Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YZV4

Protein Details
Accession A0A4Y9YZV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-62VIPVLERLVRRERRHKKHEIGALIIHydrophilic
543-574AWSNKTVKKTEKDKRREKKDRKKAWMKSQVAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-53RRHK
547-567KTVKKTEKDKRREKKDRKKAW
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 7, extr 5, nucl 3.5, plas 3, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR029052  Metallo-depent_PP-like  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR018946  PhoD-like_MPP  
IPR038607  PhoD-like_sf  
IPR032093  PhoD_N  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PF09423  PhoD  
PF16655  PhoD_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17960  DEADc_DDX55  
cd07389  MPP_PhoD  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MGHTQMTPVQASTIPLFMGNKDVVVEAVTGSGKTLAFVIPVLERLVRRERRHKKHEIGALIISPTRELASQIYSIFELFLSSQPMSEHDGVPDTSGQYPPPLLLVSSSTSSPAEDVQRFVSTGADIVIGTPGRVEEFLLGKGRDTVSAKELEVLVLDEADRLLDLGFQQTLARILTHLPKQRRTGLFSATMTDADAVSELVRVGLRNPARVIVKVQAKKGQKRDTAIEERRIPANLKIFYLVCRPPEKVVQLTRIIALETSRHQSARFILYFATGASVDHFYRILSLFLPKGTKLHSLHGHLPPASRTRTLSSFASSVAIPSAPSILLATDVAARGLDIPDVDVVVQFDPPSDTKMFSHRSGRTARAGRSGRAWVLLVGREQEYIDFLFVRKIPVTQHAYINEDGSEDPRNCDERADDTAVGHFLDTIRSELRTDRVLHDKAVKAFVSFVRAYSNHEASYIFRIKDLDLVGIAKAFGLLRLPRMPELKNANRDGWADADIDWDTYPYLDKAQEAKRIATAEAQKAQALEKPRAPPVDKTKYTAWSNKTVKKTEKDKRREKKDRKKAWMKSQVAEDAKGAEGETLKRSRADSDAGEDDDWEELAREERMAKKDSDVMYVVFYELCGKMLILRWQAWRVTSAQLFLASGVKMSLAGKSGSICSSSPKAFGTSNHLSMVKNVTAGGVMKLLVLILSASAALASTLLERNLVYHSPFHDHPQFSHDTREIHARQLRNARRQVQAASAFNDDHYPTFYGADFSNSPFVWNGGLNFTHSVASGDPFDTSVLLWTRAVPVTNSTSPGPDQSVPVCVSYKVFSSPSLTGRPVNTGEAFTSYDVDFTVKVEATDLKADTKYWFVFADCTNPSSVSPTGVTRTLSNPDTPAHEVNGGKNLTLAVFSCSQYQAGWFNAYGVAAHNTTADVFVHLGDYIYESLGNGAHIGRQTLGRELATIHDYRQRLNQYRTDASLLFAHQNAPWITLTSSRARDDHEVADNSWKAGTADSNDTSVGCAFSPSGACFTDRKLAAVRAYHEWMPVRQVTADDKLRIWRNFQIGKLLDLTMLDTRKLFIGQRSGAVCLLQGVRRHAAEEHWHLYLEYVNTIAAYPNRSLMGLPQENWFFDSLSESKSRGAVWRVVGQQIVFTQLNESGAFDLDAWDGYRANRQRVLDHLYENKIDNTIILSGDSHANWVSDLAHPNDTSYDPVTGKGAIGVEFAGTAVTSGSSFGTNIAPPAADQISDVLVAVNDELQWSEGSYRGFFTLTINPDTLTATYYAMNNITFANLDAFASAQFVVHNGANKLTRPVAGGSVNAGVLKSSVVNATKTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.17
4 0.15
5 0.19
6 0.16
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.08
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.11
26 0.1
27 0.12
28 0.13
29 0.16
30 0.16
31 0.21
32 0.32
33 0.39
34 0.47
35 0.57
36 0.66
37 0.73
38 0.82
39 0.87
40 0.86
41 0.86
42 0.86
43 0.8
44 0.74
45 0.66
46 0.58
47 0.5
48 0.42
49 0.33
50 0.24
51 0.19
52 0.16
53 0.13
54 0.12
55 0.13
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.15
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.17
72 0.22
73 0.23
74 0.22
75 0.19
76 0.22
77 0.21
78 0.23
79 0.22
80 0.18
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.17
100 0.21
101 0.21
102 0.22
103 0.23
104 0.24
105 0.25
106 0.24
107 0.21
108 0.14
109 0.13
110 0.12
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.11
124 0.15
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.22
129 0.22
130 0.24
131 0.25
132 0.25
133 0.23
134 0.26
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.19
139 0.17
140 0.15
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.12
162 0.19
163 0.27
164 0.34
165 0.4
166 0.47
167 0.52
168 0.61
169 0.62
170 0.61
171 0.58
172 0.55
173 0.53
174 0.47
175 0.45
176 0.37
177 0.32
178 0.26
179 0.22
180 0.17
181 0.1
182 0.1
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.15
192 0.17
193 0.2
194 0.21
195 0.25
196 0.27
197 0.28
198 0.3
199 0.3
200 0.38
201 0.39
202 0.43
203 0.46
204 0.53
205 0.6
206 0.67
207 0.69
208 0.65
209 0.66
210 0.67
211 0.68
212 0.7
213 0.69
214 0.67
215 0.63
216 0.59
217 0.56
218 0.52
219 0.45
220 0.4
221 0.41
222 0.34
223 0.3
224 0.3
225 0.28
226 0.29
227 0.33
228 0.31
229 0.28
230 0.3
231 0.3
232 0.31
233 0.36
234 0.38
235 0.39
236 0.41
237 0.41
238 0.41
239 0.4
240 0.38
241 0.33
242 0.29
243 0.22
244 0.18
245 0.15
246 0.15
247 0.18
248 0.19
249 0.19
250 0.19
251 0.21
252 0.24
253 0.29
254 0.26
255 0.23
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.19
260 0.16
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.12
274 0.12
275 0.15
276 0.17
277 0.15
278 0.16
279 0.18
280 0.25
281 0.24
282 0.3
283 0.34
284 0.37
285 0.44
286 0.47
287 0.48
288 0.41
289 0.41
290 0.37
291 0.37
292 0.35
293 0.3
294 0.28
295 0.28
296 0.3
297 0.32
298 0.3
299 0.27
300 0.25
301 0.23
302 0.22
303 0.18
304 0.15
305 0.12
306 0.11
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.12
340 0.14
341 0.14
342 0.22
343 0.26
344 0.28
345 0.36
346 0.35
347 0.4
348 0.42
349 0.45
350 0.47
351 0.49
352 0.47
353 0.48
354 0.48
355 0.44
356 0.43
357 0.42
358 0.34
359 0.3
360 0.28
361 0.19
362 0.19
363 0.19
364 0.16
365 0.15
366 0.15
367 0.14
368 0.13
369 0.12
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.11
377 0.13
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.21
382 0.27
383 0.26
384 0.3
385 0.3
386 0.33
387 0.32
388 0.31
389 0.23
390 0.18
391 0.16
392 0.14
393 0.17
394 0.14
395 0.15
396 0.18
397 0.2
398 0.19
399 0.2
400 0.2
401 0.18
402 0.22
403 0.24
404 0.21
405 0.19
406 0.2
407 0.2
408 0.18
409 0.14
410 0.1
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.12
419 0.14
420 0.16
421 0.18
422 0.2
423 0.27
424 0.27
425 0.28
426 0.33
427 0.34
428 0.32
429 0.34
430 0.3
431 0.23
432 0.24
433 0.22
434 0.22
435 0.18
436 0.17
437 0.17
438 0.18
439 0.23
440 0.26
441 0.27
442 0.22
443 0.22
444 0.22
445 0.2
446 0.26
447 0.25
448 0.2
449 0.19
450 0.2
451 0.19
452 0.22
453 0.21
454 0.14
455 0.1
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.06
465 0.07
466 0.1
467 0.12
468 0.14
469 0.16
470 0.19
471 0.2
472 0.24
473 0.33
474 0.37
475 0.41
476 0.43
477 0.41
478 0.4
479 0.4
480 0.35
481 0.27
482 0.22
483 0.15
484 0.12
485 0.13
486 0.11
487 0.1
488 0.09
489 0.08
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.05
494 0.07
495 0.07
496 0.09
497 0.15
498 0.19
499 0.26
500 0.26
501 0.27
502 0.27
503 0.28
504 0.27
505 0.26
506 0.26
507 0.23
508 0.25
509 0.25
510 0.23
511 0.22
512 0.22
513 0.2
514 0.2
515 0.19
516 0.2
517 0.23
518 0.25
519 0.29
520 0.31
521 0.34
522 0.4
523 0.47
524 0.44
525 0.45
526 0.45
527 0.47
528 0.5
529 0.5
530 0.43
531 0.43
532 0.49
533 0.52
534 0.55
535 0.54
536 0.56
537 0.58
538 0.64
539 0.64
540 0.67
541 0.71
542 0.76
543 0.8
544 0.85
545 0.89
546 0.9
547 0.92
548 0.93
549 0.93
550 0.93
551 0.93
552 0.9
553 0.9
554 0.89
555 0.82
556 0.73
557 0.66
558 0.62
559 0.53
560 0.45
561 0.34
562 0.24
563 0.2
564 0.18
565 0.14
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.12
570 0.12
571 0.13
572 0.14
573 0.14
574 0.15
575 0.16
576 0.17
577 0.14
578 0.16
579 0.18
580 0.18
581 0.17
582 0.15
583 0.14
584 0.11
585 0.1
586 0.06
587 0.05
588 0.04
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.07
593 0.12
594 0.15
595 0.17
596 0.17
597 0.17
598 0.23
599 0.23
600 0.23
601 0.2
602 0.17
603 0.15
604 0.15
605 0.14
606 0.08
607 0.08
608 0.07
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.05
613 0.06
614 0.09
615 0.13
616 0.13
617 0.15
618 0.16
619 0.18
620 0.19
621 0.18
622 0.18
623 0.16
624 0.17
625 0.15
626 0.14
627 0.12
628 0.12
629 0.11
630 0.1
631 0.1
632 0.06
633 0.06
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.12
649 0.12
650 0.13
651 0.13
652 0.14
653 0.14
654 0.15
655 0.21
656 0.21
657 0.22
658 0.22
659 0.22
660 0.21
661 0.21
662 0.23
663 0.15
664 0.12
665 0.1
666 0.09
667 0.08
668 0.09
669 0.08
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.03
677 0.03
678 0.02
679 0.02
680 0.02
681 0.02
682 0.02
683 0.02
684 0.02
685 0.02
686 0.02
687 0.03
688 0.04
689 0.04
690 0.05
691 0.05
692 0.06
693 0.07
694 0.08
695 0.08
696 0.09
697 0.1
698 0.14
699 0.15
700 0.18
701 0.23
702 0.23
703 0.22
704 0.26
705 0.28
706 0.25
707 0.28
708 0.26
709 0.21
710 0.22
711 0.29
712 0.25
713 0.28
714 0.32
715 0.29
716 0.32
717 0.41
718 0.47
719 0.47
720 0.53
721 0.51
722 0.5
723 0.51
724 0.47
725 0.43
726 0.41
727 0.34
728 0.3
729 0.26
730 0.23
731 0.21
732 0.21
733 0.16
734 0.11
735 0.11
736 0.1
737 0.09
738 0.1
739 0.1
740 0.1
741 0.09
742 0.12
743 0.11
744 0.11
745 0.13
746 0.12
747 0.13
748 0.11
749 0.12
750 0.1
751 0.09
752 0.09
753 0.08
754 0.09
755 0.09
756 0.1
757 0.1
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.07
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.07
766 0.07
767 0.07
768 0.06
769 0.06
770 0.07
771 0.08
772 0.08
773 0.08
774 0.08
775 0.1
776 0.11
777 0.11
778 0.09
779 0.11
780 0.15
781 0.16
782 0.18
783 0.16
784 0.17
785 0.17
786 0.18
787 0.18
788 0.13
789 0.14
790 0.12
791 0.15
792 0.15
793 0.16
794 0.15
795 0.13
796 0.13
797 0.12
798 0.13
799 0.12
800 0.12
801 0.11
802 0.14
803 0.16
804 0.19
805 0.21
806 0.21
807 0.21
808 0.21
809 0.24
810 0.21
811 0.21
812 0.19
813 0.16
814 0.15
815 0.15
816 0.15
817 0.12
818 0.13
819 0.1
820 0.1
821 0.09
822 0.09
823 0.07
824 0.07
825 0.09
826 0.07
827 0.07
828 0.08
829 0.08
830 0.09
831 0.11
832 0.11
833 0.11
834 0.12
835 0.13
836 0.13
837 0.15
838 0.14
839 0.13
840 0.13
841 0.11
842 0.14
843 0.13
844 0.18
845 0.16
846 0.16
847 0.16
848 0.16
849 0.16
850 0.17
851 0.17
852 0.13
853 0.13
854 0.13
855 0.15
856 0.16
857 0.17
858 0.14
859 0.16
860 0.19
861 0.19
862 0.19
863 0.18
864 0.18
865 0.21
866 0.23
867 0.21
868 0.18
869 0.21
870 0.2
871 0.2
872 0.25
873 0.22
874 0.18
875 0.17
876 0.16
877 0.12
878 0.12
879 0.11
880 0.08
881 0.1
882 0.1
883 0.12
884 0.12
885 0.12
886 0.12
887 0.13
888 0.13
889 0.12
890 0.13
891 0.11
892 0.11
893 0.11
894 0.11
895 0.1
896 0.09
897 0.1
898 0.08
899 0.09
900 0.08
901 0.08
902 0.08
903 0.09
904 0.07
905 0.06
906 0.06
907 0.06
908 0.06
909 0.06
910 0.06
911 0.05
912 0.07
913 0.06
914 0.06
915 0.06
916 0.05
917 0.06
918 0.06
919 0.06
920 0.05
921 0.05
922 0.07
923 0.07
924 0.08
925 0.08
926 0.1
927 0.11
928 0.13
929 0.14
930 0.12
931 0.12
932 0.12
933 0.14
934 0.15
935 0.15
936 0.14
937 0.19
938 0.19
939 0.2
940 0.26
941 0.33
942 0.37
943 0.42
944 0.46
945 0.46
946 0.48
947 0.49
948 0.46
949 0.37
950 0.31
951 0.28
952 0.24
953 0.19
954 0.17
955 0.16
956 0.13
957 0.18
958 0.16
959 0.16
960 0.15
961 0.15
962 0.15
963 0.17
964 0.2
965 0.22
966 0.25
967 0.25
968 0.26
969 0.28
970 0.31
971 0.31
972 0.31
973 0.32
974 0.3
975 0.29
976 0.34
977 0.31
978 0.27
979 0.24
980 0.21
981 0.15
982 0.14
983 0.15
984 0.12
985 0.16
986 0.17
987 0.18
988 0.17
989 0.17
990 0.17
991 0.15
992 0.13
993 0.08
994 0.07
995 0.07
996 0.07
997 0.09
998 0.09
999 0.11
1000 0.11
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.16
1004 0.22
1005 0.21
1006 0.22
1007 0.23
1008 0.26
1009 0.28
1010 0.3
1011 0.31
1012 0.28
1013 0.31
1014 0.3
1015 0.3
1016 0.29
1017 0.26
1018 0.27
1019 0.25
1020 0.22
1021 0.19
1022 0.2
1023 0.21
1024 0.26
1025 0.3
1026 0.27
1027 0.27
1028 0.33
1029 0.4
1030 0.39
1031 0.4
1032 0.38
1033 0.42
1034 0.45
1035 0.44
1036 0.46
1037 0.39
1038 0.39
1039 0.37
1040 0.31
1041 0.23
1042 0.19
1043 0.2
1044 0.16
1045 0.16
1046 0.15
1047 0.13
1048 0.13
1049 0.14
1050 0.16
1051 0.16
1052 0.16
1053 0.22
1054 0.23
1055 0.27
1056 0.28
1057 0.28
1058 0.27
1059 0.25
1060 0.2
1061 0.16
1062 0.17
1063 0.16
1064 0.18
1065 0.21
1066 0.24
1067 0.24
1068 0.25
1069 0.24
1070 0.25
1071 0.29
1072 0.33
1073 0.31
1074 0.29
1075 0.29
1076 0.27
1077 0.27
1078 0.26
1079 0.19
1080 0.13
1081 0.1
1082 0.1
1083 0.09
1084 0.1
1085 0.12
1086 0.11
1087 0.12
1088 0.13
1089 0.14
1090 0.15
1091 0.15
1092 0.15
1093 0.16
1094 0.23
1095 0.24
1096 0.25
1097 0.27
1098 0.28
1099 0.29
1100 0.3
1101 0.27
1102 0.18
1103 0.15
1104 0.19
1105 0.15
1106 0.18
1107 0.19
1108 0.19
1109 0.19
1110 0.2
1111 0.21
1112 0.21
1113 0.24
1114 0.25
1115 0.27
1116 0.32
1117 0.34
1118 0.34
1119 0.34
1120 0.29
1121 0.27
1122 0.22
1123 0.25
1124 0.18
1125 0.16
1126 0.16
1127 0.16
1128 0.17
1129 0.15
1130 0.16
1131 0.11
1132 0.11
1133 0.11
1134 0.09
1135 0.09
1136 0.08
1137 0.09
1138 0.09
1139 0.09
1140 0.1
1141 0.1
1142 0.19
1143 0.23
1144 0.28
1145 0.32
1146 0.33
1147 0.35
1148 0.39
1149 0.46
1150 0.4
1151 0.41
1152 0.43
1153 0.42
1154 0.43
1155 0.42
1156 0.37
1157 0.31
1158 0.28
1159 0.22
1160 0.17
1161 0.14
1162 0.12
1163 0.11
1164 0.1
1165 0.11
1166 0.13
1167 0.13
1168 0.13
1169 0.12
1170 0.12
1171 0.11
1172 0.12
1173 0.12
1174 0.13
1175 0.18
1176 0.19
1177 0.22
1178 0.22
1179 0.23
1180 0.24
1181 0.24
1182 0.22
1183 0.2
1184 0.21
1185 0.18
1186 0.19
1187 0.2
1188 0.18
1189 0.17
1190 0.16
1191 0.15
1192 0.11
1193 0.11
1194 0.1
1195 0.09
1196 0.08
1197 0.08
1198 0.06
1199 0.05
1200 0.04
1201 0.04
1202 0.04
1203 0.04
1204 0.05
1205 0.06
1206 0.07
1207 0.07
1208 0.08
1209 0.11
1210 0.11
1211 0.11
1212 0.12
1213 0.11
1214 0.1
1215 0.15
1216 0.14
1217 0.12
1218 0.12
1219 0.12
1220 0.12
1221 0.12
1222 0.12
1223 0.08
1224 0.07
1225 0.07
1226 0.07
1227 0.07
1228 0.06
1229 0.06
1230 0.06
1231 0.07
1232 0.07
1233 0.08
1234 0.09
1235 0.12
1236 0.14
1237 0.14
1238 0.15
1239 0.15
1240 0.16
1241 0.15
1242 0.17
1243 0.22
1244 0.24
1245 0.26
1246 0.25
1247 0.25
1248 0.25
1249 0.26
1250 0.23
1251 0.17
1252 0.14
1253 0.12
1254 0.13
1255 0.14
1256 0.15
1257 0.15
1258 0.15
1259 0.14
1260 0.13
1261 0.13
1262 0.11
1263 0.11
1264 0.12
1265 0.1
1266 0.1
1267 0.1
1268 0.1
1269 0.09
1270 0.1
1271 0.09
1272 0.07
1273 0.07
1274 0.07
1275 0.1
1276 0.12
1277 0.16
1278 0.16
1279 0.21
1280 0.24
1281 0.25
1282 0.29
1283 0.28
1284 0.27
1285 0.25
1286 0.26
1287 0.26
1288 0.25
1289 0.24
1290 0.22
1291 0.21
1292 0.21
1293 0.18
1294 0.16
1295 0.12
1296 0.1
1297 0.1
1298 0.09
1299 0.08
1300 0.13
1301 0.15