Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9Z1N1

Protein Details
Accession A0A4Y9Z1N1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61TPAAAPPKPKPAPKRPAETLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-60PPKPKPAPKRPAET
69-71PKK
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.833, nucl 9.5, cyto_mito 7.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MTNPQDDADRIRLKRLAKLQSASPSPAASTSTTPPPTTPSSTPAAAPPKPKPAPKRPAETLPAPVPVAPKKRPQAAPAQLDLPKWEEETVGRVFNVTLSKDVAEKSGWEVVWLKHLAAELESEGMQQPIRLSADIADRLLISRLELNPQSMSDDLEYLAVIASLPPQQTVFEYLVGCWKRLNVNRSIITKKNYPPVQAQQATDILEKLRDLIISYAGLTLQEPEMFPQPIGKPLGPTELLTPLLSLSALTGPLLSSSATSANTLGPAEVEPFLQDLVKRFEPDNEIDGVLGPVVNQLCFHESLFRPEGLAGGDGSWRAVISGLEALVNIKSIAVMITRLQFWNPEATPVTFERVSLLGPLLRLGVFDREWPAIANTYYSKPKDRSQADIGSSTASLRGTLKSLQSSLFNILNALVRASPDSREAVLQYFARVVSLNVRRAGMQVDPDTVASDCFMVNLQAILLRFCEPFMDANYTKVSSSNASLGRETDDKKIDRIDPAYYAHSSRIDLKEETRINATSEVAEQWRQKNESAAAAPPNFISDIFYLTLATNHYGYQKTISTFEDLARQYDEMNRHLEVLEGDGSWRGSPLQARVEHSINAVKTEMDKAMATQLAYTVQLADPELVFRSVGFTNFVSTWLIRHVDPKHTHPNPSLELPLPREVPESFNVLPEYIIEDIVDYHLFVVRQSPDSLELSGKNELLVWALTFLTSTWYIKNPFLKSKLVEALFYATLNWGNHRSVLAMTLNTHPMALKYLVPALMHFYIEVEQTGASSQFYDKFNSRRNIAYLFKAIWDNSTHREALKKETRTNMDKFVRFVNLMINDVTYLMDESLSDLAKIHEIQTEMEDTETFNSKPAQYRRERESALRTLERHTSGYVQLGRSTVEMLKAFTGETKEPFMVPEIVDRLAAMLDYNLDALAGPRCQNLVVKNPEKYKFNPKQLLSDIIDVYLNLSDQGEFVRAVAADGRSYRKELFERTAGIAKRRVLKSDTEIEKLLLFVVKVEEKKATLEAEEDLGEVPDEFLDPLMYTVMRDPVTLPSSQVVLDRSTIKSHLLSDAKDPFNRVPLALEDVVSNPELKQRIDAFLAERRNKNTALDKPADEIVKMDESA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.55
3 0.56
4 0.54
5 0.57
6 0.57
7 0.61
8 0.63
9 0.58
10 0.51
11 0.43
12 0.36
13 0.33
14 0.29
15 0.23
16 0.22
17 0.23
18 0.3
19 0.32
20 0.32
21 0.32
22 0.35
23 0.38
24 0.4
25 0.38
26 0.34
27 0.36
28 0.36
29 0.36
30 0.39
31 0.42
32 0.4
33 0.44
34 0.46
35 0.52
36 0.57
37 0.65
38 0.67
39 0.7
40 0.76
41 0.77
42 0.81
43 0.77
44 0.79
45 0.77
46 0.71
47 0.68
48 0.61
49 0.56
50 0.47
51 0.42
52 0.39
53 0.4
54 0.44
55 0.42
56 0.47
57 0.51
58 0.6
59 0.63
60 0.62
61 0.65
62 0.66
63 0.67
64 0.61
65 0.6
66 0.53
67 0.5
68 0.47
69 0.4
70 0.32
71 0.26
72 0.23
73 0.19
74 0.17
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.19
82 0.22
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.18
87 0.19
88 0.2
89 0.19
90 0.16
91 0.15
92 0.17
93 0.21
94 0.2
95 0.2
96 0.23
97 0.22
98 0.28
99 0.28
100 0.24
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.17
105 0.18
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.12
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.15
120 0.21
121 0.22
122 0.21
123 0.18
124 0.17
125 0.17
126 0.19
127 0.16
128 0.11
129 0.14
130 0.15
131 0.2
132 0.21
133 0.23
134 0.22
135 0.22
136 0.24
137 0.19
138 0.2
139 0.15
140 0.15
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.08
145 0.08
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.06
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.24
162 0.24
163 0.23
164 0.2
165 0.21
166 0.27
167 0.33
168 0.38
169 0.37
170 0.44
171 0.5
172 0.56
173 0.6
174 0.57
175 0.55
176 0.58
177 0.56
178 0.57
179 0.55
180 0.53
181 0.54
182 0.56
183 0.61
184 0.57
185 0.53
186 0.46
187 0.45
188 0.43
189 0.36
190 0.29
191 0.2
192 0.17
193 0.16
194 0.14
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.18
215 0.18
216 0.22
217 0.26
218 0.24
219 0.22
220 0.23
221 0.28
222 0.24
223 0.23
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.18
228 0.17
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.08
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.17
264 0.18
265 0.2
266 0.2
267 0.23
268 0.27
269 0.28
270 0.27
271 0.23
272 0.21
273 0.19
274 0.19
275 0.15
276 0.11
277 0.08
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.12
287 0.16
288 0.16
289 0.23
290 0.25
291 0.24
292 0.22
293 0.21
294 0.22
295 0.16
296 0.15
297 0.09
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.04
321 0.05
322 0.07
323 0.08
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.17
330 0.16
331 0.17
332 0.18
333 0.18
334 0.21
335 0.21
336 0.24
337 0.18
338 0.18
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.12
343 0.12
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.16
364 0.21
365 0.23
366 0.27
367 0.29
368 0.33
369 0.41
370 0.41
371 0.44
372 0.44
373 0.48
374 0.45
375 0.43
376 0.38
377 0.3
378 0.27
379 0.21
380 0.16
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.12
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.16
393 0.18
394 0.17
395 0.15
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.12
400 0.11
401 0.08
402 0.07
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.14
413 0.13
414 0.12
415 0.11
416 0.1
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.14
421 0.19
422 0.22
423 0.22
424 0.23
425 0.23
426 0.23
427 0.24
428 0.17
429 0.15
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.11
436 0.1
437 0.07
438 0.07
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.1
457 0.16
458 0.14
459 0.16
460 0.18
461 0.18
462 0.17
463 0.16
464 0.16
465 0.1
466 0.11
467 0.14
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.18
473 0.2
474 0.21
475 0.2
476 0.23
477 0.22
478 0.23
479 0.26
480 0.25
481 0.24
482 0.24
483 0.21
484 0.18
485 0.19
486 0.2
487 0.18
488 0.18
489 0.16
490 0.15
491 0.15
492 0.18
493 0.18
494 0.18
495 0.18
496 0.19
497 0.25
498 0.25
499 0.25
500 0.22
501 0.21
502 0.19
503 0.19
504 0.18
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.1
509 0.13
510 0.14
511 0.17
512 0.2
513 0.21
514 0.21
515 0.22
516 0.22
517 0.21
518 0.19
519 0.18
520 0.18
521 0.17
522 0.17
523 0.14
524 0.14
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.08
536 0.08
537 0.07
538 0.07
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.14
549 0.15
550 0.19
551 0.18
552 0.17
553 0.16
554 0.15
555 0.14
556 0.16
557 0.18
558 0.14
559 0.16
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.14
564 0.11
565 0.1
566 0.08
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.05
574 0.05
575 0.07
576 0.09
577 0.15
578 0.16
579 0.19
580 0.22
581 0.24
582 0.23
583 0.23
584 0.23
585 0.18
586 0.17
587 0.14
588 0.11
589 0.1
590 0.12
591 0.1
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.09
596 0.1
597 0.09
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.06
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.09
618 0.09
619 0.1
620 0.11
621 0.12
622 0.1
623 0.09
624 0.1
625 0.1
626 0.12
627 0.1
628 0.16
629 0.17
630 0.25
631 0.28
632 0.33
633 0.42
634 0.43
635 0.46
636 0.43
637 0.45
638 0.39
639 0.38
640 0.34
641 0.26
642 0.26
643 0.26
644 0.26
645 0.22
646 0.2
647 0.2
648 0.18
649 0.19
650 0.18
651 0.2
652 0.17
653 0.18
654 0.18
655 0.16
656 0.15
657 0.13
658 0.13
659 0.08
660 0.08
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.07
665 0.07
666 0.05
667 0.04
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.09
672 0.1
673 0.12
674 0.12
675 0.13
676 0.14
677 0.15
678 0.16
679 0.14
680 0.14
681 0.15
682 0.16
683 0.15
684 0.12
685 0.11
686 0.11
687 0.1
688 0.09
689 0.06
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.07
696 0.08
697 0.08
698 0.09
699 0.12
700 0.15
701 0.18
702 0.25
703 0.26
704 0.31
705 0.34
706 0.36
707 0.34
708 0.36
709 0.39
710 0.33
711 0.3
712 0.24
713 0.24
714 0.21
715 0.19
716 0.15
717 0.09
718 0.12
719 0.12
720 0.13
721 0.13
722 0.13
723 0.14
724 0.14
725 0.14
726 0.11
727 0.13
728 0.13
729 0.11
730 0.12
731 0.13
732 0.15
733 0.14
734 0.14
735 0.11
736 0.1
737 0.12
738 0.12
739 0.1
740 0.1
741 0.11
742 0.12
743 0.12
744 0.12
745 0.14
746 0.13
747 0.12
748 0.11
749 0.11
750 0.1
751 0.11
752 0.1
753 0.07
754 0.06
755 0.06
756 0.07
757 0.06
758 0.05
759 0.06
760 0.07
761 0.11
762 0.12
763 0.16
764 0.2
765 0.26
766 0.34
767 0.37
768 0.39
769 0.37
770 0.39
771 0.41
772 0.4
773 0.37
774 0.32
775 0.28
776 0.27
777 0.26
778 0.24
779 0.2
780 0.2
781 0.2
782 0.21
783 0.23
784 0.22
785 0.21
786 0.26
787 0.26
788 0.32
789 0.38
790 0.4
791 0.42
792 0.49
793 0.55
794 0.56
795 0.58
796 0.58
797 0.56
798 0.53
799 0.49
800 0.45
801 0.41
802 0.35
803 0.32
804 0.28
805 0.22
806 0.21
807 0.2
808 0.17
809 0.14
810 0.14
811 0.13
812 0.08
813 0.07
814 0.05
815 0.05
816 0.05
817 0.06
818 0.07
819 0.07
820 0.07
821 0.07
822 0.08
823 0.1
824 0.1
825 0.1
826 0.11
827 0.12
828 0.12
829 0.13
830 0.15
831 0.13
832 0.13
833 0.12
834 0.1
835 0.12
836 0.14
837 0.12
838 0.12
839 0.14
840 0.16
841 0.24
842 0.3
843 0.38
844 0.43
845 0.5
846 0.55
847 0.6
848 0.61
849 0.58
850 0.6
851 0.57
852 0.56
853 0.54
854 0.48
855 0.44
856 0.47
857 0.44
858 0.37
859 0.32
860 0.27
861 0.24
862 0.29
863 0.29
864 0.24
865 0.23
866 0.23
867 0.22
868 0.19
869 0.2
870 0.15
871 0.15
872 0.15
873 0.15
874 0.15
875 0.14
876 0.14
877 0.14
878 0.17
879 0.15
880 0.16
881 0.19
882 0.19
883 0.19
884 0.19
885 0.2
886 0.18
887 0.16
888 0.18
889 0.17
890 0.17
891 0.17
892 0.16
893 0.13
894 0.11
895 0.11
896 0.07
897 0.05
898 0.05
899 0.05
900 0.06
901 0.05
902 0.05
903 0.05
904 0.06
905 0.08
906 0.1
907 0.1
908 0.11
909 0.12
910 0.13
911 0.16
912 0.19
913 0.26
914 0.34
915 0.39
916 0.45
917 0.52
918 0.56
919 0.57
920 0.58
921 0.6
922 0.61
923 0.65
924 0.67
925 0.62
926 0.65
927 0.64
928 0.66
929 0.57
930 0.51
931 0.41
932 0.33
933 0.31
934 0.23
935 0.2
936 0.14
937 0.11
938 0.07
939 0.07
940 0.06
941 0.07
942 0.08
943 0.08
944 0.08
945 0.08
946 0.09
947 0.08
948 0.09
949 0.12
950 0.12
951 0.13
952 0.16
953 0.21
954 0.21
955 0.24
956 0.25
957 0.28
958 0.32
959 0.35
960 0.38
961 0.38
962 0.39
963 0.4
964 0.45
965 0.43
966 0.43
967 0.43
968 0.42
969 0.47
970 0.46
971 0.46
972 0.42
973 0.44
974 0.46
975 0.5
976 0.5
977 0.44
978 0.43
979 0.4
980 0.37
981 0.32
982 0.26
983 0.18
984 0.13
985 0.1
986 0.13
987 0.18
988 0.18
989 0.21
990 0.22
991 0.21
992 0.24
993 0.25
994 0.22
995 0.18
996 0.18
997 0.17
998 0.17
999 0.16
1000 0.15
1001 0.12
1002 0.11
1003 0.1
1004 0.09
1005 0.08
1006 0.06
1007 0.07
1008 0.06
1009 0.06
1010 0.06
1011 0.06
1012 0.07
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.1
1017 0.15
1018 0.14
1019 0.15
1020 0.16
1021 0.2
1022 0.23
1023 0.23
1024 0.22
1025 0.19
1026 0.19
1027 0.2
1028 0.21
1029 0.16
1030 0.16
1031 0.18
1032 0.2
1033 0.21
1034 0.23
1035 0.24
1036 0.24
1037 0.24
1038 0.24
1039 0.3
1040 0.3
1041 0.3
1042 0.34
1043 0.41
1044 0.44
1045 0.44
1046 0.46
1047 0.4
1048 0.43
1049 0.42
1050 0.35
1051 0.29
1052 0.27
1053 0.32
1054 0.28
1055 0.26
1056 0.21
1057 0.21
1058 0.22
1059 0.2
1060 0.18
1061 0.12
1062 0.17
1063 0.19
1064 0.19
1065 0.24
1066 0.25
1067 0.28
1068 0.3
1069 0.32
1070 0.3
1071 0.35
1072 0.44
1073 0.46
1074 0.49
1075 0.5
1076 0.52
1077 0.51
1078 0.53
1079 0.55
1080 0.53
1081 0.54
1082 0.54
1083 0.51
1084 0.5
1085 0.54
1086 0.48
1087 0.39
1088 0.32
1089 0.27