FuNGI

A0A4Y9Y3G9

Protein Details

Accession

A0A4Y9Y3G9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
335-357	DEDQPSKKGKKKKKSSALEAMVE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
341-348	KKGKKKKK

Subcellular Location(s)

cyto 9, cyto_mito 8.333, cyto_nucl 7.333, mito 6.5, extr 5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047107 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_C IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02735 RNAP_I_Rpa1_C

Amino Acid Sequences

MLAYTYIFLLVWSAPTSALPVVPRGFINGSLAIPVGNVGAPSILQAFDVNMTVSSNASSTAEPAYPSVPIRPLSPEPGPAVSGAGPELFRPGMPLNQSKSQSSNNVEGTSSTDPAHPSARIDSLLHFPPRYMVTSVPYKISLTLPSFNRDFNASAILEGIKDQLSGNNSDPTNDGTAFSSSIVDSAIPSGSTENLPLPSPAGPVLAAAKVSYPMEIDPAGSRSVHPDGETFGPGSPGSGVRTHGTTKRTLMALAGARAGTTTMRRSALRSAVRRMGTMESEVGDGDATEEKWKKQTKQQVSYEDDSEEDEDEDMGEMDEAEIEAAYASDAGSAMDEDQPSKKGKKKKKSSALEAMVEKTSEAFLKNFSHATAFDFRPENCTIELKFGADVPKLLLVGIVERTCLKTIVREIPGIVDLFRVREPNKDGSINITTNGSNFKGLWEFATGEHRMIDENNIRSNDIYAILCTYGVEMARAAIVQEVSGVFNVYNIDVDIRHLELIADYMTFEGGYKPFNRKGISMHPSPLLKASFETTAAFLSEATLYGDFDDLRTPSSNLVLGRPSLSGTGVFDIVSPLAQAEVAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.1
3	0.13
4	0.12
5	0.14
6	0.14
7	0.17
8	0.18
9	0.19
10	0.2
11	0.21
12	0.22
13	0.2
14	0.22
15	0.2
16	0.18
17	0.17
18	0.17
19	0.13
20	0.11
21	0.11
22	0.08
23	0.06
24	0.06
25	0.05
26	0.06
27	0.05
28	0.07
29	0.07
30	0.07
31	0.07
32	0.07
33	0.08
34	0.09
35	0.09
36	0.09
37	0.08
38	0.09
39	0.09
40	0.09
41	0.09
42	0.08
43	0.08
44	0.1
45	0.09
46	0.1
47	0.12
48	0.13
49	0.13
50	0.14
51	0.14
52	0.15
53	0.16
54	0.18
55	0.19
56	0.19
57	0.2
58	0.25
59	0.28
60	0.31
61	0.32
62	0.33
63	0.32
64	0.32
65	0.31
66	0.25
67	0.23
68	0.18
69	0.16
70	0.13
71	0.11
72	0.1
73	0.09
74	0.12
75	0.1
76	0.1
77	0.12
78	0.14
79	0.16
80	0.21
81	0.27
82	0.3
83	0.37
84	0.4
85	0.39
86	0.42
87	0.42
88	0.44
89	0.42
90	0.44
91	0.39
92	0.38
93	0.36
94	0.32
95	0.32
96	0.28
97	0.25
98	0.19
99	0.18
100	0.18
101	0.2
102	0.22
103	0.18
104	0.17
105	0.18
106	0.19
107	0.19
108	0.19
109	0.19
110	0.21
111	0.26
112	0.28
113	0.25
114	0.23
115	0.24
116	0.25
117	0.26
118	0.23
119	0.19
120	0.2
121	0.27
122	0.28
123	0.27
124	0.26
125	0.23
126	0.23
127	0.24
128	0.24
129	0.2
130	0.25
131	0.25
132	0.29
133	0.29
134	0.28
135	0.28
136	0.25
137	0.23
138	0.17
139	0.19
140	0.15
141	0.14
142	0.14
143	0.13
144	0.11
145	0.1
146	0.1
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.09
151	0.11
152	0.14
153	0.15
154	0.2
155	0.19
156	0.2
157	0.21
158	0.2
159	0.21
160	0.18
161	0.17
162	0.13
163	0.14
164	0.14
165	0.13
166	0.11
167	0.09
168	0.08
169	0.08
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.08
180	0.09
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.09
189	0.07
190	0.07
191	0.09
192	0.08
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.07
197	0.08
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.12
210	0.14
211	0.13
212	0.13
213	0.12
214	0.13
215	0.15
216	0.15
217	0.12
218	0.1
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.08
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.11
227	0.11
228	0.13
229	0.15
230	0.19
231	0.2
232	0.2
233	0.21
234	0.22
235	0.21
236	0.2
237	0.17
238	0.17
239	0.16
240	0.14
241	0.13
242	0.11
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.1
250	0.12
251	0.12
252	0.14
253	0.18
254	0.24
255	0.29
256	0.31
257	0.34
258	0.38
259	0.38
260	0.36
261	0.35
262	0.29
263	0.23
264	0.2
265	0.16
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.08
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.17
279	0.21
280	0.23
281	0.29
282	0.39
283	0.45
284	0.53
285	0.6
286	0.61
287	0.62
288	0.62
289	0.56
290	0.46
291	0.37
292	0.28
293	0.22
294	0.15
295	0.09
296	0.07
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.04
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.02
308	0.02
309	0.02
310	0.02
311	0.02
312	0.02
313	0.02
314	0.02
315	0.02
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.04
321	0.05
322	0.06
323	0.07
324	0.08
325	0.1
326	0.14
327	0.19
328	0.24
329	0.32
330	0.43
331	0.53
332	0.63
333	0.71
334	0.79
335	0.83
336	0.85
337	0.85
338	0.8
339	0.74
340	0.64
341	0.56
342	0.45
343	0.36
344	0.27
345	0.17
346	0.13
347	0.09
348	0.09
349	0.07
350	0.1
351	0.12
352	0.13
353	0.13
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.16
358	0.19
359	0.17
360	0.19
361	0.21
362	0.21
363	0.24
364	0.25
365	0.23
366	0.19
367	0.21
368	0.19
369	0.2
370	0.21
371	0.17
372	0.15
373	0.15
374	0.17
375	0.14
376	0.14
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.06
383	0.07
384	0.1
385	0.09
386	0.08
387	0.09
388	0.11
389	0.11
390	0.12
391	0.11
392	0.12
393	0.18
394	0.24
395	0.26
396	0.25
397	0.24
398	0.25
399	0.26
400	0.22
401	0.17
402	0.12
403	0.1
404	0.12
405	0.12
406	0.15
407	0.15
408	0.2
409	0.24
410	0.28
411	0.31
412	0.31
413	0.3
414	0.31
415	0.36
416	0.31
417	0.27
418	0.23
419	0.2
420	0.19
421	0.22
422	0.17
423	0.13
424	0.13
425	0.14
426	0.14
427	0.14
428	0.14
429	0.13
430	0.13
431	0.14
432	0.19
433	0.18
434	0.17
435	0.17
436	0.16
437	0.15
438	0.15
439	0.2
440	0.2
441	0.22
442	0.27
443	0.28
444	0.28
445	0.28
446	0.28
447	0.23
448	0.19
449	0.16
450	0.12
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.1
455	0.09
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.07
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.06
473	0.07
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.08
479	0.07
480	0.09
481	0.1
482	0.11
483	0.1
484	0.1
485	0.1
486	0.09
487	0.1
488	0.09
489	0.07
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.08
496	0.08
497	0.12
498	0.16
499	0.23
500	0.28
501	0.33
502	0.35
503	0.34
504	0.39
505	0.46
506	0.49
507	0.46
508	0.45
509	0.45
510	0.44
511	0.44
512	0.42
513	0.34
514	0.28
515	0.25
516	0.25
517	0.21
518	0.21
519	0.21
520	0.17
521	0.16
522	0.16
523	0.14
524	0.11
525	0.1
526	0.1
527	0.09
528	0.1
529	0.1
530	0.09
531	0.1
532	0.11
533	0.09
534	0.1
535	0.13
536	0.11
537	0.14
538	0.16
539	0.16
540	0.17
541	0.19
542	0.22
543	0.19
544	0.22
545	0.22
546	0.21
547	0.22
548	0.21
549	0.2
550	0.18
551	0.17
552	0.15
553	0.14
554	0.15
555	0.14
556	0.13
557	0.12
558	0.13
559	0.12
560	0.11
561	0.09
562	0.07
563	0.07

A0A4Y9Y3G9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer