Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4C2E3H9

Protein Details
Accession A0A4C2E3H9    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPKRFNKKNSQKYVVVHRPHHydrophilic
304-330GELPSIKQTKGKKRKDRQKMGTKSDLTHydrophilic
421-444DEVSKGKLSQRRNRERTAKSTKGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-322KGKKRKDRQK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKRFNKKNSQKYVVVHRPHDDPQYYDNDAPEHVLVSASNPNSTKATERLPSLVEDPARTTGKKENEHVGEAVLYGIDFDDSKYDYTKHLKPIGTDPENSLFIPAKKQVDRTKSKKSIDDLFVEPQYQNANSNKNEPVFTRGVARQEYLERQQNVADELTGFRPDMNPALREALEALEDEAYVVNKDRELKKAQEDANEDDDDVFQQLLEGGQAADEDEFEENLDEWDIDNLDAYEDEHYQKEMEELDNVENLEDLKNIDYQADVQRFKKEQKRDILDDQVSSAGPQSVEPEEELDQEENDGLGELPSIKQTKGKKRKDRQKMGTKSDLTGFSMSSSAIARTETMTILDDKYDNVISGYENYQDEQEELEEKHSKPFDMSQERSDFESMLDDFLDNYELGKGGRELHKKDEEVQNMKRAADEVSKGKLSQRRNRERTAKSTKGITSSLSGLHI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.71
4 0.65
5 0.62
6 0.6
7 0.62
8 0.54
9 0.47
10 0.44
11 0.46
12 0.47
13 0.43
14 0.4
15 0.33
16 0.3
17 0.29
18 0.24
19 0.18
20 0.13
21 0.12
22 0.1
23 0.12
24 0.18
25 0.17
26 0.2
27 0.2
28 0.22
29 0.24
30 0.26
31 0.27
32 0.24
33 0.29
34 0.29
35 0.31
36 0.31
37 0.31
38 0.32
39 0.29
40 0.31
41 0.27
42 0.24
43 0.25
44 0.28
45 0.3
46 0.27
47 0.29
48 0.32
49 0.39
50 0.43
51 0.45
52 0.48
53 0.48
54 0.51
55 0.48
56 0.4
57 0.32
58 0.26
59 0.22
60 0.12
61 0.08
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.05
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.12
72 0.17
73 0.24
74 0.29
75 0.34
76 0.4
77 0.41
78 0.42
79 0.49
80 0.54
81 0.51
82 0.47
83 0.43
84 0.4
85 0.4
86 0.37
87 0.31
88 0.24
89 0.21
90 0.25
91 0.26
92 0.28
93 0.29
94 0.37
95 0.42
96 0.49
97 0.58
98 0.61
99 0.67
100 0.7
101 0.72
102 0.71
103 0.68
104 0.66
105 0.6
106 0.57
107 0.5
108 0.45
109 0.41
110 0.37
111 0.31
112 0.24
113 0.22
114 0.18
115 0.2
116 0.19
117 0.25
118 0.25
119 0.29
120 0.32
121 0.31
122 0.32
123 0.28
124 0.3
125 0.26
126 0.25
127 0.25
128 0.24
129 0.27
130 0.27
131 0.26
132 0.22
133 0.24
134 0.28
135 0.29
136 0.34
137 0.31
138 0.3
139 0.31
140 0.29
141 0.27
142 0.23
143 0.18
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.14
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.12
174 0.14
175 0.19
176 0.22
177 0.25
178 0.3
179 0.36
180 0.37
181 0.38
182 0.39
183 0.38
184 0.38
185 0.35
186 0.29
187 0.23
188 0.21
189 0.15
190 0.12
191 0.08
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.09
249 0.14
250 0.19
251 0.21
252 0.21
253 0.26
254 0.29
255 0.36
256 0.41
257 0.43
258 0.45
259 0.53
260 0.58
261 0.58
262 0.61
263 0.61
264 0.55
265 0.47
266 0.4
267 0.32
268 0.25
269 0.19
270 0.15
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.08
295 0.1
296 0.1
297 0.16
298 0.24
299 0.35
300 0.46
301 0.56
302 0.64
303 0.74
304 0.84
305 0.9
306 0.93
307 0.92
308 0.92
309 0.91
310 0.88
311 0.87
312 0.78
313 0.68
314 0.61
315 0.52
316 0.43
317 0.34
318 0.26
319 0.18
320 0.16
321 0.14
322 0.11
323 0.1
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.13
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.16
357 0.21
358 0.21
359 0.27
360 0.28
361 0.27
362 0.27
363 0.31
364 0.37
365 0.41
366 0.44
367 0.44
368 0.47
369 0.48
370 0.48
371 0.44
372 0.34
373 0.25
374 0.25
375 0.18
376 0.15
377 0.14
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.12
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.1
388 0.1
389 0.15
390 0.24
391 0.31
392 0.34
393 0.42
394 0.49
395 0.49
396 0.55
397 0.58
398 0.59
399 0.59
400 0.61
401 0.61
402 0.56
403 0.55
404 0.49
405 0.4
406 0.35
407 0.32
408 0.32
409 0.29
410 0.32
411 0.34
412 0.33
413 0.4
414 0.42
415 0.47
416 0.51
417 0.58
418 0.64
419 0.7
420 0.79
421 0.82
422 0.84
423 0.84
424 0.85
425 0.82
426 0.75
427 0.75
428 0.69
429 0.64
430 0.57
431 0.49
432 0.42
433 0.36