Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XMP4

Protein Details
Accession A0A4Y9XMP4    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-377WGWLTKGKRTRKPGPKGPKNSNKMVHydrophilic
811-835TGTGSGSKSKRARKRARTYEGDEVFHydrophilic
864-889AAQQPLPLRRRPLRRRAPPALHPPLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-115RKNGGRNNHGRITVRHRGGGHKRRI
336-372HGGGRGKSKSNKHPRSPWGWLTKGKRTRKPGPKGPKN
818-826KSKRARKRA
871-920LRRRPLRRRAPPALHPPLAAAPHARAGLARPGAVRQTRRRGAERVSRGGG
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 3, nucl 1, plas 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR005880  Ribosomal_L2_bac/org-type  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR022671  Ribosomal_L2_CS  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR012583  RIX1_N  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
PF08167  RIX1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00467  RIBOSOMAL_L2  
Amino Acid Sequences MFSVRGGSSSLLRSCLSSLSPQTLTATRSNVLRGFATEAQRPTEVSEAFARTANLFKTYKPITPGIRHLRRPLNPHIWEGRPLRLLTVPLRKNGGRNNHGRITVRHRGGGHKRRIRLVDFVRDEPGLHDVVRIEYDPNRSAHIALIKNRNPEVDGRKKWSYILACEGLRAGSVVESFRQGIPDGFVPGYVDSKANRGKVLTEQTEGSSVQTNSGSLALGLLRAKTIRPGNVLPLRLIPTGTVIHNIALSPEGRGILVRSAGSFGQVIAHDDSGRYTQVRLQSGEVRKVLQDCCATIGKVSNPLWKNRSLGKAGRARWLGIRPTVRGVAMNANDHPHGGGRGKSKSNKHPRSPWGWLTKGKRTRKPGPKGPKNSNKMVQRAMDSPDTLRTFLQLQLATDAYAVLHLPYVLSVLSAQSLGPSEHLQKWTTRLSSLLYSKDPAARWAGLCLALQTSVLSKAIMMENAQGWIAIALPLLSKNEPVPNLKTAIRLLFRIFSAATDVPEFQRQLATPNVPKFGLALLTLADKHTDHELKILAIDVLSQLVPLYPTLLRPIQASLSSFCLRQLNGSAAPPTDPATLTSVSRLYAALPVTGGKVGAANLWRSAVDDTLNFAWDAFAGVRTTFPVEERLYAAQPRQGQTANEEALVAVPLNVDRLRCATAALCELLKFAHARPVQIPMGQLVQFCLALVRSTTEDKRDGHLDATRRAMEESVVPDLWIFGCSILDSLASSTRQHLAPHISRFVTVIVYHLEQPLPASHRLPFLRALTTLLKSSRPLHHPILPTRATKALLQPLTALLPSQSAVQTQAASTGTGSGSKSKRARKRARTYEGDEVFNIANAVMCPTVADGAVVLQSLEGVLAPPAAQQPLPLRRRPLRRRAPPALHPPLAAAPHARAGLARPGAVRQTRRRGAERVSRGGGGHDERAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.23
5 0.24
6 0.28
7 0.28
8 0.28
9 0.31
10 0.32
11 0.33
12 0.31
13 0.31
14 0.27
15 0.28
16 0.32
17 0.31
18 0.3
19 0.27
20 0.25
21 0.28
22 0.32
23 0.34
24 0.36
25 0.35
26 0.37
27 0.36
28 0.35
29 0.31
30 0.31
31 0.27
32 0.24
33 0.27
34 0.26
35 0.27
36 0.28
37 0.26
38 0.22
39 0.25
40 0.24
41 0.25
42 0.23
43 0.22
44 0.29
45 0.32
46 0.34
47 0.35
48 0.4
49 0.42
50 0.47
51 0.57
52 0.6
53 0.65
54 0.67
55 0.71
56 0.74
57 0.73
58 0.73
59 0.73
60 0.72
61 0.66
62 0.67
63 0.66
64 0.59
65 0.61
66 0.57
67 0.53
68 0.47
69 0.44
70 0.4
71 0.36
72 0.36
73 0.36
74 0.43
75 0.41
76 0.4
77 0.46
78 0.45
79 0.49
80 0.53
81 0.56
82 0.54
83 0.58
84 0.62
85 0.62
86 0.65
87 0.63
88 0.61
89 0.6
90 0.61
91 0.56
92 0.53
93 0.49
94 0.54
95 0.61
96 0.65
97 0.67
98 0.65
99 0.68
100 0.7
101 0.74
102 0.67
103 0.66
104 0.63
105 0.63
106 0.59
107 0.56
108 0.52
109 0.46
110 0.43
111 0.35
112 0.3
113 0.21
114 0.16
115 0.15
116 0.13
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.17
122 0.22
123 0.24
124 0.24
125 0.26
126 0.26
127 0.25
128 0.27
129 0.3
130 0.3
131 0.34
132 0.43
133 0.44
134 0.49
135 0.49
136 0.47
137 0.41
138 0.43
139 0.45
140 0.46
141 0.48
142 0.5
143 0.53
144 0.52
145 0.52
146 0.52
147 0.46
148 0.4
149 0.4
150 0.38
151 0.34
152 0.34
153 0.33
154 0.25
155 0.21
156 0.17
157 0.11
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.12
177 0.13
178 0.11
179 0.18
180 0.23
181 0.23
182 0.24
183 0.23
184 0.24
185 0.29
186 0.36
187 0.33
188 0.3
189 0.29
190 0.29
191 0.3
192 0.28
193 0.23
194 0.2
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.12
202 0.07
203 0.08
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.15
212 0.18
213 0.2
214 0.23
215 0.25
216 0.33
217 0.38
218 0.39
219 0.33
220 0.33
221 0.33
222 0.29
223 0.28
224 0.19
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.18
265 0.21
266 0.21
267 0.23
268 0.3
269 0.34
270 0.39
271 0.36
272 0.31
273 0.3
274 0.32
275 0.3
276 0.26
277 0.23
278 0.18
279 0.21
280 0.21
281 0.19
282 0.17
283 0.19
284 0.15
285 0.21
286 0.22
287 0.27
288 0.28
289 0.33
290 0.36
291 0.36
292 0.38
293 0.36
294 0.4
295 0.37
296 0.38
297 0.41
298 0.46
299 0.45
300 0.5
301 0.45
302 0.41
303 0.4
304 0.41
305 0.35
306 0.34
307 0.34
308 0.28
309 0.3
310 0.3
311 0.26
312 0.22
313 0.2
314 0.2
315 0.19
316 0.2
317 0.18
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.16
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.14
326 0.17
327 0.22
328 0.28
329 0.35
330 0.41
331 0.5
332 0.6
333 0.65
334 0.68
335 0.72
336 0.72
337 0.73
338 0.73
339 0.7
340 0.66
341 0.61
342 0.61
343 0.59
344 0.62
345 0.64
346 0.65
347 0.66
348 0.67
349 0.73
350 0.76
351 0.79
352 0.8
353 0.82
354 0.83
355 0.85
356 0.87
357 0.86
358 0.81
359 0.78
360 0.75
361 0.7
362 0.64
363 0.59
364 0.51
365 0.43
366 0.4
367 0.37
368 0.31
369 0.25
370 0.21
371 0.23
372 0.22
373 0.2
374 0.17
375 0.15
376 0.15
377 0.16
378 0.19
379 0.14
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.1
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.07
407 0.1
408 0.13
409 0.15
410 0.16
411 0.16
412 0.19
413 0.22
414 0.21
415 0.18
416 0.17
417 0.17
418 0.2
419 0.22
420 0.2
421 0.18
422 0.18
423 0.19
424 0.21
425 0.19
426 0.17
427 0.16
428 0.15
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.11
433 0.11
434 0.09
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.05
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.07
465 0.09
466 0.11
467 0.13
468 0.16
469 0.16
470 0.19
471 0.19
472 0.2
473 0.18
474 0.2
475 0.19
476 0.17
477 0.17
478 0.15
479 0.14
480 0.14
481 0.12
482 0.09
483 0.12
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.11
488 0.11
489 0.13
490 0.13
491 0.1
492 0.11
493 0.1
494 0.12
495 0.15
496 0.17
497 0.2
498 0.22
499 0.23
500 0.21
501 0.21
502 0.19
503 0.16
504 0.13
505 0.09
506 0.07
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.07
514 0.11
515 0.12
516 0.11
517 0.13
518 0.14
519 0.13
520 0.13
521 0.12
522 0.08
523 0.06
524 0.06
525 0.04
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.06
534 0.05
535 0.06
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.13
544 0.11
545 0.16
546 0.16
547 0.16
548 0.16
549 0.17
550 0.16
551 0.15
552 0.16
553 0.14
554 0.15
555 0.16
556 0.15
557 0.13
558 0.14
559 0.13
560 0.14
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.12
565 0.13
566 0.13
567 0.14
568 0.12
569 0.11
570 0.12
571 0.11
572 0.08
573 0.1
574 0.1
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.09
579 0.09
580 0.08
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.1
591 0.1
592 0.09
593 0.09
594 0.08
595 0.1
596 0.1
597 0.11
598 0.1
599 0.09
600 0.08
601 0.07
602 0.08
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.09
610 0.08
611 0.09
612 0.12
613 0.13
614 0.14
615 0.16
616 0.17
617 0.18
618 0.19
619 0.19
620 0.19
621 0.22
622 0.22
623 0.23
624 0.23
625 0.22
626 0.23
627 0.27
628 0.23
629 0.2
630 0.18
631 0.15
632 0.13
633 0.13
634 0.1
635 0.05
636 0.04
637 0.04
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.08
642 0.1
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.11
647 0.12
648 0.14
649 0.14
650 0.13
651 0.11
652 0.11
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.08
657 0.16
658 0.17
659 0.19
660 0.2
661 0.26
662 0.26
663 0.26
664 0.26
665 0.18
666 0.21
667 0.2
668 0.19
669 0.14
670 0.14
671 0.12
672 0.11
673 0.11
674 0.08
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.09
679 0.14
680 0.17
681 0.2
682 0.23
683 0.25
684 0.28
685 0.29
686 0.28
687 0.26
688 0.29
689 0.3
690 0.29
691 0.32
692 0.3
693 0.28
694 0.27
695 0.24
696 0.2
697 0.19
698 0.18
699 0.17
700 0.16
701 0.15
702 0.14
703 0.14
704 0.14
705 0.11
706 0.09
707 0.05
708 0.05
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.09
716 0.1
717 0.11
718 0.13
719 0.16
720 0.17
721 0.18
722 0.2
723 0.26
724 0.31
725 0.35
726 0.38
727 0.35
728 0.34
729 0.34
730 0.31
731 0.24
732 0.18
733 0.15
734 0.13
735 0.14
736 0.15
737 0.15
738 0.15
739 0.13
740 0.14
741 0.17
742 0.18
743 0.19
744 0.19
745 0.2
746 0.27
747 0.28
748 0.29
749 0.29
750 0.28
751 0.28
752 0.27
753 0.29
754 0.26
755 0.27
756 0.28
757 0.25
758 0.25
759 0.25
760 0.31
761 0.34
762 0.35
763 0.39
764 0.41
765 0.46
766 0.52
767 0.54
768 0.57
769 0.54
770 0.51
771 0.48
772 0.46
773 0.41
774 0.36
775 0.37
776 0.38
777 0.34
778 0.33
779 0.3
780 0.28
781 0.28
782 0.25
783 0.19
784 0.1
785 0.1
786 0.1
787 0.11
788 0.1
789 0.09
790 0.12
791 0.13
792 0.13
793 0.12
794 0.15
795 0.13
796 0.13
797 0.12
798 0.12
799 0.11
800 0.12
801 0.13
802 0.19
803 0.2
804 0.29
805 0.36
806 0.45
807 0.54
808 0.63
809 0.73
810 0.76
811 0.86
812 0.88
813 0.9
814 0.89
815 0.86
816 0.86
817 0.79
818 0.7
819 0.59
820 0.51
821 0.41
822 0.32
823 0.25
824 0.15
825 0.11
826 0.09
827 0.1
828 0.08
829 0.07
830 0.07
831 0.08
832 0.08
833 0.07
834 0.07
835 0.05
836 0.06
837 0.07
838 0.06
839 0.06
840 0.05
841 0.05
842 0.05
843 0.04
844 0.04
845 0.04
846 0.04
847 0.04
848 0.05
849 0.07
850 0.09
851 0.1
852 0.1
853 0.13
854 0.22
855 0.32
856 0.38
857 0.42
858 0.49
859 0.57
860 0.68
861 0.75
862 0.78
863 0.79
864 0.83
865 0.88
866 0.9
867 0.9
868 0.88
869 0.89
870 0.87
871 0.78
872 0.67
873 0.6
874 0.53
875 0.46
876 0.38
877 0.3
878 0.22
879 0.24
880 0.24
881 0.22
882 0.17
883 0.19
884 0.25
885 0.25
886 0.25
887 0.22
888 0.25
889 0.33
890 0.4
891 0.46
892 0.47
893 0.56
894 0.62
895 0.68
896 0.71
897 0.7
898 0.72
899 0.74
900 0.73
901 0.7
902 0.66
903 0.61
904 0.55
905 0.51
906 0.49
907 0.42