FuNGI

A0A4Y9YTD6

Protein Details

Accession

A0A4Y9YTD6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1135-1160	IRTDRLPFNRTRRFRNPWNHGREVKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR018593 tRNA-endonuc_su_Sen15 IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR036167 tRNA_intron_Endo_cat-like_sf IPR007275 YTH_domain IPR045168 YTH_prot
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF09631 Sen15 PF04146 YTH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM PS50882 YTH
CDD	cd00590 RRM_SF cd21134 YTH

Amino Acid Sequences

MSYNNPDDQDFQSSGINRSAGSQAFDKDVGSGNLDSGTNQSQGQYQSQGQWDGNQRQGRQNPTVVDQGYDKYEGSGDAQYARSGDAQYARSDDKYAQSGDQYTQPRSEDQYGRSQDLEGKRVRDAQSGEQRGQHDQGNQQKPTLTEKVKGTAEKLMGKSKGDSGTAQRGEQRQQTNNVARVPDDLALAILSSRSMEAHSTYPVLAPYLSKYPYSGGAVYQTYNDLLLAQRWSDLQVVELSLCGRCGFRGFRPESVAAACVVPCSLAEMLSMSWLQNAFDGFGNPPELYVAISSDDASTVYYKLNNLYRSVRLSRRDSVPAFDDLEPCPSPPFPDISPGLAERSAILKPPAPSVYMDGDAGGDKRALNMPDSHTSTPDTERISVRPSPPLVTGGSSPTYQHTPPFRHRASFVGPQYSMSHQQPPLNIMHSAPQFAYPPHLGIPGREASIPHMAYSSSPSMMPMLQPHAPLYQFQNQSPDGSITPQHSFATNLGPAPPLYALSDPSPPPVSPTQGHPGQAGTHPSTFSSPAPYSSMAYSSPHQYAYATPPSFAASPRVYPPQYASAPYPASYAPSGDQEGHGTWWYVPPPGHPNASSPYEGMQPSFHAPYNMGFRPVAHRHNEGYSSSRPSATPGPSSTSPRLPQPQPQTQPQAGLLGPGAVPGHRSPSSPGTSHNSPPPVEDSESAAPSATSDHARQLKRRPYHPNPPVQRSDWVMWAGNVPSDATHDELWRSTGGVSSIFLISRSNCAFVNFESQQHLEAATRHFNGQPLRPTDPRCPRLVCRIRRPTDDLRSGVGGQRGMGIHAKWVREQKQKAGKEPPNAGSPEEVAARIESLALSDDEGLRTGHEMASMSNSSGSFTSTNSAMLAQYFPQRYFILKSLTQVDLDISVQQGLWATQRHNEGILDQAYRTSQDVFLIFGVNKSGEFYGYARMTGPISRGEHSVDWPPITSPRSVHSQASAPDGAQGDHSASSSNVALGKRAQPPMFFDEGHMIDESPVPVSVARDRPPMVTQKHRSGQPFSAPPEPHQPHRKLTVNTPQIGYSLDRGIPPGLPRGFELDSKAPLQALKHKSEDVLGHTPTSDARKEHSAPVPVTSSLRPVQEVAESLQTPSPAPPPEQQQEGAVWGEAFPIQWIRTDRLPFNRTRRFRNPWNHGREVKVSRDGTELEPSVGKALLEEWNRPAPSPPTSPVGGSRPNPSHRGLRPSQQHPHS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.31
3	0.28
4	0.22
5	0.24
6	0.27
7	0.23
8	0.24
9	0.24
10	0.23
11	0.25
12	0.26
13	0.23
14	0.2
15	0.22
16	0.2
17	0.2
18	0.19
19	0.16
20	0.17
21	0.17
22	0.16
23	0.16
24	0.18
25	0.16
26	0.16
27	0.17
28	0.19
29	0.22
30	0.25
31	0.26
32	0.26
33	0.3
34	0.33
35	0.36
36	0.33
37	0.36
38	0.42
39	0.44
40	0.5
41	0.5
42	0.5
43	0.55
44	0.62
45	0.62
46	0.59
47	0.58
48	0.53
49	0.51
50	0.54
51	0.45
52	0.4
53	0.35
54	0.32
55	0.29
56	0.28
57	0.24
58	0.17
59	0.18
60	0.16
61	0.17
62	0.16
63	0.15
64	0.16
65	0.17
66	0.17
67	0.17
68	0.17
69	0.16
70	0.15
71	0.17
72	0.2
73	0.21
74	0.22
75	0.25
76	0.27
77	0.26
78	0.28
79	0.27
80	0.26
81	0.28
82	0.29
83	0.26
84	0.27
85	0.28
86	0.28
87	0.33
88	0.34
89	0.32
90	0.34
91	0.34
92	0.33
93	0.37
94	0.42
95	0.41
96	0.4
97	0.47
98	0.48
99	0.49
100	0.46
101	0.42
102	0.41
103	0.41
104	0.44
105	0.39
106	0.37
107	0.37
108	0.44
109	0.45
110	0.44
111	0.42
112	0.45
113	0.51
114	0.54
115	0.53
116	0.51
117	0.51
118	0.49
119	0.47
120	0.41
121	0.36
122	0.38
123	0.46
124	0.5
125	0.49
126	0.47
127	0.46
128	0.44
129	0.47
130	0.48
131	0.41
132	0.38
133	0.4
134	0.45
135	0.47
136	0.47
137	0.42
138	0.39
139	0.41
140	0.41
141	0.41
142	0.42
143	0.4
144	0.4
145	0.39
146	0.38
147	0.37
148	0.32
149	0.31
150	0.3
151	0.37
152	0.38
153	0.38
154	0.38
155	0.4
156	0.43
157	0.48
158	0.49
159	0.45
160	0.49
161	0.57
162	0.59
163	0.59
164	0.57
165	0.51
166	0.44
167	0.4
168	0.36
169	0.28
170	0.21
171	0.15
172	0.12
173	0.11
174	0.1
175	0.08
176	0.06
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.07
183	0.1
184	0.12
185	0.13
186	0.14
187	0.14
188	0.15
189	0.14
190	0.14
191	0.12
192	0.11
193	0.13
194	0.17
195	0.18
196	0.17
197	0.18
198	0.18
199	0.21
200	0.23
201	0.2
202	0.16
203	0.19
204	0.2
205	0.19
206	0.18
207	0.16
208	0.14
209	0.13
210	0.12
211	0.09
212	0.08
213	0.1
214	0.11
215	0.1
216	0.1
217	0.11
218	0.12
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.11
224	0.1
225	0.11
226	0.1
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.12
233	0.15
234	0.19
235	0.29
236	0.32
237	0.34
238	0.39
239	0.4
240	0.37
241	0.35
242	0.31
243	0.22
244	0.19
245	0.15
246	0.11
247	0.09
248	0.08
249	0.06
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.07
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.11
267	0.1
268	0.11
269	0.13
270	0.12
271	0.11
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.1
289	0.15
290	0.2
291	0.21
292	0.24
293	0.27
294	0.29
295	0.34
296	0.39
297	0.41
298	0.43
299	0.47
300	0.49
301	0.5
302	0.53
303	0.49
304	0.46
305	0.42
306	0.38
307	0.36
308	0.31
309	0.29
310	0.22
311	0.26
312	0.23
313	0.2
314	0.2
315	0.16
316	0.17
317	0.16
318	0.19
319	0.14
320	0.19
321	0.2
322	0.2
323	0.22
324	0.2
325	0.21
326	0.18
327	0.17
328	0.12
329	0.13
330	0.12
331	0.12
332	0.13
333	0.14
334	0.15
335	0.19
336	0.19
337	0.18
338	0.19
339	0.2
340	0.21
341	0.19
342	0.18
343	0.14
344	0.13
345	0.13
346	0.12
347	0.1
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.15
355	0.19
356	0.24
357	0.29
358	0.28
359	0.26
360	0.27
361	0.28
362	0.27
363	0.26
364	0.23
365	0.21
366	0.22
367	0.22
368	0.25
369	0.27
370	0.26
371	0.28
372	0.27
373	0.26
374	0.26
375	0.26
376	0.22
377	0.19
378	0.18
379	0.16
380	0.17
381	0.15
382	0.14
383	0.15
384	0.17
385	0.16
386	0.2
387	0.24
388	0.29
389	0.36
390	0.45
391	0.44
392	0.43
393	0.44
394	0.44
395	0.43
396	0.45
397	0.4
398	0.36
399	0.34
400	0.33
401	0.34
402	0.33
403	0.32
404	0.25
405	0.28
406	0.26
407	0.28
408	0.27
409	0.28
410	0.26
411	0.24
412	0.22
413	0.17
414	0.2
415	0.18
416	0.19
417	0.16
418	0.16
419	0.14
420	0.14
421	0.18
422	0.12
423	0.13
424	0.12
425	0.16
426	0.15
427	0.14
428	0.17
429	0.15
430	0.15
431	0.15
432	0.14
433	0.14
434	0.19
435	0.19
436	0.15
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.17
441	0.15
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.11
448	0.09
449	0.12
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.15
455	0.16
456	0.19
457	0.23
458	0.24
459	0.24
460	0.27
461	0.26
462	0.26
463	0.26
464	0.23
465	0.15
466	0.15
467	0.16
468	0.14
469	0.15
470	0.16
471	0.15
472	0.14
473	0.15
474	0.14
475	0.16
476	0.14
477	0.13
478	0.12
479	0.12
480	0.11
481	0.11
482	0.1
483	0.07
484	0.08
485	0.08
486	0.09
487	0.1
488	0.13
489	0.12
490	0.14
491	0.15
492	0.14
493	0.17
494	0.17
495	0.19
496	0.17
497	0.21
498	0.25
499	0.25
500	0.26
501	0.23
502	0.22
503	0.2
504	0.21
505	0.21
506	0.17
507	0.15
508	0.15
509	0.15
510	0.15
511	0.16
512	0.14
513	0.15
514	0.14
515	0.14
516	0.16
517	0.16
518	0.16
519	0.15
520	0.15
521	0.11
522	0.13
523	0.13
524	0.14
525	0.14
526	0.13
527	0.13
528	0.12
529	0.13
530	0.16
531	0.23
532	0.2
533	0.19
534	0.19
535	0.21
536	0.21
537	0.19
538	0.19
539	0.12
540	0.14
541	0.16
542	0.21
543	0.19
544	0.19
545	0.21
546	0.22
547	0.22
548	0.22
549	0.21
550	0.2
551	0.2
552	0.2
553	0.19
554	0.13
555	0.14
556	0.12
557	0.12
558	0.09
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.1
566	0.09
567	0.08
568	0.07
569	0.09
570	0.09
571	0.1
572	0.09
573	0.11
574	0.15
575	0.17
576	0.18
577	0.17
578	0.19
579	0.21
580	0.23
581	0.21
582	0.17
583	0.16
584	0.17
585	0.17
586	0.15
587	0.12
588	0.11
589	0.12
590	0.13
591	0.12
592	0.1
593	0.1
594	0.12
595	0.17
596	0.16
597	0.16
598	0.14
599	0.14
600	0.2
601	0.24
602	0.27
603	0.24
604	0.26
605	0.26
606	0.28
607	0.29
608	0.23
609	0.24
610	0.22
611	0.23
612	0.22
613	0.21
614	0.19
615	0.2
616	0.24
617	0.22
618	0.22
619	0.18
620	0.22
621	0.23
622	0.28
623	0.28
624	0.27
625	0.26
626	0.28
627	0.33
628	0.3
629	0.35
630	0.39
631	0.45
632	0.45
633	0.49
634	0.5
635	0.45
636	0.44
637	0.37
638	0.32
639	0.23
640	0.19
641	0.14
642	0.09
643	0.08
644	0.07
645	0.07
646	0.04
647	0.06
648	0.05
649	0.1
650	0.1
651	0.11
652	0.13
653	0.18
654	0.21
655	0.2
656	0.23
657	0.25
658	0.28
659	0.3
660	0.31
661	0.29
662	0.26
663	0.27
