Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9Y1G1

Protein Details
Accession A0A4Y9Y1G1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-68DKLQNERKPEKRRKLLDSWFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-59KR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
Amino Acid Sequences MLPTPAPSSPPSSPKLEAVTAEDHELVYPAPPKNRGSAPFHVLAALFDKLQNERKPEKRRKLLDSWFNKDRERAVYGLKEKNLAKTYIKLIPLGMRDPDAIRLLNWKKPTERDKSSGDFPTVLYEVVSKRSSVIEGSLTVDELNDVLDELAKNMGKSELQSKILQRVYNRSTPEEQRWIVRIILKGPTVLLPILSYPH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.42
3 0.37
4 0.33
5 0.31
6 0.31
7 0.27
8 0.27
9 0.24
10 0.19
11 0.17
12 0.16
13 0.13
14 0.11
15 0.15
16 0.17
17 0.21
18 0.25
19 0.26
20 0.31
21 0.36
22 0.39
23 0.41
24 0.44
25 0.44
26 0.42
27 0.41
28 0.37
29 0.31
30 0.26
31 0.22
32 0.16
33 0.12
34 0.11
35 0.12
36 0.15
37 0.22
38 0.25
39 0.29
40 0.37
41 0.46
42 0.56
43 0.66
44 0.73
45 0.75
46 0.79
47 0.79
48 0.8
49 0.8
50 0.79
51 0.77
52 0.74
53 0.7
54 0.66
55 0.6
56 0.52
57 0.46
58 0.39
59 0.33
60 0.27
61 0.24
62 0.27
63 0.32
64 0.34
65 0.32
66 0.33
67 0.31
68 0.36
69 0.34
70 0.3
71 0.26
72 0.24
73 0.27
74 0.27
75 0.27
76 0.21
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.15
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.17
90 0.18
91 0.22
92 0.24
93 0.25
94 0.26
95 0.33
96 0.4
97 0.4
98 0.42
99 0.43
100 0.45
101 0.46
102 0.49
103 0.44
104 0.38
105 0.3
106 0.26
107 0.24
108 0.19
109 0.16
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.14
114 0.14
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.13
119 0.11
120 0.12
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.12
144 0.17
145 0.2
146 0.22
147 0.26
148 0.28
149 0.35
150 0.39
151 0.4
152 0.37
153 0.42
154 0.44
155 0.46
156 0.47
157 0.44
158 0.47
159 0.51
160 0.55
161 0.54
162 0.5
163 0.49
164 0.48
165 0.45
166 0.41
167 0.39
168 0.35
169 0.3
170 0.33
171 0.29
172 0.27
173 0.26
174 0.24
175 0.22
176 0.19
177 0.16
178 0.12