Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1NIW2

Protein Details
Accession A0A4Z1NIW2    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-82SKSAQLLKTTPRKRGRPKKVISSPQPAPHydrophilic
256-278AAPPPAKKRGRPPKNRVEQPVESHydrophilic
304-324EEIMMPKRNRGRPPKNATAETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-94TPRKRGRPKKVISSPQPAPAKATRGRGRPKK
166-180KPPKGMPKGGGKNSK
231-240PKKAARGRKR
259-270PPAKKRGRPPKN
311-318RNRGRPPK
332-342SSKGRGRARKK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 10.166, cyto 8, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MSALLNIFAPTSTSSPSDSQTLHNTATQPIPATPFEAEDTARVSSSSLGSSRSTSKSAQLLKTTPRKRGRPKKVISSPQPAPAKATRGRGRPKKILSSPQSAEAMTRSRATTTPAEIDEPHADEVAETPIEGEEDESDDDGNDGEVSKNILRLAVEEVKAATPTAKPPKGMPKGGGKNSKKTNATSTPNTRPTRDAAMKSAEKTSANYALSSDPMTDHAGVELAFEDAAAPKKAARGRKRASVGDEGDEVDGEEGAAPPPAKKRGRPPKNRVEQPVESTARHARLQNGFYEPVAVDADESPLAEEIMMPKRNRGRPPKNATAETSEAAAAGSSKGRGRARKKATTTNGNTPVDPATLRIRGFTFGMQGGVLEAQFDFVVGDDEDGYEIERTENGGFKMSFSGNLRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.22
4 0.25
5 0.24
6 0.27
7 0.31
8 0.34
9 0.32
10 0.33
11 0.33
12 0.32
13 0.33
14 0.3
15 0.25
16 0.23
17 0.25
18 0.22
19 0.23
20 0.21
21 0.2
22 0.2
23 0.2
24 0.19
25 0.16
26 0.18
27 0.16
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.15
34 0.13
35 0.15
36 0.16
37 0.19
38 0.24
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.3
43 0.35
44 0.41
45 0.43
46 0.43
47 0.45
48 0.51
49 0.6
50 0.61
51 0.63
52 0.66
53 0.71
54 0.77
55 0.83
56 0.85
57 0.85
58 0.88
59 0.89
60 0.9
61 0.9
62 0.88
63 0.85
64 0.78
65 0.76
66 0.72
67 0.61
68 0.56
69 0.49
70 0.48
71 0.44
72 0.5
73 0.48
74 0.53
75 0.63
76 0.67
77 0.72
78 0.74
79 0.75
80 0.75
81 0.76
82 0.77
83 0.73
84 0.72
85 0.65
86 0.6
87 0.55
88 0.45
89 0.39
90 0.31
91 0.28
92 0.21
93 0.21
94 0.17
95 0.17
96 0.18
97 0.22
98 0.22
99 0.21
100 0.23
101 0.22
102 0.23
103 0.22
104 0.25
105 0.22
106 0.21
107 0.18
108 0.15
109 0.14
110 0.12
111 0.13
112 0.11
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.04
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.11
149 0.07
150 0.14
151 0.22
152 0.23
153 0.24
154 0.27
155 0.38
156 0.43
157 0.44
158 0.41
159 0.42
160 0.48
161 0.55
162 0.62
163 0.54
164 0.56
165 0.6
166 0.63
167 0.55
168 0.49
169 0.49
170 0.47
171 0.49
172 0.48
173 0.5
174 0.51
175 0.58
176 0.58
177 0.52
178 0.46
179 0.43
180 0.44
181 0.41
182 0.35
183 0.28
184 0.32
185 0.32
186 0.32
187 0.31
188 0.25
189 0.2
190 0.2
191 0.19
192 0.18
193 0.17
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.13
199 0.11
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.12
220 0.16
221 0.25
222 0.31
223 0.4
224 0.43
225 0.51
226 0.56
227 0.55
228 0.55
229 0.54
230 0.48
231 0.39
232 0.36
233 0.28
234 0.24
235 0.2
236 0.16
237 0.09
238 0.07
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.11
247 0.2
248 0.23
249 0.27
250 0.37
251 0.48
252 0.59
253 0.68
254 0.74
255 0.76
256 0.84
257 0.87
258 0.84
259 0.81
260 0.73
261 0.67
262 0.67
263 0.59
264 0.48
265 0.44
266 0.42
267 0.37
268 0.35
269 0.32
270 0.29
271 0.32
272 0.34
273 0.33
274 0.32
275 0.3
276 0.27
277 0.27
278 0.21
279 0.16
280 0.15
281 0.12
282 0.09
283 0.08
284 0.1
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.09
293 0.16
294 0.22
295 0.21
296 0.27
297 0.36
298 0.43
299 0.53
300 0.6
301 0.63
302 0.68
303 0.77
304 0.82
305 0.8
306 0.77
307 0.71
308 0.66
309 0.59
310 0.49
311 0.41
312 0.3
313 0.23
314 0.19
315 0.15
316 0.09
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.17
322 0.23
323 0.32
324 0.4
325 0.49
326 0.57
327 0.65
328 0.7
329 0.74
330 0.77
331 0.79
332 0.78
333 0.78
334 0.78
335 0.7
336 0.63
337 0.55
338 0.48
339 0.38
340 0.31
341 0.24
342 0.21
343 0.24
344 0.24
345 0.24
346 0.23
347 0.24
348 0.25
349 0.24
350 0.21
351 0.17
352 0.17
353 0.15
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.1
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.08
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.11
378 0.12
379 0.16
380 0.16
381 0.21
382 0.21
383 0.21
384 0.26
385 0.24
386 0.28