Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9Y2D4

Protein Details
Accession A0A4Y9Y2D4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-158SLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-148KKRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.833, cyto 9, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDMEEGPSKTPQNTRHETIQVGNTLLLKLPSGDIKTWKLEKDSTANLGKFGSFYANELVGQPFGLTYEIVDKKLKAVSPRTLQEVEDTEATNELINDGQFVQPLTSEEIEMLKKSGLHASEIIKKQIEQHANYSLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFTVVDPTVFNVCDYWFNKDQNRLRDIRPDALGQILNLANIRPGGRYLAVDDASGIVVAGMLERLGGRGRLITVCDVDSPPAYPAMVHMNFTKEVTQVLSSLNWATADEDYTPSKIKSDAQKSRLNKRKAVSETLNQTREELFAGEFDGLVVASEYDPFSILQNLSPYLAGSANIVVHSPYIQIVTDLQNQLRNLPQYLGAAVTEMWLRRYQVLPGRTHPFMNTSGSGGFIMHTIKVYDPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.58
3 0.59
4 0.58
5 0.55
6 0.52
7 0.45
8 0.39
9 0.35
10 0.28
11 0.25
12 0.24
13 0.19
14 0.14
15 0.12
16 0.13
17 0.16
18 0.18
19 0.2
20 0.24
21 0.28
22 0.35
23 0.39
24 0.4
25 0.4
26 0.4
27 0.42
28 0.43
29 0.43
30 0.43
31 0.46
32 0.43
33 0.4
34 0.37
35 0.33
36 0.26
37 0.23
38 0.2
39 0.13
40 0.14
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.13
47 0.13
48 0.11
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.06
53 0.06
54 0.14
55 0.16
56 0.19
57 0.21
58 0.2
59 0.22
60 0.26
61 0.28
62 0.27
63 0.32
64 0.37
65 0.43
66 0.46
67 0.49
68 0.47
69 0.44
70 0.41
71 0.38
72 0.32
73 0.26
74 0.24
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.14
79 0.1
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.14
103 0.12
104 0.14
105 0.16
106 0.19
107 0.27
108 0.29
109 0.31
110 0.27
111 0.27
112 0.3
113 0.35
114 0.37
115 0.3
116 0.32
117 0.39
118 0.4
119 0.39
120 0.37
121 0.3
122 0.25
123 0.24
124 0.23
125 0.21
126 0.26
127 0.35
128 0.41
129 0.5
130 0.6
131 0.69
132 0.77
133 0.8
134 0.84
135 0.85
136 0.89
137 0.9
138 0.89
139 0.84
140 0.76
141 0.72
142 0.63
143 0.52
144 0.48
145 0.38
146 0.29
147 0.24
148 0.22
149 0.18
150 0.17
151 0.16
152 0.09
153 0.09
154 0.14
155 0.14
156 0.19
157 0.22
158 0.25
159 0.28
160 0.37
161 0.41
162 0.42
163 0.46
164 0.43
165 0.4
166 0.45
167 0.45
168 0.4
169 0.36
170 0.3
171 0.26
172 0.24
173 0.23
174 0.14
175 0.14
176 0.11
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.17
231 0.18
232 0.18
233 0.18
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.17
258 0.25
259 0.34
260 0.42
261 0.46
262 0.55
263 0.6
264 0.69
265 0.74
266 0.7
267 0.65
268 0.6
269 0.63
270 0.59
271 0.62
272 0.56
273 0.53
274 0.57
275 0.59
276 0.59
277 0.5
278 0.46
279 0.39
280 0.34
281 0.28
282 0.2
283 0.12
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.1
326 0.15
327 0.21
328 0.23
329 0.24
330 0.28
331 0.28
332 0.3
333 0.33
334 0.31
335 0.27
336 0.25
337 0.25
338 0.22
339 0.22
340 0.2
341 0.15
342 0.13
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.13
348 0.14
349 0.16
350 0.19
351 0.2
352 0.26
353 0.31
354 0.38
355 0.41
356 0.45
357 0.5
358 0.49
359 0.49
360 0.44
361 0.39
362 0.35
363 0.35
364 0.3
365 0.26
366 0.24
367 0.23
368 0.22
369 0.18
370 0.16
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.12
375 0.12