FuNGI

A0A4Y9YS39

Protein Details

Accession

A0A4Y9YS39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-70	QDEGKRPGTSKSKRKKGKAKAKKGLKATKNRVESV	Basic
122-141	EKRQYELRTNLKKNKRSTSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-64	KRPGTSKSKRKKGKAKAKKGLKATK

Subcellular Location(s)

nucl 10, cyto 8, pero 6, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime
Gene Ontology	GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription

Amino Acid Sequences

VQDSKTATFTALSEIAGDQVREWEKMEAESATLAAQDEGKRPGTSKSKRKKGKAKAKKGLKATKNRVESVYLLNEDIVPRAGKVYEELAKQEIEPAGNFSAAAAHSVPRGTVNYFRKGMDLEKRQYELRTNLKKNKRSTSDDDEDGASMAGTKATRRTLRRELDKWRELQVSLMPEIDFPDADGELDDDDDDDDDDDTTTGTPEDEPLALPSDFTATERDDLGLQALATIERRIRVGHAYDLLDGIKQSLNHQGAFLLDKRKHARGQKDNTRSQTQVNAAVARTRAIAGLYNYNRDRLIALSCDDSDVLPQLNLDSDLKGKNWNKPRQLGDSRDEASWIWTVVPPWRSEGQAEAWQLEVDRVQWFRAKAEMTRANEEVNKLHAEFKRTILGFKNMSKAWEAVSAKDLSRGAQVYARKKADMFSKMSLQCANAFASTRRDYQEKWDYAKNIEDATNDRLKAAPGATIRDSFESKVERGQLGWAPERPVRAEGPEGGQQRQADLMRSSFEETVEILMEAAVVGERDDCHGIAENVIFGQMAPMGTGAFDVALDIDMLKDVIVDHRLPVETVMAAQVGAGMTPGQVAMMPYDTNSPMRNTDVSFKGEAATFSPLAVNGGEEPANFSYIGFGQSPVAILRPSSWTDFAYVLADAASTQPHVSGILADEPSLFTDFTVILPHVASPIVQPGFTMILSDISCSN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.17
4	0.16
5	0.11
6	0.17
7	0.2
8	0.19
9	0.21
10	0.21
11	0.21
12	0.22
13	0.24
14	0.18
15	0.16
16	0.16
17	0.14
18	0.12
19	0.11
20	0.1
21	0.08
22	0.12
23	0.13
24	0.17
25	0.2
26	0.23
27	0.23
28	0.24
29	0.32
30	0.39
31	0.47
32	0.54
33	0.62
34	0.7
35	0.79
36	0.88
37	0.91
38	0.91
39	0.93
40	0.93
41	0.93
42	0.93
43	0.94
44	0.91
45	0.91
46	0.9
47	0.88
48	0.88
49	0.87
50	0.86
51	0.82
52	0.77
53	0.68
54	0.61
55	0.54
56	0.49
57	0.45
58	0.36
59	0.3
60	0.28
61	0.26
62	0.23
63	0.22
64	0.18
65	0.12
66	0.11
67	0.12
68	0.12
69	0.11
70	0.13
71	0.17
72	0.2
73	0.21
74	0.23
75	0.24
76	0.24
77	0.23
78	0.26
79	0.22
80	0.18
81	0.17
82	0.18
83	0.17
84	0.16
85	0.16
86	0.12
87	0.13
88	0.11
89	0.13
90	0.1
91	0.1
92	0.11
93	0.11
94	0.12
95	0.11
96	0.13
97	0.14
98	0.23
99	0.27
100	0.33
101	0.35
102	0.35
103	0.35
104	0.35
105	0.38
106	0.39
107	0.43
108	0.42
109	0.45
110	0.47
111	0.48
112	0.49
113	0.49
114	0.47
115	0.48
116	0.53
117	0.57
118	0.65
119	0.73
120	0.78
121	0.79
122	0.81
123	0.79
124	0.76
125	0.75
126	0.74
127	0.71
128	0.65
129	0.59
130	0.49
131	0.42
132	0.34
133	0.26
134	0.16
135	0.1
136	0.07
137	0.08
138	0.07
139	0.08
140	0.12
141	0.19
142	0.26
143	0.3
144	0.38
145	0.46
146	0.55
147	0.63
148	0.66
149	0.7
150	0.73
151	0.75
152	0.69
153	0.65
154	0.58
155	0.49
156	0.44
157	0.37
158	0.31
159	0.26
160	0.24
161	0.19
162	0.16
163	0.18
164	0.16
165	0.12
166	0.09
167	0.09
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.05
188	0.06
189	0.05
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.11
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.12
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.12
207	0.11
208	0.11
209	0.11
210	0.09
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.09
220	0.09
221	0.11
222	0.14
223	0.15
224	0.16
225	0.19
226	0.19
227	0.19
228	0.19
229	0.17
230	0.14
231	0.12
232	0.11
233	0.09
234	0.08
235	0.09
236	0.16
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.17
241	0.16
242	0.18
243	0.2
244	0.2
245	0.2
246	0.26
247	0.3
248	0.34
249	0.39
250	0.44
251	0.51
252	0.53
253	0.62
254	0.66
255	0.71
256	0.74
257	0.73
258	0.7
259	0.62
260	0.53
261	0.48
262	0.39
263	0.35
264	0.29
265	0.25
266	0.21
267	0.22
268	0.2
269	0.16
270	0.14
271	0.1
272	0.09
273	0.08
274	0.1
275	0.09
276	0.17
277	0.17
278	0.23
279	0.23
280	0.24
281	0.23
282	0.21
283	0.21
284	0.14
285	0.15
286	0.1
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.11
292	0.1
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.08
304	0.09
305	0.1
306	0.18
307	0.2
308	0.27
309	0.36
310	0.43
311	0.46
312	0.52
313	0.55
314	0.56
315	0.6
316	0.57
317	0.5
318	0.48
319	0.44
320	0.38
321	0.35
322	0.25
323	0.21
324	0.16
325	0.13
326	0.09
327	0.07
328	0.08
329	0.11
330	0.13
331	0.12
332	0.15
333	0.16
334	0.16
335	0.15
336	0.16
337	0.15
338	0.18
339	0.18
340	0.15
341	0.14
342	0.14
343	0.13
344	0.12
345	0.09
346	0.06
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.11
351	0.11
352	0.12
353	0.14
354	0.14
355	0.13
356	0.21
357	0.26
358	0.26
359	0.29
360	0.29
361	0.28
362	0.28
363	0.28
364	0.21
365	0.17
366	0.15
367	0.13
368	0.18
369	0.18
370	0.21
371	0.22
372	0.22
373	0.26
374	0.25
375	0.26
376	0.23
377	0.26
378	0.25
379	0.26
380	0.29
381	0.23
382	0.24
383	0.24
384	0.21
385	0.18
386	0.21
387	0.2
388	0.16
389	0.19
390	0.19
391	0.18
392	0.2
393	0.19
394	0.13
395	0.15
396	0.14
397	0.12
398	0.15
399	0.2
400	0.23
401	0.31
402	0.31
403	0.29
404	0.29
405	0.31
406	0.34
407	0.34
408	0.32
409	0.27
410	0.34
411	0.34
412	0.35
413	0.33
414	0.27
415	0.23
416	0.21
417	0.19
418	0.12
419	0.13
420	0.13
421	0.18
422	0.19
423	0.21
424	0.21
425	0.23
426	0.23
427	0.3
428	0.38
429	0.36
430	0.38
431	0.4
432	0.39
433	0.39
434	0.42
435	0.34
436	0.26
437	0.23
438	0.21
439	0.19
440	0.22
441	0.25
442	0.21
443	0.2
444	0.19
445	0.19
446	0.19
447	0.16
448	0.15
449	0.12
450	0.16
451	0.17
452	0.18
453	0.19
454	0.2
455	0.21
456	0.17
457	0.2
458	0.19
459	0.18
460	0.2
461	0.22
462	0.19
463	0.18
464	0.21
465	0.2
466	0.21
467	0.24
468	0.22
469	0.23
470	0.25
471	0.26
472	0.24
473	0.24
474	0.21
475	0.2
476	0.2
477	0.18
478	0.2
479	0.25
480	0.26
481	0.24
482	0.26
483	0.24
484	0.23
485	0.25
486	0.22
487	0.19
488	0.18
489	0.18
490	0.16
491	0.18
492	0.2
493	0.16
494	0.16
495	0.13
496	0.12
497	0.12
498	0.11
499	0.09
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.05
504	0.04
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.04
509	0.04
510	0.06
511	0.08
512	0.08
513	0.09
514	0.11
515	0.11
516	0.11
517	0.11
518	0.1
519	0.09
520	0.09
521	0.07
522	0.05
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.04
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.06
546	0.09
547	0.1
548	0.1
549	0.13
550	0.14
551	0.14
552	0.14
553	0.13
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.07
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.03
569	0.04
570	0.05
571	0.05
572	0.07
573	0.07
574	0.08
575	0.11
576	0.13
577	0.14
578	0.16
579	0.17
580	0.18
581	0.21
582	0.23
583	0.22
584	0.28
585	0.29
586	0.31
587	0.3
588	0.28
589	0.26
590	0.25
591	0.24
592	0.19
593	0.19
594	0.15
595	0.15
596	0.15
597	0.13
598	0.13
599	0.13
600	0.12
601	0.08
602	0.1
603	0.1
604	0.1
605	0.14
606	0.13
607	0.14
608	0.13
609	0.12
610	0.12
611	0.13
612	0.15
613	0.12
614	0.12
615	0.12
616	0.12
617	0.13
618	0.11
619	0.12
620	0.1
621	0.1
622	0.11
623	0.14
624	0.17
625	0.2
626	0.21
627	0.2
628	0.22
629	0.23
630	0.21
631	0.19
632	0.16
633	0.12
634	0.1
635	0.1
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.09
644	0.09
645	0.09
646	0.1
647	0.14
648	0.14
649	0.14
650	0.14
651	0.14
652	0.16
653	0.16
654	0.14
655	0.09
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.13
660	0.11
661	0.11
662	0.11
663	0.12
664	0.11
665	0.11
666	0.11
667	0.09
668	0.16
669	0.17
670	0.16
671	0.16
672	0.17
673	0.19
674	0.18
675	0.18
676	0.11
677	0.14
678	0.14

A0A4Y9YS39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer