Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YGM4

Protein Details
Accession A0A4Y9YGM4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-353VPSNQRSDKLRKTPVRLVRRRGTSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.833, cyto 10, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MSSAPLNPLDVPPYQLQPLLASVGDNSARLPGQQAHIRCAQALGAELYVGCSNGELLRFSIQLQEGSTADSYTLLSRQAVVHERPIQEIVLLPSLLRALVLADHQVYIYTLPSLDQIPPTVIKPIRNVVTIAVDEQHLRRPPPADPLYPADPVDFCVIKRSAISLYSLSKERLFFQKEIPLPSGGFVARRTGKALCIADKEYYNVIDLELASMVPLLPLSQASDGQTIKPSITVISENEFLIVSWTGASSLGVFITGDGEPVRGTLEWPAHPETISLDYPYMTTLLPNETIEIHSVETQAIVQVVPAPADGAQIPERKKLNSSANGFYVPSNQRSDKLRKTPVRLVRRRGTSEAGGSSGKESGGEDLEEVPGMSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.22
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.16
8 0.13
9 0.12
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.14
16 0.13
17 0.17
18 0.16
19 0.22
20 0.28
21 0.3
22 0.32
23 0.37
24 0.37
25 0.34
26 0.31
27 0.25
28 0.19
29 0.19
30 0.16
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.07
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.1
42 0.09
43 0.1
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.17
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.17
52 0.15
53 0.17
54 0.17
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.15
66 0.2
67 0.21
68 0.27
69 0.32
70 0.33
71 0.33
72 0.33
73 0.29
74 0.23
75 0.23
76 0.18
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.08
84 0.06
85 0.04
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.18
108 0.19
109 0.2
110 0.22
111 0.27
112 0.27
113 0.27
114 0.27
115 0.22
116 0.22
117 0.2
118 0.18
119 0.13
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.2
128 0.21
129 0.29
130 0.32
131 0.28
132 0.29
133 0.33
134 0.33
135 0.33
136 0.31
137 0.23
138 0.19
139 0.19
140 0.18
141 0.14
142 0.11
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.16
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.17
159 0.22
160 0.24
161 0.23
162 0.24
163 0.29
164 0.3
165 0.32
166 0.31
167 0.25
168 0.21
169 0.21
170 0.19
171 0.13
172 0.12
173 0.1
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.15
178 0.14
179 0.15
180 0.19
181 0.2
182 0.17
183 0.18
184 0.19
185 0.19
186 0.19
187 0.19
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.1
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.12
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.09
253 0.13
254 0.14
255 0.17
256 0.2
257 0.2
258 0.2
259 0.2
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.16
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.06
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.14
300 0.2
301 0.22
302 0.28
303 0.3
304 0.31
305 0.34
306 0.38
307 0.43
308 0.46
309 0.5
310 0.48
311 0.48
312 0.48
313 0.46
314 0.39
315 0.38
316 0.34
317 0.32
318 0.34
319 0.33
320 0.36
321 0.42
322 0.51
323 0.53
324 0.58
325 0.65
326 0.67
327 0.73
328 0.79
329 0.81
330 0.84
331 0.83
332 0.83
333 0.81
334 0.82
335 0.8
336 0.75
337 0.7
338 0.63
339 0.59
340 0.52
341 0.45
342 0.37
343 0.32
344 0.28
345 0.24
346 0.19
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.13