Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YXE7

Protein Details
Accession A0A4Y9YXE7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-173AKEPAPRRTSTPAKKRKQDDDFIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-127PKKKA
143-166ASKPTPKAKEPAPRRTSTPAKKRK
193-237PKKGKAKSKAAPQKAPSKKAVPAKKGASAKAPAEKATGTKGKAAA
371-379KKLEKDREA
381-381R
386-396EMEKREKKAAK
959-994KLIKAPKKAAAKSATAKGTTKGTAKGTAKGKAKAKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.666, cyto_mito 10.332, cyto 10, mito_nucl 9.332, mito 9, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF00533  BRCT  
PF08519  RFC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
CDD cd00009  AAA  
cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MAGTKIKPSAKSQGKDIRGFFAGGGGGSKSAGSSMSTQRSNGSLKPSGSTKPDVIEIMSDEDHVESGSKHFHPKATPRSTQPKSERVMDEDDTPSPAPTLKRKKTLIVSSDEEDEEAEKASPPKKKAAVAASSSKAASSSTSASKPTPKAKEPAPRRTSTPAKKRKQDDDFIASSSEEEVHDDYQDNEDEDLPKKGKAKSKAAPQKAPSKKAVPAKKGASAKAPAEKATGTKGKAAAKEETVDADEDKPKPKFNWAAAKAAKAAGPMAPGSKPLPTPAAPDCLAGLSFVFTGELTSLSRDEAVELAKRNGGRITGQPSSKTSYVVVGSDAGPSKLAAIKKNNLKTLDEDGFLNLIATRVPDMSSLDDKTKKKLEKDREAIRTAAAEMEKREKKAAKASAASGSTSKTAAENKLWTDRYAPQTLKEVCGNKGQVEKLQRWLHDWSSSLKSGFKKPGKDGMNVFRAVLITGSPGIGKTTSAHLCAKLEGFTPIELNASDARSKKLVENSTNIANTSLDGWMGGGQTTNAAGVTITEKSCLIMDEVDGMSAGDRGGVGALAALIRKAKIPIICIANDRGAPKLKPLATVAYNLTFRKPEVASVRSRILSIAFKEKMKIPANVIDQLIEGAQSDIRQVLNMLSTWRLQADTMDFDEGKALVKMNEKYAIMTPFNIIQKMLGPYMFSSTSRETLNDKMELYFHDHSFVPLFIQENYLKTQPARVKNLDGPEKALKQLELLDKAAASISDGDLVDSLIHGPEQHWSLMPLHAVCSTVRPASFLYGMGVAYGGPNAMSFPQWLGQNSKQNKLTRQLTEVQARMRLHVSGDKAEIRQSYIPAMFPYIVKPLVDEGASAVDEVIERMDDYFISREDWDTIVELGVDQNKDDFVLKKISTATKTSFTRKYNARDHPIPFHKAADMGKAPRQLAAAGPIPDLEEALDVDEVEDAADEVEDASDHDVSKDKLIKAPKKAAAKSATAKGTTKGTAKGTAKGKAKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.69
3 0.65
4 0.6
5 0.52
6 0.49
7 0.39
8 0.32
9 0.24
10 0.18
11 0.17
12 0.12
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.13
21 0.21
22 0.28
23 0.3
24 0.3
25 0.32
26 0.36
27 0.38
28 0.36
29 0.36
30 0.35
31 0.34
32 0.37
33 0.39
34 0.4
35 0.41
36 0.43
37 0.37
38 0.33
39 0.35
40 0.32
41 0.29
42 0.26
43 0.22
44 0.21
45 0.19
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.11
52 0.08
53 0.1
54 0.16
55 0.17
56 0.24
57 0.27
58 0.31
59 0.38
60 0.47
61 0.56
62 0.59
63 0.63
64 0.65
65 0.73
66 0.73
67 0.76
68 0.74
69 0.71
70 0.67
71 0.69
72 0.63
73 0.57
74 0.58
75 0.5
76 0.47
77 0.42
78 0.38
79 0.33
80 0.3
81 0.26
82 0.2
83 0.22
84 0.22
85 0.3
86 0.4
87 0.44
88 0.53
89 0.56
90 0.63
91 0.68
92 0.73
93 0.68
94 0.64
95 0.61
96 0.54
97 0.54
98 0.47
99 0.37
100 0.29
101 0.24
102 0.17
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.15
107 0.21
108 0.28
109 0.3
110 0.37
111 0.41
112 0.44
113 0.48
114 0.52
115 0.53
116 0.52
117 0.56
118 0.51
119 0.48
120 0.44
121 0.37
122 0.29
123 0.23
124 0.18
125 0.14
126 0.16
127 0.18
128 0.21
129 0.23
130 0.26
131 0.33
132 0.38
133 0.44
134 0.48
135 0.48
136 0.51
137 0.57
138 0.65
139 0.67
140 0.72
141 0.7
142 0.65
143 0.65
144 0.69
145 0.72
146 0.71
147 0.73
148 0.72
149 0.75
150 0.81
151 0.84
152 0.86
153 0.84
154 0.81
155 0.78
156 0.75
157 0.67
158 0.59
159 0.52
160 0.42
161 0.33
162 0.26
163 0.19
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.16
177 0.17
178 0.21
179 0.2
180 0.22
181 0.26
182 0.31
183 0.37
184 0.43
185 0.51
186 0.53
187 0.63
188 0.7
189 0.74
190 0.76
191 0.73
192 0.76
193 0.75
194 0.74
195 0.68
196 0.63
197 0.61
198 0.62
199 0.66
200 0.61
201 0.61
202 0.59
203 0.61
204 0.61
205 0.56
206 0.53
207 0.49
208 0.47
209 0.45
210 0.43
211 0.36
212 0.33
213 0.32
214 0.27
215 0.29
216 0.3
217 0.24
218 0.26
219 0.3
220 0.33
221 0.36
222 0.38
223 0.34
224 0.31
225 0.31
226 0.28
227 0.25
228 0.22
229 0.19
230 0.16
231 0.16
232 0.19
233 0.2
234 0.26
235 0.26
236 0.29
237 0.29
238 0.36
239 0.39
240 0.41
241 0.5
242 0.47
243 0.55
244 0.53
245 0.53
246 0.47
247 0.41
248 0.35
249 0.24
250 0.22
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.14
259 0.13
260 0.14
261 0.17
262 0.16
263 0.2
264 0.21
265 0.25
266 0.23
267 0.23
268 0.21
269 0.18
270 0.17
271 0.13
272 0.11
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.05
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.16
298 0.15
299 0.18
300 0.23
301 0.25
302 0.27
303 0.27
304 0.29
305 0.32
306 0.31
307 0.27
308 0.22
309 0.19
310 0.19
311 0.17
312 0.16
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.14
323 0.17
324 0.22
325 0.29
326 0.37
327 0.42
328 0.46
329 0.45
330 0.44
331 0.42
332 0.43
333 0.38
334 0.31
335 0.26
336 0.22
337 0.2
338 0.18
339 0.14
340 0.08
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.1
350 0.13
351 0.14
352 0.18
353 0.25
354 0.26
355 0.3
356 0.37
357 0.38
358 0.43
359 0.51
360 0.57
361 0.6
362 0.68
363 0.72
364 0.71
365 0.68
366 0.61
367 0.52
368 0.42
369 0.32
370 0.26
371 0.18
372 0.13
373 0.12
374 0.21
375 0.23
376 0.23
377 0.28
378 0.28
379 0.29
380 0.36
381 0.4
382 0.36
383 0.35
384 0.36
385 0.36
386 0.34
387 0.33
388 0.25
389 0.21
390 0.16
391 0.14
392 0.13
393 0.1
394 0.12
395 0.13
396 0.15
397 0.16
398 0.18
399 0.24
400 0.25
401 0.23
402 0.24
403 0.27
404 0.3
405 0.33
406 0.31
407 0.26
408 0.33
409 0.33
410 0.32
411 0.31
412 0.29
413 0.25
414 0.29
415 0.29
416 0.23
417 0.26
418 0.24
419 0.24
420 0.26
421 0.26
422 0.3
423 0.33
424 0.31
425 0.31
426 0.33
427 0.31
428 0.28
429 0.27
430 0.23
431 0.23
432 0.24
433 0.22
434 0.22
435 0.23
436 0.26
437 0.34
438 0.35
439 0.35
440 0.37
441 0.45
442 0.44
443 0.44
444 0.44
445 0.41
446 0.41
447 0.37
448 0.34
449 0.26
450 0.23
451 0.2
452 0.16
453 0.09
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.1
464 0.1
465 0.13
466 0.14
467 0.14
468 0.15
469 0.15
470 0.15
471 0.11
472 0.11
473 0.09
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.1
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.15
489 0.2
490 0.24
491 0.24
492 0.26
493 0.27
494 0.3
495 0.29
496 0.27
497 0.21
498 0.16
499 0.13
500 0.11
501 0.09
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.05
527 0.05
528 0.07
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.02
542 0.02
543 0.02
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.04
548 0.04
549 0.05
550 0.06
551 0.08
552 0.09
553 0.11
554 0.15
555 0.17
556 0.18
557 0.2
558 0.21
559 0.2
560 0.2
561 0.19
562 0.18
563 0.18
564 0.17
565 0.18
566 0.22
567 0.21
568 0.21
569 0.22
570 0.23
571 0.2
572 0.23
573 0.22
574 0.19
575 0.21
576 0.2
577 0.2
578 0.17
579 0.16
580 0.17
581 0.16
582 0.18
583 0.21
584 0.24
585 0.26
586 0.29
587 0.32
588 0.28
589 0.28
590 0.24
591 0.2
592 0.2
593 0.19
594 0.23
595 0.22
596 0.22
597 0.24
598 0.27
599 0.33
600 0.33
601 0.33
602 0.27
603 0.32
604 0.34
605 0.35
606 0.32
607 0.24
608 0.21
609 0.19
610 0.16
611 0.1
612 0.07
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.07
623 0.07
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.09
630 0.08
631 0.09
632 0.1
633 0.11
634 0.12
635 0.13
636 0.13
637 0.12
638 0.13
639 0.12
640 0.1
641 0.09
642 0.08
643 0.08
644 0.14
645 0.15
646 0.16
647 0.19
648 0.19
649 0.2
650 0.22
651 0.24
652 0.2
653 0.19
654 0.18
655 0.19
656 0.21
657 0.2
658 0.16
659 0.13
660 0.15
661 0.17
662 0.16
663 0.12
664 0.11
665 0.11
666 0.14
667 0.15
668 0.12
669 0.14
670 0.16
671 0.18
672 0.18
673 0.19
674 0.19
675 0.22
676 0.25
677 0.23
678 0.22
679 0.2
680 0.2
681 0.2
682 0.24
683 0.22
684 0.19
685 0.2
686 0.19
687 0.19
688 0.2
689 0.18
690 0.12
691 0.1
692 0.11
693 0.09
694 0.13
695 0.14
696 0.14
697 0.17
698 0.18
699 0.18
700 0.17
701 0.24
702 0.27
703 0.34
704 0.39
705 0.39
706 0.43
707 0.47
708 0.54
709 0.54
710 0.47
711 0.45
712 0.43
713 0.42
714 0.39
715 0.36
716 0.28
717 0.21
718 0.26
719 0.26
720 0.23
721 0.22
722 0.21
723 0.19
724 0.19
725 0.18
726 0.13
727 0.09
728 0.07
729 0.06
730 0.08
731 0.08
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.07
736 0.06
737 0.07
738 0.04
739 0.05
740 0.05
741 0.05
742 0.08
743 0.1
744 0.1
745 0.1
746 0.12
747 0.13
748 0.15
749 0.16
750 0.14
751 0.13
752 0.13
753 0.14
754 0.12
755 0.14
756 0.15
757 0.15
758 0.15
759 0.15
760 0.15
761 0.17
762 0.18
763 0.15
764 0.14
765 0.12
766 0.12
767 0.1
768 0.1
769 0.07
770 0.06
771 0.06
772 0.04
773 0.03
774 0.04
775 0.04
776 0.05
777 0.06
778 0.06
779 0.07
780 0.11
781 0.13
782 0.15
783 0.21
784 0.27
785 0.36
786 0.4
787 0.47
788 0.5
789 0.53
790 0.57
791 0.59
792 0.6
793 0.54
794 0.55
795 0.54
796 0.53
797 0.55
798 0.53
799 0.47
800 0.46
801 0.43
802 0.4
803 0.35
804 0.29
805 0.25
806 0.26
807 0.26
808 0.22
809 0.25
810 0.26
811 0.25
812 0.29
813 0.27
814 0.26
815 0.25
816 0.24
817 0.25
818 0.23
819 0.23
820 0.2
821 0.22
822 0.19
823 0.17
824 0.18
825 0.17
826 0.17
827 0.16
828 0.16
829 0.15
830 0.16
831 0.15
832 0.13
833 0.1
834 0.11
835 0.12
836 0.11
837 0.09
838 0.07
839 0.07
840 0.07
841 0.07
842 0.05
843 0.05
844 0.06
845 0.06
846 0.06
847 0.09
848 0.1
849 0.11
850 0.13
851 0.13
852 0.14
853 0.16
854 0.16
855 0.15
856 0.14
857 0.14
858 0.12
859 0.11
860 0.1
861 0.1
862 0.14
863 0.13
864 0.12
865 0.12
866 0.12
867 0.13
868 0.15
869 0.15
870 0.14
871 0.21
872 0.21
873 0.23
874 0.28
875 0.33
876 0.34
877 0.38
878 0.38
879 0.39
880 0.44
881 0.49
882 0.53
883 0.5
884 0.55
885 0.58
886 0.63
887 0.64
888 0.69
889 0.7
890 0.69
891 0.71
892 0.73
893 0.73
894 0.7
895 0.62
896 0.55
897 0.47
898 0.44
899 0.4
900 0.37
901 0.36
902 0.35
903 0.38
904 0.41
905 0.4
906 0.38
907 0.37
908 0.3
909 0.26
910 0.26
911 0.26
912 0.22
913 0.22
914 0.2
915 0.21
916 0.2
917 0.18
918 0.13
919 0.08
920 0.07
921 0.09
922 0.08
923 0.07
924 0.07
925 0.07
926 0.07
927 0.06
928 0.06
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.04
934 0.04
935 0.04
936 0.05
937 0.07
938 0.08
939 0.09
940 0.1
941 0.14
942 0.15
943 0.22
944 0.28
945 0.28
946 0.33
947 0.43
948 0.5
949 0.56
950 0.64
951 0.64
952 0.67
953 0.68
954 0.71
955 0.66
956 0.66
957 0.64
958 0.62
959 0.6
960 0.53
961 0.52
962 0.47
963 0.46
964 0.43
965 0.4
966 0.38
967 0.36
968 0.42
969 0.43
970 0.48
971 0.49
972 0.53
973 0.55
974 0.58