Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XVH6

Protein Details
Accession A0A4Y9XVH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
467-488HINRLVAKRKTKKRGQPTLHDVHydrophilic
736-760LSGTSKRPPRTSHPRPSVRSSRSPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
474-480KRKTKKR
Subcellular Location(s) mito 15, plas 4, extr 4, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MGHAQRYVDARRALPPSVQYPVSRVVCRMPYSQHLADPSTKNDQFPKRLSMFSVHVHPDGSRIATGGLDAKVRIWSTKPILNQASEASGRPPKSLCTLTMHTGPVLCVRWAHSGRWLASGSDDEIVMIWDLDPTAKGKVWGSDEVNVEGWKPLKRLPGHESDVTDLAWSPGDRYLASVGLDSQVLIWCGYTLERLRKIDQHQGFVKGVCWDPVGEFLATQSDDRSVKIWRTTDWQLEAEVRKPFEDSPGSTFFRRLSWSPDGAHITASNATNNKGFVFIAAVIARNSWTSEISLVGHENTVEVAAYNPHIFLRNPTAPVVTSNICSVVALGADDRSVSVWQTKSARPLIVAKEVFERQIMDLSWSWDGLTLYAVSSDGTLAVFSFAEEELEGIAPHSAQQQYLQKFGFTPPPLPADYSHTIAPARAQSQSGGQGVTPPPSPTRAQSQQPQNGFGAGTNGSASPGGEHINRLVAKRKTKKRGQPTLHDVPSASTAPGAGPSSLIGPGIGMHESVFAPPVTHDVDMGMGMVMGMSVDSGDVPIDALDTSGLGGGERGKRKSHAMEGVLDERPTKARTLGGDRARESGPVVVKELARAPGGSGLGAGADLFEPPRVLTYLNVKVLEAAEDVVEARNAESGVTEITYTSGKQTQWLDFLPSPVVALAATTAFTAAALADGSLNVYSPTGRRLMPTLTLDSAVSFLAGCKASLIALTSTGMLYSWYALFSLTDIVFLLTVLSGTSKRPPRTSHPRPSVRSSRSPPMPPPAASP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.37
4 0.39
5 0.4
6 0.34
7 0.33
8 0.4
9 0.42
10 0.38
11 0.36
12 0.37
13 0.4
14 0.43
15 0.44
16 0.4
17 0.41
18 0.47
19 0.48
20 0.45
21 0.42
22 0.42
23 0.45
24 0.44
25 0.43
26 0.44
27 0.44
28 0.43
29 0.49
30 0.54
31 0.55
32 0.56
33 0.59
34 0.53
35 0.53
36 0.53
37 0.49
38 0.45
39 0.41
40 0.44
41 0.38
42 0.35
43 0.35
44 0.32
45 0.29
46 0.27
47 0.24
48 0.17
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.18
62 0.24
63 0.28
64 0.33
65 0.35
66 0.4
67 0.43
68 0.42
69 0.41
70 0.35
71 0.35
72 0.31
73 0.29
74 0.26
75 0.28
76 0.28
77 0.28
78 0.28
79 0.26
80 0.31
81 0.32
82 0.3
83 0.31
84 0.34
85 0.36
86 0.39
87 0.38
88 0.32
89 0.3
90 0.28
91 0.25
92 0.23
93 0.19
94 0.16
95 0.18
96 0.27
97 0.28
98 0.29
99 0.31
100 0.36
101 0.36
102 0.4
103 0.37
104 0.28
105 0.28
106 0.28
107 0.22
108 0.17
109 0.15
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.13
125 0.17
126 0.21
127 0.25
128 0.26
129 0.29
130 0.3
131 0.31
132 0.31
133 0.26
134 0.23
135 0.2
136 0.21
137 0.19
138 0.18
139 0.2
140 0.27
141 0.3
142 0.36
143 0.39
144 0.45
145 0.47
146 0.49
147 0.47
148 0.42
149 0.4
150 0.33
151 0.27
152 0.19
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.09
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.1
178 0.14
179 0.2
180 0.26
181 0.29
182 0.32
183 0.38
184 0.42
185 0.48
186 0.47
187 0.47
188 0.45
189 0.46
190 0.45
191 0.39
192 0.36
193 0.28
194 0.26
195 0.2
196 0.17
197 0.13
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.11
207 0.09
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.17
214 0.22
215 0.23
216 0.21
217 0.27
218 0.31
219 0.33
220 0.33
221 0.31
222 0.27
223 0.31
224 0.31
225 0.29
226 0.28
227 0.24
228 0.21
229 0.22
230 0.21
231 0.21
232 0.23
233 0.2
234 0.22
235 0.27
236 0.3
237 0.29
238 0.3
239 0.26
240 0.24
241 0.26
242 0.22
243 0.23
244 0.25
245 0.27
246 0.27
247 0.3
248 0.32
249 0.29
250 0.28
251 0.21
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.17
300 0.19
301 0.2
302 0.2
303 0.2
304 0.19
305 0.2
306 0.21
307 0.14
308 0.12
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.06
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.08
326 0.08
327 0.12
328 0.16
329 0.17
330 0.21
331 0.23
332 0.23
333 0.21
334 0.25
335 0.24
336 0.28
337 0.27
338 0.23
339 0.24
340 0.24
341 0.23
342 0.19
343 0.17
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.07
356 0.07
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.04
381 0.03
382 0.04
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.1
387 0.17
388 0.18
389 0.21
390 0.21
391 0.18
392 0.19
393 0.2
394 0.24
395 0.18
396 0.19
397 0.17
398 0.2
399 0.2
400 0.2
401 0.2
402 0.2
403 0.21
404 0.21
405 0.19
406 0.18
407 0.18
408 0.16
409 0.17
410 0.13
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.15
417 0.14
418 0.12
419 0.1
420 0.13
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.12
425 0.12
426 0.15
427 0.16
428 0.15
429 0.22
430 0.26
431 0.29
432 0.36
433 0.44
434 0.48
435 0.48
436 0.49
437 0.41
438 0.36
439 0.32
440 0.24
441 0.17
442 0.11
443 0.1
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.05
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.12
456 0.14
457 0.15
458 0.22
459 0.26
460 0.36
461 0.45
462 0.55
463 0.6
464 0.68
465 0.76
466 0.79
467 0.84
468 0.81
469 0.81
470 0.8
471 0.8
472 0.72
473 0.63
474 0.52
475 0.42
476 0.38
477 0.29
478 0.2
479 0.11
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.1
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.08
511 0.08
512 0.06
513 0.04
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.02
518 0.02
519 0.02
520 0.02
521 0.02
522 0.02
523 0.02
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.03
530 0.04
531 0.03
532 0.03
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.08
539 0.15
540 0.19
541 0.21
542 0.23
543 0.25
544 0.3
545 0.34
546 0.37
547 0.38
548 0.35
549 0.37
550 0.39
551 0.41
552 0.37
553 0.33
554 0.27
555 0.21
556 0.22
557 0.19
558 0.17
559 0.14
560 0.15
561 0.19
562 0.27
563 0.34
564 0.38
565 0.43
566 0.43
567 0.44
568 0.42
569 0.38
570 0.31
571 0.28
572 0.24
573 0.2
574 0.21
575 0.21
576 0.2
577 0.22
578 0.23
579 0.2
580 0.17
581 0.16
582 0.15
583 0.15
584 0.15
585 0.13
586 0.11
587 0.08
588 0.08
589 0.07
590 0.06
591 0.04
592 0.03
593 0.04
594 0.04
595 0.05
596 0.05
597 0.06
598 0.07
599 0.08
600 0.08
601 0.1
602 0.18
603 0.24
604 0.28
605 0.28
606 0.26
607 0.27
608 0.26
609 0.25
610 0.18
611 0.12
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.07
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.07
629 0.08
630 0.08
631 0.11
632 0.15
633 0.14
634 0.19
635 0.23
636 0.24
637 0.27
638 0.28
639 0.31
640 0.28
641 0.3
642 0.26
643 0.22
644 0.2
645 0.16
646 0.15
647 0.08
648 0.07
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.05
667 0.06
668 0.07
669 0.08
670 0.11
671 0.13
672 0.14
673 0.16
674 0.19
675 0.22
676 0.26
677 0.29
678 0.3
679 0.29
680 0.29
681 0.27
682 0.24
683 0.22
684 0.16
685 0.12
686 0.08
687 0.07
688 0.1
689 0.1
690 0.1
691 0.1
692 0.1
693 0.1
694 0.11
695 0.12
696 0.09
697 0.09
698 0.1
699 0.1
700 0.1
701 0.1
702 0.09
703 0.08
704 0.07
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.12
713 0.1
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.07
724 0.08
725 0.1
726 0.19
727 0.27
728 0.33
729 0.4
730 0.46
731 0.54
732 0.65
733 0.73
734 0.75
735 0.78
736 0.82
737 0.83
738 0.86
739 0.87
740 0.83
741 0.83
742 0.79
743 0.78
744 0.77
745 0.77
746 0.73
747 0.72
748 0.71