Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YB53

Protein Details
Accession A0A4Y9YB53    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-207GDTGKGKERHRRMCRLKDGFVBasic
646-675HGHGDGRYHEQRRRRRRVGRWGRRREDGITBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
656-670QRRRRRRVGRWGRRR
Subcellular Location(s) extr 9, cyto 7, nucl 5, mito 5, mito_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021643  Mediator_Med13_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF11597  Med13_N  
Amino Acid Sequences PPISLSSSILASALALPPKPLVSYAVFAPAAAAASDPLDTLELARRAVLKRAQPTLVASLLPTVLVDKDTLRLYVFAVDSLSEPDSTGSRTALSALCLDGLSLVETATFVPGDIYPCSPACAAQRKPCSACRLPDSHPPPSTPSTSSNLNTSPSCRYLPRIPLRPVLAQFLRAVRERVIDDLCTHEGDTGKGKERHRRMCRLKDGFVLFPPSAGARISDAVDWGMGWEHNASNRPLVHCTLHLYLTPTRILLHPLLRATHFLPLCPSPNLSQVSCRACPLEACTPITLLPYGTPAYYLTAYTGPTAALTHLFRASLTGLGCAALLPPSVSSQHTSSSSTDDPTLTSGGAYMLAWVPVQNRQGEQKGLIVIWPTGLALRFVPSAPVPHARTRLASLPVLPVQLMPSPPMPSANASVAASVAGTPAPEVLRPPPLLPALTRRPCLSPTSAARRVLRTLTMGGVGGIDAPCAPDVSVVAKEAEAYVDAVAKEREKERERLRREREAASGAGPSQTETPPAQTPSQSQSQQVPPAPEPEPFYPSPSPSAGSMPPATAISIAPPPAPPPMLSTGSVTPAPTSMEAPSTADATPALDAFITAPLPQGTPLAGPDAFGDFDAWAQDPNGWLSNSGSFMNMPGGGPDVGMDIGHGHGDGRYHEQRRRRRRVGRWGRRREDGITVCTYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.14
4 0.15
5 0.17
6 0.17
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.18
11 0.18
12 0.23
13 0.22
14 0.21
15 0.21
16 0.17
17 0.15
18 0.13
19 0.12
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.18
32 0.22
33 0.23
34 0.3
35 0.35
36 0.35
37 0.41
38 0.46
39 0.46
40 0.43
41 0.45
42 0.42
43 0.37
44 0.3
45 0.23
46 0.19
47 0.17
48 0.15
49 0.12
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.08
55 0.12
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.17
62 0.17
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.15
68 0.15
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.07
99 0.1
100 0.11
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.15
106 0.16
107 0.21
108 0.29
109 0.34
110 0.41
111 0.49
112 0.53
113 0.57
114 0.61
115 0.62
116 0.59
117 0.59
118 0.56
119 0.54
120 0.52
121 0.58
122 0.58
123 0.58
124 0.54
125 0.5
126 0.49
127 0.47
128 0.47
129 0.4
130 0.38
131 0.33
132 0.36
133 0.36
134 0.34
135 0.31
136 0.31
137 0.29
138 0.28
139 0.29
140 0.26
141 0.28
142 0.25
143 0.29
144 0.33
145 0.42
146 0.48
147 0.53
148 0.54
149 0.57
150 0.59
151 0.58
152 0.53
153 0.5
154 0.42
155 0.34
156 0.33
157 0.29
158 0.29
159 0.26
160 0.26
161 0.2
162 0.22
163 0.21
164 0.22
165 0.21
166 0.18
167 0.18
168 0.2
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.2
176 0.19
177 0.26
178 0.31
179 0.36
180 0.44
181 0.53
182 0.62
183 0.66
184 0.73
185 0.75
186 0.79
187 0.85
188 0.82
189 0.76
190 0.72
191 0.66
192 0.58
193 0.49
194 0.44
195 0.33
196 0.26
197 0.24
198 0.17
199 0.15
200 0.13
201 0.11
202 0.07
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.09
217 0.12
218 0.12
219 0.15
220 0.17
221 0.19
222 0.2
223 0.21
224 0.2
225 0.19
226 0.22
227 0.2
228 0.19
229 0.18
230 0.2
231 0.19
232 0.2
233 0.19
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.17
242 0.18
243 0.18
244 0.19
245 0.17
246 0.21
247 0.18
248 0.16
249 0.18
250 0.18
251 0.2
252 0.19
253 0.2
254 0.15
255 0.21
256 0.23
257 0.21
258 0.21
259 0.25
260 0.29
261 0.28
262 0.27
263 0.22
264 0.2
265 0.2
266 0.22
267 0.22
268 0.2
269 0.2
270 0.2
271 0.2
272 0.2
273 0.2
274 0.15
275 0.09
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.09
318 0.09
319 0.11
320 0.12
321 0.14
322 0.14
323 0.17
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.09
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.15
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.15
352 0.14
353 0.13
354 0.13
355 0.1
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.09
370 0.11
371 0.16
372 0.18
373 0.21
374 0.25
375 0.24
376 0.25
377 0.26
378 0.28
379 0.25
380 0.22
381 0.19
382 0.19
383 0.19
384 0.18
385 0.16
386 0.12
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.09
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.1
404 0.08
405 0.06
406 0.05
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.08
415 0.12
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.17
421 0.17
422 0.22
423 0.28
424 0.32
425 0.33
426 0.32
427 0.33
428 0.34
429 0.36
430 0.32
431 0.29
432 0.31
433 0.39
434 0.43
435 0.46
436 0.47
437 0.46
438 0.45
439 0.4
440 0.34
441 0.27
442 0.22
443 0.18
444 0.16
445 0.13
446 0.11
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.06
451 0.05
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.05
459 0.07
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.08
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.09
473 0.1
474 0.11
475 0.13
476 0.16
477 0.24
478 0.26
479 0.34
480 0.43
481 0.53
482 0.6
483 0.68
484 0.72
485 0.74
486 0.74
487 0.7
488 0.63
489 0.57
490 0.49
491 0.4
492 0.34
493 0.24
494 0.2
495 0.17
496 0.14
497 0.13
498 0.12
499 0.14
500 0.13
501 0.16
502 0.18
503 0.22
504 0.22
505 0.21
506 0.25
507 0.26
508 0.33
509 0.31
510 0.3
511 0.33
512 0.36
513 0.41
514 0.41
515 0.41
516 0.35
517 0.38
518 0.37
519 0.33
520 0.33
521 0.29
522 0.32
523 0.28
524 0.33
525 0.3
526 0.31
527 0.32
528 0.28
529 0.27
530 0.22
531 0.25
532 0.21
533 0.23
534 0.21
535 0.18
536 0.18
537 0.17
538 0.16
539 0.13
540 0.12
541 0.1
542 0.12
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.15
548 0.16
549 0.14
550 0.16
551 0.2
552 0.23
553 0.23
554 0.25
555 0.24
556 0.26
557 0.26
558 0.23
559 0.18
560 0.15
561 0.16
562 0.14
563 0.14
564 0.12
565 0.13
566 0.13
567 0.15
568 0.15
569 0.15
570 0.14
571 0.13
572 0.12
573 0.11
574 0.11
575 0.09
576 0.08
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.09
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.13
592 0.12
593 0.12
594 0.12
595 0.14
596 0.13
597 0.13
598 0.13
599 0.09
600 0.1
601 0.11
602 0.1
603 0.09
604 0.09
605 0.1
606 0.1
607 0.13
608 0.16
609 0.14
610 0.15
611 0.16
612 0.18
613 0.19
614 0.19
615 0.17
616 0.14
617 0.15
618 0.16
619 0.14
620 0.12
621 0.1
622 0.13
623 0.11
624 0.11
625 0.1
626 0.09
627 0.09
628 0.08
629 0.08
630 0.06
631 0.07
632 0.07
633 0.07
634 0.06
635 0.07
636 0.09
637 0.11
638 0.19
639 0.27
640 0.34
641 0.41
642 0.5
643 0.6
644 0.7
645 0.79
646 0.81
647 0.83
648 0.86
649 0.91
650 0.93
651 0.94
652 0.94
653 0.94
654 0.91
655 0.88
656 0.82
657 0.75
658 0.73
659 0.68
660 0.62