Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9Y930

Protein Details
Accession A0A4Y9Y930    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-73AESPKPTTPPSKRKPSESSTKPAKKKRKKQQKPVQDAAERYHydrophilic
117-141SMSTGPPIKSRRRRAWSPSAPLRDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-64SPKPTTPPSKRKPSESSTKPAKKKRKKQQK
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 6.5, cyto_nucl 5.5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MLSAVAARKARLEGKQVSVQAAPPPPKRATVSAESPKPTTPPSKRKPSESSTKPAKKKRKKQQKPVQDAAERYFAEDAFKMQQDVIVVGDSSESEDDFVDAQFAEEMGAATAGPSGSMSTGPPIKSRRRRAWSPSAPLRDSSDEEDDDNIDDDVAAIPTHPVVAPVAGPSRTMPKVLSTFQPVLGQNMFYLTPEEAKTLELQSSQSDDIGTLIVLHASDTLALLGTYCLTVLQGAVSLTGSIVSASHTCHRIFAPRSSPIPVIRSVAANLSHRTIELPDRIRPAVGSGAAVVLLQELQTGVERLGLVCRTFEGVFSPSRFQSKMSTIDLNLRGVYMLRTETSDASPFIMPPSWEAAASSVVAHAANPQKMSYSRSVYLVKGPRNTGKSTFAKVLLNALLTRYRRVAFLECDLGQSEFTPAGMVALNILDAPVFGPAFTHPGLPYASHFVGATSPKSSPSYYLECVSALIQSYNLDVQHGALLNDYDEKGVDHDKITDTIPLVVNTMGWTRGLGSDLSLKIEEAVEPSQIFELEAPQGDDGYATNPPFDGTPSRIRAPLLAHGPDGDDRIRRLEAVPPSAASNFFTAADHRTLSVLSYFHATFILPSSDATVATATSASSCVARTWDVTLPLCAQLPYEVDCQAAFDQVVLIGAGMEDVVPSELVHVLNGAIVGLVQCEAGTMDDLTSDTELSVPGLPYTQGSPPPPSFSSKCCGLALVRGISQSATGTLMHIITPVPSEQLANVRVLIKGELELPVWGMLDFRNTQGDVAGVERDNVPFLRWGKSEGVGAERRRVRRNLMRRGQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.5
3 0.5
4 0.48
5 0.44
6 0.41
7 0.4
8 0.41
9 0.43
10 0.42
11 0.46
12 0.45
13 0.49
14 0.51
15 0.5
16 0.49
17 0.48
18 0.53
19 0.55
20 0.6
21 0.58
22 0.56
23 0.53
24 0.49
25 0.47
26 0.48
27 0.49
28 0.53
29 0.6
30 0.69
31 0.73
32 0.79
33 0.82
34 0.79
35 0.8
36 0.76
37 0.77
38 0.77
39 0.81
40 0.82
41 0.84
42 0.87
43 0.88
44 0.91
45 0.92
46 0.93
47 0.94
48 0.95
49 0.96
50 0.96
51 0.95
52 0.93
53 0.91
54 0.87
55 0.8
56 0.72
57 0.69
58 0.57
59 0.49
60 0.41
61 0.31
62 0.27
63 0.23
64 0.22
65 0.19
66 0.2
67 0.19
68 0.17
69 0.18
70 0.16
71 0.16
72 0.14
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.09
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.1
107 0.15
108 0.16
109 0.22
110 0.29
111 0.39
112 0.49
113 0.59
114 0.65
115 0.7
116 0.77
117 0.81
118 0.85
119 0.84
120 0.84
121 0.83
122 0.81
123 0.73
124 0.67
125 0.62
126 0.55
127 0.48
128 0.43
129 0.37
130 0.3
131 0.29
132 0.28
133 0.24
134 0.21
135 0.19
136 0.14
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.19
158 0.19
159 0.2
160 0.18
161 0.2
162 0.24
163 0.26
164 0.28
165 0.28
166 0.29
167 0.29
168 0.34
169 0.29
170 0.29
171 0.27
172 0.24
173 0.17
174 0.17
175 0.16
176 0.11
177 0.13
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.15
191 0.15
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.08
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.08
233 0.11
234 0.14
235 0.14
236 0.16
237 0.17
238 0.23
239 0.26
240 0.3
241 0.32
242 0.34
243 0.36
244 0.38
245 0.4
246 0.35
247 0.34
248 0.29
249 0.26
250 0.22
251 0.21
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.16
263 0.2
264 0.22
265 0.24
266 0.27
267 0.27
268 0.27
269 0.25
270 0.22
271 0.18
272 0.15
273 0.12
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.06
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.15
303 0.17
304 0.15
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.2
309 0.21
310 0.24
311 0.25
312 0.25
313 0.23
314 0.3
315 0.3
316 0.27
317 0.23
318 0.18
319 0.15
320 0.14
321 0.13
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.08
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.08
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.08
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.14
356 0.15
357 0.19
358 0.19
359 0.19
360 0.19
361 0.22
362 0.24
363 0.23
364 0.29
365 0.31
366 0.31
367 0.3
368 0.31
369 0.33
370 0.34
371 0.36
372 0.31
373 0.33
374 0.32
375 0.32
376 0.31
377 0.28
378 0.26
379 0.24
380 0.23
381 0.16
382 0.14
383 0.12
384 0.11
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.16
392 0.17
393 0.15
394 0.16
395 0.19
396 0.17
397 0.17
398 0.17
399 0.15
400 0.12
401 0.11
402 0.09
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.03
414 0.03
415 0.02
416 0.02
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.04
422 0.04
423 0.07
424 0.07
425 0.08
426 0.07
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.1
436 0.12
437 0.13
438 0.14
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.14
443 0.14
444 0.14
445 0.17
446 0.21
447 0.21
448 0.22
449 0.2
450 0.19
451 0.19
452 0.17
453 0.13
454 0.09
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.08
471 0.08
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.1
480 0.11
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.11
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.12
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.1
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.11
502 0.11
503 0.13
504 0.12
505 0.12
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.06
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.07
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.12
536 0.14
537 0.21
538 0.25
539 0.26
540 0.27
541 0.27
542 0.28
543 0.27
544 0.29
545 0.26
546 0.24
547 0.22
548 0.21
549 0.22
550 0.21
551 0.2
552 0.17
553 0.14
554 0.13
555 0.16
556 0.16
557 0.16
558 0.16
559 0.21
560 0.23
561 0.25
562 0.25
563 0.22
564 0.24
565 0.24
566 0.23
567 0.18
568 0.14
569 0.12
570 0.11
571 0.11
572 0.11
573 0.13
574 0.14
575 0.13
576 0.13
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.13
581 0.1
582 0.09
583 0.12
584 0.12
585 0.11
586 0.12
587 0.11
588 0.09
589 0.11
590 0.12
591 0.09
592 0.09
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.09
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.05
602 0.05
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.07
608 0.09
609 0.1
610 0.11
611 0.14
612 0.16
613 0.19
614 0.19
615 0.21
616 0.2
617 0.21
618 0.21
619 0.17
620 0.14
621 0.12
622 0.13
623 0.14
624 0.14
625 0.14
626 0.13
627 0.13
628 0.15
629 0.14
630 0.13
631 0.1
632 0.08
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.05
637 0.05
638 0.04
639 0.03
640 0.03
641 0.03
642 0.03
643 0.02
644 0.03
645 0.03
646 0.04
647 0.04
648 0.05
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.03
664 0.04
665 0.04
666 0.05
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.07
672 0.08
673 0.08
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.07
678 0.08
679 0.09
680 0.09
681 0.08
682 0.09
683 0.09
684 0.1
685 0.13
686 0.15
687 0.18
688 0.21
689 0.27
690 0.28
691 0.34
692 0.34
693 0.39
694 0.38
695 0.37
696 0.4
697 0.38
698 0.39
699 0.34
700 0.34
701 0.28
702 0.31
703 0.32
704 0.3
705 0.26
706 0.23
707 0.23
708 0.22
709 0.21
710 0.16
711 0.11
712 0.1
713 0.09
714 0.09
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.08
721 0.1
722 0.09
723 0.1
724 0.1
725 0.1
726 0.12
727 0.18
728 0.19
729 0.18
730 0.2
731 0.19
732 0.2
733 0.2
734 0.19
735 0.14
736 0.13
737 0.14
738 0.13
739 0.12
740 0.12
741 0.12
742 0.11
743 0.11
744 0.1
745 0.09
746 0.08
747 0.13
748 0.14
749 0.14
750 0.17
751 0.17
752 0.18
753 0.17
754 0.17
755 0.13
756 0.14
757 0.16
758 0.12
759 0.14
760 0.15
761 0.15
762 0.17
763 0.16
764 0.16
765 0.19
766 0.21
767 0.26
768 0.25
769 0.29
770 0.3
771 0.32
772 0.33
773 0.29
774 0.34
775 0.36
776 0.38
777 0.43
778 0.48
779 0.52
780 0.57
781 0.6
782 0.62
783 0.66
784 0.73
785 0.75