Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9Y539

Protein Details
Accession A0A4Y9Y539    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-78FDENKNKNRDHDKSKSQAKHQKKSKAQTRGRSTDLDAERPRKKRKTDGDKVAETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-105NRDHDKSKSQAKHQKKSKAQTRGRSTDLDAERPRKKRKTDGDKVAETVKRPVKKPRKSEGAAASKSQKGKQPAK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
Amino Acid Sequences MRGRKPDPRESSSPEIQIIEKPAAFDENKNKNRDHDKSKSQAKHQKKSKAQTRGRSTDLDAERPRKKRKTDGDKVAETVKRPVKKPRKSEGAAASKSQKGKQPAKGSSDSSPQAGPSPQEDDRIIADHPLCKWPDTISGDENYQREFINCDNCDAWFHYGCVGLAADDPRLTEEDSKFFCPPCEVATEEREGQHASQQNKTAQCARPDCQSSETGQWFIECIVGRRPSLTQPSNNGVPKFLWLVKWSGYEMKDATWEFPENLGDPAQLVSEFEVAAELENKDLSDPHKPTLLNEAAKCWS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.49
3 0.42
4 0.39
5 0.35
6 0.3
7 0.25
8 0.23
9 0.21
10 0.24
11 0.24
12 0.27
13 0.34
14 0.41
15 0.48
16 0.51
17 0.52
18 0.55
19 0.64
20 0.66
21 0.65
22 0.64
23 0.66
24 0.72
25 0.8
26 0.8
27 0.8
28 0.82
29 0.83
30 0.84
31 0.84
32 0.85
33 0.84
34 0.87
35 0.86
36 0.87
37 0.85
38 0.85
39 0.86
40 0.82
41 0.76
42 0.68
43 0.61
44 0.59
45 0.54
46 0.52
47 0.49
48 0.51
49 0.55
50 0.6
51 0.68
52 0.66
53 0.7
54 0.71
55 0.75
56 0.78
57 0.81
58 0.83
59 0.82
60 0.76
61 0.72
62 0.68
63 0.6
64 0.5
65 0.48
66 0.44
67 0.41
68 0.42
69 0.51
70 0.55
71 0.62
72 0.69
73 0.71
74 0.73
75 0.7
76 0.75
77 0.74
78 0.72
79 0.65
80 0.59
81 0.54
82 0.48
83 0.48
84 0.43
85 0.39
86 0.38
87 0.43
88 0.48
89 0.53
90 0.54
91 0.58
92 0.58
93 0.56
94 0.5
95 0.48
96 0.41
97 0.33
98 0.28
99 0.22
100 0.2
101 0.18
102 0.16
103 0.12
104 0.16
105 0.16
106 0.18
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.19
122 0.2
123 0.22
124 0.19
125 0.2
126 0.21
127 0.23
128 0.23
129 0.17
130 0.15
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.17
136 0.17
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.19
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.11
161 0.15
162 0.17
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.17
168 0.17
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.17
179 0.16
180 0.18
181 0.21
182 0.21
183 0.23
184 0.27
185 0.31
186 0.32
187 0.34
188 0.36
189 0.35
190 0.4
191 0.41
192 0.39
193 0.42
194 0.43
195 0.43
196 0.38
197 0.36
198 0.32
199 0.33
200 0.33
201 0.27
202 0.23
203 0.21
204 0.19
205 0.17
206 0.17
207 0.11
208 0.11
209 0.16
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.22
214 0.24
215 0.32
216 0.36
217 0.34
218 0.37
219 0.42
220 0.48
221 0.51
222 0.46
223 0.39
224 0.34
225 0.32
226 0.31
227 0.27
228 0.22
229 0.19
230 0.21
231 0.22
232 0.23
233 0.23
234 0.24
235 0.24
236 0.25
237 0.24
238 0.22
239 0.24
240 0.23
241 0.23
242 0.21
243 0.22
244 0.2
245 0.21
246 0.22
247 0.18
248 0.19
249 0.17
250 0.14
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.14
271 0.21
272 0.24
273 0.26
274 0.31
275 0.31
276 0.32
277 0.4
278 0.44
279 0.42
280 0.4