
330	0.19
331	0.13
332	0.11
333	0.08
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.09
338	0.1
339	0.12
340	0.13
341	0.14
342	0.14
343	0.16
344	0.16
345	0.18
346	0.25
347	0.33
348	0.36
349	0.44
350	0.48
351	0.46
352	0.48
353	0.46
354	0.42
355	0.35
356	0.33
357	0.26
358	0.28
359	0.3
360	0.33
361	0.35
362	0.36
363	0.34
364	0.32
365	0.33
366	0.28
367	0.25
368	0.24
369	0.23
370	0.2
371	0.22
372	0.2
373	0.2
374	0.19
375	0.18
376	0.14
377	0.11
378	0.12
379	0.11
380	0.13
381	0.13
382	0.15
383	0.16
384	0.19
385	0.19
386	0.19
387	0.2
388	0.2
389	0.23
390	0.22
391	0.21
392	0.19
393	0.18
394	0.17
395	0.16
396	0.14
397	0.1
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.1
409	0.15
410	0.18
411	0.24
412	0.3
413	0.34
414	0.36
415	0.37
416	0.41
417	0.38
418	0.42
419	0.41
420	0.39
421	0.36
422	0.34
423	0.31
424	0.25
425	0.24
426	0.17
427	0.15
428	0.11
429	0.13
430	0.15
431	0.15
432	0.16
433	0.16
434	0.16
435	0.16
436	0.17
437	0.18
438	0.15
439	0.16
440	0.18
441	0.18
442	0.18
443	0.16
444	0.17
445	0.14
446	0.16
447	0.2
448	0.2
449	0.24
450	0.28
451	0.28
452	0.27
453	0.3
454	0.36
455	0.37
456	0.39
457	0.38
458	0.39
459	0.44
460	0.45
461	0.45
462	0.37
463	0.33
464	0.32
465	0.33
466	0.33
467	0.32
468	0.33
469	0.29
470	0.3
471	0.3
472	0.32
473	0.28
474	0.25
475	0.19
476	0.21
477	0.22
478	0.23
479	0.24
480	0.21
481	0.25
482	0.27
483	0.28
484	0.27
485	0.28
486	0.28
487	0.28
488	0.27
489	0.22
490	0.21
491	0.2
492	0.26
493	0.3
494	0.34
495	0.33
496	0.38
497	0.43
498	0.46
499	0.47
500	0.43
501	0.44
502	0.48
503	0.55
504	0.51
505	0.48
506	0.51
507	0.55
508	0.54
509	0.48
510	0.42
511	0.42
512	0.5
513	0.54
514	0.56
515	0.55
516	0.59
517	0.59
518	0.58
519	0.48
520	0.4
521	0.36
522	0.3
523	0.24
524	0.17
525	0.17
526	0.15
527	0.16
528	0.17
529	0.15
530	0.17
531	0.17
532	0.17
533	0.18
534	0.18
535	0.23
536	0.25
537	0.27
538	0.25
539	0.27
540	0.29
541	0.3
542	0.33
543	0.32
544	0.33
545	0.35
546	0.41
547	0.46
548	0.5
549	0.59
550	0.65
551	0.7
552	0.72
553	0.78
554	0.81
555	0.84
556	0.88
557	0.88
558	0.88
559	0.87
560	0.89
561	0.89
562	0.88
563	0.87
564	0.86
565	0.87
566	0.87
567	0.89
568	0.88
569	0.87
570	0.86
571	0.86
572	0.82
573	0.81
574	0.81
575	0.79
576	0.78
577	0.73
578	0.75
579	0.7
580	0.74
581	0.73
582	0.74
583	0.72
584	0.72
585	0.71
586	0.71
587	0.75
588	0.74
589	0.72
590	0.71
591	0.74
592	0.76
593	0.82
594	0.83
595	0.8
596	0.82
597	0.84
598	0.85
599	0.84
600	0.81
601	0.79
602	0.77
603	0.81
604	0.77
605	0.76
606	0.73
607	0.71
608	0.66
609	0.68
610	0.65
611	0.64
612	0.67
613	0.69
614	0.72
615	0.75
616	0.82
617	0.8
618	0.84
619	0.86
620	0.87
621	0.87
622	0.84
623	0.78
624	0.7
625	0.65
626	0.59
627	0.49
628	0.46
629	0.37
630	0.32
631	0.28
632	0.26
633	0.29
634	0.29
635	0.31
636	0.29
637	0.36
638	0.39
639	0.43
640	0.46
641	0.45
642	0.51
643	0.58
644	0.6
645	0.64
646	0.66
647	0.63
648	0.64
649	0.62

A0A5C3QL53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer