Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZFK3

Protein Details
Accession A0A4Y9ZFK3    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34MYVPERGSKRSKLKVCWKSRQQTGVPHydrophilic
48-79TDLWKSRKDEGDRRRRWHCRERPRASHVQREABasic
120-146ESSSKPPKSTSPPQKKRKLPPLAPQLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-137KKRK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 11, nucl 9.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MIWEVFCHMYVPERGSKRSKLKVCWKSRQQTGVPDLKFRTAVWLFDQTDLWKSRKDEGDRRRRWHCRERPRASHVQREADHVPDAEILVVLALVRLDLHLLRMKRTAIVSYSDSSESEAESSSKPPKSTSPPQKKRKLPPLAPQLTLPIPVDDPSKHQGRVRTTPHAEGQWAAYVYAQISLNDTENAKLKKAVRKAFDRAREKVPGLHSLCSTIAGKTEGLFEGPNEDLENLHVSLTRPFFLRAHQREEVKRAIRAVAKSHKQFIASFASFSELMNDERTRTFLCMEVGGGHNEFRELSDALTPTLRAFKQKEYYERPRFHASFAWALLEGSTPPIPSDPSDTPVAPSRDDLGALTPTSGLPRPLKRYTSSPAPSTAPVPKPASLPAIPSFPPDLVPDLNADFAKVLVSPTCAFEVRELKVRIGKDVFGWSLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.45
3 0.54
4 0.58
5 0.65
6 0.69
7 0.7
8 0.77
9 0.81
10 0.85
11 0.87
12 0.88
13 0.87
14 0.87
15 0.86
16 0.8
17 0.79
18 0.77
19 0.75
20 0.66
21 0.63
22 0.57
23 0.51
24 0.47
25 0.38
26 0.38
27 0.31
28 0.31
29 0.29
30 0.35
31 0.33
32 0.34
33 0.35
34 0.28
35 0.33
36 0.35
37 0.33
38 0.3
39 0.31
40 0.37
41 0.44
42 0.51
43 0.54
44 0.61
45 0.71
46 0.75
47 0.8
48 0.83
49 0.84
50 0.85
51 0.86
52 0.86
53 0.86
54 0.88
55 0.9
56 0.89
57 0.88
58 0.89
59 0.84
60 0.84
61 0.79
62 0.77
63 0.67
64 0.65
65 0.58
66 0.5
67 0.45
68 0.35
69 0.29
70 0.2
71 0.19
72 0.13
73 0.1
74 0.07
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.04
84 0.04
85 0.08
86 0.12
87 0.14
88 0.16
89 0.19
90 0.2
91 0.22
92 0.23
93 0.22
94 0.19
95 0.22
96 0.23
97 0.21
98 0.23
99 0.21
100 0.2
101 0.19
102 0.18
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.14
109 0.19
110 0.22
111 0.22
112 0.23
113 0.29
114 0.36
115 0.45
116 0.53
117 0.58
118 0.66
119 0.76
120 0.84
121 0.87
122 0.89
123 0.88
124 0.88
125 0.84
126 0.83
127 0.84
128 0.79
129 0.7
130 0.61
131 0.53
132 0.43
133 0.38
134 0.28
135 0.18
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.12
140 0.16
141 0.18
142 0.21
143 0.23
144 0.25
145 0.3
146 0.34
147 0.42
148 0.44
149 0.48
150 0.47
151 0.48
152 0.48
153 0.43
154 0.37
155 0.29
156 0.25
157 0.19
158 0.16
159 0.13
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.15
173 0.16
174 0.15
175 0.18
176 0.22
177 0.28
178 0.35
179 0.4
180 0.4
181 0.45
182 0.52
183 0.56
184 0.61
185 0.6
186 0.56
187 0.55
188 0.53
189 0.48
190 0.44
191 0.39
192 0.37
193 0.33
194 0.31
195 0.26
196 0.24
197 0.23
198 0.21
199 0.19
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.09
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.17
229 0.27
230 0.27
231 0.33
232 0.36
233 0.41
234 0.42
235 0.46
236 0.49
237 0.41
238 0.38
239 0.33
240 0.32
241 0.31
242 0.3
243 0.32
244 0.34
245 0.39
246 0.39
247 0.42
248 0.4
249 0.38
250 0.36
251 0.33
252 0.32
253 0.25
254 0.23
255 0.2
256 0.2
257 0.19
258 0.18
259 0.17
260 0.1
261 0.11
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.14
266 0.16
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.12
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.11
292 0.16
293 0.16
294 0.19
295 0.21
296 0.27
297 0.35
298 0.4
299 0.48
300 0.52
301 0.63
302 0.67
303 0.68
304 0.67
305 0.68
306 0.63
307 0.57
308 0.52
309 0.45
310 0.39
311 0.35
312 0.31
313 0.22
314 0.21
315 0.19
316 0.15
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.18
326 0.17
327 0.19
328 0.22
329 0.22
330 0.24
331 0.3
332 0.31
333 0.25
334 0.24
335 0.24
336 0.22
337 0.22
338 0.2
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.11
344 0.11
345 0.13
346 0.14
347 0.16
348 0.21
349 0.28
350 0.35
351 0.41
352 0.45
353 0.46
354 0.51
355 0.53
356 0.57
357 0.55
358 0.5
359 0.48
360 0.47
361 0.44
362 0.43
363 0.45
364 0.38
365 0.39
366 0.4
367 0.38
368 0.37
369 0.38
370 0.4
371 0.32
372 0.33
373 0.29
374 0.3
375 0.28
376 0.3
377 0.29
378 0.23
379 0.24
380 0.21
381 0.22
382 0.19
383 0.19
384 0.19
385 0.17
386 0.2
387 0.18
388 0.17
389 0.13
390 0.12
391 0.12
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.12
396 0.13
397 0.15
398 0.18
399 0.19
400 0.19
401 0.24
402 0.29
403 0.29
404 0.37
405 0.37
406 0.38
407 0.43
408 0.43
409 0.44
410 0.4
411 0.38
412 0.32
413 0.36