Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1PJB7

Protein Details
Accession A0A4Z1PJB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-121VRPASPPKKPAKPAKTGYERYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-115RPASPPKKPAKPAK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 8, plas 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDPDPSQSHRPNAPGFGQLQDPFAGLKRQAIPDDDVLDFEETFDGLDDSGDAFNDDTFGAGGPNVGKDFDFSGQTDNVARAIEEERMRFAATRPAVRPASPPKKPAKPAKTGYERYIPKLEADASLWGNAPARVSEPVYNQMQQNQPGPSVQPRQMMSLEEVEAMMSGQLPPSQQEKQPDQQYGGLPAYSFPQAQIAQQYQASLQQQHPSGQPLNYSHPPHILQRPHPPGQQQQQQSSPNPTAQNAQQPQILQRPRQENQQPLPAQQQQPVQAQQPPTQPGQQPRHILQNPNRLSGPGQPLAHLPQQMLQQQHHNQGQRISPMPGHGRGPSYNGPVITNAAQILNLSEEDKAAFMQEEARRAKRNHKIHMMSKDNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVTATGNIDAASPEAALDEDFYYQVYAQIRGASRQNPHQPASQFAHTYLFQTGGRYGMRRNMRHGDNHMQRMEQQVQRAIEAAKAKPKNKQLVVEGSLGKISFSNAKTPKPLLNFKRRDGDLSANSAARRAGQGHLNDAAADRRTILRNIENVYSDLMQMEDHERQVPPPPNENDAGSIQRHMEWRETLQNLNKKLWEDLKVMEPIVENSPVAHPFIAILCHPKGKKCIPRVMRHIDDNQRLTMITIITIHLDQLDVISRALPTPGATPDAPLVPPPLAVREEVELFAQTVMPSIFGYIGDAPLNIITGLLGLLIQRTTVPLIALTKIGLLLLTVLMSRAEVLRETSANQKEEWTAWSDLYTDLFALIEPSLPHVFPGSVVDADDVHVWQFLASMGVGASPDQQQRLVLGVKERVMETVGVSRTLPKEMGEVRLGNVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.46
4 0.49
5 0.46
6 0.44
7 0.41
8 0.37
9 0.38
10 0.33
11 0.31
12 0.26
13 0.24
14 0.2
15 0.2
16 0.22
17 0.18
18 0.23
19 0.27
20 0.3
21 0.32
22 0.35
23 0.37
24 0.36
25 0.39
26 0.32
27 0.28
28 0.25
29 0.24
30 0.2
31 0.17
32 0.13
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.14
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.2
68 0.18
69 0.17
70 0.15
71 0.14
72 0.12
73 0.14
74 0.18
75 0.2
76 0.21
77 0.22
78 0.23
79 0.24
80 0.23
81 0.23
82 0.26
83 0.27
84 0.33
85 0.33
86 0.39
87 0.4
88 0.4
89 0.46
90 0.48
91 0.54
92 0.52
93 0.58
94 0.6
95 0.68
96 0.75
97 0.79
98 0.77
99 0.76
100 0.78
101 0.8
102 0.81
103 0.77
104 0.73
105 0.72
106 0.66
107 0.62
108 0.61
109 0.51
110 0.42
111 0.4
112 0.36
113 0.28
114 0.26
115 0.24
116 0.19
117 0.19
118 0.19
119 0.16
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.16
127 0.19
128 0.2
129 0.25
130 0.28
131 0.3
132 0.29
133 0.33
134 0.36
135 0.36
136 0.37
137 0.34
138 0.31
139 0.3
140 0.31
141 0.32
142 0.34
143 0.35
144 0.36
145 0.35
146 0.37
147 0.37
148 0.36
149 0.31
150 0.28
151 0.24
152 0.18
153 0.17
154 0.14
155 0.12
156 0.1
157 0.07
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.09
164 0.14
165 0.17
166 0.21
167 0.28
168 0.34
169 0.41
170 0.47
171 0.48
172 0.46
173 0.46
174 0.44
175 0.41
176 0.36
177 0.27
178 0.21
179 0.18
180 0.18
181 0.16
182 0.14
183 0.1
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.2
188 0.19
189 0.2
190 0.2
191 0.21
192 0.16
193 0.21
194 0.22
195 0.2
196 0.21
197 0.23
198 0.25
199 0.27
200 0.28
201 0.28
202 0.28
203 0.26
204 0.27
205 0.26
206 0.31
207 0.35
208 0.36
209 0.33
210 0.34
211 0.35
212 0.37
213 0.41
214 0.41
215 0.4
216 0.47
217 0.54
218 0.54
219 0.55
220 0.55
221 0.55
222 0.58
223 0.61
224 0.56
225 0.53
226 0.55
227 0.58
228 0.56
229 0.54
230 0.47
231 0.43
232 0.39
233 0.35
234 0.32
235 0.3
236 0.36
237 0.33
238 0.32
239 0.3
240 0.29
241 0.32
242 0.37
243 0.38
244 0.32
245 0.37
246 0.43
247 0.43
248 0.52
249 0.54
250 0.54
251 0.53
252 0.59
253 0.53
254 0.47
255 0.53
256 0.5
257 0.46
258 0.41
259 0.41
260 0.36
261 0.39
262 0.39
263 0.35
264 0.32
265 0.33
266 0.33
267 0.35
268 0.33
269 0.31
270 0.34
271 0.35
272 0.41
273 0.45
274 0.46
275 0.46
276 0.45
277 0.53
278 0.51
279 0.55
280 0.53
281 0.57
282 0.53
283 0.51
284 0.49
285 0.4
286 0.38
287 0.36
288 0.34
289 0.28
290 0.26
291 0.24
292 0.25
293 0.28
294 0.29
295 0.24
296 0.18
297 0.17
298 0.2
299 0.23
300 0.24
301 0.22
302 0.27
303 0.3
304 0.37
305 0.39
306 0.38
307 0.36
308 0.37
309 0.38
310 0.34
311 0.32
312 0.26
313 0.22
314 0.23
315 0.24
316 0.23
317 0.22
318 0.2
319 0.21
320 0.2
321 0.24
322 0.23
323 0.23
324 0.23
325 0.21
326 0.2
327 0.19
328 0.2
329 0.16
330 0.13
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.11
348 0.12
349 0.18
350 0.22
351 0.25
352 0.3
353 0.32
354 0.41
355 0.44
356 0.51
357 0.52
358 0.58
359 0.61
360 0.62
361 0.7
362 0.67
363 0.58
364 0.52
365 0.47
366 0.38
367 0.31
368 0.25
369 0.17
370 0.12
371 0.16
372 0.15
373 0.16
374 0.15
375 0.17
376 0.18
377 0.18
378 0.19
379 0.2
380 0.22
381 0.22
382 0.25
383 0.24
384 0.24
385 0.23
386 0.22
387 0.16
388 0.14
389 0.11
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.06
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.11
414 0.11
415 0.13
416 0.16
417 0.17
418 0.18
419 0.24
420 0.31
421 0.32
422 0.34
423 0.37
424 0.35
425 0.36
426 0.38
427 0.33
428 0.26
429 0.23
430 0.24
431 0.19
432 0.2
433 0.15
434 0.13
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.16
443 0.24
444 0.24
445 0.29
446 0.34
447 0.36
448 0.38
449 0.43
450 0.47
451 0.46
452 0.5
453 0.45
454 0.39
455 0.37
456 0.39
457 0.39
458 0.31
459 0.26
460 0.25
461 0.24
462 0.24
463 0.24
464 0.2
465 0.16
466 0.18
467 0.17
468 0.22
469 0.27
470 0.29
471 0.34
472 0.4
473 0.45
474 0.45
475 0.48
476 0.43
477 0.44
478 0.46
479 0.43
480 0.37
481 0.29
482 0.26
483 0.22
484 0.18
485 0.12
486 0.1
487 0.11
488 0.12
489 0.2
490 0.22
491 0.24
492 0.26
493 0.29
494 0.32
495 0.32
496 0.41
497 0.41
498 0.49
499 0.53
500 0.54
501 0.6
502 0.56
503 0.53
504 0.48
505 0.46
506 0.37
507 0.36
508 0.35
509 0.29
510 0.28
511 0.25
512 0.22
513 0.16
514 0.15
515 0.11
516 0.12
517 0.15
518 0.16
519 0.18
520 0.19
521 0.18
522 0.17
523 0.16
524 0.16
525 0.12
526 0.11
527 0.1
528 0.11
529 0.13
530 0.14
531 0.17
532 0.18
533 0.21
534 0.23
535 0.24
536 0.23
537 0.21
538 0.22
539 0.19
540 0.15
541 0.12
542 0.1
543 0.08
544 0.08
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.12
549 0.12
550 0.13
551 0.21
552 0.28
553 0.28
554 0.34
555 0.36
556 0.37
557 0.38
558 0.38
559 0.33
560 0.28
561 0.28
562 0.21
563 0.19
564 0.17
565 0.18
566 0.2
567 0.18
568 0.19
569 0.18
570 0.2
571 0.26
572 0.27
573 0.29
574 0.34
575 0.39
576 0.39
577 0.4
578 0.39
579 0.33
580 0.35
581 0.35
582 0.32
583 0.28
584 0.27
585 0.29
586 0.28
587 0.26
588 0.24
589 0.2
590 0.17
591 0.17
592 0.16
593 0.11
594 0.11
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.11
599 0.09
600 0.09
601 0.1
602 0.1
603 0.08
604 0.12
605 0.13
606 0.19
607 0.21
608 0.23
609 0.3
610 0.37
611 0.45
612 0.49
613 0.57
614 0.6
615 0.68
616 0.73
617 0.76
618 0.72
619 0.68
620 0.69
621 0.68
622 0.66
623 0.6
624 0.51
625 0.43
626 0.38
627 0.33
628 0.27
629 0.18
630 0.11
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.07
637 0.07
638 0.06
639 0.06
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.09
646 0.09
647 0.09
648 0.07
649 0.09
650 0.11
651 0.14
652 0.13
653 0.14
654 0.15
655 0.17
656 0.16
657 0.15
658 0.15
659 0.12
660 0.13
661 0.13
662 0.14
663 0.14
664 0.14
665 0.15
666 0.15
667 0.16
668 0.15
669 0.15
670 0.13
671 0.12
672 0.12
673 0.11
674 0.08
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.09
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.08
689 0.09
690 0.07
691 0.06
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.03
698 0.04
699 0.04
700 0.05
701 0.05
702 0.06
703 0.07
704 0.08
705 0.08
706 0.09
707 0.11
708 0.12
709 0.12
710 0.11
711 0.1
712 0.1
713 0.09
714 0.07
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.04
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.06
724 0.06
725 0.07
726 0.08
727 0.1
728 0.12
729 0.13
730 0.16
731 0.24
732 0.29
733 0.3
734 0.29
735 0.29
736 0.28
737 0.29
738 0.29
739 0.25
740 0.21
741 0.2
742 0.2
743 0.19
744 0.17
745 0.17
746 0.15
747 0.1
748 0.09
749 0.08
750 0.08
751 0.08
752 0.07
753 0.08
754 0.08
755 0.12
756 0.14
757 0.14
758 0.14
759 0.14
760 0.14
761 0.13
762 0.16
763 0.15
764 0.13
765 0.14
766 0.14
767 0.13
768 0.14
769 0.14
770 0.11
771 0.09
772 0.09
773 0.09
774 0.08
775 0.08
776 0.07
777 0.07
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.07
784 0.09
785 0.13
786 0.16
787 0.17
788 0.18
789 0.18
790 0.19
791 0.22
792 0.23
793 0.21
794 0.24
795 0.27
796 0.29
797 0.3
798 0.3
799 0.26
800 0.25
801 0.22
802 0.19
803 0.21
804 0.2
805 0.19
806 0.2
807 0.24
808 0.24
809 0.27
810 0.26
811 0.19
812 0.25
813 0.26
814 0.31
815 0.31
816 0.3
817 0.28
818 0.34
819 0.33
820 0.27
821 0.28
822 0.24
823 0.2
824 0.19
825 0.17
826 0.11
827 0.11
828 0.12
829 0.08
830 0.08