Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Y9Z3A4

Protein Details
Accession A0A4Y9Z3A4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
432-454EAERSDQKRRRKQGKIQHMSRYNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
439-443KRRRK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.5, cyto 7, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSYFGFDNPIDLESEKRKFLESGGQGSREDIAVYTWGEQGYDGLGDELHEGGDELNDETFGGVGEVGKDFDFSHTVLPSDDLPQAAPSRAQQARPQVYEQPPSQPVQSSAASRPTHSLESVWDDKSPFSVLGRMNGVSRSTEPHHPSHTPSPSQSFKFSPFSATNNEPLPAGQPLGGISSGLSKGAYTLEEVEAEMRAQAALQHQQQQQQQIAQPTSLTHTQMRAQIPRQGTPQHAASPPPRMHPHSQSPRFHQQQQQHQIHLMHVQQQQQERQLLDLARHRERQKLLQEQQLLQQQQQQQIMEQLRLEEIERARQIRLQQMQSANHMHSPLLHQRQSPALSERHPRSVGRQSPAIMGGVGALGGAPLEVPLQQSLAYMPHDIQLQQRLLAEMAQAEFLNSMQGGPQSEREIREERELQEMLRAEAMRKIMEAERSDQKRRRKQGKIQHMSRYNDLMTQSDKDFITRIQVSQLVTQDPYADDFYAQVYGAIIRSRMGIQTQDDRILKFGSGAGVGLGPGQKGSGRRPSAMQRMEAQVERIVNNAKMREKEKISLNSLQGALGKTSGRSYKAAPRQLLQVDASSPSPSPAHAHISKVDEEPRKDGMSAAHEAAKIGHQALGGAANSEGVIAKDPLKHREALMILERLYDLVLDIEQLRRDQPLPEDGFEAQDAWEVELDARVQQLLTGLRLHVYLETSVPHPFISLLMPIKGKRLLPRVVRHLPSERILTMLTLIIACFHQVDVVVNSPKLDTLEESKERAEVEQHSEVFLSSLVQSVLPAIGKLDLSMLTGLLGMLFKHNDVAAVARTPPGIALLTMFLSRVQNIKEAIASVPMTTAEPELPDPIDERRWQEVFDELFNVLAPGLLLLFPSIRISKNSGGSVPYGKVPGTDDMDQPIWQFLAAMAVHSSMEQQQYLVTALRELVLENVSSVRRGFLASEEEREKRMGNVDIFMRALGLDSSQIAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.3
4 0.31
5 0.3
6 0.32
7 0.37
8 0.34
9 0.39
10 0.41
11 0.43
12 0.41
13 0.41
14 0.39
15 0.3
16 0.25
17 0.16
18 0.12
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.11
58 0.13
59 0.12
60 0.15
61 0.15
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.15
69 0.15
70 0.17
71 0.19
72 0.18
73 0.19
74 0.17
75 0.25
76 0.28
77 0.31
78 0.34
79 0.42
80 0.49
81 0.51
82 0.53
83 0.53
84 0.55
85 0.59
86 0.55
87 0.52
88 0.47
89 0.45
90 0.43
91 0.37
92 0.33
93 0.31
94 0.32
95 0.29
96 0.29
97 0.36
98 0.35
99 0.34
100 0.35
101 0.34
102 0.34
103 0.3
104 0.27
105 0.22
106 0.29
107 0.32
108 0.29
109 0.27
110 0.25
111 0.25
112 0.26
113 0.24
114 0.17
115 0.14
116 0.19
117 0.18
118 0.22
119 0.24
120 0.23
121 0.23
122 0.24
123 0.24
124 0.21
125 0.21
126 0.22
127 0.23
128 0.31
129 0.34
130 0.37
131 0.42
132 0.42
133 0.47
134 0.51
135 0.54
136 0.5
137 0.49
138 0.52
139 0.53
140 0.53
141 0.51
142 0.45
143 0.43
144 0.44
145 0.4
146 0.39
147 0.35
148 0.36
149 0.37
150 0.37
151 0.36
152 0.32
153 0.32
154 0.26
155 0.24
156 0.22
157 0.18
158 0.15
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.08
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.08
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.1
188 0.15
189 0.18
190 0.26
191 0.29
192 0.35
193 0.39
194 0.42
195 0.41
196 0.4
197 0.4
198 0.39
199 0.37
200 0.31
201 0.28
202 0.24
203 0.26
204 0.24
205 0.23
206 0.18
207 0.2
208 0.23
209 0.29
210 0.33
211 0.34
212 0.34
213 0.38
214 0.39
215 0.4
216 0.4
217 0.38
218 0.36
219 0.34
220 0.35
221 0.33
222 0.32
223 0.33
224 0.32
225 0.37
226 0.36
227 0.38
228 0.41
229 0.42
230 0.46
231 0.49
232 0.57
233 0.59
234 0.66
235 0.65
236 0.68
237 0.73
238 0.72
239 0.71
240 0.68
241 0.65
242 0.67
243 0.72
244 0.69
245 0.6
246 0.59
247 0.54
248 0.47
249 0.43
250 0.34
251 0.31
252 0.3
253 0.33
254 0.33
255 0.37
256 0.39
257 0.39
258 0.4
259 0.32
260 0.3
261 0.29
262 0.25
263 0.25
264 0.28
265 0.29
266 0.32
267 0.38
268 0.39
269 0.42
270 0.45
271 0.49
272 0.51
273 0.55
274 0.55
275 0.56
276 0.58
277 0.53
278 0.55
279 0.53
280 0.46
281 0.36
282 0.37
283 0.34
284 0.35
285 0.36
286 0.31
287 0.25
288 0.3
289 0.31
290 0.27
291 0.22
292 0.18
293 0.15
294 0.16
295 0.16
296 0.14
297 0.13
298 0.17
299 0.19
300 0.2
301 0.21
302 0.23
303 0.25
304 0.28
305 0.34
306 0.31
307 0.34
308 0.38
309 0.39
310 0.4
311 0.41
312 0.34
313 0.29
314 0.27
315 0.21
316 0.17
317 0.2
318 0.24
319 0.29
320 0.3
321 0.29
322 0.3
323 0.35
324 0.35
325 0.33
326 0.28
327 0.24
328 0.26
329 0.34
330 0.35
331 0.36
332 0.37
333 0.35
334 0.37
335 0.44
336 0.46
337 0.41
338 0.41
339 0.36
340 0.35
341 0.36
342 0.29
343 0.19
344 0.13
345 0.1
346 0.07
347 0.05
348 0.04
349 0.03
350 0.02
351 0.02
352 0.02
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.16
372 0.15
373 0.16
374 0.16
375 0.15
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.11
395 0.14
396 0.15
397 0.19
398 0.22
399 0.22
400 0.26
401 0.28
402 0.26
403 0.29
404 0.28
405 0.24
406 0.24
407 0.22
408 0.18
409 0.17
410 0.15
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.1
415 0.1
416 0.12
417 0.11
418 0.15
419 0.16
420 0.17
421 0.25
422 0.3
423 0.37
424 0.42
425 0.5
426 0.56
427 0.64
428 0.7
429 0.71
430 0.76
431 0.79
432 0.84
433 0.84
434 0.81
435 0.8
436 0.78
437 0.71
438 0.64
439 0.56
440 0.45
441 0.37
442 0.3
443 0.23
444 0.17
445 0.16
446 0.14
447 0.15
448 0.14
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.14
457 0.15
458 0.17
459 0.18
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.1
465 0.1
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.08
485 0.09
486 0.14
487 0.15
488 0.19
489 0.19
490 0.19
491 0.19
492 0.18
493 0.16
494 0.12
495 0.11
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.06
508 0.08
509 0.11
510 0.19
511 0.21
512 0.22
513 0.25
514 0.31
515 0.38
516 0.39
517 0.37
518 0.31
519 0.32
520 0.33
521 0.3
522 0.25
523 0.18
524 0.17
525 0.16
526 0.15
527 0.14
528 0.13
529 0.15
530 0.17
531 0.18
532 0.21
533 0.23
534 0.27
535 0.28
536 0.3
537 0.35
538 0.37
539 0.39
540 0.4
541 0.39
542 0.36
543 0.33
544 0.29
545 0.24
546 0.2
547 0.15
548 0.11
549 0.11
550 0.09
551 0.11
552 0.12
553 0.13
554 0.14
555 0.16
556 0.24
557 0.32
558 0.38
559 0.37
560 0.36
561 0.39
562 0.39
563 0.38
564 0.29
565 0.22
566 0.17
567 0.17
568 0.16
569 0.12
570 0.11
571 0.1
572 0.1
573 0.09
574 0.11
575 0.12
576 0.18
577 0.18
578 0.2
579 0.21
580 0.24
581 0.25
582 0.25
583 0.3
584 0.29
585 0.29
586 0.3
587 0.3
588 0.28
589 0.26
590 0.25
591 0.2
592 0.19
593 0.2
594 0.18
595 0.17
596 0.17
597 0.17
598 0.16
599 0.15
600 0.11
601 0.1
602 0.1
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.08
608 0.07
609 0.07
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.05
614 0.04
615 0.05
616 0.06
617 0.08
618 0.12
619 0.15
620 0.19
621 0.21
622 0.22
623 0.21
624 0.25
625 0.24
626 0.23
627 0.24
628 0.22
629 0.2
630 0.19
631 0.19
632 0.14
633 0.13
634 0.1
635 0.06
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.07
641 0.08
642 0.09
643 0.1
644 0.11
645 0.12
646 0.13
647 0.15
648 0.21
649 0.23
650 0.23
651 0.24
652 0.23
653 0.23
654 0.21
655 0.19
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.05
670 0.08
671 0.08
672 0.09
673 0.1
674 0.09
675 0.1
676 0.1
677 0.11
678 0.09
679 0.09
680 0.08
681 0.08
682 0.09
683 0.1
684 0.11
685 0.11
686 0.1
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.09
691 0.11
692 0.12
693 0.14
694 0.16
695 0.17
696 0.2
697 0.22
698 0.24
699 0.27
700 0.32
701 0.37
702 0.43
703 0.5
704 0.56
705 0.61
706 0.61
707 0.59
708 0.58
709 0.54
710 0.49
711 0.45
712 0.36
713 0.29
714 0.27
715 0.22
716 0.17
717 0.13
718 0.11
719 0.07
720 0.07
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.05
726 0.05
727 0.06
728 0.08
729 0.08
730 0.13
731 0.15
732 0.15
733 0.15
734 0.15
735 0.16
736 0.15
737 0.14
738 0.11
739 0.15
740 0.23
741 0.25
742 0.27
743 0.26
744 0.27
745 0.26
746 0.25
747 0.23
748 0.19
749 0.23
750 0.27
751 0.26
752 0.26
753 0.25
754 0.24
755 0.21
756 0.17
757 0.12
758 0.07
759 0.08
760 0.07
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.08
765 0.07
766 0.07
767 0.06
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.08
772 0.07
773 0.08
774 0.08
775 0.07
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.07
783 0.07
784 0.07
785 0.08
786 0.09
787 0.09
788 0.09
789 0.11
790 0.1
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.12
795 0.12
796 0.12
797 0.11
798 0.1
799 0.08
800 0.08
801 0.08
802 0.09
803 0.09
804 0.1
805 0.1
806 0.1
807 0.12
808 0.14
809 0.14
810 0.17
811 0.18
812 0.19
813 0.18
814 0.18
815 0.17
816 0.17
817 0.16
818 0.13
819 0.12
820 0.12
821 0.12
822 0.11
823 0.12
824 0.09
825 0.1
826 0.11
827 0.12
828 0.12
829 0.13
830 0.14
831 0.16
832 0.21
833 0.23
834 0.27
835 0.31
836 0.32
837 0.32
838 0.31
839 0.34
840 0.31
841 0.29
842 0.26
843 0.2
844 0.19
845 0.18
846 0.17
847 0.1
848 0.08
849 0.06
850 0.04
851 0.04
852 0.04
853 0.04
854 0.05
855 0.05
856 0.06
857 0.09
858 0.11
859 0.13
860 0.16
861 0.21
862 0.26
863 0.31
864 0.33
865 0.31
866 0.31
867 0.32
868 0.34
869 0.3
870 0.27
871 0.23
872 0.21
873 0.2
874 0.21
875 0.23
876 0.25
877 0.25
878 0.24
879 0.27
880 0.29
881 0.28
882 0.26
883 0.23
884 0.17
885 0.14
886 0.13
887 0.09
888 0.12
889 0.12
890 0.12
891 0.11
892 0.12
893 0.12
894 0.12
895 0.14
896 0.12
897 0.14
898 0.13
899 0.13
900 0.12
901 0.14
902 0.15
903 0.16
904 0.12
905 0.11
906 0.12
907 0.12
908 0.12
909 0.11
910 0.12
911 0.11
912 0.1
913 0.1
914 0.13
915 0.13
916 0.15
917 0.15
918 0.14
919 0.13
920 0.14
921 0.14
922 0.14
923 0.22
924 0.23
925 0.3
926 0.35
927 0.37
928 0.38
929 0.38
930 0.36
931 0.3
932 0.33
933 0.33
934 0.29
935 0.31
936 0.32
937 0.33
938 0.32
939 0.29
940 0.24
941 0.17
942 0.16
943 0.11
944 0.1
945 0.08