FuNGI

A0A4Y9YSH0

Protein Details

Accession

A0A4Y9YSH0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-47	IEMDDARRARKKRKADPNEILAEI	Hydrophilic
355-377	VEPLNGRPKPRRRAKQPEAAATE	Hydrophilic
446-477	DNAPSTSKPLSRPKPKPRRKRPEDSHARLTTD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-37	RRARKKRK
361-369	RPKPRRRAK
454-467	PLSRPKPKPRRKRP

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 10, cyto 5, mito 2, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MQTQLLETIGRSPPKRPDDWNSDIEMDDARRARKKRKADPNEILAEILRGDEGSDFDEDDMALLGGDVDPNTLCPWCDERLPPAPSPHLESLIAAARRSSTRDPRPVNALGLRAPVGTFVSVCQRHRFESHQIPKAQARGWPTKIDWDSVAPRVKALRAKLQEIIDDVDEDFLPGAHRADDAGDDDVARWSDRPRKGSTFWRDVVKSVRKSGSRKTAGVAGQLANFSKTQPGYYGELGYVIIHQTMYDMFPPASFPPESTLPLNSTDFIQLILIPEAVVSLIMEDMYQTREEAIETLRDSAEYGVAMFPDDQAEGADAVDQGERIIMRRAEARRRELAVEDRLEKEMLQTSSQGVEPLNGRPKPRRRAKQPEAAATEPDSEKSDVEVGPVRPSKKGKERGMQSRDHTDCEASAVDDGHDAGRRMTRSQSRARSIQANSDIEMDVSDNAPSTSKPLSRPKPKPRRKRPEDSHARLTTDDLDLGELEMDGVLPPSVPQPIPEVHWDAKGHAHLSRAGSMVDEDPTPRASKISRPTDRASKETSIPPLQRARDRRAKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.54
3	0.55
4	0.58
5	0.61
6	0.66
7	0.64
8	0.59
9	0.53
10	0.48
11	0.42
12	0.36
13	0.28
14	0.27
15	0.27
16	0.29
17	0.35
18	0.42
19	0.51
20	0.57
21	0.66
22	0.71
23	0.78
24	0.83
25	0.86
26	0.88
27	0.87
28	0.83
29	0.73
30	0.63
31	0.51
32	0.41
33	0.3
34	0.21
35	0.13
36	0.07
37	0.07
38	0.07
39	0.07
40	0.09
41	0.09
42	0.09
43	0.09
44	0.1
45	0.09
46	0.09
47	0.08
48	0.06
49	0.05
50	0.04
51	0.05
52	0.04
53	0.05
54	0.05
55	0.05
56	0.05
57	0.06
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.11
62	0.15
63	0.17
64	0.21
65	0.22
66	0.28
67	0.36
68	0.4
69	0.4
70	0.41
71	0.44
72	0.42
73	0.46
74	0.42
75	0.36
76	0.32
77	0.29
78	0.27
79	0.28
80	0.28
81	0.21
82	0.19
83	0.19
84	0.2
85	0.25
86	0.3
87	0.33
88	0.41
89	0.51
90	0.55
91	0.57
92	0.62
93	0.59
94	0.56
95	0.49
96	0.42
97	0.34
98	0.31
99	0.28
100	0.21
101	0.19
102	0.15
103	0.13
104	0.11
105	0.09
106	0.08
107	0.16
108	0.21
109	0.23
110	0.29
111	0.3
112	0.33
113	0.37
114	0.41
115	0.4
116	0.47
117	0.54
118	0.55
119	0.55
120	0.56
121	0.56
122	0.55
123	0.48
124	0.4
125	0.38
126	0.38
127	0.39
128	0.39
129	0.36
130	0.41
131	0.41
132	0.39
133	0.34
134	0.3
135	0.3
136	0.33
137	0.37
138	0.28
139	0.28
140	0.28
141	0.31
142	0.31
143	0.31
144	0.34
145	0.32
146	0.35
147	0.38
148	0.38
149	0.35
150	0.32
151	0.3
152	0.21
153	0.18
154	0.15
155	0.11
156	0.1
157	0.09
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.07
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.08
177	0.12
178	0.2
179	0.25
180	0.29
181	0.33
182	0.38
183	0.42
184	0.51
185	0.55
186	0.54
187	0.52
188	0.54
189	0.49
190	0.46
191	0.51
192	0.49
193	0.44
194	0.42
195	0.44
196	0.43
197	0.47
198	0.52
199	0.54
200	0.5
201	0.47
202	0.44
203	0.44
204	0.39
205	0.37
206	0.32
207	0.22
208	0.18
209	0.18
210	0.17
211	0.12
212	0.12
213	0.1
214	0.11
215	0.1
216	0.1
217	0.11
218	0.14
219	0.16
220	0.16
221	0.17
222	0.13
223	0.14
224	0.13
225	0.12
226	0.09
227	0.06
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.08
239	0.08
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.11
244	0.13
245	0.15
246	0.15
247	0.15
248	0.14
249	0.16
250	0.16
251	0.13
252	0.12
253	0.11
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.03
266	0.02
267	0.02
268	0.02
269	0.02
270	0.02
271	0.02
272	0.03
273	0.04
274	0.05
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.07
282	0.07
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.09
313	0.08
314	0.09
315	0.16
316	0.21
317	0.29
318	0.35
319	0.39
320	0.4
321	0.42
322	0.42
323	0.39
324	0.39
325	0.36
326	0.33
327	0.31
328	0.28
329	0.27
330	0.26
331	0.23
332	0.19
333	0.19
334	0.16
335	0.15
336	0.14
337	0.14
338	0.15
339	0.15
340	0.14
341	0.09
342	0.1
343	0.11
344	0.15
345	0.23
346	0.24
347	0.27
348	0.36
349	0.45
350	0.54
351	0.63
352	0.68
353	0.7
354	0.79
355	0.84
356	0.85
357	0.82
358	0.8
359	0.76
360	0.67
361	0.58
362	0.48
363	0.43
364	0.33
365	0.28
366	0.22
367	0.16
368	0.15
369	0.14
370	0.15
371	0.12
372	0.14
373	0.17
374	0.16
375	0.22
376	0.25
377	0.26
378	0.29
379	0.32
380	0.38
381	0.44
382	0.53
383	0.54
384	0.59
385	0.67
386	0.73
387	0.76
388	0.74
389	0.68
390	0.68
391	0.62
392	0.56
393	0.48
394	0.38
395	0.32
396	0.27
397	0.23
398	0.14
399	0.13
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.1
406	0.1
407	0.11
408	0.14
409	0.16
410	0.17
411	0.25
412	0.31
413	0.36
414	0.45
415	0.52
416	0.55
417	0.57
418	0.59
419	0.59
420	0.53
421	0.54
422	0.52
423	0.45
424	0.39
425	0.37
426	0.34
427	0.26
428	0.24
429	0.17
430	0.1
431	0.09
432	0.09
433	0.07
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.1
438	0.14
439	0.17
440	0.24
441	0.35
442	0.45
443	0.55
444	0.66
445	0.74
446	0.81
447	0.88
448	0.92
449	0.93
450	0.95
451	0.94
452	0.94
453	0.92
454	0.93
455	0.93
456	0.9
457	0.89
458	0.81
459	0.74
460	0.63
461	0.55
462	0.46
463	0.36
464	0.29
465	0.19
466	0.15
467	0.13
468	0.13
469	0.11
470	0.08
471	0.06
472	0.05
473	0.05
474	0.04
475	0.05
476	0.04
477	0.04
478	0.05
479	0.07
480	0.1
481	0.1
482	0.11
483	0.15
484	0.17
485	0.2
486	0.24
487	0.29
488	0.27
489	0.33
490	0.33
491	0.3
492	0.34
493	0.34
494	0.31
495	0.27
496	0.27
497	0.26
498	0.28
499	0.29
500	0.25
501	0.22
502	0.21
503	0.21
504	0.2
505	0.17
506	0.15
507	0.14
508	0.15
509	0.17
510	0.18
511	0.17
512	0.19
513	0.2
514	0.27
515	0.36
516	0.45
517	0.51
518	0.56
519	0.62
520	0.69
521	0.72
522	0.68
523	0.65
524	0.59
525	0.56
526	0.56
527	0.57
528	0.56
529	0.53
530	0.55
531	0.57
532	0.59
533	0.63
534	0.65
535	0.67

A0A4Y9YSH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer