Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3QRN6

Protein Details
Accession A0A5C3QRN6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-201LEKLLQGQRHKRHPQHPGKAQTKDKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.666, mito_nucl 9.166, cyto 8, cyto_mito 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
Amino Acid Sequences MDVASFPRSGVILFGPNSLHALVSSNIINQVEALLASHKIPEAKALADQYKTKLGKKQYTEGEEAQELQYVYQRIGMQCFAETRFEEAGECFLNGDLDPRVVLSFYPDLIGSLLSSEDSVTLYSGIEECLPSETSVEDIIAMNLVRNYSPYMSPNTRSAPPTTELRTIYLANAQTMLEKLLQGQRHKRHPQHPGKAQTKDKGKVLQVDIITDTVLAKIYALSEKTQALYELLQDRHDVDLAEVEPVLKSAGRNRALCMIYKQGGHNEKLLEAWSLIAQGEWSEEDVTDPVGDMLELLSREKDRVLVQKWGLWITERDPERGLKLLISRDTGKRKDNRGSEASLLQELQELNPAAGLKYLEHLVLQKRSVLPEFHTQLALACIDQVLEYLQDTAVSKLWRAKASSYASSTSEATFVSYFLSTTPNSESKHARLKTIMLLQGSKFYDVQLIRERLSPHSGILRTELAIVEGKLENHKSSLSILVHDIHDTVAAKAYCALGGAILPSRLTQAIGEQCGLQSWTSVFGLQPATLKNAATTTTDDALKYTLTKILLEVFMNEEKPSFEKAAQLLNAQAAHMDVIEALTMIPDDWPLTLPVPFLASSLRRVLHERHEGQIVKAIAAAQNLKVSEDSWAVIREQGYVVEETDSDDEDKKGDMEYVNEKTMEAPTSTSAVDIELSEKASTLGGTYGVESVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.19
4 0.21
5 0.19
6 0.16
7 0.11
8 0.13
9 0.12
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.13
17 0.13
18 0.11
19 0.1
20 0.09
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.12
26 0.13
27 0.13
28 0.17
29 0.18
30 0.18
31 0.22
32 0.27
33 0.29
34 0.31
35 0.34
36 0.33
37 0.4
38 0.42
39 0.43
40 0.44
41 0.5
42 0.55
43 0.58
44 0.64
45 0.63
46 0.66
47 0.67
48 0.63
49 0.58
50 0.5
51 0.46
52 0.37
53 0.31
54 0.25
55 0.19
56 0.21
57 0.17
58 0.16
59 0.18
60 0.21
61 0.2
62 0.22
63 0.23
64 0.2
65 0.21
66 0.23
67 0.2
68 0.21
69 0.2
70 0.22
71 0.22
72 0.21
73 0.2
74 0.18
75 0.2
76 0.17
77 0.16
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.12
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.11
135 0.12
136 0.14
137 0.15
138 0.22
139 0.26
140 0.29
141 0.32
142 0.34
143 0.36
144 0.37
145 0.37
146 0.33
147 0.32
148 0.35
149 0.35
150 0.36
151 0.33
152 0.32
153 0.32
154 0.29
155 0.26
156 0.26
157 0.22
158 0.17
159 0.17
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.09
165 0.08
166 0.11
167 0.15
168 0.2
169 0.26
170 0.35
171 0.42
172 0.51
173 0.61
174 0.67
175 0.71
176 0.77
177 0.81
178 0.82
179 0.83
180 0.84
181 0.82
182 0.82
183 0.79
184 0.76
185 0.74
186 0.68
187 0.63
188 0.58
189 0.53
190 0.52
191 0.48
192 0.45
193 0.36
194 0.33
195 0.3
196 0.24
197 0.21
198 0.14
199 0.12
200 0.07
201 0.07
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.06
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.13
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.14
225 0.08
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.05
235 0.06
236 0.11
237 0.2
238 0.25
239 0.25
240 0.26
241 0.33
242 0.33
243 0.34
244 0.31
245 0.28
246 0.25
247 0.26
248 0.26
249 0.26
250 0.29
251 0.29
252 0.29
253 0.25
254 0.23
255 0.21
256 0.21
257 0.14
258 0.1
259 0.09
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.04
266 0.05
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.11
290 0.17
291 0.2
292 0.24
293 0.25
294 0.26
295 0.27
296 0.26
297 0.24
298 0.18
299 0.16
300 0.13
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.19
308 0.17
309 0.12
310 0.14
311 0.16
312 0.16
313 0.17
314 0.19
315 0.23
316 0.29
317 0.31
318 0.35
319 0.39
320 0.44
321 0.49
322 0.5
323 0.5
324 0.47
325 0.46
326 0.41
327 0.36
328 0.31
329 0.24
330 0.19
331 0.14
332 0.12
333 0.1
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.09
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.15
354 0.17
355 0.18
356 0.16
357 0.16
358 0.21
359 0.23
360 0.22
361 0.21
362 0.19
363 0.18
364 0.18
365 0.15
366 0.08
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.03
373 0.03
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.13
384 0.17
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.24
389 0.28
390 0.3
391 0.28
392 0.27
393 0.26
394 0.26
395 0.26
396 0.19
397 0.16
398 0.12
399 0.11
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.09
407 0.08
408 0.1
409 0.13
410 0.16
411 0.18
412 0.21
413 0.24
414 0.26
415 0.35
416 0.35
417 0.33
418 0.3
419 0.3
420 0.32
421 0.33
422 0.32
423 0.24
424 0.24
425 0.23
426 0.27
427 0.25
428 0.22
429 0.17
430 0.15
431 0.19
432 0.17
433 0.21
434 0.23
435 0.25
436 0.25
437 0.28
438 0.3
439 0.27
440 0.3
441 0.27
442 0.2
443 0.24
444 0.24
445 0.21
446 0.22
447 0.2
448 0.17
449 0.17
450 0.16
451 0.11
452 0.11
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.14
461 0.14
462 0.12
463 0.13
464 0.18
465 0.15
466 0.15
467 0.16
468 0.17
469 0.17
470 0.17
471 0.16
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.09
476 0.12
477 0.12
478 0.11
479 0.12
480 0.12
481 0.11
482 0.1
483 0.1
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.11
496 0.15
497 0.16
498 0.16
499 0.15
500 0.15
501 0.15
502 0.16
503 0.11
504 0.08
505 0.07
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.09
510 0.1
511 0.12
512 0.12
513 0.14
514 0.12
515 0.15
516 0.16
517 0.16
518 0.14
519 0.14
520 0.15
521 0.14
522 0.16
523 0.16
524 0.18
525 0.19
526 0.18
527 0.17
528 0.17
529 0.16
530 0.14
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.12
535 0.13
536 0.15
537 0.16
538 0.15
539 0.15
540 0.15
541 0.17
542 0.17
543 0.17
544 0.14
545 0.14
546 0.16
547 0.18
548 0.17
549 0.15
550 0.19
551 0.2
552 0.26
553 0.26
554 0.24
555 0.22
556 0.23
557 0.22
558 0.18
559 0.16
560 0.1
561 0.09
562 0.08
563 0.07
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.05
575 0.05
576 0.07
577 0.08
578 0.09
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.12
583 0.11
584 0.11
585 0.14
586 0.14
587 0.17
588 0.21
589 0.22
590 0.22
591 0.26
592 0.31
593 0.36
594 0.44
595 0.43
596 0.42
597 0.48
598 0.47
599 0.44
600 0.46
601 0.38
602 0.28
603 0.26
604 0.24
605 0.18
606 0.19
607 0.2
608 0.15
609 0.18
610 0.18
611 0.18
612 0.17
613 0.16
614 0.16
615 0.15
616 0.15
617 0.13
618 0.15
619 0.14
620 0.17
621 0.17
622 0.15
623 0.15
624 0.15
625 0.15
626 0.15
627 0.15
628 0.13
629 0.13
630 0.14
631 0.14
632 0.15
633 0.14
634 0.15
635 0.15
636 0.15
637 0.16
638 0.14
639 0.13
640 0.15
641 0.14
642 0.17
643 0.24
644 0.27
645 0.29
646 0.29
647 0.28
648 0.27
649 0.28
650 0.26
651 0.19
652 0.17
653 0.16
654 0.18
655 0.18
656 0.17
657 0.14
658 0.12
659 0.12
660 0.11
661 0.11
662 0.1
663 0.12
664 0.12
665 0.12
666 0.12
667 0.11
668 0.11
669 0.1
670 0.09
671 0.08
672 0.09
673 0.1