Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XQF4

Protein Details
Accession A0A4Y9XQF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MASVRQPKPSRKGPPNDSGPNRRPAHydrophilic
770-790CTLPHKWRRCHVSTPPSPPGRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.333, mito 5.5, cyto_mito 5.166, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MASVRQPKPSRKGPPNDSGPNRRPAWGSMGRSSPAFSPSPNSARLPNGPPPANSSAAPAFPPLANPVAPRQDAPQDKVLQALTGLTGTTITLTTKTSQRYEGVVASTAGEGDTAGVSLRDVKEISTPGAPLKDQFFIASTNIDTWASGPADAKVPNGDSFKTDTDISHKLQQRRERELTAWADSPLPPSLSPLSPALGTRNLAHSDDITFGTGASTTTSWDQFDANERLFGVKTAFDEDQYTTKLDRTAKDFKEREKRAQVIANEILGATTNNPHIAEERSMNNTDENGTNEEDKYGAVVRGTNAYVPPGARKQPAGGAKAPEIPKVAVNAPDGTAVSQPETGSSSSKAPSPAPTSATNANASKPPADALPAFRDFVTHEKQRLTQKRIAIVKNERDKRMAELVKFSQSFKLNKPIPDDLVTILAKDEDKQRQIREKSNQDAASAQARAIAIAGAAAAAAPSASSKNIAAAQAKAVKGVIPPSASAGNALGLSGPGLGKGGESKGAAPSTNGGAGKRISMFIQPIPAFKGKSSAPQKPTVNTSGQALQAGKGANGGTPVLTPTTANKLNVNASSFKPNPKAVAFTPVSASPNTAVSPSIASASPKPKGESPPTPNPFFGNRVLKKQPVHVKDDFNPFKYNKVAEATAVSAIWPYQGKRYMQMFPPVSLQPQQQSPHMAPPGPPPMPPPSYEEDSAAQAAAATRGYVYAYPPYGYPGQPMMPGMAPPPPGAYMPGPYMQHMPYPPSMPPPNGQWDCIQVPRTLLTPTIQLCTLPHKWRRCHVSTPPSPPGRSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.86
4 0.85
5 0.85
6 0.81
7 0.8
8 0.73
9 0.66
10 0.59
11 0.52
12 0.51
13 0.49
14 0.49
15 0.46
16 0.48
17 0.46
18 0.44
19 0.43
20 0.36
21 0.31
22 0.27
23 0.22
24 0.23
25 0.29
26 0.33
27 0.36
28 0.36
29 0.35
30 0.39
31 0.45
32 0.45
33 0.46
34 0.5
35 0.49
36 0.48
37 0.51
38 0.5
39 0.47
40 0.41
41 0.37
42 0.31
43 0.29
44 0.29
45 0.24
46 0.21
47 0.19
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.24
54 0.29
55 0.3
56 0.29
57 0.3
58 0.37
59 0.41
60 0.44
61 0.45
62 0.42
63 0.41
64 0.43
65 0.39
66 0.3
67 0.25
68 0.21
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.1
80 0.13
81 0.18
82 0.23
83 0.25
84 0.28
85 0.29
86 0.31
87 0.32
88 0.31
89 0.28
90 0.25
91 0.22
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.12
96 0.09
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.17
110 0.18
111 0.21
112 0.17
113 0.18
114 0.19
115 0.21
116 0.21
117 0.19
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.16
125 0.15
126 0.13
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.15
138 0.16
139 0.16
140 0.14
141 0.16
142 0.19
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.22
147 0.23
148 0.23
149 0.21
150 0.19
151 0.22
152 0.26
153 0.27
154 0.32
155 0.37
156 0.41
157 0.49
158 0.56
159 0.58
160 0.63
161 0.65
162 0.6
163 0.55
164 0.56
165 0.52
166 0.48
167 0.41
168 0.33
169 0.29
170 0.26
171 0.27
172 0.2
173 0.18
174 0.14
175 0.15
176 0.18
177 0.17
178 0.18
179 0.17
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.16
185 0.17
186 0.16
187 0.19
188 0.2
189 0.2
190 0.2
191 0.18
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.13
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.17
211 0.2
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.18
229 0.14
230 0.15
231 0.19
232 0.21
233 0.22
234 0.26
235 0.34
236 0.37
237 0.46
238 0.49
239 0.53
240 0.6
241 0.63
242 0.65
243 0.63
244 0.62
245 0.56
246 0.59
247 0.51
248 0.47
249 0.43
250 0.35
251 0.26
252 0.23
253 0.18
254 0.13
255 0.12
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.16
267 0.19
268 0.21
269 0.21
270 0.2
271 0.18
272 0.18
273 0.16
274 0.16
275 0.15
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.13
296 0.14
297 0.18
298 0.18
299 0.19
300 0.19
301 0.24
302 0.28
303 0.29
304 0.28
305 0.27
306 0.27
307 0.32
308 0.32
309 0.27
310 0.24
311 0.2
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.11
322 0.11
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.12
333 0.11
334 0.13
335 0.15
336 0.14
337 0.17
338 0.19
339 0.2
340 0.21
341 0.22
342 0.23
343 0.24
344 0.25
345 0.24
346 0.21
347 0.2
348 0.19
349 0.18
350 0.16
351 0.14
352 0.12
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.11
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.18
364 0.21
365 0.19
366 0.21
367 0.22
368 0.27
369 0.36
370 0.43
371 0.45
372 0.43
373 0.43
374 0.48
375 0.53
376 0.5
377 0.48
378 0.47
379 0.49
380 0.54
381 0.56
382 0.51
383 0.46
384 0.45
385 0.41
386 0.42
387 0.37
388 0.28
389 0.28
390 0.28
391 0.31
392 0.31
393 0.29
394 0.25
395 0.26
396 0.28
397 0.26
398 0.33
399 0.32
400 0.34
401 0.38
402 0.35
403 0.33
404 0.32
405 0.3
406 0.22
407 0.22
408 0.19
409 0.15
410 0.13
411 0.12
412 0.09
413 0.1
414 0.15
415 0.15
416 0.2
417 0.23
418 0.27
419 0.36
420 0.4
421 0.47
422 0.5
423 0.53
424 0.53
425 0.57
426 0.53
427 0.45
428 0.41
429 0.35
430 0.29
431 0.23
432 0.18
433 0.13
434 0.12
435 0.11
436 0.1
437 0.08
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.02
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.02
449 0.03
450 0.03
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.08
455 0.1
456 0.11
457 0.11
458 0.14
459 0.18
460 0.18
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.13
465 0.15
466 0.13
467 0.1
468 0.1
469 0.11
470 0.12
471 0.11
472 0.11
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.05
487 0.05
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.1
492 0.11
493 0.11
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.13
498 0.13
499 0.11
500 0.12
501 0.13
502 0.14
503 0.13
504 0.13
505 0.11
506 0.12
507 0.14
508 0.13
509 0.19
510 0.18
511 0.18
512 0.22
513 0.23
514 0.22
515 0.2
516 0.23
517 0.17
518 0.26
519 0.32
520 0.37
521 0.38
522 0.46
523 0.48
524 0.47
525 0.51
526 0.45
527 0.4
528 0.33
529 0.31
530 0.26
531 0.24
532 0.24
533 0.2
534 0.16
535 0.16
536 0.16
537 0.13
538 0.11
539 0.11
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.15
551 0.18
552 0.19
553 0.19
554 0.21
555 0.24
556 0.26
557 0.26
558 0.23
559 0.22
560 0.29
561 0.29
562 0.32
563 0.34
564 0.33
565 0.34
566 0.33
567 0.35
568 0.28
569 0.35
570 0.3
571 0.26
572 0.27
573 0.26
574 0.26
575 0.22
576 0.22
577 0.14
578 0.14
579 0.14
580 0.12
581 0.11
582 0.1
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.11
588 0.16
589 0.22
590 0.25
591 0.26
592 0.28
593 0.31
594 0.38
595 0.44
596 0.49
597 0.51
598 0.58
599 0.61
600 0.62
601 0.58
602 0.54
603 0.5
604 0.43
605 0.43
606 0.43
607 0.4
608 0.45
609 0.5
610 0.53
611 0.51
612 0.56
613 0.58
614 0.53
615 0.57
616 0.54
617 0.56
618 0.56
619 0.65
620 0.61
621 0.55
622 0.56
623 0.49
624 0.48
625 0.45
626 0.4
627 0.32
628 0.32
629 0.29
630 0.24
631 0.25
632 0.23
633 0.19
634 0.18
635 0.14
636 0.1
637 0.1
638 0.11
639 0.11
640 0.11
641 0.16
642 0.22
643 0.23
644 0.3
645 0.34
646 0.38
647 0.4
648 0.48
649 0.44
650 0.4
651 0.43
652 0.38
653 0.37
654 0.35
655 0.33
656 0.28
657 0.32
658 0.33
659 0.31
660 0.36
661 0.35
662 0.39
663 0.39
664 0.37
665 0.32
666 0.37
667 0.43
668 0.38
669 0.37
670 0.33
671 0.36
672 0.37
673 0.37
674 0.35
675 0.33
676 0.37
677 0.38
678 0.37
679 0.31
680 0.31
681 0.3
682 0.25
683 0.18
684 0.13
685 0.13
686 0.11
687 0.09
688 0.07
689 0.06
690 0.07
691 0.08
692 0.08
693 0.1
694 0.13
695 0.15
696 0.16
697 0.16
698 0.2
699 0.22
700 0.22
701 0.23
702 0.21
703 0.22
704 0.22
705 0.23
706 0.21
707 0.18
708 0.19
709 0.17
710 0.18
711 0.17
712 0.16
713 0.17
714 0.16
715 0.16
716 0.19
717 0.19
718 0.18
719 0.2
720 0.24
721 0.23
722 0.24
723 0.27
724 0.25
725 0.28
726 0.27
727 0.28
728 0.27
729 0.29
730 0.29
731 0.34
732 0.38
733 0.36
734 0.37
735 0.38
736 0.46
737 0.45
738 0.45
739 0.39
740 0.4
741 0.41
742 0.44
743 0.4
744 0.31
745 0.31
746 0.3
747 0.3
748 0.25
749 0.23
750 0.19
751 0.22
752 0.23
753 0.24
754 0.22
755 0.21
756 0.22
757 0.28
758 0.34
759 0.38
760 0.45
761 0.52
762 0.58
763 0.67
764 0.75
765 0.73
766 0.75
767 0.76
768 0.78
769 0.78
770 0.81
771 0.81
772 0.79