Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1PDZ2

Protein Details
Accession A0A4Z1PDZ2    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-50AISNATPSNNKRKQNNGCNNTRQNKRPKIWDARKITAQTHydrophilic
95-126VPKELRRRTASHNVRKVPKRLQRRAKREMVEDBasic
131-176ISARRRKPSGHQRLRLETAKRLQNLSSRSKKRSQEKKDARENIENEHydrophilic
200-238VVAVRKAKVKKSKLKEPPLPPAKFRKRQIHKTWLPTHMFHydrophilic
367-389NGTANTKKKTPRRKAFIRVHPAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-122ELRRRTASHNVRKVPKRLQRRAKRE
133-167ARRRKPSGHQRLRLETAKRLQNLSSRSKKRSQEKK
204-228RKAKVKKSKLKEPPLPPAKFRKRQI
374-380KKTPRRK
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 11, cyto 6.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSNATSNATSNAISNATPSNNKRKQNNGCNNTRQNKRPKIWDARKITAQTSDKALSNGELNVDAFVKAREFEIKALEDSIKKSKHGLTTRAFQEVPKELRRRTASHNVRKVPKRLQRRAKREMVEDNTPTISARRRKPSGHQRLRLETAKRLQNLSSRSKKRSQEKKDARENIENEVTVEPEVPQKNAASTEPKIVAPAVVAVRKAKVKKSKLKEPPLPPAKFRKRQIHKTWLPTHMFHAKRATMTPPKEPLWRFALPLTPTIKNYRSTHRVSTQRGAVAWDMSYMATISLEGPEKSIEGLLKALGVGAGGDPEGIWSRPGSKWRRGTRTWEGWLYQRQTYPAHGIAPATVMWCAEETADIVSQASNGTANTKKKTPRRKAFIRVHPAGFLQLWEQVVRIGKIQKPSVTVEDLRFEIGSIEITGPNASEAIVAVVRPVGQEVDGCNGNTTLKDTWSTISAHPPSALPKGAVIAFEASDPRLKYPPRTLTPDQSDPIKGIQMLANWPLDTPASPARLFDRNTRLKASRSLPSQKSINRRKASALPGDFPEPRSSDPSIPVLVYCSRSPASGSGIWTILLPWKCVDPVWRSIMYYPLSTGGNVKFGGVKEKRQIAFESGTPWYPADYPGLKSGDEWEAQEQAQRKAEWLRRPKGRRTEFQRLSLGNDKKGEIGMGWACDWQRLLRGFDKPLATSGDVELPDAPAVDTEAVQGADLSVAAKEKPILQMAHLPLPIAIKLFTGKGTTTTIDPPTDSLITVKLTMVTRGVPQTCARIYRLPTSDALLRSQWLSQLSTAANRKKKDGLPRFSHRAPEGATAAMQRAYLAASILAGPTQPGDAGYPVVPDEDDLIGFVTTGNYNLGEGRGIGIGSLLVSKVLSDQEGGEGKERCLCIVRDAGQSVGRLARWELV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.2
4 0.28
5 0.34
6 0.43
7 0.49
8 0.58
9 0.63
10 0.7
11 0.77
12 0.8
13 0.85
14 0.83
15 0.85
16 0.87
17 0.9
18 0.89
19 0.87
20 0.85
21 0.85
22 0.86
23 0.84
24 0.83
25 0.83
26 0.85
27 0.86
28 0.87
29 0.85
30 0.82
31 0.83
32 0.76
33 0.69
34 0.67
35 0.6
36 0.53
37 0.5
38 0.45
39 0.39
40 0.36
41 0.34
42 0.26
43 0.24
44 0.23
45 0.18
46 0.16
47 0.14
48 0.15
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.12
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.26
63 0.28
64 0.26
65 0.29
66 0.35
67 0.33
68 0.32
69 0.35
70 0.38
71 0.44
72 0.49
73 0.53
74 0.5
75 0.56
76 0.59
77 0.6
78 0.54
79 0.46
80 0.45
81 0.45
82 0.46
83 0.46
84 0.5
85 0.46
86 0.55
87 0.6
88 0.58
89 0.58
90 0.62
91 0.64
92 0.68
93 0.76
94 0.76
95 0.8
96 0.84
97 0.83
98 0.82
99 0.81
100 0.81
101 0.82
102 0.85
103 0.86
104 0.88
105 0.89
106 0.88
107 0.84
108 0.8
109 0.79
110 0.74
111 0.71
112 0.63
113 0.56
114 0.47
115 0.42
116 0.35
117 0.29
118 0.31
119 0.31
120 0.38
121 0.45
122 0.5
123 0.54
124 0.65
125 0.72
126 0.76
127 0.78
128 0.78
129 0.77
130 0.79
131 0.81
132 0.78
133 0.7
134 0.67
135 0.64
136 0.63
137 0.57
138 0.52
139 0.48
140 0.47
141 0.5
142 0.52
143 0.55
144 0.55
145 0.6
146 0.66
147 0.71
148 0.76
149 0.8
150 0.79
151 0.8
152 0.83
153 0.87
154 0.89
155 0.89
156 0.85
157 0.83
158 0.75
159 0.7
160 0.63
161 0.52
162 0.44
163 0.35
164 0.28
165 0.2
166 0.18
167 0.12
168 0.16
169 0.17
170 0.16
171 0.17
172 0.17
173 0.18
174 0.2
175 0.22
176 0.21
177 0.21
178 0.26
179 0.26
180 0.25
181 0.25
182 0.23
183 0.2
184 0.14
185 0.16
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.19
191 0.25
192 0.28
193 0.33
194 0.39
195 0.48
196 0.57
197 0.65
198 0.72
199 0.77
200 0.84
201 0.85
202 0.82
203 0.83
204 0.83
205 0.78
206 0.73
207 0.73
208 0.73
209 0.73
210 0.74
211 0.74
212 0.74
213 0.82
214 0.86
215 0.86
216 0.83
217 0.84
218 0.83
219 0.8
220 0.74
221 0.64
222 0.6
223 0.58
224 0.52
225 0.45
226 0.44
227 0.37
228 0.35
229 0.36
230 0.38
231 0.37
232 0.39
233 0.42
234 0.41
235 0.42
236 0.48
237 0.47
238 0.44
239 0.42
240 0.39
241 0.35
242 0.31
243 0.34
244 0.28
245 0.32
246 0.32
247 0.27
248 0.29
249 0.33
250 0.34
251 0.35
252 0.37
253 0.4
254 0.43
255 0.45
256 0.49
257 0.52
258 0.57
259 0.56
260 0.58
261 0.53
262 0.48
263 0.44
264 0.4
265 0.32
266 0.25
267 0.19
268 0.14
269 0.11
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.04
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.09
306 0.12
307 0.21
308 0.26
309 0.34
310 0.43
311 0.52
312 0.59
313 0.6
314 0.66
315 0.66
316 0.68
317 0.64
318 0.57
319 0.5
320 0.47
321 0.5
322 0.45
323 0.38
324 0.32
325 0.29
326 0.28
327 0.28
328 0.27
329 0.22
330 0.19
331 0.17
332 0.16
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.05
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.08
356 0.13
357 0.17
358 0.19
359 0.25
360 0.32
361 0.41
362 0.52
363 0.59
364 0.64
365 0.7
366 0.76
367 0.82
368 0.84
369 0.86
370 0.84
371 0.77
372 0.68
373 0.59
374 0.5
375 0.41
376 0.31
377 0.21
378 0.13
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.14
388 0.16
389 0.2
390 0.22
391 0.22
392 0.23
393 0.25
394 0.25
395 0.24
396 0.24
397 0.21
398 0.2
399 0.19
400 0.17
401 0.15
402 0.13
403 0.09
404 0.08
405 0.06
406 0.05
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.05
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.1
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.11
443 0.13
444 0.11
445 0.17
446 0.18
447 0.17
448 0.17
449 0.17
450 0.17
451 0.17
452 0.17
453 0.11
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.1
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.14
468 0.14
469 0.18
470 0.25
471 0.33
472 0.34
473 0.42
474 0.43
475 0.46
476 0.51
477 0.51
478 0.45
479 0.39
480 0.35
481 0.28
482 0.26
483 0.19
484 0.13
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.1
497 0.11
498 0.13
499 0.13
500 0.14
501 0.16
502 0.21
503 0.23
504 0.26
505 0.33
506 0.36
507 0.38
508 0.43
509 0.42
510 0.39
511 0.44
512 0.42
513 0.38
514 0.39
515 0.45
516 0.42
517 0.44
518 0.47
519 0.46
520 0.53
521 0.57
522 0.6
523 0.54
524 0.54
525 0.53
526 0.54
527 0.54
528 0.52
529 0.44
530 0.37
531 0.36
532 0.38
533 0.35
534 0.3
535 0.27
536 0.21
537 0.2
538 0.22
539 0.22
540 0.2
541 0.22
542 0.22
543 0.2
544 0.19
545 0.17
546 0.15
547 0.15
548 0.16
549 0.14
550 0.15
551 0.14
552 0.14
553 0.15
554 0.14
555 0.16
556 0.16
557 0.17
558 0.15
559 0.15
560 0.15
561 0.14
562 0.13
563 0.15
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.12
568 0.12
569 0.13
570 0.18
571 0.16
572 0.2
573 0.24
574 0.24
575 0.24
576 0.25
577 0.29
578 0.26
579 0.22
580 0.18
581 0.15
582 0.15
583 0.14
584 0.17
585 0.13
586 0.14
587 0.13
588 0.13
589 0.13
590 0.13
591 0.23
592 0.22
593 0.26
594 0.29
595 0.36
596 0.37
597 0.37
598 0.38
599 0.33
600 0.33
601 0.29
602 0.27
603 0.21
604 0.21
605 0.2
606 0.18
607 0.15
608 0.13
609 0.13
610 0.14
611 0.15
612 0.15
613 0.19
614 0.21
615 0.19
616 0.19
617 0.21
618 0.2
619 0.19
620 0.18
621 0.15
622 0.16
623 0.16
624 0.19
625 0.19
626 0.2
627 0.23
628 0.22
629 0.22
630 0.29
631 0.36
632 0.42
633 0.48
634 0.53
635 0.6
636 0.66
637 0.74
638 0.76
639 0.77
640 0.77
641 0.77
642 0.8
643 0.75
644 0.74
645 0.71
646 0.61
647 0.6
648 0.6
649 0.54
650 0.47
651 0.43
652 0.38
653 0.32
654 0.31
655 0.25
656 0.16
657 0.16
658 0.13
659 0.12
660 0.12
661 0.13
662 0.13
663 0.14
664 0.14
665 0.11
666 0.15
667 0.17
668 0.21
669 0.24
670 0.28
671 0.3
672 0.34
673 0.35
674 0.3
675 0.3
676 0.29
677 0.25
678 0.22
679 0.2
680 0.2
681 0.18
682 0.18
683 0.16
684 0.13
685 0.12
686 0.12
687 0.1
688 0.06
689 0.07
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.06
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.04
702 0.05
703 0.05
704 0.06
705 0.07
706 0.09
707 0.12
708 0.16
709 0.16
710 0.17
711 0.24
712 0.27
713 0.31
714 0.29
715 0.26
716 0.23
717 0.24
718 0.22
719 0.16
720 0.13
721 0.09
722 0.1
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.11
727 0.13
728 0.15
729 0.15
730 0.16
731 0.2
732 0.22
733 0.21
734 0.21
735 0.2
736 0.21
737 0.2
738 0.18
739 0.15
740 0.14
741 0.14
742 0.15
743 0.14
744 0.14
745 0.14
746 0.15
747 0.15
748 0.15
749 0.17
750 0.22
751 0.23
752 0.22
753 0.23
754 0.27
755 0.29
756 0.31
757 0.32
758 0.32
759 0.34
760 0.4
761 0.41
762 0.38
763 0.36
764 0.37
765 0.38
766 0.34
767 0.33
768 0.26
769 0.24
770 0.23
771 0.22
772 0.22
773 0.18
774 0.18
775 0.16
776 0.19
777 0.19
778 0.25
779 0.33
780 0.38
781 0.43
782 0.44
783 0.47
784 0.51
785 0.56
786 0.6
787 0.62
788 0.64
789 0.66
790 0.73
791 0.78
792 0.74
793 0.74
794 0.64
795 0.58
796 0.51
797 0.47
798 0.39
799 0.32
800 0.29
801 0.24
802 0.24
803 0.2
804 0.17
805 0.12
806 0.1
807 0.1
808 0.09
809 0.08
810 0.07
811 0.06
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.06
819 0.06
820 0.06
821 0.08
822 0.08
823 0.1
824 0.11
825 0.11
826 0.11
827 0.12
828 0.11
829 0.1
830 0.11
831 0.1
832 0.1
833 0.09
834 0.1
835 0.09
836 0.09
837 0.09
838 0.08
839 0.07
840 0.08
841 0.09
842 0.08
843 0.09
844 0.1
845 0.1
846 0.09
847 0.09
848 0.1
849 0.09
850 0.09
851 0.08
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.07
856 0.06
857 0.05
858 0.05
859 0.06
860 0.08
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.1
865 0.15
866 0.19
867 0.2
868 0.24
869 0.25
870 0.25
871 0.3
872 0.29
873 0.26
874 0.27
875 0.27
876 0.26
877 0.32
878 0.35
879 0.35
880 0.37
881 0.38
882 0.36
883 0.35
884 0.33
885 0.29
886 0.25
887 0.22