FuNGI

A0A4Y9YF56

Protein Details

Accession

A0A4Y9YF56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
425-445	ARSRIAKAPRRRTRSSLPSGS	Hydrophilic
451-472	QQLRRRAAATRARRWRCCCSRA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
428-442	RIAKAPRRRTRSSLP
454-457	RRRA

Subcellular Location(s)

plas 7, cyto 6.5, cyto_nucl 4.5, mito 4, extr 2, pero 2, E.R. 2, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008949 Isoprenoid_synthase_dom_sf IPR002060 Squ/phyt_synthse IPR006449 Squal_synth-like IPR019845 Squalene/phytoene_synthase_CS IPR044844 Trans_IPPS_euk-type IPR033904 Trans_IPPS_HH
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0004310 F:farnesyl-diphosphate farnesyltransferase activity GO:0051996 F:squalene synthase activity GO:0008610 P:lipid biosynthetic process
Pfam	View protein in Pfam PF00494 SQS_PSY
PROSITE	View protein in PROSITE PS01044 SQUALEN_PHYTOEN_SYN_1 PS01045 SQUALEN_PHYTOEN_SYN_2
CDD	cd00683 Trans_IPPS_HH

Amino Acid Sequences

MGALSMLTLLLTHPHEFRTLVQFYLYHEPKRDITAKREHDTSGWDRASMRRCWELLDLTSRSFAAVVKELEGDLARAICLFYVVLRGLDTIEDDMTIPDDVKQPLLRSFHEKTLTPGWTFNGNGPDEKDRIVLVDYDKVVAEVSLLKPAYRDVIISVCQKMEVGMADYAHRAATTGAISLNTVADYDLYCHFVAGLVGEGLSSIWAASGLETTLFADQLELSNSMGLLLQKTNIIRDFREDCDDRRFFWPREIWACAEYGGPDAGEMKEITELLRPENAQRAAWVQSGMVLDALRHSVDALDYLRLVRNQSVFNFCAIPAVMAMATLNLCFMNPEMFQHNIKIRKAEAAKLIMRSTNPREVAYTFREYARSIHKKATPADPNFLRISVACCKIEQWAEHHFPSFVHVMQSKVSSGASQVIDPNDARSRIAKAPRRRTRSSLPSGSGPPGLQQLRRRAAATRARRWRCCCSRAGWCLRSWA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.19
3	0.2
4	0.23
5	0.27
6	0.26
7	0.25
8	0.25
9	0.24
10	0.27
11	0.37
12	0.38
13	0.34
14	0.36
15	0.39
16	0.39
17	0.46
18	0.49
19	0.44
20	0.48
21	0.54
22	0.59
23	0.6
24	0.61
25	0.55
26	0.49
27	0.51
28	0.47
29	0.46
30	0.38
31	0.35
32	0.34
33	0.39
34	0.44
35	0.41
36	0.41
37	0.37
38	0.37
39	0.39
40	0.41
41	0.38
42	0.36
43	0.39
44	0.35
45	0.31
46	0.32
47	0.29
48	0.25
49	0.21
50	0.19
51	0.15
52	0.17
53	0.17
54	0.17
55	0.17
56	0.17
57	0.18
58	0.17
59	0.13
60	0.1
61	0.09
62	0.08
63	0.07
64	0.07
65	0.06
66	0.06
67	0.06
68	0.05
69	0.08
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.1
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.12
87	0.12
88	0.15
89	0.17
90	0.18
91	0.23
92	0.26
93	0.27
94	0.3
95	0.34
96	0.37
97	0.39
98	0.37
99	0.37
100	0.41
101	0.41
102	0.35
103	0.33
104	0.28
105	0.28
106	0.28
107	0.27
108	0.25
109	0.23
110	0.23
111	0.25
112	0.27
113	0.25
114	0.25
115	0.22
116	0.16
117	0.16
118	0.15
119	0.14
120	0.12
121	0.16
122	0.15
123	0.15
124	0.15
125	0.14
126	0.13
127	0.11
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.12
132	0.13
133	0.12
134	0.13
135	0.13
136	0.15
137	0.12
138	0.12
139	0.09
140	0.11
141	0.15
142	0.17
143	0.18
144	0.15
145	0.15
146	0.15
147	0.13
148	0.12
149	0.09
150	0.08
151	0.08
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.1
156	0.09
157	0.08
158	0.06
159	0.05
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.05
169	0.05
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.06
174	0.07
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.07
182	0.06
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.02
191	0.02
192	0.02
193	0.02
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.09
220	0.12
221	0.13
222	0.12
223	0.17
224	0.19
225	0.19
226	0.25
227	0.24
228	0.23
229	0.31
230	0.31
231	0.29
232	0.31
233	0.35
234	0.3
235	0.34
236	0.35
237	0.3
238	0.33
239	0.33
240	0.28
241	0.24
242	0.24
243	0.18
244	0.16
245	0.12
246	0.09
247	0.07
248	0.06
249	0.05
250	0.06
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.11
262	0.11
263	0.12
264	0.18
265	0.19
266	0.16
267	0.16
268	0.18
269	0.18
270	0.18
271	0.17
272	0.11
273	0.12
274	0.12
275	0.11
276	0.1
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.1
292	0.11
293	0.12
294	0.13
295	0.15
296	0.16
297	0.19
298	0.23
299	0.22
300	0.22
301	0.21
302	0.19
303	0.17
304	0.15
305	0.13
306	0.08
307	0.08
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.05
319	0.07
320	0.07
321	0.09
322	0.12
323	0.15
324	0.16
325	0.2
326	0.26
327	0.3
328	0.31
329	0.31
330	0.29
331	0.34
332	0.36
333	0.36
334	0.35
335	0.35
336	0.36
337	0.37
338	0.37
339	0.31
340	0.31
341	0.33
342	0.33
343	0.35
344	0.33
345	0.31
346	0.32
347	0.32
348	0.35
349	0.34
350	0.34
351	0.28
352	0.28
353	0.29
354	0.27
355	0.3
356	0.35
357	0.38
358	0.36
359	0.41
360	0.44
361	0.48
362	0.51
363	0.57
364	0.56
365	0.52
366	0.57
367	0.52
368	0.51
369	0.47
370	0.43
371	0.34
372	0.25
373	0.27
374	0.25
375	0.28
376	0.24
377	0.23
378	0.24
379	0.27
380	0.3
381	0.27
382	0.25
383	0.29
384	0.33
385	0.34
386	0.35
387	0.31
388	0.27
389	0.29
390	0.27
391	0.2
392	0.2
393	0.2
394	0.2
395	0.21
396	0.23
397	0.2
398	0.18
399	0.18
400	0.13
401	0.13
402	0.17
403	0.16
404	0.16
405	0.18
406	0.18
407	0.21
408	0.21
409	0.25
410	0.24
411	0.24
412	0.24
413	0.24
414	0.28
415	0.33
416	0.43
417	0.47
418	0.53
419	0.63
420	0.72
421	0.78
422	0.79
423	0.79
424	0.8
425	0.81
426	0.8
427	0.77
428	0.71
429	0.68
430	0.66
431	0.61
432	0.53
433	0.43
434	0.35
435	0.35
436	0.34
437	0.35
438	0.39
439	0.46
440	0.5
441	0.53
442	0.52
443	0.48
444	0.54
445	0.58
446	0.61
447	0.61
448	0.66
449	0.72
450	0.8
451	0.83
452	0.84
453	0.84
454	0.79
455	0.75
456	0.71
457	0.72
458	0.73
459	0.77
460	0.7

A0A4Y9YF56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer