FuNGI

A0A4Y9XWN6

Protein Details

Accession

A0A4Y9XWN6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
945-950	GGGRGG

Subcellular Location(s)

mito 12, cyto 9, nucl 5, cyto_pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIIMPVVEEEETKIEDEAGKEIVVPIDMSGPNPNQKEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPETEEEMMVEIFNYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSSQEAKEKEEARKESIALWEAMGKTLSEEEKNTKSWDSNAITPGTPFMDLLAASLRYWVVQKANTDPGWKQMEVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRSNPGHDPNTQHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFAQSGSSTACRICGEEGHYAAQCTGTKADIKKPVSTEKKPFIFLDVTVLREYLEVELNVPQAPFPFSLEMAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKDELPRMGGYIANHGQLVLSRAQIILEGLAKREDEIFRKRRESEERQDQNAKRRKVEGRGNHTGANGSSGPSSKLQLTSNPDSSRVAQEFAAKADSIGLGGPKTAESANNTTTAAQALAGSNRDVVANRAAIRLANLSAAETLKAEMAGLMPVKRSNSPQKPVIVKPPVQDAAMADSNPSDEVPGLGAAAFVEQVISSAQEAVASMPQASDDADAEGEADPDASAGANGDTAMDQDGSTSSSAKKRKFDEAAEDLVDDEDLMEEDEGEEEDAAARPKKLALKVNPDGTVEQEDTVKLWEPGYRDRYYRQKFGVEPTDIEFKKQITTCYVEGMAWVLCYYYQGTPSWQWYYPYHFAPFAHDFDEVSKMNVTFDLGQPFKPFEQLMGVFPAASRQHIPKVFHDLMTKEDSPIIDFYPPTFEIDMNGKRMAWQGVALLPFIDPKRLLDAMAEYYPDLTEEEVRRNKWGNNVLFTPDEHPLYPFLETLYGKKKTQEPLPLDPKQSKGMSGSVLPNPDCIPGSTYYSPLESQGMPDIKNDRTLSALYFFPKQLTPHRSVLLPGVRRPPRTLTADDLERTRRGGGRGGRSGRNGRMDFGGHASTFASQAYYGPMSSSYNNGRPQGRDGGSYQQSSYSNSSRGSYNSYNAPPQNYGTYGGGRPAAPPVSSYNNGPSYGSRGGAPRGGYQGGSYGRGGYSGGPPPARGGYNSGGPPGGGGRGGYGGYGGYGGGPGGGGGNAGYNSNGYGGYGSSNRGSYPAPRGGRGRGGPRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.61
3	0.64
4	0.67
5	0.64
6	0.6
7	0.57
8	0.54
9	0.47
10	0.43
11	0.36
12	0.31
13	0.26
14	0.21
15	0.16
16	0.13
17	0.14
18	0.15
19	0.15
20	0.14
21	0.13
22	0.13
23	0.14
24	0.13
25	0.11
26	0.1
27	0.09
28	0.13
29	0.13
30	0.14
31	0.19
32	0.23
33	0.3
34	0.32
35	0.33
36	0.3
37	0.31
38	0.38
39	0.36
40	0.38
41	0.35
42	0.34
43	0.34
44	0.32
45	0.31
46	0.24
47	0.2
48	0.15
49	0.11
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.28
58	0.37
59	0.43
60	0.49
61	0.49
62	0.5
63	0.52
64	0.54
65	0.48
66	0.43
67	0.37
68	0.31
69	0.29
70	0.23
71	0.18
72	0.14
73	0.12
74	0.08
75	0.07
76	0.07
77	0.09
78	0.1
79	0.13
80	0.14
81	0.21
82	0.3
83	0.38
84	0.4
85	0.42
86	0.43
87	0.44
88	0.44
89	0.42
90	0.34
91	0.29
92	0.29
93	0.25
94	0.25
95	0.21
96	0.21
97	0.17
98	0.16
99	0.12
100	0.14
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.77
113	0.77
114	0.77
115	0.79
116	0.75
117	0.72
118	0.75
119	0.73
120	0.7
121	0.69
122	0.62
123	0.56
124	0.53
125	0.49
126	0.44
127	0.43
128	0.38
129	0.29
130	0.26
131	0.24
132	0.22
133	0.22
134	0.19
135	0.14
136	0.12
137	0.15
138	0.17
139	0.15
140	0.18
141	0.23
142	0.27
143	0.29
144	0.31
145	0.3
146	0.29
147	0.3
148	0.35
149	0.33
150	0.34
151	0.35
152	0.35
153	0.33
154	0.31
155	0.3
156	0.23
157	0.19
158	0.14
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.1
169	0.11
170	0.14
171	0.14
172	0.17
173	0.2
174	0.24
175	0.31
176	0.32
177	0.35
178	0.32
179	0.36
180	0.38
181	0.36
182	0.31
183	0.27
184	0.29
185	0.26
186	0.27
187	0.19
188	0.14
189	0.14
190	0.14
191	0.11
192	0.08
193	0.07
194	0.05
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.15
203	0.2
204	0.28
205	0.37
206	0.41
207	0.42
208	0.51
209	0.58
210	0.62
211	0.65
212	0.66
213	0.62
214	0.63
215	0.67
216	0.62
217	0.61
218	0.52
219	0.43
220	0.34
221	0.29
222	0.24
223	0.2
224	0.15
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.05
230	0.05
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.12
240	0.14
241	0.14
242	0.18
243	0.21
244	0.22
245	0.24
246	0.24
247	0.22
248	0.22
249	0.21
250	0.17
251	0.14
252	0.12
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.07
257	0.09
258	0.09
259	0.11
260	0.11
261	0.13
262	0.16
263	0.18
264	0.2
265	0.2
266	0.2
267	0.2
268	0.19
269	0.19
270	0.15
271	0.14
272	0.13
273	0.12
274	0.16
275	0.19
276	0.26
277	0.32
278	0.34
279	0.36
280	0.39
281	0.47
282	0.52
283	0.56
284	0.58
285	0.58
286	0.58
287	0.58
288	0.54
289	0.48
290	0.41
291	0.34
292	0.33
293	0.26
294	0.24
295	0.22
296	0.21
297	0.17
298	0.16
299	0.16
300	0.1
301	0.1
302	0.08
303	0.09
304	0.11
305	0.11
306	0.12
307	0.11
308	0.1
309	0.09
310	0.11
311	0.1
312	0.11
313	0.11
314	0.1
315	0.11
316	0.11
317	0.12
318	0.11
319	0.11
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.04
326	0.03
327	0.02
328	0.02
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.05
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.12
341	0.12
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.11
348	0.07
349	0.06
350	0.08
351	0.1
352	0.09
353	0.09
354	0.11
355	0.14
356	0.17
357	0.19
358	0.19
359	0.21
360	0.22
361	0.22
362	0.22
363	0.2
364	0.17
365	0.2
366	0.19
367	0.16
368	0.16
369	0.15
370	0.14
371	0.13
372	0.15
373	0.09
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.06
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.13
388	0.14
389	0.17
390	0.26
391	0.33
392	0.37
393	0.42
394	0.44
395	0.48
396	0.55
397	0.58
398	0.59
399	0.63
400	0.63
401	0.64
402	0.72
403	0.68
404	0.69
405	0.69
406	0.63
407	0.54
408	0.56
409	0.55
410	0.55
411	0.6
412	0.59
413	0.59
414	0.64
415	0.63
416	0.58
417	0.53
418	0.45
419	0.36
420	0.3
421	0.21
422	0.13
423	0.12
424	0.11
425	0.12
426	0.12
427	0.13
428	0.11
429	0.13
430	0.13
431	0.17
432	0.24
433	0.27
434	0.32
435	0.31
436	0.31
437	0.3
438	0.31
439	0.31
440	0.25
441	0.21
442	0.17
443	0.19
444	0.18
445	0.18
446	0.17
447	0.12
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.04
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.09
462	0.13
463	0.14
464	0.15
465	0.15
466	0.14
467	0.14
468	0.13
469	0.1
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.08
481	0.09
482	0.1
483	0.1
484	0.11
485	0.11
486	0.1
487	0.11
488	0.1
489	0.09
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.09
509	0.1
510	0.15
511	0.24
512	0.3
513	0.34
514	0.37
515	0.42
516	0.45
517	0.46
518	0.5
519	0.46
520	0.42
521	0.38
522	0.39
523	0.35
524	0.3
525	0.28
526	0.19
527	0.18
528	0.17
529	0.15
530	0.11
531	0.09
532	0.1
533	0.09
534	0.09
535	0.05
536	0.03
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.02
547	0.02
548	0.02
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.04
574	0.04
575	0.03
576	0.03
577	0.04
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.05
593	0.06
594	0.06
595	0.08
596	0.14
597	0.2
598	0.24
599	0.29
600	0.31
601	0.38
602	0.41
603	0.41
604	0.42
605	0.4
606	0.39
607	0.34
608	0.31
609	0.24
610	0.2
611	0.17
612	0.1
613	0.06
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.03
625	0.04
626	0.04
627	0.06
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.1
632	0.14
633	0.18
634	0.25
635	0.29
636	0.38
637	0.42
638	0.45
639	0.44
640	0.41
641	0.37
642	0.31
643	0.28
644	0.19
645	0.15
646	0.12
647	0.11
648	0.1
649	0.1
650	0.1
651	0.07
652	0.07
653	0.09
654	0.11
655	0.18
656	0.23
657	0.24
658	0.25
659	0.3
660	0.4
661	0.43
662	0.46
663	0.42
664	0.41
665	0.4
666	0.44
667	0.46
668	0.37
669	0.33
670	0.3
671	0.36
672	0.32
673	0.32
674	0.27
675	0.2
676	0.23
677	0.23
678	0.22
679	0.17
680	0.21
681	0.2
682	0.21
683	0.21
684	0.16
685	0.15
686	0.15
687	0.11
688	0.07
689	0.07
690	0.05
691	0.04
692	0.05
693	0.07
694	0.06
695	0.08
696	0.08
697	0.11
698	0.13
699	0.17
700	0.19
701	0.19
702	0.21
703	0.21
704	0.28
705	0.29
706	0.3
707	0.28
708	0.26
709	0.25
710	0.28
711	0.3
712	0.24
713	0.22
714	0.2
715	0.18
716	0.18
717	0.22
718	0.16
719	0.14
720	0.14
721	0.12
722	0.13
723	0.12
724	0.12
725	0.09
726	0.11
727	0.16
728	0.16
729	0.16
730	0.17
731	0.19
732	0.18
733	0.18
734	0.16
735	0.11
736	0.15
737	0.15
738	0.15
739	0.16
740	0.15
741	0.13
742	0.13
743	0.17
744	0.13
745	0.14
746	0.14
747	0.14
748	0.21
749	0.26
750	0.29
751	0.27
752	0.36
753	0.36
754	0.36
755	0.37
756	0.31
757	0.3
758	0.33
759	0.31
760	0.22
761	0.22
762	0.2
763	0.18
764	0.18
765	0.16
766	0.12
767	0.11
768	0.11
769	0.14
770	0.15
771	0.15
772	0.15
773	0.14
774	0.14
775	0.21
776	0.23
777	0.22
778	0.22
779	0.19
780	0.2
781	0.22
782	0.21
783	0.15
784	0.12
785	0.11
786	0.13
787	0.14
788	0.13
789	0.1
790	0.09
791	0.13
792	0.12
793	0.13
794	0.11
795	0.11
796	0.16
797	0.16
798	0.16
799	0.14
800	0.16
801	0.17
802	0.17
803	0.17
804	0.12
805	0.12
806	0.12
807	0.11
808	0.09
809	0.07
810	0.11
811	0.13
812	0.21
813	0.26
814	0.27
815	0.3
816	0.33
817	0.35
818	0.37
819	0.44
820	0.4
821	0.39
822	0.4
823	0.39
824	0.37
825	0.36
826	0.31
827	0.25
828	0.23
829	0.18
830	0.18
831	0.16
832	0.16
833	0.16
834	0.13
835	0.11
836	0.14
837	0.14
838	0.18
839	0.25
840	0.28
841	0.28
842	0.32
843	0.37
844	0.38
845	0.45
846	0.49
847	0.48
848	0.54
849	0.62
850	0.63
851	0.62
852	0.59
853	0.55
854	0.52
855	0.46
856	0.37
857	0.31
858	0.28
859	0.25
860	0.25
861	0.27
862	0.24
863	0.27
864	0.26
865	0.25
866	0.23
867	0.23
868	0.2
869	0.16
870	0.16
871	0.14
872	0.21
873	0.2
874	0.22
875	0.21
876	0.22
877	0.22
878	0.2
879	0.21
880	0.14
881	0.15
882	0.2
883	0.21
884	0.2
885	0.22
886	0.25
887	0.24
888	0.3
889	0.29
890	0.23
891	0.23
892	0.23
893	0.22
894	0.2
895	0.22
896	0.17
897	0.2
898	0.2
899	0.2
900	0.21
901	0.23
902	0.29
903	0.34
904	0.38
905	0.39
906	0.4
907	0.39
908	0.37
909	0.41
910	0.4
911	0.38
912	0.37
913	0.43
914	0.47
915	0.49
916	0.51
917	0.5
918	0.48
919	0.49
920	0.48
921	0.44
922	0.45
923	0.47
924	0.45
925	0.44
926	0.41
927	0.37
928	0.35
929	0.32
930	0.29
931	0.26
932	0.31
933	0.34
934	0.39
935	0.47
936	0.52
937	0.53
938	0.56
939	0.61
940	0.59
941	0.61
942	0.53
943	0.46
944	0.43
945	0.4
946	0.35
947	0.32
948	0.29
949	0.19
950	0.19
951	0.18
952	0.15
953	0.14
954	0.13
955	0.1
956	0.07
957	0.08
958	0.11
959	0.11
960	0.11
961	0.11
962	0.12
963	0.14
964	0.15
965	0.2
966	0.22
967	0.28
968	0.33
969	0.38
970	0.4
971	0.4
972	0.44
973	0.47
974	0.43
975	0.39
976	0.37
977	0.41
978	0.42
979	0.41
980	0.36
981	0.32
982	0.32
983	0.33
984	0.36
985	0.3
986	0.29
987	0.29
988	0.31
989	0.28
990	0.29
991	0.33
992	0.31
993	0.3
994	0.34
995	0.36
996	0.42
997	0.43
998	0.44
999	0.39
1000	0.38
1001	0.38
1002	0.32
1003	0.32
1004	0.27
1005	0.28
1006	0.25
1007	0.25
1008	0.25
1009	0.21
1010	0.21
1011	0.22
1012	0.21
1013	0.18
1014	0.19
1015	0.21
1016	0.26
1017	0.28
1018	0.29
1019	0.32
1020	0.33
1021	0.34
1022	0.33
1023	0.3
1024	0.29
1025	0.29
1026	0.28
1027	0.23
1028	0.23
1029	0.25
1030	0.27
1031	0.28
1032	0.25
1033	0.27
1034	0.27
1035	0.25
1036	0.22
1037	0.25
1038	0.24
1039	0.24
1040	0.21
1041	0.19
1042	0.17
1043	0.18
1044	0.18
1045	0.14
1046	0.17
1047	0.2
1048	0.25
1049	0.24
1050	0.25
1051	0.28
1052	0.31
1053	0.3
1054	0.26
1055	0.26
1056	0.24
1057	0.3
1058	0.31
1059	0.29
1060	0.26
1061	0.24
1062	0.23
1063	0.19
1064	0.17
1065	0.11
1066	0.1
1067	0.09
1068	0.1
1069	0.11
1070	0.1
1071	0.09
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.06
1076	0.04
1077	0.05
1078	0.04
1079	0.04
1080	0.04
1081	0.04
1082	0.04
1083	0.04
1084	0.04
1085	0.04
1086	0.06
1087	0.07
1088	0.07
1089	0.08
1090	0.07
1091	0.08
1092	0.09
1093	0.09
1094	0.07
1095	0.08
1096	0.08
1097	0.11
1098	0.12
1099	0.15
1100	0.16
1101	0.17
1102	0.17
1103	0.19
1104	0.2
1105	0.22
1106	0.29
1107	0.35
1108	0.36
1109	0.41
1110	0.45
1111	0.48
1112	0.55
1113	0.56

A0A4Y9XWN6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer