FuNGI

A0A4Y9Y6L0

Protein Details

Accession

A0A4Y9Y6L0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-64	ASTSRAQGGPPNKKRKRNNNNNNGNNNHNH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
46-50	NKKRK
84-93	RGGGGGKRRS

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9.833, cyto 7, cyto_mito 6.333, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007231 Nucleoporin_int_Nup93/Nic96 IPR047313 SMN_C
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
CDD	cd22852 SMN_C cd22851 SMN_N

Amino Acid Sequences

MARLVVSYDDIAGPSSFPAGPSAAIGPQVPPPAFASTSRAQGGPPNKKRKRNNNNNNGNNNHNHYPQNNGYGNNRGNYHNNRGRGGGGGKRRSEVRAALGRPRECGACNVVRWGRGRGVTTTILLQEDDSYDYEDGEVGEVGEEKGAEEEEESRELTHDDIWDDSALIDAWESATAEYEAYHGKGKSWKDEPVKKSPLWYNVPPPLSKLKSAQQPKANGIAAVVAEAVAEAETSQPLDFDTFVPQHDPSLAYLAAPTGLVSEAQLAEVPAGWPDQDEAFSRAMSAMYWSGYWTAVYHSHQKLGKKATASTNEQGDGAADEGEYAADADESMGAPADEDEDLVSTQLAEPSASRRVASSVFNCVLSLRGLTHTLRANVQIALPADATLHGEKELPTTMADLSSLLTSSKALTSHLSKPDLPHVNLSLDQIEAQSRRLVSRQPGAAADSGRANYLLAQAHVDAPALASSIAHLNTSTTFSPLQPLQDTDIAGYLRHAHEQNIISTIEEARRETQDEFYHVLEERGRRDWEARKKRVFE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.12
3	0.11
4	0.11
5	0.12
6	0.12
7	0.12
8	0.13
9	0.14
10	0.13
11	0.14
12	0.14
13	0.14
14	0.17
15	0.22
16	0.21
17	0.21
18	0.22
19	0.25
20	0.26
21	0.26
22	0.28
23	0.25
24	0.3
25	0.31
26	0.28
27	0.25
28	0.31
29	0.4
30	0.45
31	0.52
32	0.59
33	0.66
34	0.76
35	0.86
36	0.9
37	0.91
38	0.91
39	0.92
40	0.92
41	0.94
42	0.94
43	0.93
44	0.86
45	0.81
46	0.75
47	0.71
48	0.64
49	0.57
50	0.52
51	0.44
52	0.47
53	0.44
54	0.47
55	0.43
56	0.41
57	0.4
58	0.45
59	0.47
60	0.42
61	0.41
62	0.36
63	0.42
64	0.45
65	0.52
66	0.5
67	0.51
68	0.49
69	0.48
70	0.45
71	0.41
72	0.39
73	0.36
74	0.39
75	0.42
76	0.42
77	0.43
78	0.45
79	0.43
80	0.42
81	0.38
82	0.36
83	0.37
84	0.39
85	0.44
86	0.5
87	0.48
88	0.46
89	0.45
90	0.39
91	0.32
92	0.32
93	0.3
94	0.27
95	0.27
96	0.33
97	0.33
98	0.35
99	0.36
100	0.37
101	0.35
102	0.33
103	0.34
104	0.28
105	0.3
106	0.28
107	0.26
108	0.24
109	0.21
110	0.19
111	0.16
112	0.15
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.1
117	0.11
118	0.11
119	0.11
120	0.1
121	0.1
122	0.09
123	0.08
124	0.07
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.07
137	0.09
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.11
143	0.11
144	0.1
145	0.1
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.06
154	0.05
155	0.05
156	0.04
157	0.04
158	0.04
159	0.05
160	0.04
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.07
167	0.08
168	0.11
169	0.11
170	0.13
171	0.18
172	0.2
173	0.25
174	0.28
175	0.35
176	0.41
177	0.5
178	0.53
179	0.57
180	0.61
181	0.55
182	0.58
183	0.55
184	0.53
185	0.5
186	0.48
187	0.45
188	0.46
189	0.48
190	0.42
191	0.4
192	0.4
193	0.36
194	0.35
195	0.31
196	0.31
197	0.37
198	0.44
199	0.48
200	0.46
201	0.48
202	0.48
203	0.5
204	0.44
205	0.35
206	0.28
207	0.22
208	0.16
209	0.12
210	0.1
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.02
216	0.02
217	0.02
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.08
236	0.1
237	0.1
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.05
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.03
257	0.04
258	0.03
259	0.03
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.07
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.08
271	0.07
272	0.06
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.09
282	0.11
283	0.19
284	0.19
285	0.24
286	0.27
287	0.29
288	0.32
289	0.34
290	0.35
291	0.29
292	0.32
293	0.34
294	0.36
295	0.39
296	0.36
297	0.33
298	0.31
299	0.29
300	0.26
301	0.19
302	0.14
303	0.09
304	0.07
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.02
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.09
337	0.13
338	0.14
339	0.13
340	0.13
341	0.15
342	0.17
343	0.2
344	0.19
345	0.21
346	0.21
347	0.22
348	0.21
349	0.19
350	0.18
351	0.15
352	0.14
353	0.08
354	0.09
355	0.11
356	0.12
357	0.16
358	0.18
359	0.19
360	0.19
361	0.2
362	0.2
363	0.18
364	0.18
365	0.17
366	0.14
367	0.14
368	0.13
369	0.11
370	0.1
371	0.1
372	0.12
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.11
379	0.12
380	0.1
381	0.1
382	0.11
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.12
398	0.17
399	0.24
400	0.29
401	0.32
402	0.31
403	0.34
404	0.42
405	0.45
406	0.42
407	0.38
408	0.35
409	0.34
410	0.34
411	0.33
412	0.25
413	0.18
414	0.17
415	0.14
416	0.16
417	0.14
418	0.14
419	0.16
420	0.16
421	0.17
422	0.19
423	0.24
424	0.26
425	0.32
426	0.34
427	0.33
428	0.33
429	0.34
430	0.34
431	0.29
432	0.25
433	0.21
434	0.18
435	0.17
436	0.16
437	0.13
438	0.12
439	0.15
440	0.14
441	0.12
442	0.13
443	0.13
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.1
448	0.09
449	0.08
450	0.07
451	0.06
452	0.05
453	0.06
454	0.09
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.1
459	0.11
460	0.15
461	0.15
462	0.14
463	0.15
464	0.15
465	0.21
466	0.21
467	0.24
468	0.23
469	0.24
470	0.26
471	0.27
472	0.27
473	0.22
474	0.24
475	0.2
476	0.18
477	0.17
478	0.18
479	0.17
480	0.21
481	0.22
482	0.2
483	0.26
484	0.29
485	0.29
486	0.28
487	0.26
488	0.22
489	0.22
490	0.24
491	0.21
492	0.21
493	0.22
494	0.23
495	0.26
496	0.28
497	0.29
498	0.32
499	0.32
500	0.34
501	0.34
502	0.32
503	0.32
504	0.29
505	0.3
506	0.29
507	0.29
508	0.29
509	0.32
510	0.34
511	0.34
512	0.41
513	0.48
514	0.54
515	0.61
516	0.67

A0A4Y9Y6L0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer