Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3QWL0

Protein Details
Accession A0A5C3QWL0    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-219SESGSRSRSRSRSRSRGRSGSVHydrophilic
247-270SASPSRSRSRSRSRSLSKGPRISRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-216RRSRSESGSRSRSRSRSRSRGRS
254-269RSRSRSRSLSKGPRIS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANSTVKTANWVHGSNPQHLVETVIRNRIYESDYWKEHCFALTAESIIDKALELRHLGGVYGNQRPTEFLCLLLKLLQIQPEKEILLEYLQAEEFKYLRALTALYIRMTFRATEVYEILEELLKDYRKLRLRNMSGYELTYMDELVDKLLTEERVCDLILPRLAKRDVLEENGEIGPRKSRLLNALEGKEEVSRRSRSESGSRSRSRSRSRSRGRSGSVATDESRGRGRKMDDGEMSDDQDKDRYISASPSRSRSRSRSRSLSKGPRISRARSQSPYQSRSRSVSPDRMEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.41
4 0.36
5 0.33
6 0.32
7 0.34
8 0.31
9 0.36
10 0.35
11 0.37
12 0.36
13 0.35
14 0.36
15 0.34
16 0.32
17 0.28
18 0.31
19 0.31
20 0.34
21 0.38
22 0.39
23 0.38
24 0.36
25 0.33
26 0.27
27 0.2
28 0.19
29 0.17
30 0.15
31 0.13
32 0.13
33 0.12
34 0.11
35 0.1
36 0.06
37 0.07
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.14
47 0.17
48 0.22
49 0.22
50 0.21
51 0.21
52 0.22
53 0.23
54 0.25
55 0.21
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.19
61 0.18
62 0.14
63 0.15
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.18
71 0.17
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.12
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.09
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.18
114 0.24
115 0.27
116 0.32
117 0.39
118 0.42
119 0.47
120 0.5
121 0.47
122 0.41
123 0.39
124 0.33
125 0.24
126 0.2
127 0.14
128 0.1
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.17
155 0.19
156 0.2
157 0.16
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.18
169 0.21
170 0.27
171 0.29
172 0.3
173 0.29
174 0.29
175 0.28
176 0.25
177 0.23
178 0.18
179 0.19
180 0.2
181 0.21
182 0.26
183 0.28
184 0.3
185 0.38
186 0.43
187 0.46
188 0.53
189 0.56
190 0.56
191 0.61
192 0.66
193 0.67
194 0.69
195 0.71
196 0.72
197 0.78
198 0.83
199 0.84
200 0.83
201 0.78
202 0.74
203 0.66
204 0.61
205 0.53
206 0.45
207 0.38
208 0.33
209 0.3
210 0.25
211 0.29
212 0.26
213 0.24
214 0.26
215 0.28
216 0.31
217 0.35
218 0.39
219 0.36
220 0.37
221 0.41
222 0.37
223 0.38
224 0.33
225 0.29
226 0.23
227 0.22
228 0.19
229 0.15
230 0.16
231 0.14
232 0.13
233 0.2
234 0.26
235 0.33
236 0.36
237 0.43
238 0.48
239 0.52
240 0.59
241 0.61
242 0.66
243 0.67
244 0.72
245 0.76
246 0.76
247 0.81
248 0.84
249 0.86
250 0.85
251 0.84
252 0.8
253 0.79
254 0.77
255 0.74
256 0.73
257 0.71
258 0.7
259 0.66
260 0.68
261 0.69
262 0.72
263 0.72
264 0.71
265 0.68
266 0.65
267 0.64
268 0.63
269 0.62
270 0.6
271 0.64