664	0.27
665	0.23
666	0.21
667	0.2
668	0.2
669	0.19
670	0.19
671	0.18
672	0.15
673	0.12
674	0.1
675	0.11
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.14
680	0.21
681	0.23
682	0.28
683	0.36
684	0.44
685	0.47
686	0.54
687	0.59
688	0.6
689	0.69
690	0.71
691	0.73
692	0.71
693	0.72
694	0.69
695	0.61
696	0.55
697	0.48
698	0.42
699	0.35
700	0.29
701	0.23
702	0.19
703	0.18
704	0.15
705	0.12
706	0.1
707	0.08
708	0.06
709	0.07
710	0.08
711	0.08
712	0.09
713	0.09
714	0.1
715	0.1
716	0.11
717	0.1
718	0.09
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.07
723	0.07
724	0.07
725	0.08
726	0.07
727	0.07
728	0.08
729	0.07
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.11
734	0.12
735	0.13
736	0.13
737	0.2
738	0.18
739	0.18
740	0.2
741	0.2
742	0.19
743	0.18
744	0.18
745	0.12
746	0.13
747	0.14
748	0.16
749	0.16
750	0.17
751	0.17
752	0.2
753	0.22
754	0.25
755	0.29
756	0.29
757	0.34
758	0.36
759	0.4
760	0.46
761	0.53
762	0.52
763	0.5
764	0.49
765	0.47
766	0.55
767	0.6
768	0.59
769	0.6
770	0.67
771	0.67
772	0.68
773	0.71
774	0.69
775	0.68
776	0.65
777	0.55
778	0.47
779	0.44
780	0.4
781	0.36
782	0.29
783	0.21
784	0.15
785	0.16
786	0.14
787	0.13
788	0.14
789	0.11
790	0.15
791	0.18
792	0.19
793	0.2
794	0.28
795	0.34
796	0.42
797	0.45
798	0.48
799	0.55
800	0.59
801	0.62
802	0.65
803	0.63
804	0.61
805	0.64
806	0.58
807	0.53
808	0.5
809	0.44
810	0.34
811	0.29
812	0.23
813	0.18
814	0.15
815	0.1
816	0.09
817	0.09
818	0.08
819	0.07
820	0.05
821	0.05
822	0.06
823	0.05
824	0.06
825	0.06
826	0.07
827	0.07
828	0.08
829	0.07
830	0.06
831	0.08
832	0.08
833	0.07
834	0.08
835	0.08
836	0.07
837	0.11
838	0.12
839	0.11
840	0.11
841	0.11
842	0.11
843	0.11
844	0.12
845	0.09
846	0.09
847	0.11
848	0.1
849	0.1
850	0.1
851	0.1
852	0.08
853	0.09
854	0.09
855	0.09
856	0.14
857	0.16
858	0.16
859	0.18
860	0.19
861	0.2
862	0.22
863	0.24
864	0.24
865	0.23
866	0.25
867	0.26
868	0.27
869	0.25
870	0.22
871	0.19
872	0.15
873	0.14
874	0.12
875	0.08
876	0.08
877	0.07
878	0.07
879	0.07
880	0.06
881	0.09
882	0.1
883	0.11
884	0.15
885	0.18
886	0.18
887	0.19
888	0.19
889	0.17
890	0.19
891	0.2
892	0.17
893	0.15
894	0.15
895	0.14
896	0.15
897	0.15
898	0.12
899	0.11
900	0.11
901	0.12
902	0.12
903	0.12
904	0.13
905	0.12
906	0.1
907	0.11
908	0.1
909	0.09
910	0.1
911	0.1
912	0.08
913	0.09
914	0.1
915	0.15
916	0.15
917	0.16
918	0.15
919	0.16
920	0.16
921	0.16
922	0.17
923	0.16
924	0.18
925	0.19
926	0.2
927	0.22
928	0.22
929	0.23
930	0.28
931	0.24
932	0.22
933	0.22
934	0.22
935	0.24
936	0.24
937	0.24
938	0.19
939	0.2
940	0.26
941	0.28
942	0.28
943	0.26
944	0.29
945	0.28
946	0.32
947	0.3
948	0.23
949	0.23
950	0.23
951	0.2
952	0.16
953	0.15
954	0.12
955	0.11
956	0.11
957	0.09
958	0.08
959	0.1
960	0.09
961	0.1
962	0.12
963	0.12
964	0.14
965	0.16
966	0.22
967	0.27
968	0.32
969	0.33
970	0.3
971	0.35
972	0.4
973	0.4
974	0.34
975	0.29
976	0.29
977	0.28
978	0.28
979	0.24
980	0.18
981	0.15
982	0.16
983	0.15
984	0.1
985	0.09
986	0.08
987	0.09
988	0.11
989	0.17
990	0.21
991	0.23
992	0.27
993	0.29
994	0.31
995	0.35
996	0.41
997	0.41
998	0.46
999	0.51
1000	0.56
1001	0.61
1002	0.64
1003	0.64
1004	0.62
1005	0.6
1006	0.58
1007	0.57
1008	0.52
1009	0.54
1010	0.5
1011	0.48
1012	0.53
1013	0.52
1014	0.53
1015	0.56
1016	0.56
1017	0.54
1018	0.61
1019	0.66
1020	0.58
1021	0.63
1022	0.64
1023	0.62
1024	0.61
1025	0.56
1026	0.48
1027	0.41
1028	0.39
1029	0.32
1030	0.24
1031	0.2
1032	0.18
1033	0.17
1034	0.18
1035	0.18
1036	0.19
1037	0.19
1038	0.25
1039	0.22
1040	0.22
1041	0.23
1042	0.27
1043	0.28
1044	0.26
1045	0.31
1046	0.26
1047	0.28
1048	0.28
1049	0.28
1050	0.23
1051	0.23
1052	0.25
1053	0.28
1054	0.31
1055	0.33
1056	0.36
1057	0.36
1058	0.36
1059	0.38
1060	0.38
1061	0.35
1062	0.35
1063	0.31
1064	0.28
1065	0.27
1066	0.27
1067	0.27
1068	0.29
1069	0.25
1070	0.2
1071	0.23
1072	0.3
1073	0.33
1074	0.4
1075	0.43
1076	0.45
1077	0.42
1078	0.44
1079	0.43
1080	0.38
1081	0.38
1082	0.31
1083	0.3
1084	0.27
1085	0.27
1086	0.25
1087	0.23
1088	0.23
1089	0.22
1090	0.23
1091	0.2
1092	0.22
1093	0.21
1094	0.22
1095	0.23
1096	0.22
1097	0.2
1098	0.21
1099	0.24
1100	0.2
1101	0.24
1102	0.27
1103	0.34
1104	0.38
1105	0.41
1106	0.39
1107	0.36
1108	0.35
1109	0.33
1110	0.29
1111	0.21
1112	0.17
1113	0.13
1114	0.13
1115	0.11
1116	0.1
1117	0.09
1118	0.11
1119	0.11
1120	0.16
1121	0.19
1122	0.23
1123	0.29
1124	0.35
1125	0.4
1126	0.47
1127	0.52
1128	0.56
1129	0.63
1130	0.7
1131	0.7
1132	0.74
1133	0.77
1134	0.76
1135	0.81
1136	0.84
1137	0.84
1138	0.84
1139	0.86
1140	0.86
1141	0.8
1142	0.77
1143	0.76
1144	0.71
1145	0.67
1146	0.65
1147	0.57
1148	0.5
1149	0.49
1150	0.46
1151	0.39
1152	0.4
1153	0.34
1154	0.27
1155	0.27
1156	0.25
1157	0.24
1158	0.21
1159	0.18
1160	0.12
1161	0.13
1162	0.18
1163	0.2
1164	0.23
1165	0.26
1166	0.33
1167	0.34
1168	0.34
1169	0.37
1170	0.34
1171	0.38
1172	0.4
1173	0.39
1174	0.36
1175	0.37
1176	0.38
1177	0.39
1178	0.41
1179	0.42
1180	0.4
1181	0.45
1182	0.49
1183	0.53
1184	0.55
1185	0.54
1186	0.57
1187	0.56
1188	0.62
1189	0.59
1190	0.6
1191	0.64
1192	0.7

A0A4Y9YTD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer