FuNGI

A0A4Y9XXN0

Protein Details

Accession

A0A4Y9XXN0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
230-252	RSGKDKDKAKKAREASKKRPGRA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
228-251	QFRSGKDKDKAKKAREASKKRPGR

Subcellular Location(s)

plas 13, mito 6, extr 3, cyto 2.5, cyto_nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MEARLRTLAALRIVKGSETRPSFTPPLDASERRDLRDFENRRDLAAGEIWGCVEREQQTHLEAIRDDPEVMWVKLESVHMQKRPGTRFNTCNALLSLSTAEDESLSMLSTRASQLKSDMKALRPQDFDIAKLDNELVLMALIRALPAGYAALRQTLLLDDALTLEKLQDTFVALENQPGALSTIPVLSQVAAAIICAFCGRSGHSEEQCFSKRDASVKAKERVSQRTQFRSGKDKDKAKKAREASKKRPGRAGCVPGVRWSGHSANWNTDTGASAHMMPHRHWFRSYSPHSIPIRLANLHIVYSAGLGSVVFQPAERDXVLPPAVVLHXVLHVPALASNLLSVFHLTXEKGYVVELQAANAFFYQDCELRFEAXVNEHNVGYLXGQTVSQTKNASSASTTCXLDLALWHQRCSHVNLDDLRSAHSKXLVSGLTIXSKRTPDPICXPCLAGKLHXHSIPXFASRKXVRIALVHTDLKGALPTPTPEGYVYWMTFICDASRFWVVAFLKRKSDAFSAFQAFKVYAENTLGLVLKATHDDKGGEYMGKQFVDFCAQHGNQRQHTEPDEPHQNGVAERANRTIAEGGTALLVQSKLPPSFWGHAVSTFVHTRNRMPASSLRGAVPWTVWKGDGRKPDVSYFRAFGCLAYVLVRKKDCKAMQPHTRKCIFVGYPEGTKAWRFWDPAAKKFVISSHAVFDERCFPGNSPFINVFGLPLDEIDVSGPADXXGEPAEDVPDAPELHDQGGDDSDDPAPPAPPPQNXLPLPXNARENFPDRPARPPSPPAXPPPAPXPLRPVVRRQMDNYDGYRPYPAPSRRLPARSTRFQGSLNNDDLQXXXLLPQRFRVDSTXPASTPEPGQRAETPXRNSXSPDPLIDAPLSPPAAVPAPLPEPVSPPSPTSSDDELDFLRGDGHEDALGCSLEAMIAGVEHVYSAEREDFLSYDEALDFXFESVVQNACKADQGHFGKPKXFXXAMKRPPDERGKWLKAAQDEVQSLVENGTFELVQLPPGRKAIGSXWVFRVKRNADGSIERYKGRXXAKGFSQRPGFDYNETFAPTPXWASIRAILALAALEDLELESVDISSAYLNGELXEEVYMQQPEGFEQKTPDWVWXLLKALYGXKQAGRCWHEKLHEVLTKLGFSRLICEHSVWVYLRDGVRIIXXVFVDDITIAAKSKAAIQRVKDDLRTHFKLRDLGPTSWLLGVKIEXDRTKHSLXIXQQQYALXVLERYGXANCDPVSTPMEPGLRLXAEMAPKTSSXVREMQNIPYDQAVGSLFYLAVATRPDXARTVGXXXXXXXXXXXXHWKAVKHLFRYIKGTLDYKLTYSPASDSELFASYTDADHAGCPDTGRSVGCSAPQSDSKGLSRAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.31
3	0.3
4	0.31
5	0.32
6	0.34
7	0.33
8	0.39
9	0.41
10	0.39
11	0.42
12	0.34
13	0.37
14	0.41
15	0.42
16	0.42
17	0.5
18	0.52
19	0.49
20	0.52
21	0.48
22	0.47
23	0.54
24	0.54
25	0.52
26	0.59
27	0.55
28	0.52
29	0.51
30	0.45
31	0.38
32	0.34
33	0.28
34	0.18
35	0.18
36	0.17
37	0.16
38	0.16
39	0.13
40	0.15
41	0.17
42	0.18
43	0.21
44	0.23
45	0.23
46	0.27
47	0.27
48	0.26
49	0.23
50	0.24
51	0.24
52	0.23
53	0.22
54	0.18
55	0.23
56	0.24
57	0.23
58	0.22
59	0.19
60	0.18
61	0.2
62	0.22
63	0.21
64	0.25
65	0.33
66	0.36
67	0.4
68	0.45
69	0.51
70	0.56
71	0.6
72	0.58
73	0.58
74	0.6
75	0.6
76	0.62
77	0.55
78	0.51
79	0.44
80	0.4
81	0.31
82	0.28
83	0.24
84	0.17
85	0.16
86	0.12
87	0.12
88	0.09
89	0.09
90	0.08
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.07
96	0.09
97	0.12
98	0.17
99	0.17
100	0.18
101	0.24
102	0.32
103	0.34
104	0.4
105	0.42
106	0.41
107	0.48
108	0.52
109	0.52
110	0.48
111	0.47
112	0.47
113	0.43
114	0.4
115	0.36
116	0.33
