Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XZN2

Protein Details
Accession A0A4Y9XZN2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
441-472DSSAGRRHRSSRHRSRRRTRKRMSILTNRYYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-462GRRHRSSRHRSRRRTRKR
Subcellular Location(s) nucl 6mito 6cyto 6plas 6cyto_nucl 6cyto_mito 6mito_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR003084  His_deacetylse_1  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences MSKRRVTYYYDSDVGAYTYGYGHLMKPQRMRITHELVSAYGMLDKMHILRAKRASAETMTRFHTDEYIEFLSKVTPENVEELISQRSRFLVLGDDNPAFEGIFEFCSISAGGSIAAAERLASGATDIAINWAGGLHHAKKREASGFCFINDIVLCILELLRSVPRVLYIDIDCHHGDGVEEAFYTTNRVMTCSFHKYGEFFPGTGTLQDRGRGKGKGYAVNVPLKDGVTDESFKSIFEPVIDQILAVFQPSAIVLQCGADSLAGDRLGCLNLTMEGHANCIKYVRARNIPLVLLGGGGYTVKNVVRAWTYETACALGIEREIDPNLPWNEYFEWFGPRYRLEVLPNNMEDMNVKDGSLDEVRRRVLEQLSELQPAPSVGMQDVPKESLGEHLGFGNANSEEPMDELDERVAQHTRFVYGLQEAAASDNESDEDDADSLSDDSSAGRRHRSSRHRSRRRTRKRMSILTNRYYDVPRTDEHGEEALPDLCGGAYTNGNGNGAGQKRAGRRKFFQSAARWDPVAEKVLVEWDTMHTPRIGVAAAMANPTRDWGARNGYSRDMDGVDGVDEDAYEEMDVDEEDGEDEGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.24
3 0.16
4 0.1
5 0.08
6 0.09
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.18
11 0.25
12 0.31
13 0.37
14 0.45
15 0.52
16 0.54
17 0.61
18 0.61
19 0.62
20 0.59
21 0.56
22 0.49
23 0.41
24 0.39
25 0.31
26 0.24
27 0.17
28 0.14
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.16
34 0.19
35 0.2
36 0.28
37 0.34
38 0.37
39 0.39
40 0.4
41 0.38
42 0.39
43 0.46
44 0.42
45 0.4
46 0.4
47 0.38
48 0.37
49 0.34
50 0.32
51 0.25
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.22
58 0.2
59 0.19
60 0.2
61 0.16
62 0.14
63 0.14
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.17
69 0.21
70 0.22
71 0.21
72 0.19
73 0.19
74 0.19
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.2
80 0.24
81 0.24
82 0.22
83 0.22
84 0.22
85 0.15
86 0.12
87 0.1
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.12
122 0.16
123 0.19
124 0.23
125 0.24
126 0.26
127 0.31
128 0.37
129 0.36
130 0.35
131 0.38
132 0.37
133 0.36
134 0.35
135 0.3
136 0.25
137 0.22
138 0.18
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.08
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.16
158 0.2
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.09
172 0.07
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.11
177 0.14
178 0.19
179 0.24
180 0.26
181 0.24
182 0.25
183 0.25
184 0.26
185 0.31
186 0.26
187 0.2
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.13
194 0.13
195 0.17
196 0.18
197 0.19
198 0.23
199 0.23
200 0.23
201 0.27
202 0.3
203 0.31
204 0.32
205 0.34
206 0.34
207 0.38
208 0.37
209 0.32
210 0.29
211 0.23
212 0.2
213 0.15
214 0.14
215 0.11
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.09
224 0.08
225 0.1
226 0.08
227 0.1
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.13
270 0.17
271 0.21
272 0.24
273 0.26
274 0.28
275 0.29
276 0.29
277 0.24
278 0.21
279 0.15
280 0.1
281 0.08
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.13
295 0.17
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.15
302 0.11
303 0.06
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.12
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.14
316 0.15
317 0.16
318 0.17
319 0.13
320 0.16
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.16
325 0.17
326 0.17
327 0.18
328 0.18
329 0.24
330 0.26
331 0.29
332 0.28
333 0.28
334 0.25
335 0.24
336 0.2
337 0.15
338 0.15
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.13
344 0.14
345 0.15
346 0.13
347 0.16
348 0.17
349 0.18
350 0.18
351 0.19
352 0.18
353 0.18
354 0.18
355 0.21
356 0.23
357 0.24
358 0.23
359 0.2
360 0.18
361 0.17
362 0.15
363 0.09
364 0.08
365 0.06
366 0.1
367 0.1
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.13
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.09
395 0.09
396 0.11
397 0.13
398 0.11
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.12
406 0.13
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.09
430 0.14
431 0.15
432 0.2
433 0.24
434 0.3
435 0.4
436 0.49
437 0.58
438 0.64
439 0.74
440 0.8
441 0.87
442 0.93
443 0.94
444 0.95
445 0.96
446 0.94
447 0.93
448 0.93
449 0.92
450 0.9
451 0.9
452 0.88
453 0.84
454 0.77
455 0.67
456 0.6
457 0.52
458 0.45
459 0.38
460 0.32
461 0.25
462 0.27
463 0.29
464 0.26
465 0.26
466 0.25
467 0.21
468 0.18
469 0.2
470 0.15
471 0.12
472 0.11
473 0.09
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.11
481 0.12
482 0.13
483 0.12
484 0.13
485 0.17
486 0.18
487 0.19
488 0.19
489 0.24
490 0.32
491 0.43
492 0.49
493 0.51
494 0.55
495 0.63
496 0.69
497 0.69
498 0.69
499 0.67
500 0.69
501 0.69
502 0.66
503 0.57
504 0.49
505 0.46
506 0.41
507 0.36
508 0.27
509 0.19
510 0.16
511 0.21
512 0.21
513 0.18
514 0.15
515 0.15
516 0.2
517 0.2
518 0.21
519 0.17
520 0.17
521 0.17
522 0.17
523 0.15
524 0.09
525 0.1
526 0.12
527 0.13
528 0.16
529 0.15
530 0.15
531 0.15
532 0.16
533 0.16
534 0.14
535 0.16
536 0.18
537 0.26
538 0.31
539 0.37
540 0.4
541 0.43
542 0.44
543 0.42
544 0.4
545 0.32
546 0.27
547 0.21
548 0.18
549 0.14
550 0.12
551 0.11
552 0.09
553 0.07
554 0.08
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.07