FuNGI

A0A4Y9YF13

Protein Details

Accession

A0A4Y9YF13

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
649-677	EKRHRKYETFEKRQRLREKEKLKHEQYKL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
390-430	RGRGRGRSNAPARGRRDDHGRGRGRGRGRGRERGRGRGRGR
660-669	KRQRLREKEK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR029332 PEHE_dom IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MDSGLAFKVPSIVPQDLQLIQGIVGELPVPSTSKAPANSVTAKNDELIDSSDSDADSEQEVEADILGGLEDEAEEPSGPTSSESISDSDSSSDSDSDESSADKRRTTAKAPADEGDLDDADETGPAVTSAAQLRTKNEIEESEIVVPTIEEVSPHEALEKVGEVMSIVDRVVIVKGSASEIATRASERALDSDTLLVFEDRRVLGYIYETFGPTSQPLYQVKFNDKYPLDPEKVKVSRAVFHVPERSNFVFVRALRQIKGSDASNINDEEPAEDEMEYSDDEAEAAAKRTRTQRHRSRSAASSRHTTPIPSMRRDADMAEDDTSGASPYSERDPYNDLDYGAGPSRPAPMPYDDPYADNYGVPETSPAVTSGSQGRDDHRSESGEAYADRGRGRGRSNAPARGRRDDHGRGRGRGRGRGRERGRGRGRGRDDRQSWGGGDRGPQMRSSPHDEYDVQQRRSMSPTSLAIARATGQYSDEASMAQDMQHHPDASQHMNGGGWGGQYPPQQQFNFPGYGYQNQYVQPHINPRFASTFAMNFGFAQANQYAPYGNAGAVENEPLIPATTKFLLTTNSSLVPSTSDAPNFEVEINTHAYGRYFDRPEVQKAYKEQQLIQTPEFTQLDEDASVGGRFRPRVAEDEPADTSDAAYEKRHRKYETFEKRQRLREKEKLKHEQYKLKERIDQLRGMDPSAFLTLPASDFPPPPDVPPDDVVEQNGDGIELGGLHPHGAAQVEGERRRKEMLAIASSLEDRYRTLLNPDKKPPEKKYGSHAVSEVVASDSEPEPEENDEMQEEAAEVEEEEEVDELDQSEEADTMLPQRPSYHDESGESEVDFDERDRQRSKGLKLKIKFPPRTPAQLKDALSKSTTKKKETDHAVTIHEACTRGEPEGGRPESDQNARDDIHPHHHRLCPAARSWSQWQVPAERQGARQRKSYEGTPPKTPTHRQPGVLHASDEANERRVDLLRSGAAGKQEQTTCVLMAAALRNSAAPNVRKTRRNVLAFGARVPPEIELVRDFEVPEWVLNQDTEDDAQDELSLDGGPPDEYRSLSRDFKRESVASERNGLLSRANEEDTVQIAYLEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.28
3	0.25
4	0.26
5	0.23
6	0.17
7	0.15
8	0.15
9	0.13
10	0.09
11	0.08
12	0.07
13	0.06
14	0.07
15	0.07
16	0.08
17	0.09
18	0.11
19	0.14
20	0.19
21	0.21
22	0.24
23	0.27
24	0.31
25	0.38
26	0.41
27	0.43
28	0.41
29	0.4
30	0.37
31	0.35
32	0.29
33	0.24
34	0.22
35	0.19
36	0.17
37	0.17
38	0.17
39	0.16
40	0.15
41	0.14
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.08
50	0.07
51	0.06
52	0.05
53	0.05
54	0.05
55	0.04
56	0.04
57	0.04
58	0.04
59	0.05
60	0.06
61	0.06
62	0.06
63	0.08
64	0.08
65	0.08
66	0.09
67	0.1
68	0.1
69	0.12
70	0.13
71	0.13
72	0.15
73	0.16
74	0.16
75	0.16
76	0.16
77	0.15
78	0.15
79	0.14
80	0.13
81	0.13
82	0.13
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.14
87	0.22
88	0.23
89	0.24
90	0.26
91	0.32
92	0.37
93	0.41
94	0.47
95	0.47
96	0.52
97	0.54
98	0.53
99	0.5
100	0.45
101	0.4
102	0.34
103	0.25
104	0.18
105	0.15
106	0.13
107	0.1
108	0.09
109	0.08
110	0.05
111	0.05
112	0.04
113	0.05
114	0.05
115	0.07
116	0.11
117	0.15
118	0.2
119	0.21
120	0.24
121	0.31
122	0.32
123	0.31
124	0.3
125	0.27
126	0.28
127	0.29
128	0.29
129	0.25
130	0.24
131	0.22
132	0.19
133	0.18
134	0.13
135	0.12
136	0.08
137	0.06
138	0.08
139	0.14
140	0.14
141	0.14
142	0.15
143	0.14
144	0.14
145	0.15
146	0.14
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.07
163	0.09
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.12
169	0.13
170	0.13
171	0.12
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.13
176	0.14
177	0.14
178	0.14
179	0.16
180	0.15
181	0.14
182	0.14
183	0.12
184	0.1
185	0.1
186	0.13
187	0.11
188	0.12
189	0.13
190	0.12
191	0.13
192	0.15
193	0.16
194	0.15
195	0.15
196	0.15
197	0.14
198	0.14
199	0.14
200	0.12
201	0.13
202	0.12
203	0.17
204	0.2
205	0.23
206	0.28
207	0.31
208	0.38
209	0.39
210	0.39
211	0.42
212	0.4
213	0.4
214	0.41
215	0.44
216	0.41
217	0.4
218	0.41
219	0.42
220	0.44
221	0.41
222	0.4
223	0.35
224	0.36
225	0.37
226	0.41
227	0.34
228	0.37
229	0.44
230	0.4
231	0.4
232	0.42
233	0.39
234	0.36
235	0.33
236	0.31
237	0.29
238	0.27
239	0.32
240	0.31
241	0.33
242	0.3
243	0.32
244	0.3
245	0.27
246	0.3
247	0.24
248	0.23
249	0.23
250	0.24
251	0.24
252	0.24
253	0.22
254	0.2
255	0.18
256	0.14
257	0.13
258	0.12
259	0.11
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.1
264	0.09
265	0.07
266	0.06
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.06
272	0.08
273	0.1
274	0.11
275	0.15
276	0.23
277	0.32
278	0.4
279	0.5
280	0.58
281	0.66
282	0.75
283	0.76
284	0.75
285	0.74
286	0.74
287	0.71
288	0.64
289	0.6
290	0.53
291	0.52
292	0.46
293	0.39
294	0.34
295	0.36
296	0.39
297	0.36
298	0.37
299	0.35
300	0.37
301	0.37
302	0.32
303	0.27
304	0.24
305	0.22
306	0.2
307	0.18
308	0.16
309	0.15
310	0.14
311	0.1
312	0.07
313	0.05
314	0.05
315	0.06
316	0.1
317	0.13
318	0.13
319	0.16
320	0.19
321	0.21
322	0.24
323	0.23
324	0.2
325	0.18
326	0.18
327	0.17
328	0.15
329	0.14
330	0.1
331	0.1
332	0.13
333	0.13
334	0.13
335	0.14
336	0.16
337	0.21
338	0.24
339	0.29
340	0.26
341	0.26
342	0.27
343	0.28
344	0.24
345	0.19
346	0.17
347	0.13
348	0.12
349	0.11
350	0.09
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.1
358	0.14
359	0.15
360	0.17
361	0.17
362	0.19
363	0.23
364	0.24
365	0.25
366	0.23
367	0.23
368	0.22
369	0.22
370	0.21
371	0.17
372	0.15
373	0.16
374	0.15
375	0.15
376	0.14
377	0.14
378	0.15
379	0.17
380	0.19
381	0.24
382	0.27
383	0.34
384	0.39
385	0.46
386	0.52
387	0.56
388	0.58
389	0.58
390	0.57
391	0.5
392	0.53
393	0.53
394	0.54
395	0.57
396	0.57
397	0.54
398	0.54
399	0.57
400	0.53
401	0.53
402	0.51
403	0.52
404	0.53
405	0.59
406	0.6
407	0.64
408	0.64
409	0.67
410	0.67
411	0.67
412	0.64
413	0.63
414	0.66
415	0.66
416	0.66
417	0.65
418	0.61
419	0.56
420	0.55
421	0.47
422	0.4
423	0.31
424	0.28
425	0.19
426	0.19
427	0.19
428	0.2
429	0.2
430	0.2
431	0.19
432	0.2
433	0.23
434	0.28
435	0.26
436	0.24
437	0.26
438	0.26
439	0.27
440	0.36
441	0.41
442	0.34
443	0.33
444	0.33
445	0.31
446	0.34
447	0.33
448	0.23
449	0.17
450	0.17
451	0.17
452	0.17
453	0.16
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.07
461	0.07
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.07
466	0.06
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.08
471	0.08
472	0.11
473	0.13
474	0.13
475	0.12
476	0.15
477	0.18
478	0.17
479	0.17
480	0.14
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.09
485	0.07
486	0.05
487	0.04
488	0.05
489	0.08
490	0.09
491	0.12
492	0.14
493	0.19
494	0.19
495	0.2
496	0.24
497	0.24
498	0.24
499	0.21
500	0.21
501	0.18
502	0.21
503	0.22
504	0.19
505	0.18
506	0.18
507	0.19
508	0.18
509	0.18
510	0.16
511	0.23
512	0.25
513	0.26
514	0.24
515	0.26
516	0.26
517	0.25
518	0.25
519	0.17
520	0.15
521	0.13
522	0.13
523	0.11
524	0.09
525	0.1
526	0.08
527	0.07
528	0.09
529	0.07
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.06
535	0.07
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.07
541	0.06
542	0.07
543	0.06
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.04
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.07
554	0.08
555	0.1
556	0.11
557	0.12
558	0.12
559	0.12
560	0.13
561	0.12
562	0.11
563	0.1
564	0.1
565	0.11
566	0.1
567	0.1
568	0.1
569	0.12
570	0.12
571	0.12
572	0.11
573	0.09
574	0.08
575	0.1
576	0.11
577	0.1
578	0.1
579	0.09
580	0.09
581	0.1
582	0.13
583	0.16
584	0.16
585	0.16
586	0.22
587	0.25
588	0.29
589	0.34
590	0.33
591	0.31
592	0.33
593	0.37
594	0.34
595	0.33
596	0.31
597	0.31
598	0.36
599	0.36
600	0.32
601	0.3
602	0.27
603	0.29
604	0.28
605	0.21
606	0.15
607	0.12
608	0.12
609	0.1
610	0.1
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.09
619	0.11
620	0.12
621	0.17
622	0.19
623	0.24
624	0.23
625	0.26
626	0.26
627	0.24
628	0.23
629	0.19
630	0.16
631	0.11
632	0.1
633	0.08
634	0.1
635	0.17
636	0.24
637	0.3
638	0.35
639	0.37
640	0.39
641	0.46
642	0.55
643	0.59
644	0.62
645	0.64
646	0.69
647	0.73
648	0.8
649	0.81
650	0.79
651	0.77
652	0.76
653	0.78
654	0.77
655	0.8
656	0.81
657	0.8
658	0.8
659	0.78
660	0.76
661	0.73
662	0.75
663	0.72
664	0.65
665	0.62
666	0.56
667	0.59
668	0.54
669	0.51
670	0.42
671	0.41
672	0.39
673	0.34
674	0.3
675	0.21
676	0.19
677	0.17
678	0.14
679	0.08
680	0.08
681	0.07
682	0.08
683	0.08
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.11
688	0.15
689	0.16
690	0.16
691	0.19
692	0.2
693	0.21
694	0.23
695	0.23
696	0.2
697	0.2
698	0.2
699	0.17
700	0.14
701	0.12
702	0.1
703	0.07
704	0.05
705	0.05
706	0.04
707	0.03
708	0.03
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.05
718	0.09
719	0.15
720	0.2
721	0.26
722	0.27
723	0.28
724	0.3
725	0.29
726	0.27
727	0.27
728	0.28
729	0.25
730	0.25
731	0.24
732	0.23
733	0.23
734	0.21
735	0.16
736	0.1
737	0.08
738	0.09
739	0.1
740	0.1
741	0.16
742	0.25
743	0.32
744	0.39
745	0.46
746	0.54
747	0.6
748	0.68
749	0.67
750	0.69
751	0.68
752	0.64
753	0.64
754	0.65
755	0.6
756	0.53
757	0.48
758	0.38
759	0.32
760	0.29
761	0.22
762	0.12
763	0.09
764	0.07
765	0.09
766	0.08
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.1
771	0.11
772	0.13
773	0.11
774	0.11
775	0.11
776	0.1
777	0.1
778	0.09
779	0.07
780	0.05
781	0.05
782	0.04
783	0.04
784	0.04
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.05
794	0.05
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.06
800	0.05
801	0.09
802	0.13
803	0.14
804	0.14
805	0.15
806	0.18
807	0.23
808	0.29
809	0.29
810	0.27
811	0.28
812	0.32
813	0.34
814	0.32
815	0.26
816	0.21
817	0.17
818	0.15
819	0.14
820	0.11
821	0.16
822	0.17
823	0.23
824	0.25
825	0.26
826	0.34
827	0.41
828	0.48
829	0.47
830	0.54
831	0.58
832	0.59
833	0.67
834	0.69
835	0.72
836	0.72
837	0.68
838	0.68
839	0.65
840	0.72
841	0.68
842	0.64
843	0.6
844	0.6
845	0.57
846	0.56
847	0.52
848	0.44
849	0.41
850	0.41
851	0.41
852	0.44
853	0.48
854	0.44
855	0.48
856	0.51
857	0.58
858	0.61
859	0.62
860	0.58
861	0.55
862	0.53
863	0.51
864	0.46
865	0.39
866	0.32
867	0.25
868	0.2
869	0.2
870	0.19
871	0.16
872	0.18
873	0.17
874	0.2
875	0.29
876	0.3
877	0.28
878	0.29
879	0.31
880	0.34
881	0.38
882	0.35
883	0.29
884	0.31
885	0.3
886	0.3
887	0.31
888	0.29
889	0.35
890	0.38
891	0.4
892	0.43
893	0.46
894	0.46
895	0.48
896	0.5
897	0.45
898	0.43
899	0.46
900	0.42
901	0.44
902	0.48
903	0.51
904	0.47
905	0.47
906	0.46
907	0.44
908	0.47
909	0.48
910	0.47
911	0.41
912	0.45
913	0.5
914	0.57
915	0.54
916	0.57
917	0.53
918	0.56
919	0.57
920	0.55
921	0.56
922	0.57
923	0.59
924	0.59
925	0.61
926	0.61
927	0.64
928	0.66
929	0.65
930	0.65
931	0.66
932	0.63
933	0.62
934	0.63
935	0.64
936	0.6
937	0.5
938	0.41
939	0.37
940	0.32
941	0.34
942	0.27
943	0.21
944	0.2
945	0.19
946	0.2
947	0.21
948	0.22
949	0.19
950	0.2
951	0.18
952	0.2
953	0.21
954	0.21
955	0.22
956	0.22
957	0.22
958	0.25
959	0.25
960	0.24
961	0.26
962	0.25
963	0.22
964	0.2
965	0.18
966	0.12
967	0.14
968	0.17
969	0.14
970	0.13
971	0.13
972	0.14
973	0.14
974	0.18
975	0.21
976	0.22
977	0.3
978	0.39
979	0.47
980	0.53
981	0.59
982	0.66
983	0.69
984	0.69
985	0.64
986	0.62
987	0.63
988	0.58
989	0.55
990	0.51
991	0.42
992	0.38
993	0.36
994	0.28
995	0.23
996	0.22
997	0.21
998	0.16
999	0.19
1000	0.2
1001	0.2
1002	0.2
1003	0.17
1004	0.2
1005	0.19
1006	0.17
1007	0.16
1008	0.14
1009	0.15
1010	0.14
1011	0.15
1012	0.12
1013	0.13
1014	0.13
1015	0.13
1016	0.13
1017	0.12
1018	0.12
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.09
1022	0.09
1023	0.07
1024	0.06
1025	0.07
1026	0.08
1027	0.08
1028	0.08
1029	0.11
1030	0.12
1031	0.14
1032	0.17
1033	0.2
1034	0.25
1035	0.33
1036	0.39
1037	0.45
1038	0.48
1039	0.51
1040	0.55
1041	0.54
1042	0.53
1043	0.54
1044	0.55
1045	0.49
1046	0.49
1047	0.46
1048	0.42
1049	0.42
1050	0.37
1051	0.31
1052	0.26
1053	0.27
1054	0.25
1055	0.26
1056	0.23
1057	0.22
1058	0.23
1059	0.21
1060	0.2
1061	0.16

A0A4Y9YF13

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer