FuNGI

A0A4Y9YM86

Protein Details

Accession

A0A4Y9YM86

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
464-485	AKGKAKEKDKRQKGANKPQTER	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
464-482	AKGKAKEKDKRQKGANKPQ
671-705	AKKDDKKKAAAGGGAKPAPAEQPLGKKAKKAAAKA

Subcellular Location(s)

mito 15, cyto 5.5, cyto_nucl 5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032675 LRR_dom_sf IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MLFQWVSLRWTFRNKKKTVLPTEVCEQIIDLIYFDSPVPMDQETARALKSCQLVCKAWSYRSRHYLLHTIIVRDEAELQAISRALSRSRDRAARVRELILAVNRQSGVPLVRVFSLMLVRRLPNVKHLCLRGMASRDGLPRLPSQIHLKALTMLSYFTSLSSLTLQDVTFPSITILIRICAALHALKTLECQEIHFVDWGNVYIPTRPASVSTLVVRRQQKRIGHLLAALGNLTTLVCDGGHELEHDYADVIRPPAPLRLHSLLLRGILLSPALVNMMIAMIEFDHLRTLMLDAHMRELTVVQTLCDAAGRSLRHLAVNVDLGTWQEYEGPFPAFEANEMLQTLRIACRPRELLVTMISHLCIPSLEQLTICISSQHAMDLGFDDLDLPSLDEVVSCAEFAPKRVVFELGYSIAETELQELETELCAYMPNAGGRASPTLVELREPTHMFNAVESAKLSLSPNAKGKAKEKDKRQKGANKPQTERLKTIVRRLPPNLPEDIFWQSVQQWVTDETAQWKAYYQGKFRKRLNKENISSRAYIAFRNEEQLAIFSRDYDGHVFRDKAGNESIAVVEFAPYQKIPSEKKKVDNRVGTIEKDEDFLSFMKSLEEGGSKPVDGETLETLIAASQPPPQPTTTPLLEALKAEKSAQKDKEAILRAHAHYKDPSVVASAKKDDKKKAAAGGGAKPAPAEQPLGKKAKKAAAKAAQQPAGPSSAPGTKASAPTNAPAQAKQAQAQQAGSPTKTPRPPRERQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.68
3	0.74
4	0.8
5	0.78
6	0.79
7	0.74
8	0.69
9	0.71
10	0.66
11	0.56
12	0.46
13	0.37
14	0.28
15	0.25
16	0.2
17	0.15
18	0.11
19	0.11
20	0.12
21	0.11
22	0.1
23	0.08
24	0.09
25	0.11
26	0.11
27	0.12
28	0.12
29	0.16
30	0.18
31	0.2
32	0.2
33	0.19
34	0.19
35	0.23
36	0.29
37	0.29
38	0.32
39	0.36
40	0.37
41	0.38
42	0.46
43	0.45
44	0.47
45	0.52
46	0.53
47	0.57
48	0.62
49	0.64
50	0.58
51	0.59
52	0.6
53	0.55
54	0.55
55	0.49
56	0.43
57	0.39
58	0.38
59	0.33
60	0.24
61	0.24
62	0.15
63	0.14
64	0.12
65	0.12
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.12
70	0.13
71	0.15
72	0.22
73	0.26
74	0.31
75	0.37
76	0.43
77	0.46
78	0.53
79	0.58
80	0.6
81	0.58
82	0.54
83	0.5
84	0.46
85	0.44
86	0.39
87	0.36
88	0.28
89	0.27
90	0.25
91	0.23
92	0.22
93	0.2
94	0.18
95	0.16
96	0.17
97	0.15
98	0.15
99	0.16
100	0.16
101	0.15
102	0.19
103	0.19
104	0.21
105	0.23
106	0.23
107	0.27
108	0.32
109	0.32
110	0.36
111	0.39
112	0.42
113	0.45
114	0.46
115	0.44
116	0.41
117	0.43
118	0.38
119	0.36
120	0.32
121	0.28
122	0.3
123	0.3
124	0.3
125	0.29
126	0.26
127	0.24
128	0.27
129	0.26
130	0.25
131	0.3
132	0.32
133	0.34
134	0.33
135	0.32
136	0.3
137	0.29
138	0.27
139	0.2
140	0.16
141	0.13
142	0.13
143	0.12
144	0.09
145	0.1
146	0.08
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.11
152	0.1
153	0.12
154	0.13
155	0.14
156	0.13
157	0.12
158	0.12
159	0.13
160	0.13
161	0.12
162	0.12
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.07
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.1
174	0.11
175	0.13
176	0.15
177	0.13
178	0.14
179	0.16
180	0.17
181	0.18
182	0.18
183	0.15
184	0.13
185	0.14
186	0.13
187	0.11
188	0.11
189	0.1
190	0.11
191	0.12
192	0.12
193	0.13
194	0.12
195	0.13
196	0.15
197	0.16
198	0.17
199	0.19
200	0.23
201	0.25
202	0.32
203	0.39
204	0.41
205	0.45
206	0.49
207	0.5
208	0.51
209	0.56
210	0.52
211	0.45
212	0.42
213	0.38
214	0.32
215	0.28
216	0.21
217	0.13
218	0.09
219	0.08
220	0.07
221	0.04
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.05
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.1
241	0.11
242	0.16
243	0.17
244	0.18
245	0.23
246	0.25
247	0.26
248	0.26
249	0.27
250	0.22
251	0.22
252	0.2
253	0.14
254	0.11
255	0.09
256	0.08
257	0.06
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.02
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.06
278	0.07
279	0.09
280	0.09
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.11
285	0.1
286	0.09
287	0.1
288	0.1
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.08
294	0.07
295	0.05
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.13
300	0.14
301	0.13
302	0.14
303	0.14
304	0.12
305	0.13
306	0.12
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.07
322	0.07
323	0.08
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.09
333	0.11
334	0.11
335	0.15
336	0.16
337	0.17
338	0.19
339	0.18
340	0.17
341	0.17
342	0.17
343	0.14
344	0.13
345	0.12
346	0.1
347	0.09
348	0.08
349	0.05
350	0.05
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.04
376	0.03
377	0.04
378	0.04
379	0.03
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.06
386	0.07
387	0.08
388	0.13
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.16
393	0.13
394	0.14
395	0.15
396	0.11
397	0.11
398	0.1
399	0.09
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.05
410	0.06
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.09
423	0.08
424	0.07
425	0.08
426	0.09
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.14
432	0.14
433	0.14
434	0.14
435	0.15
436	0.14
437	0.14
438	0.15
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.09
444	0.1
445	0.1
446	0.11
447	0.13
448	0.16
449	0.2
450	0.24
451	0.27
452	0.29
453	0.34
454	0.4
455	0.48
456	0.52
457	0.58
458	0.65
459	0.71
460	0.76
461	0.79
462	0.79
463	0.8
464	0.84
465	0.83
466	0.81
467	0.75
468	0.77
469	0.78
470	0.72
471	0.63
472	0.57
473	0.56
474	0.5
475	0.56
476	0.52
477	0.48
478	0.49
479	0.51
480	0.53
481	0.48
482	0.48
483	0.43
484	0.38
485	0.33
486	0.31
487	0.31
488	0.25
489	0.21
490	0.19
491	0.16
492	0.19
493	0.18
494	0.15
495	0.12
496	0.12
497	0.14
498	0.13
499	0.14
500	0.13
501	0.17
502	0.17
503	0.16
504	0.15
505	0.18
506	0.24
507	0.28
508	0.32
509	0.38
510	0.46
511	0.53
512	0.6
513	0.67
514	0.68
515	0.74
516	0.77
517	0.78
518	0.76
519	0.78
520	0.77
521	0.71
522	0.64
523	0.55
524	0.49
525	0.4
526	0.35
527	0.29
528	0.26
529	0.23
530	0.25
531	0.24
532	0.19
533	0.19
534	0.18
535	0.18
536	0.16
537	0.16
538	0.12
539	0.13
540	0.14
541	0.15
542	0.17
543	0.17
544	0.16
545	0.21
546	0.21
547	0.21
548	0.27
549	0.25
550	0.25
551	0.25
552	0.23
553	0.19
554	0.19
555	0.18
556	0.12
557	0.12
558	0.09
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.12
566	0.17
567	0.24
568	0.33
569	0.43
570	0.47
571	0.56
572	0.65
573	0.72
574	0.76
575	0.77
576	0.7
577	0.69
578	0.67
579	0.59
580	0.53
581	0.46
582	0.36
583	0.31
584	0.27
585	0.18
586	0.16
587	0.15
588	0.14
589	0.12
590	0.12
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.11
595	0.12
596	0.1
597	0.13
598	0.14
599	0.13
600	0.14
601	0.13
602	0.12
603	0.1
604	0.12
605	0.1
606	0.1
607	0.1
608	0.1
609	0.1
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.07
614	0.12
615	0.16
616	0.18
617	0.2
618	0.22
619	0.23
620	0.26
621	0.31
622	0.27
623	0.25
624	0.27
625	0.28
626	0.27
627	0.27
628	0.26
629	0.22
630	0.22
631	0.21
632	0.21
633	0.25
634	0.33
635	0.35
636	0.37
637	0.38
638	0.4
639	0.46
640	0.49
641	0.44
642	0.41
643	0.44
644	0.42
645	0.47
646	0.46
647	0.41
648	0.38
649	0.4
650	0.37
651	0.31
652	0.29
653	0.24
654	0.27
655	0.26
656	0.29
657	0.32
658	0.37
659	0.44
660	0.51
661	0.55
662	0.59
663	0.62
664	0.62
665	0.63
666	0.59
667	0.57
668	0.55
669	0.53
670	0.53
671	0.47
672	0.42
673	0.35
674	0.31
675	0.28
676	0.24
677	0.22
678	0.19
679	0.26
680	0.34
681	0.43
682	0.44
683	0.46
684	0.51
685	0.55
686	0.58
687	0.55
688	0.58
689	0.58
690	0.65
691	0.7
692	0.72
693	0.68
694	0.61
695	0.58
696	0.49
697	0.43
698	0.34
699	0.26
700	0.21
701	0.22
702	0.23
703	0.23
704	0.25
705	0.26
706	0.3
707	0.32
708	0.33
709	0.31
710	0.32
711	0.35
712	0.37
713	0.36
714	0.32
715	0.35
716	0.36
717	0.37
718	0.37
719	0.39
720	0.39
721	0.4
722	0.4
723	0.37
724	0.39
725	0.4
726	0.38
727	0.37
728	0.36
729	0.42
730	0.5
731	0.57
732	0.6

A0A4Y9YM86

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer