Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XZH1

Protein Details
Accession A0A4Y9XZH1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-343LFGYLKSYKPKKKAKKAQTGQDEEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-334KPKKKAKK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, pero 8, cyto_mito 7.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004154  Anticodon-bd  
IPR036621  Anticodon-bd_dom_sf  
IPR041715  HisRS-like_core  
IPR000738  WHEP-TRS_dom  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004821  F:histidine-tRNA ligase activity  
GO:0006418  P:tRNA aminoacylation for protein translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03129  HGTP_anticodon  
PF13393  tRNA-synt_His  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
PS51185  WHEP_TRS_2  
CDD cd00773  HisRS-like_core  
Amino Acid Sequences MASVSAAESLQEEVAQQKALLRDLQNQKADAALIEEAKKKLADLQKSFGLLQSAMKAGGSTKKGRLLLKTPKGTRDYGPSEMHCREFIERTVKDCFTTYGGGCLDTPVFERKDILAGKYGEDAKLIFDLMDQGGEQLALRYDHTVPLARYLAMNGAQATQAKLWQVGKVYRRDNPVISKGRMREFSQADFDIAGIWDVMIPDAELISLLCTILSKLDVGEFTVKINHRKILDGIFEVCGVPADKIRTISSAVDKLDKSPWSEVKHEMTETKGLDPAVADRIGEYVKHKGGPELLETLKADAALMANPSAKAGIEEMAILFGYLKSYKPKKKAKKAQTGQDEEDEEIDESTVGVGSIAAGGRYDNLVGMFTAAAAGESKKAAQLPCVGVSIGLDRVFAIVWPRWVSKGMRSKETMAYVMSAGDGLLNERVELAQELRANGIKVSGTWFSLCSAALANSRGQTDFLFKAKPKLPAQFAAGERDEVPFAIILGETELKEGLVTVKEQYWELVDGKKQKIESADKGVKVKRADLVQWLKDRPIMKDWDSGRFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.11
4 0.14
5 0.16
6 0.18
7 0.23
8 0.24
9 0.32
10 0.41
11 0.49
12 0.49
13 0.48
14 0.45
15 0.41
16 0.39
17 0.29
18 0.23
19 0.17
20 0.16
21 0.19
22 0.23
23 0.23
24 0.25
25 0.24
26 0.22
27 0.28
28 0.33
29 0.38
30 0.39
31 0.43
32 0.45
33 0.48
34 0.48
35 0.41
36 0.36
37 0.27
38 0.24
39 0.21
40 0.18
41 0.15
42 0.15
43 0.13
44 0.14
45 0.2
46 0.23
47 0.25
48 0.29
49 0.35
50 0.4
51 0.44
52 0.48
53 0.5
54 0.56
55 0.61
56 0.67
57 0.65
58 0.67
59 0.68
60 0.65
61 0.58
62 0.56
63 0.52
64 0.49
65 0.49
66 0.45
67 0.48
68 0.48
69 0.47
70 0.38
71 0.35
72 0.33
73 0.31
74 0.33
75 0.35
76 0.33
77 0.34
78 0.39
79 0.37
80 0.35
81 0.33
82 0.3
83 0.23
84 0.26
85 0.22
86 0.21
87 0.2
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.16
92 0.13
93 0.15
94 0.16
95 0.17
96 0.16
97 0.18
98 0.17
99 0.23
100 0.25
101 0.24
102 0.25
103 0.24
104 0.25
105 0.28
106 0.29
107 0.22
108 0.21
109 0.19
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.09
128 0.1
129 0.12
130 0.13
131 0.16
132 0.15
133 0.19
134 0.2
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.14
140 0.15
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.1
147 0.11
148 0.1
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.17
153 0.22
154 0.27
155 0.33
156 0.37
157 0.39
158 0.44
159 0.45
160 0.45
161 0.45
162 0.48
163 0.48
164 0.46
165 0.47
166 0.45
167 0.47
168 0.47
169 0.44
170 0.42
171 0.38
172 0.38
173 0.37
174 0.33
175 0.29
176 0.25
177 0.22
178 0.15
179 0.12
180 0.09
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.13
210 0.15
211 0.19
212 0.22
213 0.24
214 0.22
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.23
219 0.19
220 0.18
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.18
240 0.18
241 0.18
242 0.21
243 0.2
244 0.2
245 0.21
246 0.25
247 0.25
248 0.27
249 0.29
250 0.29
251 0.29
252 0.28
253 0.24
254 0.21
255 0.21
256 0.19
257 0.16
258 0.14
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.16
278 0.15
279 0.16
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.12
285 0.11
286 0.09
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.13
312 0.22
313 0.29
314 0.39
315 0.49
316 0.59
317 0.7
318 0.79
319 0.83
320 0.86
321 0.87
322 0.87
323 0.86
324 0.81
325 0.72
326 0.65
327 0.56
328 0.44
329 0.37
330 0.28
331 0.19
332 0.12
333 0.1
334 0.07
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.17
370 0.18
371 0.19
372 0.2
373 0.18
374 0.15
375 0.16
376 0.15
377 0.12
378 0.1
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.1
385 0.09
386 0.12
387 0.15
388 0.16
389 0.17
390 0.2
391 0.21
392 0.27
393 0.35
394 0.36
395 0.39
396 0.42
397 0.44
398 0.45
399 0.46
400 0.39
401 0.3
402 0.26
403 0.21
404 0.18
405 0.14
406 0.1
407 0.07
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.11
420 0.13
421 0.13
422 0.15
423 0.17
424 0.17
425 0.15
426 0.16
427 0.12
428 0.1
429 0.14
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.14
436 0.13
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.13
441 0.14
442 0.15
443 0.16
444 0.18
445 0.17
446 0.17
447 0.16
448 0.19
449 0.2
450 0.21
451 0.25
452 0.25
453 0.33
454 0.37
455 0.44
456 0.45
457 0.49
458 0.52
459 0.5
460 0.52
461 0.51
462 0.48
463 0.47
464 0.42
465 0.36
466 0.31
467 0.29
468 0.25
469 0.18
470 0.17
471 0.1
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.06
476 0.08
477 0.1
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.12
488 0.15
489 0.16
490 0.16
491 0.17
492 0.17
493 0.18
494 0.19
495 0.22
496 0.26
497 0.33
498 0.36
499 0.4
500 0.38
501 0.38
502 0.44
503 0.47
504 0.48
505 0.5
506 0.54
507 0.54
508 0.61
509 0.62
510 0.61
511 0.55
512 0.52
513 0.47
514 0.44
515 0.43
516 0.46
517 0.5
518 0.52
519 0.56
520 0.55
521 0.52
522 0.52
523 0.52
524 0.46
525 0.44
526 0.44
527 0.4
528 0.45
529 0.46