Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9Y2U9

Protein Details
Accession A0A4Y9Y2U9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-269AWTRRFEVSCPERRRRRQQQGKGERVRGPGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-256RRR
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 7.5, cyto_nucl 5.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MRPRTSLLNPASANVRDRDSLPAAPSPLSRLAYVPPSVAVQAYARTPTTPLTTFGPPSPLLTASFPPSISGGSGMSTSSGIPPPAPLSPHLPTSEMDEAFGMGMPPPTPAYPAYGPSSPVPPTPRAQGPLAGWGGNVGPTVDIPRSRMPGTPGMGSGSGSSGSAGLGSAGLGTSGPLVGGEEVEPDGEVGGEEGKKVVVSVGLLPPPQLSAQKGLAVVGQPRIYPHDQFTLDIFVFNQSAWTRRFEVSCPERRRRRQQQGKGERVRGPGFVPLENRVRVGPLRPATCQSVRMDFLALTPGLHTIDTLTLTDVETGFSMNLRSVMDIVVHETHER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.27
4 0.28
5 0.32
6 0.3
7 0.31
8 0.3
9 0.31
10 0.3
11 0.3
12 0.29
13 0.27
14 0.29
15 0.27
16 0.25
17 0.22
18 0.24
19 0.27
20 0.27
21 0.24
22 0.19
23 0.19
24 0.18
25 0.17
26 0.15
27 0.11
28 0.12
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.16
34 0.17
35 0.21
36 0.2
37 0.2
38 0.22
39 0.25
40 0.27
41 0.27
42 0.28
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.21
47 0.19
48 0.2
49 0.2
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.1
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.19
75 0.2
76 0.23
77 0.23
78 0.23
79 0.21
80 0.26
81 0.29
82 0.23
83 0.22
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.16
88 0.09
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.13
98 0.13
99 0.16
100 0.19
101 0.18
102 0.2
103 0.2
104 0.22
105 0.19
106 0.21
107 0.22
108 0.21
109 0.23
110 0.25
111 0.27
112 0.27
113 0.27
114 0.26
115 0.23
116 0.25
117 0.24
118 0.2
119 0.17
120 0.14
121 0.13
122 0.1
123 0.1
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.1
131 0.12
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.22
137 0.23
138 0.21
139 0.19
140 0.18
141 0.17
142 0.16
143 0.13
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.06
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.17
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.23
214 0.23
215 0.24
216 0.24
217 0.23
218 0.21
219 0.2
220 0.17
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.13
225 0.1
226 0.14
227 0.15
228 0.18
229 0.2
230 0.22
231 0.24
232 0.22
233 0.32
234 0.36
235 0.45
236 0.5
237 0.57
238 0.66
239 0.74
240 0.83
241 0.85
242 0.87
243 0.88
244 0.9
245 0.91
246 0.92
247 0.94
248 0.91
249 0.87
250 0.8
251 0.75
252 0.66
253 0.56
254 0.46
255 0.41
256 0.35
257 0.31
258 0.28
259 0.28
260 0.31
261 0.31
262 0.31
263 0.25
264 0.26
265 0.25
266 0.26
267 0.29
268 0.3
269 0.33
270 0.34
271 0.37
272 0.41
273 0.41
274 0.42
275 0.37
276 0.36
277 0.35
278 0.34
279 0.31
280 0.25
281 0.23
282 0.22
283 0.19
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.08
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.15
314 0.15