Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XVI3

Protein Details
Accession A0A4Y9XVI3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-256SPSIPRRRPRGPQPHKPARPQSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-252PRRRPRGPQPHKPA
Subcellular Location(s) nucl 7, cyto 7, cyto_nucl 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
CDD cd09880  PIN_Smg5-6-like  
Amino Acid Sequences ALAVFERFIPWADLAVFLTAIPRRVTYREQQKERSDSAVLLTSGCKPLPEDWCLRGLGWGGKRVYPMGFWGKEANVEDRNVEVEVLDKSEGGDQLDGIIXDEREENEAANELGKRWIRVARAGLKIAKHVGGFAYYPAANEEQRGQWKVEGVLAAKVAQWQEEEKREREEEERRLRGRRWDEDSMDVDDDEGLAAEELTDGSEDDENDAPEIKALKARRRYLQSLLDSSAQGRVSPSIPRRRPRGPQPHKPARPQSTLRVVPGYTILVIDTNILLSSLPVVSTLVESLQWTVVIPLPVVMELDGLASNATALGEAATAALDYITSHIRSHTTSLKVQTSRGNYLSSLSIRTEQVDFAGDEASWERNMDDLILRAAIWQDEHWIDRSAMLQPDGVSRDTSGAAKVVLLSFDRMLRLKARSRQLSAANEQDMASILAPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.13
4 0.11
5 0.15
6 0.15
7 0.17
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.25
12 0.31
13 0.37
14 0.46
15 0.54
16 0.62
17 0.68
18 0.74
19 0.76
20 0.73
21 0.68
22 0.58
23 0.48
24 0.42
25 0.38
26 0.29
27 0.23
28 0.22
29 0.21
30 0.22
31 0.21
32 0.19
33 0.16
34 0.22
35 0.26
36 0.3
37 0.32
38 0.31
39 0.34
40 0.35
41 0.32
42 0.29
43 0.26
44 0.28
45 0.26
46 0.31
47 0.29
48 0.3
49 0.31
50 0.31
51 0.29
52 0.23
53 0.25
54 0.27
55 0.27
56 0.26
57 0.28
58 0.26
59 0.29
60 0.31
61 0.3
62 0.25
63 0.25
64 0.24
65 0.22
66 0.23
67 0.19
68 0.16
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.15
99 0.16
100 0.17
101 0.19
102 0.22
103 0.22
104 0.26
105 0.33
106 0.34
107 0.37
108 0.4
109 0.41
110 0.38
111 0.38
112 0.36
113 0.3
114 0.22
115 0.19
116 0.15
117 0.14
118 0.13
119 0.11
120 0.12
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.13
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.2
130 0.22
131 0.21
132 0.2
133 0.22
134 0.21
135 0.2
136 0.18
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.15
148 0.23
149 0.26
150 0.26
151 0.3
152 0.3
153 0.32
154 0.35
155 0.39
156 0.41
157 0.46
158 0.51
159 0.51
160 0.55
161 0.55
162 0.58
163 0.57
164 0.54
165 0.52
166 0.5
167 0.48
168 0.47
169 0.47
170 0.4
171 0.34
172 0.27
173 0.2
174 0.14
175 0.12
176 0.08
177 0.05
178 0.03
179 0.03
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.09
198 0.07
199 0.1
200 0.14
201 0.2
202 0.28
203 0.32
204 0.36
205 0.41
206 0.44
207 0.46
208 0.5
209 0.46
210 0.4
211 0.39
212 0.34
213 0.29
214 0.25
215 0.23
216 0.16
217 0.13
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.16
222 0.22
223 0.3
224 0.36
225 0.42
226 0.48
227 0.53
228 0.59
229 0.64
230 0.69
231 0.68
232 0.72
233 0.77
234 0.82
235 0.82
236 0.83
237 0.81
238 0.77
239 0.74
240 0.67
241 0.63
242 0.61
243 0.56
244 0.5
245 0.42
246 0.35
247 0.28
248 0.26
249 0.2
250 0.11
251 0.09
252 0.08
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.05
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.11
314 0.13
315 0.17
316 0.22
317 0.24
318 0.28
319 0.33
320 0.39
321 0.39
322 0.4
323 0.43
324 0.41
325 0.42
326 0.4
327 0.36
328 0.29
329 0.29
330 0.31
331 0.26
332 0.22
333 0.19
334 0.2
335 0.19
336 0.21
337 0.2
338 0.16
339 0.16
340 0.16
341 0.14
342 0.12
343 0.12
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.12
365 0.14
366 0.15
367 0.17
368 0.19
369 0.18
370 0.18
371 0.2
372 0.2
373 0.21
374 0.2
375 0.19
376 0.17
377 0.22
378 0.23
379 0.23
380 0.19
381 0.17
382 0.18
383 0.18
384 0.18
385 0.15
386 0.13
387 0.13
388 0.12
389 0.13
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.15
396 0.18
397 0.18
398 0.2
399 0.24
400 0.3
401 0.37
402 0.43
403 0.52
404 0.56
405 0.6
406 0.64
407 0.67
408 0.68
409 0.65
410 0.64
411 0.56
412 0.49
413 0.44
414 0.38
415 0.31
416 0.24
417 0.18