FuNGI

A0A4Y9Y9S8

Protein Details

Accession

A0A4Y9Y9S8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
239-261	EAPRKKSSPAKAKKTSPKPKSSK	Basic
274-299	DAPKKKSPPAKTKKTSPKPKSSKASS	Hydrophilic
455-477	DGKEKAGKGKPRKSNTPFQRIKT	Basic
510-538	LIVTRGSGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
124-160	KKKAAKGPSSAKVAATKPAKAAPAKPAKAAAATKPAR
241-262	PRKKSSPAKAKKTSPKPKSSKA
276-296	PKKKSPPAKTKKTSPKPKSSK
314-329	KKSPPAKTKKTSPEPK
456-467	GKEKAGKGKPRK
518-528	FRKEKNKKKRG

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MYRVRRAGLIDIRDELTIPRTVTYALIYDFLSRRSHTKAAAAVKKAADDTVDLDEASTPTEKLEDVVAGWKAAQPKADTTQKKQVEKDAESSDSSSSSSSDSESDSDSSSSESSSSSEAEDGSKKKAAKGPSSAKVAATKPAKAAPAKPAKAAAATKPARSPSPSTSKTLSSGNEGSSSSDSDSDSDSSTGKAKVATKKTVTTTTKKATKDAESSDESSDSDSDSSSSSSSSSSDSEEEAPRKKSSPAKAKKTSPKPKSSKASSSSSSSDSEDDAPKKKSPPAKTKKTSPKPKSSKASSSSSSSSSDSEDDAPKKSPPAKTKKTSPEPKSSKASSRSSSSSDSSDSDSSSSEESVKKTTKTTRTAVKRKAPSSAKSSSSSSSDSGSDSDSDSDSDSSSSSTSNSANSTPSPATRPAKKQRTAEDGSAAVTATVSNADFSAGTQHANGNGKGENGDGKEKAGKGKPRKSNTPFQRIKTDNIQFVDDRLKDNAFDSRGAGANDYGERAARDLIVTRGSGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMQSYSIKFTD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.25
3	0.21
4	0.21
5	0.19
6	0.16
7	0.16
8	0.17
9	0.17
10	0.17
11	0.16
12	0.14
13	0.14
14	0.14
15	0.19
16	0.19
17	0.21
18	0.23
19	0.22
20	0.25
21	0.3
22	0.33
23	0.31
24	0.34
25	0.39
26	0.46
27	0.52
28	0.51
29	0.5
30	0.47
31	0.47
32	0.42
33	0.36
34	0.26
35	0.2
36	0.19
37	0.17
38	0.17
39	0.15
40	0.15
41	0.15
42	0.15
43	0.15
44	0.14
45	0.1
46	0.09
47	0.1
48	0.1
49	0.09
50	0.11
51	0.09
52	0.09
53	0.14
54	0.14
55	0.13
56	0.14
57	0.15
58	0.18
59	0.19
60	0.22
61	0.19
62	0.23
63	0.3
64	0.4
65	0.43
66	0.47
67	0.56
68	0.6
69	0.64
70	0.63
71	0.63
72	0.62
73	0.6
74	0.59
75	0.53
76	0.48
77	0.43
78	0.42
79	0.34
80	0.26
81	0.23
82	0.17
83	0.13
84	0.12
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.12
89	0.12
90	0.14
91	0.14
92	0.14
93	0.14
94	0.13
95	0.14
96	0.13
97	0.12
98	0.1
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.1
103	0.1
104	0.1
105	0.1
106	0.12
107	0.17
108	0.18
109	0.21
110	0.25
111	0.25
112	0.29
113	0.33
114	0.37
115	0.39
116	0.47
117	0.51
118	0.53
119	0.59
120	0.55
121	0.51
122	0.5
123	0.44
124	0.43
125	0.37
126	0.32
127	0.28
128	0.3
129	0.33
130	0.3
131	0.32
132	0.34
133	0.41
134	0.41
135	0.4
136	0.39
137	0.36
138	0.38
139	0.37
140	0.3
141	0.3
142	0.31
143	0.31
144	0.33
145	0.34
146	0.32
147	0.33
148	0.35
149	0.32
150	0.4
151	0.4
152	0.41
153	0.41
154	0.41
155	0.39
156	0.38
157	0.32
158	0.28
159	0.27
160	0.23
161	0.22
162	0.21
163	0.21
164	0.18
165	0.18
166	0.13
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.12
171	0.11
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.1
176	0.13
177	0.12
178	0.11
179	0.14
180	0.18
181	0.26
182	0.32
183	0.37
184	0.37
185	0.4
186	0.43
187	0.49
188	0.48
189	0.45
190	0.47
191	0.49
192	0.53
193	0.5
194	0.5
195	0.45
196	0.45
197	0.44
198	0.4
199	0.37
200	0.33
201	0.34
202	0.32
203	0.28
204	0.23
205	0.19
206	0.17
207	0.12
208	0.09
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.07
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.09
221	0.1
222	0.11
223	0.13
224	0.16
225	0.19
226	0.22
227	0.24
228	0.23
229	0.24
230	0.27
231	0.31
232	0.37
233	0.45
234	0.51
235	0.58
236	0.64
237	0.72
238	0.77
239	0.81
240	0.83
241	0.8
242	0.81
243	0.78
244	0.79
245	0.79
246	0.74
247	0.71
248	0.65
249	0.62
250	0.54
251	0.51
252	0.44
253	0.38
254	0.34
255	0.27
256	0.22
257	0.18
258	0.18
259	0.18
260	0.19
261	0.2
262	0.21
263	0.22
264	0.24
265	0.27
266	0.33
267	0.37
268	0.46
269	0.53
270	0.61
271	0.64
272	0.73
273	0.79
274	0.82
275	0.85
276	0.82
277	0.83
278	0.81
279	0.84
280	0.82
281	0.77
282	0.74
283	0.67
284	0.64
285	0.56
286	0.51
287	0.44
288	0.38
289	0.34
290	0.27
291	0.23
292	0.19
293	0.17
294	0.14
295	0.15
296	0.17
297	0.16
298	0.17
299	0.17
300	0.17
301	0.2
302	0.24
303	0.28
304	0.34
305	0.43
306	0.5
307	0.54
308	0.63
309	0.7
310	0.75
311	0.79
312	0.76
313	0.76
314	0.74
315	0.74
316	0.71
317	0.64
318	0.61
319	0.58
320	0.57
321	0.49
322	0.47
323	0.45
324	0.41
325	0.41
326	0.36
327	0.3
328	0.27
329	0.25
330	0.23
331	0.21
332	0.18
333	0.15
334	0.14
335	0.13
336	0.12
337	0.12
338	0.11
339	0.13
340	0.14
341	0.18
342	0.21
343	0.21
344	0.25
345	0.32
346	0.37
347	0.41
348	0.45
349	0.49
350	0.57
351	0.65
352	0.7
353	0.71
354	0.72
355	0.67
356	0.72
357	0.68
358	0.62
359	0.59
360	0.56
361	0.5
362	0.45
363	0.46
364	0.39
365	0.36
366	0.34
367	0.28
368	0.24
369	0.2
370	0.18
371	0.17
372	0.16
373	0.13
374	0.12
375	0.12
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.11
390	0.13
391	0.13
392	0.15
393	0.15
394	0.18
395	0.18
396	0.19
397	0.21
398	0.27
399	0.32
400	0.38
401	0.47
402	0.54
403	0.62
404	0.68
405	0.71
406	0.7
407	0.73
408	0.7
409	0.63
410	0.56
411	0.46
412	0.4
413	0.34
414	0.26
415	0.17
416	0.12
417	0.09
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.11
427	0.1
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.17
432	0.21
433	0.21
434	0.18
435	0.19
436	0.19
437	0.19
438	0.18
439	0.18
440	0.17
441	0.21
442	0.19
443	0.2
444	0.25
445	0.26
446	0.32
447	0.36
448	0.43
449	0.49
450	0.58
451	0.66
452	0.7
453	0.79
454	0.79
455	0.82
456	0.83
457	0.83
458	0.81
459	0.76
460	0.78
461	0.71
462	0.69
463	0.69
464	0.65
465	0.6
466	0.54
467	0.54
468	0.43
469	0.43
470	0.45
471	0.37
472	0.33
473	0.29
474	0.28
475	0.25
476	0.27
477	0.3
478	0.24
479	0.24
480	0.22
481	0.22
482	0.24
483	0.24
484	0.24
485	0.18
486	0.19
487	0.19
488	0.18
489	0.16
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.15
494	0.12
495	0.13
496	0.13
497	0.16
498	0.17
499	0.17
500	0.17
501	0.23
502	0.24
503	0.31
504	0.34
505	0.4
506	0.48
507	0.59
508	0.68
509	0.73
510	0.81
511	0.83
512	0.89
513	0.91
514	0.91
515	0.91
516	0.88
517	0.88
518	0.86
519	0.8
520	0.71
521	0.62
522	0.54
523	0.43
524	0.37
525	0.27
526	0.18

A0A4Y9Y9S8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer