Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YLW9

Protein Details
Accession A0A4Y9YLW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
500-521PAYRFTPSPRAGKKNKGRNFEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
507-517SPRAGKKNKGR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, cyto 3.5, plas 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR038385  Sua5/YwlC_C  
IPR005145  Sua5_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF03481  Sua5_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MAPGERVPRVLVHRRDFEDAAMEAAPTTPGMKYRHYSPATPVTLLHTAPIPPPGVARIAAADLVASLRSQDAANPKKVGLLTPSDSPLLQYATDAPGIAWFPFPLGTLADPAATAQRLFDGLISLDEQGVDLILVEEISEEREGLAVMNRVRKAASDALSHCSAAPSLTGPRGLCMHNGRTAAISVLADSIYSGIAGALMSFFCSLSPPPLFSRCRTEYLLCYDFLRRPGANGLSCKYTWCTCPIPGLACPATGAKVADALGGASVSGLNFLVLRPLKTGSPPCPLLIISTYLPSLVNVCSIPGLSLISLTVSLVIMDFNASSSRDAFASYTSFLNMDRDARSLPDSDFPAPSDSTCSSHSSPSLSSEPPMPVLKVPADDEPLPTNIDFEKFWPWLKSKQANGAQAQEQFDSDGRPVLSRSQSEAPQNYHRVHIPRPPNAFMLFRSDFLKQKIIPHEVERRQQNLSRIAGECWNMLPSAEKKKWQDKAARALKEHQAKYPAYRFTPSPRAGKKNKGRNFEGDDEDEKGRIRKLRERYMPQMIGPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.63
3 0.59
4 0.51
5 0.45
6 0.37
7 0.31
8 0.24
9 0.19
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.08
14 0.09
15 0.08
16 0.14
17 0.17
18 0.22
19 0.25
20 0.31
21 0.41
22 0.43
23 0.45
24 0.46
25 0.53
26 0.5
27 0.48
28 0.43
29 0.38
30 0.38
31 0.35
32 0.29
33 0.21
34 0.2
35 0.2
36 0.23
37 0.19
38 0.15
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.16
43 0.16
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.07
56 0.07
57 0.11
58 0.2
59 0.27
60 0.32
61 0.34
62 0.34
63 0.36
64 0.37
65 0.35
66 0.29
67 0.28
68 0.26
69 0.27
70 0.29
71 0.26
72 0.26
73 0.24
74 0.22
75 0.18
76 0.15
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.13
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.1
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.11
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.11
134 0.13
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.2
139 0.2
140 0.22
141 0.24
142 0.24
143 0.24
144 0.25
145 0.29
146 0.3
147 0.3
148 0.25
149 0.2
150 0.17
151 0.12
152 0.11
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.13
157 0.12
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.19
162 0.21
163 0.23
164 0.25
165 0.25
166 0.24
167 0.23
168 0.22
169 0.18
170 0.14
171 0.11
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.09
194 0.1
195 0.12
196 0.14
197 0.21
198 0.23
199 0.25
200 0.33
201 0.32
202 0.36
203 0.36
204 0.36
205 0.33
206 0.37
207 0.37
208 0.29
209 0.27
210 0.25
211 0.25
212 0.25
213 0.25
214 0.18
215 0.17
216 0.21
217 0.23
218 0.23
219 0.23
220 0.23
221 0.22
222 0.22
223 0.22
224 0.2
225 0.18
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.17
230 0.2
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.22
235 0.18
236 0.15
237 0.15
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.02
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.14
266 0.18
267 0.17
268 0.21
269 0.22
270 0.21
271 0.21
272 0.21
273 0.19
274 0.16
275 0.15
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.06
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.17
334 0.17
335 0.18
336 0.17
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.17
341 0.16
342 0.16
343 0.18
344 0.21
345 0.2
346 0.21
347 0.22
348 0.2
349 0.19
350 0.21
351 0.23
352 0.19
353 0.18
354 0.2
355 0.19
356 0.2
357 0.21
358 0.17
359 0.14
360 0.16
361 0.16
362 0.15
363 0.16
364 0.15
365 0.18
366 0.17
367 0.18
368 0.18
369 0.18
370 0.18
371 0.16
372 0.15
373 0.13
374 0.14
375 0.12
376 0.12
377 0.16
378 0.16
379 0.19
380 0.21
381 0.24
382 0.28
383 0.37
384 0.42
385 0.41
386 0.49
387 0.53
388 0.56
389 0.55
390 0.54
391 0.48
392 0.45
393 0.43
394 0.34
395 0.27
396 0.22
397 0.2
398 0.17
399 0.14
400 0.13
401 0.12
402 0.12
403 0.13
404 0.18
405 0.21
406 0.21
407 0.26
408 0.27
409 0.31
410 0.37
411 0.41
412 0.4
413 0.44
414 0.48
415 0.44
416 0.43
417 0.44
418 0.41
419 0.41
420 0.45
421 0.46
422 0.48
423 0.52
424 0.52
425 0.5
426 0.49
427 0.46
428 0.39
429 0.39
430 0.32
431 0.28
432 0.28
433 0.28
434 0.29
435 0.31
436 0.36
437 0.29
438 0.35
439 0.41
440 0.44
441 0.44
442 0.47
443 0.54
444 0.54
445 0.61
446 0.6
447 0.56
448 0.56
449 0.57
450 0.56
451 0.53
452 0.49
453 0.46
454 0.41
455 0.4
456 0.38
457 0.35
458 0.3
459 0.23
460 0.21
461 0.17
462 0.15
463 0.18
464 0.2
465 0.29
466 0.32
467 0.39
468 0.45
469 0.55
470 0.63
471 0.66
472 0.69
473 0.67
474 0.74
475 0.77
476 0.76
477 0.7
478 0.69
479 0.7
480 0.7
481 0.64
482 0.59
483 0.56
484 0.51
485 0.56
486 0.57
487 0.54
488 0.48
489 0.49
490 0.47
491 0.49
492 0.56
493 0.54
494 0.56
495 0.59
496 0.66
497 0.7
498 0.77
499 0.79
500 0.8
501 0.83
502 0.81
503 0.78
504 0.77
505 0.77
506 0.72
507 0.68
508 0.63
509 0.57
510 0.53
511 0.48
512 0.41
513 0.35
514 0.32
515 0.31
516 0.31
517 0.36
518 0.4
519 0.49
520 0.58
521 0.66
522 0.72
523 0.75
524 0.8
525 0.76