117	0.26
118	0.25
119	0.23
120	0.15
121	0.14
122	0.12
123	0.09
124	0.06
125	0.06
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.05
135	0.05
136	0.07
137	0.08
138	0.09
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.11
144	0.09
145	0.09
146	0.08
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.08
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.08
156	0.09
157	0.1
158	0.13
159	0.17
160	0.16
161	0.17
162	0.17
163	0.17
164	0.15
165	0.14
166	0.13
167	0.08
168	0.09
169	0.07
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.09
188	0.12
189	0.18
190	0.25
191	0.29
192	0.32
193	0.33
194	0.4
195	0.42
196	0.41
197	0.36
198	0.35
199	0.33
200	0.34
201	0.42
202	0.43
203	0.48
204	0.55
205	0.6
206	0.58
207	0.61
208	0.63
209	0.63
210	0.63
211	0.62
212	0.62
213	0.63
214	0.69
215	0.69
216	0.67
217	0.68
218	0.66
219	0.68
220	0.68
221	0.69
222	0.69
223	0.75
224	0.8
225	0.76
226	0.79
227	0.77
228	0.78
229	0.79
230	0.81
231	0.81
232	0.82
233	0.84
234	0.79
235	0.8
236	0.72
237	0.69
238	0.68
239	0.65
240	0.6
241	0.58
242	0.54
243	0.5
244	0.5
245	0.43
246	0.35
247	0.33
248	0.29
249	0.26
250	0.32
251	0.3
252	0.32
253	0.34
254	0.33
255	0.28
256	0.27
257	0.25
258	0.18
259	0.17
260	0.13
261	0.11
262	0.12
263	0.15
264	0.17
265	0.17
266	0.26
267	0.29
268	0.31
269	0.32
270	0.33
271	0.35
272	0.44
273	0.48
274	0.47
275	0.45
276	0.51
277	0.52
278	0.51
279	0.47
280	0.42
281	0.41
282	0.33
283	0.31
284	0.26
285	0.25
286	0.22
287	0.2
288	0.15
289	0.11
290	0.11
291	0.1
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.05
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.11
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.12
307	0.12
308	0.11
309	0.11
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.08
331	0.08
332	0.09
333	0.1
334	0.1
335	0.11
336	0.1
337	0.1
338	0.13
339	0.13
340	0.12
341	0.13
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.07
347	0.09
348	0.11
349	0.1
350	0.11
351	0.14
352	0.15
353	0.16
354	0.16
355	0.15
356	0.17
357	0.18
358	0.21
359	0.18
360	0.18
361	0.16
362	0.16
363	0.15
364	0.11
365	0.11
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.11
370	0.12
371	0.15
372	0.16
373	0.14
374	0.17
375	0.17
376	0.17
377	0.16
378	0.16
379	0.16
380	0.17
381	0.17
382	0.13
383	0.13
384	0.12
385	0.11
386	0.13
387	0.2
388	0.21
389	0.22
390	0.23
391	0.25
392	0.27
393	0.31
394	0.33
395	0.25
396	0.28
397	0.29
398	0.32
399	0.32
400	0.3
401	0.29
402	0.25
403	0.24
404	0.21
405	0.18
406	0.16
407	0.14
408	0.15
409	0.13
410	0.11
411	0.16
412	0.18
413	0.21
414	0.2
415	0.22
416	0.21
417	0.25
418	0.26
419	0.28
420	0.31
421	0.31
422	0.33
423	0.31
424	0.31
425	0.31
426	0.31
427	0.25
428	0.22
429	0.25
430	0.26
431	0.28
432	0.28
433	0.25
434	0.28
435	0.34
436	0.33
437	0.3
438	0.29
439	0.28
440	0.3
441	0.32
442	0.28
443	0.25
444	0.27
445	0.28
446	0.3
447	0.28
448	0.26
449	0.23
450	0.22
451	0.18
452	0.14
453	0.11
454	0.08
455	0.09
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.12
460	0.12
461	0.14
462	0.15
463	0.14
464	0.13
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.12
469	0.09
470	0.08
471	0.08
472	0.1
473	0.11
474	0.1
475	0.1
476	0.16
477	0.15
478	0.21
479	0.27
480	0.27
481	0.28
482	0.3
483	0.3
484	0.27
485	0.3
486	0.26
487	0.23
488	0.25
489	0.27
490	0.26
491	0.26
492	0.24
493	0.2
494	0.17
495	0.16
496	0.12
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.09
501	0.1
502	0.1
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.06
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.12
514	0.12
515	0.1
516	0.1
517	0.12
518	0.14
519	0.13
520	0.13
521	0.11
522	0.11
523	0.15
524	0.15
525	0.13
526	0.18
527	0.18
528	0.23
529	0.3
530	0.34
531	0.33
532	0.36
533	0.37
534	0.33
535	0.35
536	0.35
537	0.29
538	0.3
539	0.33
540	0.31
541	0.3
542	0.28
543	0.26
544	0.21
545	0.23
546	0.21
547	0.15
548	0.15
549	0.16
550	0.15
551	0.14
552	0.15
553	0.14
554	0.1
555	0.1
556	0.09
557	0.08
558	0.07
559	0.07
560	0.06
561	0.05
562	0.06
563	0.04
564	0.06
565	0.08
566	0.08
567	0.08
568	0.1
569	0.13
570	0.15
571	0.16
572	0.18
573	0.16
574	0.16
575	0.18
576	0.17
577	0.16
578	0.16
579	0.16
580	0.16
581	0.17
582	0.17
583	0.22
584	0.24
585	0.21
586	0.22
587	0.25
588	0.29
589	0.3
590	0.3
591	0.24
592	0.22
593	0.22
594	0.2
595	0.16
596	0.11
597	0.1
598	0.09
599	0.1
600	0.12
601	0.15
602	0.2
603	0.25
604	0.28
605	0.3
606	0.31
607	0.35
608	0.37
609	0.36
610	0.33
611	0.28
612	0.24
613	0.22
614	0.21
615	0.16
616	0.13
617	0.1
618	0.08
619	0.09
620	0.12
621	0.11
622	0.14
623	0.16
624	0.16
625	0.18
626	0.25
627	0.25
628	0.3
629	0.37
630	0.43
631	0.52
632	0.61
633	0.64
634	0.64
635	0.64
636	0.57
637	0.49
638	0.46
639	0.36
640	0.28
641	0.28
642	0.23
643	0.21
644	0.22
645	0.21
646	0.16
647	0.16
648	0.14
649	0.12
650	0.13
651	0.13
652	0.14
653	0.23
654	0.26
655	0.3
656	0.34
657	0.31
658	0.29
659	0.28
660	0.28
661	0.21
662	0.21
663	0.17
664	0.14
665	0.15
666	0.15
667	0.15
668	0.14
669	0.17
670	0.15
671	0.15
672	0.14
673	0.14
674	0.17
675	0.21
676	0.2
677	0.17
678	0.17
679	0.16
680	0.16
681	0.15
682	0.12
683	0.09
684	0.08
685	0.06
686	0.05
687	0.05
688	0.04
689	0.05
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.03
696	0.04
697	0.03
698	0.04
699	0.04
700	0.04
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.08
709	0.07
710	0.08
711	0.08
712	0.08
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.06
717	0.07
718	0.07
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.1
725	0.11
726	0.12
727	0.14
728	0.17
729	0.24
730	0.25
731	0.28
732	0.31
733	0.34
734	0.38
735	0.37
736	0.34
737	0.32
738	0.35
739	0.34
740	0.33
741	0.35
742	0.31
743	0.36
744	0.42
745	0.41
746	0.4
747	0.42
748	0.41
749	0.43
750	0.44
751	0.42
752	0.4
753	0.38
754	0.4
755	0.42
756	0.4
757	0.34
758	0.37
759	0.39
760	0.4
761	0.42
762	0.47
763	0.44
764	0.45
765	0.46
766	0.46
767	0.43
768	0.41
769	0.4
770	0.35
771	0.31
772	0.29
773	0.28
774	0.22
775	0.2
776	0.25
777	0.26
778	0.27
779	0.29
780	0.36
781	0.4
782	0.43
783	0.45
784	0.46
785	0.51
786	0.52
787	0.53
788	0.5
789	0.46
790	0.44
791	0.46
792	0.42
793	0.39
794	0.35
795	0.32
796	0.28
797	0.26
798	0.24
799	0.2
800	0.19
801	0.15
802	0.13
803	0.15
804	0.16
805	0.16
806	0.18
807	0.18
808	0.18
809	0.2
810	0.23
811	0.24
812	0.24
813	0.26
814	0.25
815	0.24
816	0.24
817	0.24
818	0.22
819	0.21
820	0.24
821	0.28
822	0.34
823	0.38
824	0.38
825	0.4
826	0.43
827	0.42
828	0.39
829	0.35
830	0.3
831	0.28
832	0.23
833	0.21
834	0.17
835	0.16
836	0.16
837	0.16
838	0.14
839	0.1
840	0.09
841	0.09
842	0.09
843	0.09
844	0.09
845	0.09
846	0.1
847	0.11
848	0.13
849	0.12
850	0.14
851	0.16
852	0.19
853	0.17
854	0.17
855	0.18
856	0.19
857	0.2
858	0.22
859	0.23
860	0.21
861	0.2
862	0.2
863	0.18
864	0.18
865	0.16
866	0.11
867	0.09
868	0.08
869	0.1
870	0.09
871	0.09
872	0.08
873	0.09
874	0.09
875	0.09
876	0.09
877	0.07
878	0.06
879	0.05
880	0.05
881	0.04
882	0.04
883	0.02
884	0.02
885	0.03
886	0.03
887	0.02
888	0.02
889	0.03
890	0.03
891	0.03
892	0.05
893	0.06
894	0.06
895	0.07
896	0.08
897	0.08
898	0.09
899	0.1
900	0.09
901	0.09
902	0.09
903	0.08
904	0.08
905	0.08
906	0.07
907	0.05
908	0.08
909	0.07
910	0.07
911	0.1
912	0.1
913	0.1
914	0.11
915	0.11
916	0.11
917	0.12
918	0.14
919	0.21
920	0.25
921	0.32
922	0.39
923	0.4
924	0.4
925	0.41
926	0.47
927	0.44
928	0.46
929	0.48
930	0.47
931	0.57
932	0.59
933	0.66
934	0.67
935	0.64
936	0.67
937	0.67
938	0.66
939	0.59
940	0.57
941	0.52
942	0.46
943	0.47
944	0.41
945	0.36
946	0.32
947	0.29
948	0.27
949	0.23
950	0.2
951	0.16
952	0.13
953	0.08
954	0.08
955	0.07
956	0.06
957	0.06
958	0.08
959	0.07
960	0.1
961	0.13
962	0.15
963	0.16
964	0.17
965	0.18
966	0.16
967	0.16
968	0.22
969	0.27
970	0.28
971	0.3
972	0.38
973	0.41
974	0.45
975	0.5
976	0.43
977	0.42
978	0.44
979	0.43
980	0.37
981	0.39
982	0.4
983	0.43
984	0.44
985	0.36
986	0.34
987	0.35
988	0.36
989	0.35
990	0.37
991	0.32
992	0.4
993	0.48
994	0.56
995	0.58
996	0.55
997	0.54
998	0.52
999	0.51
1000	0.44
1001	0.38
1002	0.31
1003	0.27
1004	0.27
1005	0.24
1006	0.2
1007	0.22
1008	0.18
1009	0.18
1010	0.16
1011	0.16
1012	0.15
1013	0.15
1014	0.16
1015	0.12
1016	0.12
1017	0.1
1018	0.09
1019	0.07
1020	0.06
1021	0.05
1022	0.04
1023	0.03
1024	0.03
1025	0.03
1026	0.03
1027	0.03
1028	0.03
1029	0.03
1030	0.03
1031	0.04
1032	0.04
1033	0.04
1034	0.04
1035	0.04
1036	0.05
1037	0.05
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.06
1041	0.06
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.07
1048	0.07
1049	0.07
1050	0.09
1051	0.12
1052	0.12
1053	0.13
1054	0.16
1055	0.17
1056	0.23
1057	0.23
1058	0.23
1059	0.22
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.23
1063	0.23
1064	0.2
1065	0.23
1066	0.22
1067	0.24
1068	0.28
1069	0.29
1070	0.29
1071	0.33
1072	0.35
1073	0.38
1074	0.41
1075	0.41
1076	0.43
1077	0.44
1078	0.44
1079	0.43
1080	0.47
1081	0.45
1082	0.42
1083	0.42
1084	0.37
1085	0.36
1086	0.32
1087	0.29
1088	0.23
1089	0.19
1090	0.22
1091	0.2
1092	0.22
1093	0.21
1094	0.22
1095	0.22
1096	0.21
1097	0.25
1098	0.21
1099	0.2
1100	0.18
1101	0.21
1102	0.21
1103	0.2
1104	0.19
1105	0.16
1106	0.16
1107	0.14
1108	0.13
1109	0.09
1110	0.09
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.07
1114	0.06
1115	0.07
1116	0.06
1117	0.06
1118	0.07
1119	0.07
1120	0.07
1121	0.14
1122	0.19
1123	0.25
1124	0.3
1125	0.33
1126	0.41
1127	0.47
1128	0.51
1129	0.49
1130	0.49
1131	0.51
1132	0.55
1133	0.58
1134	0.54
1135	0.51
1136	0.5
1137	0.52
1138	0.49
1139	0.51
1140	0.48
1141	0.43
1142	0.42
1143	0.4
1144	0.37
1145	0.33
1146	0.32
1147	0.22
1148	0.17
1149	0.18
1150	0.18
1151	0.23
1152	0.25
1153	0.26
1154	0.31
1155	0.37
1156	0.38
1157	0.4
1158	0.43
1159	0.44
1160	0.45
1161	0.48
1162	0.44
1163	0.38
1164	0.37
1165	0.34
1166	0.3
1167	0.22
1168	0.18
1169	0.12
1170	0.14
1171	0.14
1172	0.17
1173	0.16
1174	0.17
1175	0.17
1176	0.19
1177	0.19
1178	0.18
1179	0.21
1180	0.18
1181	0.19
1182	0.22
1183	0.23
1184	0.22
1185	0.22
1186	0.22
1187	0.18
1188	0.17
1189	0.17
1190	0.19
1191	0.18
1192	0.21
1193	0.2
1194	0.2
1195	0.22
1196	0.23
1197	0.26
1198	0.22
1199	0.27
1200	0.29
1201	0.33
1202	0.36
1203	0.43
1204	0.43
1205	0.4
1206	0.37
1207	0.32
1208	0.28
1209	0.25
1210	0.2
1211	0.13
1212	0.11
1213	0.1
1214	0.09
1215	0.08
1216	0.09
1217	0.07
1218	0.08
1219	0.08
1220	0.1
1221	0.15
1222	0.17
1223	0.19
1224	0.19
1225	0.21
1226	0.26
1227	0.33
1228	0.37
1229	0.39
1230	0.41
1231	0.4
1232	0.48
1233	0.56
1234	0.55
1235	0.51
1236	0.54
1237	0.54
1238	0.55
1239	0.61
1240	0.54
1241	0.51
1242	0.49
1243	0.48
1244	0.41
1245	0.39
1246	0.36
1247	0.32
1248	0.32
1249	0.28
1250	0.24
1251	0.23
1252	0.23
1253	0.19
1254	0.24
1255	0.23
1256	0.21
1257	0.22
1258	0.23
1259	0.22
1260	0.2
1261	0.19
1262	0.14
1263	0.14
1264	0.14
1265	0.12
1266	0.11
1267	0.11
1268	0.12
1269	0.13
1270	0.13
1271	0.14
1272	0.13
1273	0.15
1274	0.16
1275	0.17
1276	0.18
1277	0.18
1278	0.19
1279	0.22
1280	0.24
1281	0.24
1282	0.28
1283	0.31
1284	0.33
1285	0.34
1286	0.37
1287	0.36

A0A4Y9XXN0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer