Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1PGD2

Protein Details
Accession A0A4Z1PGD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-104STTPSPNGRRRPKSYAPGYTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-95R
475-483RGRLQRLKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MPSSSSSYRLDNSKRKFYDLLDNISSPKINHARTDSTATLAPEQHSKRPRVTPTQTSRPLTAPSSKTRPISANNDRALVRAEPTSTTPSPNGRRRPKSYAPGYTPGKPRLRHKSSAGLALDGAADRELPNYAPWSHDQFLARLKTFADVRTWTPKPMGIGEVEWAKRGWSIAAKDTVGCKGGCGKRLLVRVVKEKKDATGPSEVDDESSWWMGDVELAMVERYKGLIIEAHDDDCLWRKAGCKDDIYRIQQADPSVWQKELKERYAALLTMETALPEVLEMPQQEREKEPFNIDAFAKIVPPTLLDRPHGKENSEPVEGAETTPPISNAINKIALNLALCGWTGQSPNGVNLAYCTKCFQRVGLWLYRIVSSTTPLSSDLEPMTFNPVDLHREHCPWKNIESQCAKGSLEGLSGWQVLVHLVTGYRKHEYMEREREREKEKELAQEREEDVASVHEEQSPRKSRDELRQEDAVKRGRLQRLKRAFTVTKKSKDKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.64
3 0.63
4 0.59
5 0.6
6 0.56
7 0.56
8 0.5
9 0.49
10 0.45
11 0.44
12 0.41
13 0.31
14 0.34
15 0.34
16 0.32
17 0.36
18 0.4
19 0.43
20 0.45
21 0.52
22 0.44
23 0.39
24 0.39
25 0.36
26 0.34
27 0.31
28 0.29
29 0.31
30 0.34
31 0.39
32 0.44
33 0.47
34 0.5
35 0.56
36 0.63
37 0.64
38 0.69
39 0.71
40 0.72
41 0.78
42 0.8
43 0.75
44 0.7
45 0.62
46 0.58
47 0.52
48 0.51
49 0.46
50 0.45
51 0.49
52 0.52
53 0.51
54 0.51
55 0.51
56 0.5
57 0.55
58 0.56
59 0.58
60 0.54
61 0.56
62 0.52
63 0.48
64 0.44
65 0.35
66 0.27
67 0.2
68 0.19
69 0.17
70 0.2
71 0.26
72 0.24
73 0.26
74 0.27
75 0.34
76 0.42
77 0.5
78 0.57
79 0.61
80 0.69
81 0.73
82 0.79
83 0.8
84 0.8
85 0.8
86 0.79
87 0.74
88 0.74
89 0.71
90 0.69
91 0.67
92 0.66
93 0.64
94 0.6
95 0.63
96 0.65
97 0.68
98 0.66
99 0.64
100 0.65
101 0.6
102 0.63
103 0.55
104 0.44
105 0.37
106 0.31
107 0.27
108 0.17
109 0.14
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.08
117 0.1
118 0.11
119 0.13
120 0.15
121 0.21
122 0.22
123 0.25
124 0.25
125 0.24
126 0.31
127 0.33
128 0.31
129 0.25
130 0.24
131 0.24
132 0.25
133 0.24
134 0.21
135 0.18
136 0.22
137 0.3
138 0.3
139 0.28
140 0.28
141 0.28
142 0.26
143 0.25
144 0.23
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.2
149 0.18
150 0.18
151 0.16
152 0.15
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.14
158 0.17
159 0.2
160 0.2
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.19
165 0.16
166 0.13
167 0.19
168 0.21
169 0.24
170 0.25
171 0.26
172 0.29
173 0.34
174 0.37
175 0.33
176 0.34
177 0.41
178 0.47
179 0.47
180 0.46
181 0.43
182 0.41
183 0.42
184 0.39
185 0.32
186 0.31
187 0.28
188 0.26
189 0.27
190 0.25
191 0.2
192 0.19
193 0.16
194 0.1
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.06
214 0.07
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.16
227 0.22
228 0.25
229 0.25
230 0.27
231 0.33
232 0.38
233 0.39
234 0.38
235 0.33
236 0.31
237 0.29
238 0.27
239 0.21
240 0.18
241 0.17
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.15
246 0.22
247 0.26
248 0.25
249 0.24
250 0.23
251 0.24
252 0.24
253 0.23
254 0.16
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.13
270 0.14
271 0.15
272 0.17
273 0.19
274 0.22
275 0.23
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.24
280 0.22
281 0.2
282 0.17
283 0.15
284 0.14
285 0.1
286 0.1
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.13
291 0.15
292 0.17
293 0.21
294 0.24
295 0.32
296 0.32
297 0.3
298 0.3
299 0.33
300 0.35
301 0.32
302 0.28
303 0.21
304 0.23
305 0.22
306 0.19
307 0.15
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.11
315 0.12
316 0.15
317 0.17
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.17
322 0.14
323 0.12
324 0.1
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.11
338 0.12
339 0.17
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.16
344 0.2
345 0.21
346 0.2
347 0.2
348 0.26
349 0.31
350 0.35
351 0.35
352 0.32
353 0.33
354 0.33
355 0.29
356 0.24
357 0.18
358 0.14
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.14
363 0.15
364 0.14
365 0.16
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.18
371 0.16
372 0.15
373 0.15
374 0.16
375 0.19
376 0.2
377 0.24
378 0.21
379 0.26
380 0.31
381 0.36
382 0.4
383 0.39
384 0.42
385 0.47
386 0.46
387 0.5
388 0.51
389 0.48
390 0.44
391 0.44
392 0.4
393 0.31
394 0.3
395 0.22
396 0.17
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.05
408 0.06
409 0.1
410 0.13
411 0.16
412 0.19
413 0.2
414 0.21
415 0.26
416 0.33
417 0.4
418 0.48
419 0.53
420 0.57
421 0.6
422 0.65
423 0.66
424 0.63
425 0.57
426 0.54
427 0.5
428 0.54
429 0.57
430 0.58
431 0.53
432 0.54
433 0.51
434 0.45
435 0.42
436 0.31
437 0.25
438 0.2
439 0.2
440 0.17
441 0.16
442 0.16
443 0.18
444 0.21
445 0.3
446 0.38
447 0.38
448 0.4
449 0.46
450 0.5
451 0.59
452 0.67
453 0.64
454 0.61
455 0.66
456 0.66
457 0.64
458 0.64
459 0.61
460 0.54
461 0.52
462 0.55
463 0.57
464 0.62
465 0.66
466 0.69
467 0.72
468 0.76
469 0.75
470 0.75
471 0.74
472 0.74
473 0.77
474 0.76
475 0.76