Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YV24

Protein Details
Accession A0A4Y9YV24    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-70STPSENPPRQNRDPEYRPRNPNADQDAHPRPDRRADNPRKKRPPRPHPSNRGPGRPNDVHydrophilic
79-105QSQTRNPDPRPPRYPRNFPRRNDGKPPHydrophilic
122-153ASSSRSQSRNRNSEPKPPRHPRNLPRRNDGESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-66RPDRRADNPRKKRPPRPHPSNRGPGR
131-181NRNSEPKPPRHPRNLPRRNDGESHAGPAAPASAGGGRQNPRGNGRASRFKG
722-726RARPR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd02325  R3H  
Amino Acid Sequences MSTADPAPLYTSTPSENPPRQNRDPEYRPRNPNADQDAHPRPDRRADNPRKKRPPRPHPSNRGPGRPNDVADASGSRSQSQTRNPDPRPPRYPRNFPRRNDGKPPAGFTGTGSGGQNDAARASSSRSQSRNRNSEPKPPRHPRNLPRRNDGESHAGPAAPASAGGGRQNPRGNGRASRFKGKLSEPAQASRAVADDTKPAEKYKAAAPHHDDLTSRLIYELRTPPYPDCPICFNPVHPAQPTWSCSPTIVHNLDESDSEKDGAKENANAQCCWTTFHLKCIRSWAAKSVKDLEDAWRARGEERKGDWRCPGCQSKRDVVPRGYWCVLMNYIKFSSCLTMVHVHVGASAVLNRSPNPLVSQLPTRVVTLAPARAPAVTRVPSHVIRVPVHLVRLRRTNPAIAERRRYRSAARTVLQIPSRTAAPRSSISRAATSAKRSCHAEITIVRVSVTRVHANHVRSRKLPSAGVERWKRRFPADLATQCLVLFLKMDKRRLGSENSTAGTSAIGPSTAVSIAAKSPVIRPRSSRLPVRVPHLSSHTAPAANTPSRPLLRLSSRQTPNSRGPPAPTRFRLVPPSAXSRLRIARMFVPHRVTLARARPARFLSCGRADVVRRHVRYPAARRAHMRRFCATARAALSAHAGDINARACAARWPRSRLRAKGKANVARCLGVETIGARSATIADCVRRVYGAPLKSWSATAVAPSSSRPSPAGRASIARTHARARPRHAGHPKTPHTCHEDPSPCPPCPFLTSKMCACGKKSVDNVRCSQERVSCGAPCGKLLRCGFHHCERPCHGDPCGPCAAVCGKPRKLCLPSLHPCPHPCHAPASCPEAEPCRTIVTITCPCGRLRQAVECGRCTGSPAGREATQKLKCSNECAIAKRNAKLAEALGIDASARGGEKPIVYSDELVAMAKANAKFVALVEKTFADFVASDKKVQVLPHMPEARRKFVHDDHARALQLAAVYRMDTEMIDQEPHRSVQLVSRLDTRIPNPLLSASISLGSSSSLGKLADLRAKPYRAPAPVAPVPAAKTTHRGWTSVVSTSHPASGSSTPPVQGPPAPAWTAPSAALRAPPVPRPAPSPRPAPPVQQAGDNVPDDWDVDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.33
3 0.4
4 0.48
5 0.56
6 0.63
7 0.67
8 0.74
9 0.78
10 0.78
11 0.8
12 0.81
13 0.81
14 0.82
15 0.83
16 0.81
17 0.81
18 0.75
19 0.75
20 0.73
21 0.69
22 0.63
23 0.63
24 0.64
25 0.62
26 0.64
27 0.58
28 0.54
29 0.57
30 0.59
31 0.59
32 0.62
33 0.67
34 0.73
35 0.8
36 0.87
37 0.89
38 0.93
39 0.95
40 0.95
41 0.95
42 0.94
43 0.95
44 0.95
45 0.94
46 0.94
47 0.94
48 0.92
49 0.9
50 0.84
51 0.8
52 0.77
53 0.71
54 0.62
55 0.57
56 0.49
57 0.39
58 0.36
59 0.31
60 0.27
61 0.26
62 0.25
63 0.21
64 0.22
65 0.26
66 0.3
67 0.37
68 0.43
69 0.49
70 0.58
71 0.61
72 0.69
73 0.74
74 0.77
75 0.78
76 0.77
77 0.78
78 0.78
79 0.85
80 0.85
81 0.88
82 0.87
83 0.81
84 0.84
85 0.82
86 0.8
87 0.8
88 0.78
89 0.76
90 0.7
91 0.71
92 0.65
93 0.57
94 0.49
95 0.4
96 0.37
97 0.29
98 0.27
99 0.22
100 0.18
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.16
110 0.21
111 0.26
112 0.33
113 0.38
114 0.46
115 0.55
116 0.64
117 0.7
118 0.72
119 0.76
120 0.73
121 0.78
122 0.81
123 0.81
124 0.81
125 0.82
126 0.83
127 0.84
128 0.9
129 0.89
130 0.9
131 0.9
132 0.87
133 0.86
134 0.82
135 0.77
136 0.7
137 0.64
138 0.61
139 0.52
140 0.48
141 0.4
142 0.33
143 0.27
144 0.24
145 0.2
146 0.11
147 0.1
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.11
152 0.17
153 0.19
154 0.25
155 0.29
156 0.32
157 0.36
158 0.39
159 0.41
160 0.43
161 0.48
162 0.53
163 0.53
164 0.59
165 0.56
166 0.55
167 0.57
168 0.51
169 0.54
170 0.47
171 0.5
172 0.43
173 0.46
174 0.44
175 0.39
176 0.36
177 0.27
178 0.24
179 0.18
180 0.16
181 0.13
182 0.16
183 0.18
184 0.21
185 0.22
186 0.22
187 0.23
188 0.23
189 0.24
190 0.26
191 0.32
192 0.31
193 0.38
194 0.42
195 0.45
196 0.46
197 0.45
198 0.39
199 0.32
200 0.35
201 0.28
202 0.21
203 0.17
204 0.16
205 0.16
206 0.22
207 0.26
208 0.24
209 0.27
210 0.29
211 0.3
212 0.36
213 0.41
214 0.36
215 0.32
216 0.35
217 0.35
218 0.38
219 0.37
220 0.32
221 0.34
222 0.37
223 0.38
224 0.33
225 0.32
226 0.3
227 0.34
228 0.37
229 0.33
230 0.31
231 0.28
232 0.27
233 0.27
234 0.27
235 0.3
236 0.28
237 0.25
238 0.24
239 0.24
240 0.24
241 0.24
242 0.21
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.17
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.23
253 0.28
254 0.3
255 0.29
256 0.28
257 0.28
258 0.27
259 0.27
260 0.25
261 0.28
262 0.26
263 0.35
264 0.41
265 0.4
266 0.4
267 0.45
268 0.48
269 0.43
270 0.44
271 0.44
272 0.44
273 0.46
274 0.48
275 0.47
276 0.42
277 0.4
278 0.39
279 0.35
280 0.36
281 0.34
282 0.33
283 0.28
284 0.28
285 0.28
286 0.33
287 0.32
288 0.3
289 0.33
290 0.42
291 0.43
292 0.46
293 0.51
294 0.48
295 0.48
296 0.48
297 0.54
298 0.5
299 0.53
300 0.56
301 0.55
302 0.6
303 0.64
304 0.63
305 0.56
306 0.57
307 0.55
308 0.56
309 0.49
310 0.42
311 0.34
312 0.3
313 0.3
314 0.26
315 0.23
316 0.2
317 0.2
318 0.19
319 0.19
320 0.18
321 0.16
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.14
326 0.15
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.11
333 0.08
334 0.09
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.15
344 0.16
345 0.18
346 0.22
347 0.21
348 0.23
349 0.23
350 0.22
351 0.2
352 0.18
353 0.18
354 0.16
355 0.17
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.14
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.19
366 0.23
367 0.24
368 0.26
369 0.27
370 0.27
371 0.24
372 0.26
373 0.27
374 0.24
375 0.26
376 0.26
377 0.26
378 0.25
379 0.32
380 0.32
381 0.34
382 0.35
383 0.34
384 0.35
385 0.42
386 0.47
387 0.44
388 0.51
389 0.52
390 0.56
391 0.56
392 0.55
393 0.5
394 0.49
395 0.52
396 0.5
397 0.45
398 0.44
399 0.43
400 0.46
401 0.44
402 0.37
403 0.3
404 0.23
405 0.24
406 0.2
407 0.19
408 0.16
409 0.16
410 0.18
411 0.21
412 0.23
413 0.26
414 0.26
415 0.26
416 0.26
417 0.27
418 0.27
419 0.3
420 0.31
421 0.29
422 0.3
423 0.31
424 0.31
425 0.3
426 0.27
427 0.26
428 0.23
429 0.27
430 0.27
431 0.24
432 0.22
433 0.19
434 0.19
435 0.18
436 0.19
437 0.17
438 0.16
439 0.2
440 0.24
441 0.27
442 0.33
443 0.35
444 0.36
445 0.34
446 0.39
447 0.39
448 0.37
449 0.36
450 0.33
451 0.36
452 0.36
453 0.43
454 0.46
455 0.48
456 0.5
457 0.52
458 0.5
459 0.44
460 0.45
461 0.38
462 0.38
463 0.4
464 0.39
465 0.4
466 0.39
467 0.37
468 0.32
469 0.3
470 0.22
471 0.12
472 0.1
473 0.06
474 0.14
475 0.18
476 0.21
477 0.22
478 0.24
479 0.27
480 0.29
481 0.33
482 0.29
483 0.3
484 0.3
485 0.29
486 0.27
487 0.24
488 0.21
489 0.16
490 0.12
491 0.08
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.1
506 0.15
507 0.18
508 0.19
509 0.22
510 0.26
511 0.34
512 0.38
513 0.39
514 0.39
515 0.44
516 0.45
517 0.48
518 0.47
519 0.41
520 0.38
521 0.37
522 0.34
523 0.27
524 0.27
525 0.23
526 0.19
527 0.17
528 0.17
529 0.17
530 0.15
531 0.15
532 0.14
533 0.16
534 0.16
535 0.17
536 0.17
537 0.17
538 0.21
539 0.27
540 0.3
541 0.36
542 0.4
543 0.44
544 0.46
545 0.47
546 0.48
547 0.48
548 0.47
549 0.39
550 0.39
551 0.42
552 0.44
553 0.45
554 0.41
555 0.38
556 0.36
557 0.38
558 0.39
559 0.33
560 0.34
561 0.3
562 0.35
563 0.33
564 0.33
565 0.32
566 0.27
567 0.28
568 0.24
569 0.23
570 0.2
571 0.24
572 0.25
573 0.28
574 0.3
575 0.27
576 0.26
577 0.25
578 0.24
579 0.23
580 0.26
581 0.29
582 0.3
583 0.31
584 0.33
585 0.35
586 0.35
587 0.32
588 0.29
589 0.27
590 0.25
591 0.24
592 0.22
593 0.23
594 0.23
595 0.24
596 0.31
597 0.34
598 0.33
599 0.33
600 0.35
601 0.37
602 0.42
603 0.46
604 0.47
605 0.45
606 0.47
607 0.51
608 0.57
609 0.62
610 0.6
611 0.57
612 0.49
613 0.48
614 0.45
615 0.45
616 0.37
617 0.31
618 0.26
619 0.24
620 0.22
621 0.18
622 0.18
623 0.13
624 0.12
625 0.09
626 0.07
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.12
635 0.17
636 0.24
637 0.28
638 0.35
639 0.41
640 0.51
641 0.58
642 0.61
643 0.66
644 0.67
645 0.68
646 0.69
647 0.72
648 0.69
649 0.65
650 0.61
651 0.52
652 0.43
653 0.38
654 0.32
655 0.23
656 0.17
657 0.14
658 0.1
659 0.09
660 0.09
661 0.09
662 0.07
663 0.07
664 0.08
665 0.07
666 0.09
667 0.09
668 0.09
669 0.1
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.1
674 0.13
675 0.18
676 0.19
677 0.19
678 0.21
679 0.22
680 0.22
681 0.22
682 0.18
683 0.14
684 0.12
685 0.12
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.14
691 0.12
692 0.13
693 0.14
694 0.15
695 0.19
696 0.21
697 0.23
698 0.21
699 0.23
700 0.25
701 0.27
702 0.3
703 0.27
704 0.26
705 0.28
706 0.31
707 0.36
708 0.38
709 0.4
710 0.46
711 0.48
712 0.56
713 0.62
714 0.65
715 0.65
716 0.7
717 0.71
718 0.69
719 0.67
720 0.62
721 0.61
722 0.55
723 0.5
724 0.49
725 0.47
726 0.42
727 0.49
728 0.5
729 0.42
730 0.41
731 0.39
732 0.32
733 0.32
734 0.33
735 0.29
736 0.3
737 0.33
738 0.34
739 0.4
740 0.42
741 0.39
742 0.37
743 0.39
744 0.36
745 0.38
746 0.44
747 0.47
748 0.5
749 0.53
750 0.54
751 0.52
752 0.51
753 0.47
754 0.44
755 0.38
756 0.34
757 0.33
758 0.32
759 0.27
760 0.27
761 0.3
762 0.26
763 0.23
764 0.25
765 0.22
766 0.27
767 0.27
768 0.3
769 0.29
770 0.36
771 0.4
772 0.43
773 0.51
774 0.46
775 0.51
776 0.51
777 0.56
778 0.53
779 0.5
780 0.45
781 0.41
782 0.39
783 0.38
784 0.37
785 0.28
786 0.23
787 0.23
788 0.25
789 0.26
790 0.31
791 0.33
792 0.37
793 0.4
794 0.43
795 0.48
796 0.48
797 0.48
798 0.49
799 0.5
800 0.52
801 0.58
802 0.6
803 0.58
804 0.57
805 0.57
806 0.53
807 0.48
808 0.42
809 0.4
810 0.36
811 0.36
812 0.37
813 0.38
814 0.35
815 0.31
816 0.32
817 0.29
818 0.3
819 0.26
820 0.24
821 0.2
822 0.19
823 0.19
824 0.18
825 0.21
826 0.24
827 0.26
828 0.28
829 0.28
830 0.28
831 0.33
832 0.34
833 0.32
834 0.31
835 0.34
836 0.4
837 0.46
838 0.49
839 0.46
840 0.46
841 0.42
842 0.37
843 0.34
844 0.31
845 0.27
846 0.25
847 0.26
848 0.26
849 0.27
850 0.3
851 0.3
852 0.34
853 0.36
854 0.38
855 0.39
856 0.43
857 0.41
858 0.44
859 0.45
860 0.45
861 0.44
862 0.45
863 0.48
864 0.5
865 0.53
866 0.5
867 0.51
868 0.44
869 0.41
870 0.38
871 0.31
872 0.27
873 0.23
874 0.21
875 0.15
876 0.13
877 0.12
878 0.1
879 0.09
880 0.05
881 0.05
882 0.05
883 0.06
884 0.08
885 0.08
886 0.1
887 0.12
888 0.14
889 0.15
890 0.16
891 0.15
892 0.15
893 0.15
894 0.14
895 0.12
896 0.1
897 0.1
898 0.14
899 0.13
900 0.13
901 0.12
902 0.12
903 0.13
904 0.12
905 0.21
906 0.16
907 0.17
908 0.17
909 0.18
910 0.18
911 0.18
912 0.17
913 0.1
914 0.09
915 0.11
916 0.19
917 0.19
918 0.2
919 0.2
920 0.22
921 0.24
922 0.24
923 0.29
924 0.27
925 0.3
926 0.38
927 0.46
928 0.45
929 0.52
930 0.57
931 0.58
932 0.52
933 0.53
934 0.5
935 0.48
936 0.58
937 0.57
938 0.57
939 0.53
940 0.57
941 0.53
942 0.46
943 0.4
944 0.31
945 0.24
946 0.19
947 0.17
948 0.11
949 0.11
950 0.11
951 0.12
952 0.1
953 0.09
954 0.09
955 0.11
956 0.11
957 0.14
958 0.14
959 0.17
960 0.19
961 0.2
962 0.19
963 0.17
964 0.17
965 0.21
966 0.29
967 0.28
968 0.28
969 0.33
970 0.34
971 0.36
972 0.39
973 0.35
974 0.35
975 0.34
976 0.33
977 0.28
978 0.28
979 0.27
980 0.24
981 0.23
982 0.15
983 0.14
984 0.14
985 0.12
986 0.12
987 0.1
988 0.1
989 0.09
990 0.09
991 0.09
992 0.09
993 0.1
994 0.12
995 0.17
996 0.24
997 0.24
998 0.3
999 0.35
1000 0.38
1001 0.39
1002 0.44
1003 0.47
1004 0.42
1005 0.47
1006 0.43
1007 0.45
1008 0.46
1009 0.47
1010 0.41
1011 0.36
1012 0.35
1013 0.33
1014 0.34
1015 0.27
1016 0.28
1017 0.28
1018 0.36
1019 0.35
1020 0.34
1021 0.32
1022 0.36
1023 0.37
1024 0.38
1025 0.37
1026 0.31
1027 0.33
1028 0.33
1029 0.33
1030 0.27
1031 0.24
1032 0.22
1033 0.24
1034 0.24
1035 0.25
1036 0.26
1037 0.24
1038 0.25
1039 0.26
1040 0.25
1041 0.25
1042 0.26
1043 0.25
1044 0.28
1045 0.29
1046 0.28
1047 0.3
1048 0.28
1049 0.27
1050 0.24
1051 0.23
1052 0.2
1053 0.2
1054 0.22
1055 0.21
1056 0.24
1057 0.26
1058 0.3
1059 0.35
1060 0.36
1061 0.38
1062 0.42
1063 0.49
1064 0.54
1065 0.56
1066 0.58
1067 0.58
1068 0.62
1069 0.63
1070 0.64
1071 0.62
1072 0.61
1073 0.57
1074 0.54
1075 0.5
1076 0.46
1077 0.48
1078 0.42
1079 0.35
1080 0.27
1081 0.26