Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Y9YTM3

Protein Details
Accession A0A4Y9YTM3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-262SEKLKKAEQKREEKRLRQIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-276KLKKAEQKREEKRLRQIANSRASAAGKRKRPG
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_mito 8.5, nucl 6, mito 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR014816  tRNA_MeTrfase_Gcd14  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08704  GCD14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51620  SAM_TRM61  
Amino Acid Sequences MWSTAREIAAGDLVIVWLTRDAVQPLVITPGKELNGKYGVYRHSDLIGVPYGSKIGSRNGRGFIHVLRPTPELWTLALPHRTQILYIADIAFVSSWLNIKPGSRIIEAGPAGHLWSYEFHEARVNKAREEFSCHGMDDIVTLTHRNVCKDGFTVLDTVDAVFLDLPMPWEAVEHAKKALRKDRTTRICCFSPCMEQVLRTVTALNDAGFTAHCVPRDITMYETLLRPHQVDSVPALPHIGQVSEKLKKAEQKREEKRLRQIANSRASAAGKRKRPGDADESDGGRAEGSAGKRPKTDDEDDVLQHEDGQLPQAENHPSGRSAGAAETEEAKFPQSVTESATPTKTTFSKTFPEVRGHTSYLTFACLLPAIPSAQADPATQEPVSSSGLPVEVVHLRPHSDTCADK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.05
5 0.07
6 0.08
7 0.1
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.2
14 0.2
15 0.18
16 0.19
17 0.22
18 0.23
19 0.26
20 0.26
21 0.25
22 0.27
23 0.27
24 0.28
25 0.29
26 0.3
27 0.33
28 0.35
29 0.3
30 0.28
31 0.28
32 0.26
33 0.25
34 0.24
35 0.19
36 0.17
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.15
41 0.13
42 0.18
43 0.25
44 0.3
45 0.34
46 0.39
47 0.4
48 0.41
49 0.42
50 0.37
51 0.39
52 0.37
53 0.35
54 0.33
55 0.33
56 0.31
57 0.31
58 0.29
59 0.21
60 0.19
61 0.19
62 0.19
63 0.24
64 0.28
65 0.25
66 0.25
67 0.27
68 0.25
69 0.23
70 0.24
71 0.21
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.09
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.12
88 0.16
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.25
94 0.24
95 0.22
96 0.18
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.06
102 0.08
103 0.11
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.22
108 0.23
109 0.28
110 0.36
111 0.34
112 0.3
113 0.34
114 0.36
115 0.31
116 0.4
117 0.36
118 0.3
119 0.31
120 0.29
121 0.25
122 0.23
123 0.21
124 0.13
125 0.11
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.11
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.15
162 0.17
163 0.2
164 0.25
165 0.33
166 0.35
167 0.39
168 0.45
169 0.53
170 0.61
171 0.64
172 0.64
173 0.61
174 0.56
175 0.51
176 0.47
177 0.39
178 0.33
179 0.29
180 0.28
181 0.23
182 0.2
183 0.21
184 0.2
185 0.18
186 0.14
187 0.13
188 0.09
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.15
204 0.14
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.14
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.12
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.06
228 0.1
229 0.15
230 0.18
231 0.2
232 0.2
233 0.23
234 0.29
235 0.37
236 0.44
237 0.48
238 0.56
239 0.63
240 0.72
241 0.79
242 0.79
243 0.81
244 0.8
245 0.74
246 0.7
247 0.69
248 0.66
249 0.64
250 0.58
251 0.5
252 0.42
253 0.4
254 0.38
255 0.39
256 0.38
257 0.38
258 0.41
259 0.43
260 0.45
261 0.47
262 0.48
263 0.47
264 0.41
265 0.4
266 0.4
267 0.38
268 0.34
269 0.31
270 0.25
271 0.17
272 0.14
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.18
277 0.22
278 0.24
279 0.25
280 0.28
281 0.32
282 0.36
283 0.38
284 0.34
285 0.36
286 0.38
287 0.37
288 0.37
289 0.33
290 0.26
291 0.22
292 0.18
293 0.14
294 0.1
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.12
299 0.16
300 0.18
301 0.18
302 0.2
303 0.19
304 0.18
305 0.19
306 0.18
307 0.15
308 0.13
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.14
321 0.13
322 0.14
323 0.18
324 0.22
325 0.24
326 0.26
327 0.28
328 0.26
329 0.25
330 0.28
331 0.25
332 0.26
333 0.27
334 0.29
335 0.33
336 0.37
337 0.44
338 0.44
339 0.5
340 0.47
341 0.49
342 0.5
343 0.47
344 0.43
345 0.36
346 0.35
347 0.28
348 0.27
349 0.21
350 0.16
351 0.15
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.13
363 0.15
364 0.17
365 0.2
366 0.19
367 0.18
368 0.17
369 0.18
370 0.21
371 0.18
372 0.16
373 0.14
374 0.15
375 0.15
376 0.14
377 0.15
378 0.16
379 0.17
380 0.21
381 0.21
382 0.23
383 0.25
384 0.27
385 0.27