Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XTX3

Protein Details
Accession A0A4Y9XTX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
469-499GHLLRNCPEKRQNPKFTQRNRTSPRRVSASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-149ERIRKIQNXRPKP
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MWTAHNLSLALIGHLLETQSNWYVICMYTKPAQSPHIFTHASGVPLRLGDSPSTTDYRVEIEPVTYGLPTLPNLWWNDDLRLFEYQKDSGEHRPVFVQEPEQEGEKRIWAFFPGSVPLEEQQKQTRAYLDTKGKAAERIRKIQNXRPKPATPAAIRRELSKHEATSPAVGTSPLVHVVPEVGTSSLTQYSSNLATGVEKKPLEPELETQSNEPEPEPESEPESDDAMSTTRTNTATKLEVPAPDKFKGQATDAKPFIRRLEMYYSATGNADANDQRKIAYALLLIDDNSDAFYWKKLHMDGEADAQEEGKHAFESWKDFKEAFLKAFPVYAEGDRDSIMLTTLKQGKTPTPAFIPKFRSIASRTDLSDKTLSGFFKRAIRRDLLDKAMNMEPPTTLQGWFDLVLRLDSRQIYNTNYYEGGNSGGNNHRSSYPSGRGSGRLDEPMEIDAMDQRERQRHQELGLCFGCHKPGHLLRNCPEKRQNPKFTQRNRTSPRRVSASSAHVREVTPAYVREVFQELPLEERAPLFEQMSKDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.08
4 0.08
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.17
13 0.15
14 0.17
15 0.23
16 0.26
17 0.29
18 0.32
19 0.38
20 0.38
21 0.43
22 0.43
23 0.44
24 0.42
25 0.38
26 0.41
27 0.36
28 0.35
29 0.3
30 0.27
31 0.21
32 0.2
33 0.22
34 0.18
35 0.17
36 0.16
37 0.17
38 0.19
39 0.22
40 0.24
41 0.24
42 0.22
43 0.21
44 0.24
45 0.22
46 0.2
47 0.17
48 0.15
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.16
60 0.18
61 0.21
62 0.25
63 0.25
64 0.28
65 0.28
66 0.28
67 0.26
68 0.31
69 0.28
70 0.27
71 0.29
72 0.26
73 0.26
74 0.27
75 0.28
76 0.3
77 0.38
78 0.35
79 0.33
80 0.34
81 0.34
82 0.35
83 0.33
84 0.31
85 0.24
86 0.28
87 0.28
88 0.29
89 0.28
90 0.25
91 0.25
92 0.23
93 0.22
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.18
98 0.17
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.23
106 0.24
107 0.26
108 0.29
109 0.32
110 0.32
111 0.32
112 0.34
113 0.31
114 0.33
115 0.37
116 0.39
117 0.38
118 0.38
119 0.39
120 0.36
121 0.39
122 0.42
123 0.43
124 0.41
125 0.47
126 0.55
127 0.61
128 0.69
129 0.73
130 0.76
131 0.76
132 0.76
133 0.73
134 0.71
135 0.65
136 0.65
137 0.6
138 0.61
139 0.55
140 0.57
141 0.52
142 0.47
143 0.48
144 0.43
145 0.44
146 0.38
147 0.35
148 0.3
149 0.32
150 0.3
151 0.29
152 0.26
153 0.2
154 0.16
155 0.15
156 0.12
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.09
179 0.08
180 0.1
181 0.14
182 0.15
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.19
187 0.21
188 0.21
189 0.18
190 0.2
191 0.22
192 0.25
193 0.25
194 0.23
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.18
199 0.12
200 0.11
201 0.13
202 0.15
203 0.14
204 0.16
205 0.16
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.13
210 0.1
211 0.1
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.17
224 0.16
225 0.19
226 0.21
227 0.24
228 0.26
229 0.25
230 0.25
231 0.23
232 0.23
233 0.21
234 0.21
235 0.24
236 0.23
237 0.28
238 0.3
239 0.31
240 0.31
241 0.31
242 0.29
243 0.25
244 0.22
245 0.19
246 0.23
247 0.24
248 0.24
249 0.24
250 0.23
251 0.2
252 0.2
253 0.17
254 0.12
255 0.09
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.14
291 0.13
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.07
299 0.08
300 0.15
301 0.18
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.22
306 0.26
307 0.26
308 0.21
309 0.19
310 0.19
311 0.17
312 0.18
313 0.16
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.1
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.11
328 0.17
329 0.17
330 0.19
331 0.2
332 0.22
333 0.29
334 0.3
335 0.27
336 0.27
337 0.33
338 0.34
339 0.39
340 0.44
341 0.4
342 0.4
343 0.38
344 0.38
345 0.33
346 0.36
347 0.33
348 0.29
349 0.28
350 0.32
351 0.32
352 0.31
353 0.29
354 0.24
355 0.23
356 0.23
357 0.22
358 0.18
359 0.2
360 0.19
361 0.26
362 0.31
363 0.34
364 0.35
365 0.37
366 0.38
367 0.41
368 0.44
369 0.42
370 0.39
371 0.35
372 0.35
373 0.34
374 0.33
375 0.28
376 0.23
377 0.18
378 0.16
379 0.18
380 0.15
381 0.13
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.1
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.13
393 0.15
394 0.15
395 0.17
396 0.18
397 0.21
398 0.26
399 0.26
400 0.26
401 0.25
402 0.24
403 0.21
404 0.2
405 0.18
406 0.13
407 0.12
408 0.14
409 0.2
410 0.23
411 0.23
412 0.24
413 0.24
414 0.26
415 0.31
416 0.34
417 0.35
418 0.35
419 0.38
420 0.38
421 0.4
422 0.41
423 0.41
424 0.36
425 0.33
426 0.3
427 0.27
428 0.26
429 0.23
430 0.2
431 0.15
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.15
436 0.17
437 0.2
438 0.28
439 0.31
440 0.37
441 0.39
442 0.4
443 0.42
444 0.46
445 0.43
446 0.43
447 0.42
448 0.37
449 0.33
450 0.3
451 0.32
452 0.24
453 0.25
454 0.26
455 0.31
456 0.4
457 0.46
458 0.53
459 0.55
460 0.66
461 0.67
462 0.66
463 0.69
464 0.68
465 0.73
466 0.75
467 0.78
468 0.77
469 0.86
470 0.88
471 0.89
472 0.91
473 0.89
474 0.89
475 0.88
476 0.88
477 0.88
478 0.86
479 0.84
480 0.81
481 0.74
482 0.69
483 0.66
484 0.65
485 0.64
486 0.58
487 0.52
488 0.46
489 0.44
490 0.42
491 0.38
492 0.31
493 0.25
494 0.24
495 0.27
496 0.29
497 0.29
498 0.28
499 0.29
500 0.27
501 0.25
502 0.29
503 0.24
504 0.24
505 0.26
506 0.24
507 0.2
508 0.2
509 0.21
510 0.19
511 0.21
512 0.19
513 0.22