Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YYD1

Protein Details
Accession A0A4Y9YYD1    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-130AEEKPKPKTKAKAEKAKPVVEBasic
157-182EDEKKTPKPAPKVKKAKKAKSSSSTSHydrophilic
361-386GTGTPQPQQKKGKNVRKTNTPFQRVKHydrophilic
421-448IVTRGDGFRKEKNKKKRGSYKGGDITMRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-138KPKPKTKAKAEKAKPVVEAKPPPSPR
160-177KKTPKPAPKVKKAKKAKS
220-223AKAK
318-335KKAAKASKKAEAEKPAEA
343-344KK
429-438RKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSQSAKVPTSEVDGSLASTYTLIYSFLTRREHTKAAEALRKAAKGVVVLRDDVPSTAPSLEDVLKEWKELRAVADAGLFRDSSSSESDSSSDEASSDSDPNDSDDESSDAEEKPKPKTKAKAEKAKPVVEAKPPPSPRSGSKTLSSGEASSDDSSSEDEKKTPKPAPKVKKAKKAKSSSSTSSDEEAKVKPAKAKVAKSFSSSSSSSDSSSDEEVKAKPAKAKAEKAKSSSSSSSSSDSSSEEEKEKAAPVVIKKAKSSSSSGSSSSSDSSSDEDEAKAGKTKEVEPSKKRKASSSDSDSSSSSSSSSDSDSESESEKKAAKASKKAEAEKPAEASGNTRVVKKRRADDGSAVTTAVETSGTGTPQPQQKKGKNVRKTNTPFQRVKVHQVVFEHEVLKDNTFESRGANDNDYGAKASQDLIVTRGDGFRKEKNKKKRGSYKGGDITMRTHSFKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.11
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.08
11 0.12
12 0.14
13 0.2
14 0.25
15 0.26
16 0.31
17 0.37
18 0.41
19 0.39
20 0.44
21 0.45
22 0.48
23 0.54
24 0.5
25 0.51
26 0.51
27 0.49
28 0.42
29 0.38
30 0.31
31 0.27
32 0.3
33 0.29
34 0.26
35 0.28
36 0.28
37 0.27
38 0.27
39 0.23
40 0.21
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.13
47 0.14
48 0.13
49 0.15
50 0.2
51 0.2
52 0.22
53 0.22
54 0.22
55 0.22
56 0.23
57 0.23
58 0.2
59 0.2
60 0.19
61 0.22
62 0.2
63 0.19
64 0.19
65 0.17
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.1
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.16
78 0.13
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.15
98 0.18
99 0.19
100 0.26
101 0.34
102 0.39
103 0.44
104 0.53
105 0.62
106 0.69
107 0.76
108 0.79
109 0.77
110 0.82
111 0.81
112 0.75
113 0.68
114 0.62
115 0.57
116 0.53
117 0.53
118 0.47
119 0.49
120 0.49
121 0.47
122 0.45
123 0.44
124 0.42
125 0.43
126 0.46
127 0.4
128 0.4
129 0.41
130 0.38
131 0.37
132 0.32
133 0.25
134 0.19
135 0.17
136 0.17
137 0.14
138 0.13
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.12
145 0.14
146 0.18
147 0.21
148 0.27
149 0.32
150 0.37
151 0.44
152 0.54
153 0.61
154 0.68
155 0.76
156 0.79
157 0.84
158 0.87
159 0.87
160 0.87
161 0.85
162 0.83
163 0.8
164 0.78
165 0.72
166 0.68
167 0.62
168 0.53
169 0.47
170 0.4
171 0.33
172 0.29
173 0.24
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.24
178 0.24
179 0.31
180 0.35
181 0.4
182 0.43
183 0.46
184 0.46
185 0.46
186 0.46
187 0.39
188 0.38
189 0.32
190 0.27
191 0.24
192 0.23
193 0.2
194 0.18
195 0.17
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.2
206 0.22
207 0.29
208 0.33
209 0.4
210 0.45
211 0.51
212 0.53
213 0.53
214 0.54
215 0.48
216 0.47
217 0.41
218 0.35
219 0.29
220 0.27
221 0.26
222 0.23
223 0.21
224 0.17
225 0.16
226 0.15
227 0.14
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.21
239 0.24
240 0.25
241 0.25
242 0.27
243 0.28
244 0.28
245 0.3
246 0.24
247 0.25
248 0.26
249 0.26
250 0.26
251 0.25
252 0.23
253 0.21
254 0.18
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.13
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.16
270 0.24
271 0.33
272 0.41
273 0.45
274 0.55
275 0.63
276 0.67
277 0.66
278 0.63
279 0.61
280 0.6
281 0.61
282 0.59
283 0.55
284 0.52
285 0.53
286 0.47
287 0.41
288 0.34
289 0.24
290 0.17
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.21
307 0.27
308 0.3
309 0.38
310 0.42
311 0.47
312 0.52
313 0.57
314 0.58
315 0.6
316 0.57
317 0.51
318 0.49
319 0.41
320 0.36
321 0.3
322 0.26
323 0.23
324 0.26
325 0.25
326 0.27
327 0.33
328 0.38
329 0.46
330 0.5
331 0.52
332 0.54
333 0.58
334 0.58
335 0.58
336 0.59
337 0.55
338 0.49
339 0.42
340 0.32
341 0.27
342 0.22
343 0.15
344 0.08
345 0.04
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.15
352 0.23
353 0.28
354 0.34
355 0.43
356 0.49
357 0.6
358 0.7
359 0.76
360 0.78
361 0.83
362 0.82
363 0.83
364 0.85
365 0.84
366 0.84
367 0.83
368 0.77
369 0.72
370 0.75
371 0.68
372 0.69
373 0.67
374 0.59
375 0.53
376 0.51
377 0.51
378 0.45
379 0.43
380 0.35
381 0.27
382 0.29
383 0.27
384 0.26
385 0.21
386 0.18
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.15
391 0.17
392 0.22
393 0.24
394 0.26
395 0.24
396 0.24
397 0.26
398 0.25
399 0.24
400 0.18
401 0.16
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.19
412 0.18
413 0.22
414 0.26
415 0.33
416 0.43
417 0.53
418 0.62
419 0.69
420 0.77
421 0.81
422 0.88
423 0.9
424 0.9
425 0.9
426 0.89
427 0.88
428 0.87
429 0.83
430 0.75
431 0.66
432 0.59
433 0.56
434 0.53
435 0.45
436 0.37