FuNGI

A0A4Y9YWS0

Protein Details

Accession

A0A4Y9YWS0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1131-1153	LKQHYERRGWRPSPHERPNTDKT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
296-305	KEGKGPKRRE

Subcellular Location(s)

mito 10, cyto 9.5, cyto_nucl 7.5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MSLSSEPRSSYTXPKLASDGSNWTSFKARTLAVLGAKGLMRHVMGAVRVPPMEMPRPPQPKMAKSGDDDDPESPLIFVPPTAEDWANYEAEALLWDEYNKREFMILTQLYATIPDSLLIKIKDLPTAQAWSSLCNEFEGRSDLYRIDIRRKMMELRCGEGADVRAHIDTLIALQDQLSALGSPLPDSDFAAVIMSSLPRSFDPTLSTITAAARINHQVLTAANVTWHVLDEYDRRRIHAARDMPNNESALYSDGNQRHGLHARGPNPNNPAYGKTCGNCHKLNHFASNCWAPGGGKEGKGPKRREKETEELAGEGAHLASVEGHFSSPFALAATTECHTIGHALASIEEDSDYVEPSRCMDAGMSSHFTRYEHELTDYVTIKPISVRAANGDMFQAIGRGNLTLEMPLGKSSTCVKLHDVLHAPTITMTLVSIPQIDRAGCSTVFKDGHCHVFSKKGVPIARVPRGQSLYLFXSXAYTDRTKPGPAPPLALAASTIKMTATDLHRRLGHISISAVKRXVANGTIKGITLISDPNEQICEACTRGKITRSSLPKTRTRPRXTRYGELVQSDLWGPAQVRSLHGHLYAMSFIDDSXYEIAISFLKSKDEAFTLYKEYEKFVEVQRSGKDIQTFXTDRGGEYLSAXFISYLKGQGTRHELTVHDTSAQNGTAERFFRTSVGRARXMLLASQLPKFLWAAAIQYAXWVWNRTGSRSFPGPSPHERATGTVPDMSNLHEWGCXVWVRIEGRRKLEPQADEGRFVGYSTVSKGVLVYWPGKRSISVERNITWDDGAIITRPPGDASVDGPDDDLSWMINGFGDDDAXDAAADVPPDAPAPAPEPVPAAPAPAPINDIAPPAPPIDAADDAPANEANDMPIDLLPDLPHTPLRGNIAPIVPDAPRRSERXRYASGXVRQLEVGHGTATGSXAGLPXGMQQPTAAGRAPITRAPSPSTDGXNGPGGAFAALXLSLNWDDPDDHTRGDCYLTMHGIEHAMAAEPSEPTEXRTIEEARRSPYWIHWKGGIGXEVGMLDKLGTWELVEXPAGVNVXGCRWVFKLKRNALNEIIKWKARLVAQGFSQVPGLDYTDTYAPVAKLASLRFLLALAARFDWEVHQMDVKNAYLHGELEETIYMKQPPGYAVPGLEHLVCLLKKPIYGLKQHYERRGWRPSPHERPNTDKTGEKRAKEEGGDAAGESLGTPESGEPRAMLGPSIGAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.43
3	0.41
4	0.4
5	0.42
6	0.37
7	0.38
8	0.36
9	0.34
10	0.37
11	0.35
12	0.35
13	0.3
14	0.27
15	0.24
16	0.27
17	0.3
18	0.28
19	0.29
20	0.25
21	0.24
22	0.25
23	0.22
24	0.2
25	0.16
26	0.14
27	0.12
28	0.14
29	0.13
30	0.13
31	0.17
32	0.18
33	0.19
34	0.19
35	0.19
36	0.2
37	0.23
38	0.28
39	0.28
40	0.32
41	0.39
42	0.47
43	0.48
44	0.55
45	0.57
46	0.58
47	0.63
48	0.64
49	0.6
50	0.57
51	0.6
52	0.57
53	0.53
54	0.5
55	0.42
56	0.37
57	0.33
58	0.28
59	0.23
60	0.17
61	0.14
62	0.12
63	0.11
64	0.1
65	0.11
66	0.13
67	0.17
68	0.17
69	0.16
70	0.19
71	0.22
72	0.2
73	0.18
74	0.16
75	0.13
76	0.12
77	0.12
78	0.1
79	0.08
80	0.08
81	0.09
82	0.11
83	0.14
84	0.17
85	0.16
86	0.16
87	0.17
88	0.17
89	0.18
90	0.25
91	0.23
92	0.21
93	0.22
94	0.22
95	0.2
96	0.21
97	0.19
98	0.11
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.11
103	0.16
104	0.15
105	0.16
106	0.19
107	0.21
108	0.24
109	0.24
110	0.26
111	0.24
112	0.28
113	0.27
114	0.29
115	0.28
116	0.26
117	0.29
118	0.28
119	0.24
120	0.22
121	0.23
122	0.17
123	0.2
124	0.21
125	0.19
126	0.19
127	0.2
128	0.18
129	0.21
130	0.26
131	0.27
132	0.32
133	0.35
134	0.37
135	0.39
136	0.42
137	0.47
138	0.48
139	0.53
140	0.47
141	0.47
142	0.45
143	0.42
144	0.39
145	0.32
146	0.29
147	0.22
148	0.19
149	0.17
150	0.14
151	0.14
152	0.13
153	0.11
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.07
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.08
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.1
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.07
182	0.07
183	0.09
184	0.08
185	0.14
186	0.16
187	0.16
188	0.19
189	0.2
190	0.24
191	0.23
192	0.23
193	0.19
194	0.18
195	0.21
196	0.19
197	0.18
198	0.17
199	0.19
200	0.2
201	0.19
202	0.19
203	0.16
204	0.14
205	0.17
206	0.15
207	0.12
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.11
213	0.08
214	0.07
215	0.1
216	0.17
217	0.21
218	0.3
219	0.3
220	0.31
221	0.35
222	0.37
223	0.4
224	0.41
225	0.44
226	0.44
227	0.53
228	0.54
229	0.52
230	0.52
231	0.48
232	0.39
233	0.31
234	0.24
235	0.17
236	0.14
237	0.13
238	0.18
239	0.2
240	0.22
241	0.24
242	0.24
243	0.26
244	0.3
245	0.3
246	0.3
247	0.34
248	0.38
249	0.46
250	0.48
251	0.49
252	0.5
253	0.5
254	0.45
255	0.41
256	0.38
257	0.33
258	0.35
259	0.33
260	0.29
261	0.34
262	0.38
263	0.42
264	0.42
265	0.42
266	0.44
267	0.48
268	0.51
269	0.53
270	0.47
271	0.43
272	0.44
273	0.44
274	0.37
275	0.29
276	0.26
277	0.17
278	0.17
279	0.21
280	0.19
281	0.16
282	0.21
283	0.29
284	0.37
285	0.46
286	0.53
287	0.56
288	0.63
289	0.68
290	0.71
291	0.7
292	0.7
293	0.68
294	0.67
295	0.58
296	0.49
297	0.43
298	0.35
299	0.27
300	0.19
301	0.12
302	0.05
303	0.04
304	0.03
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.07
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.07
328	0.08
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.1
343	0.11
344	0.1
345	0.1
346	0.09
347	0.1
348	0.11
349	0.14
350	0.16
351	0.15
352	0.16
353	0.16
354	0.16
355	0.17
356	0.21
357	0.2
358	0.18
359	0.2
360	0.19
361	0.2
362	0.24
363	0.23
364	0.18
365	0.18
366	0.16
367	0.15
368	0.15
369	0.15
370	0.13
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.16
375	0.17
376	0.17
377	0.15
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.09
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.08
397	0.1
398	0.16
399	0.17
400	0.18
401	0.2
402	0.26
403	0.27
404	0.31
405	0.32
406	0.26
407	0.27
408	0.26
409	0.23
410	0.17
411	0.17
412	0.11
413	0.08
414	0.07
415	0.04
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.12
426	0.11
427	0.12
428	0.11
429	0.15
430	0.16
431	0.16
432	0.18
433	0.18
434	0.24
435	0.24
436	0.25
437	0.21
438	0.27
439	0.28
440	0.28
441	0.28
442	0.28
443	0.28
444	0.29
445	0.35
446	0.36
447	0.41
448	0.4
449	0.4
450	0.39
451	0.39
452	0.37
453	0.31
454	0.26
455	0.22
456	0.2
457	0.19
458	0.14
459	0.14
460	0.15
461	0.17
462	0.15
463	0.14
464	0.14
465	0.16
466	0.17
467	0.2
468	0.27
469	0.24
470	0.26
471	0.25
472	0.27
473	0.25
474	0.23
475	0.19
476	0.12
477	0.12
478	0.09
479	0.09
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.09
484	0.13
485	0.2
486	0.21
487	0.24
488	0.25
489	0.26
490	0.27
491	0.25
492	0.22
493	0.14
494	0.14
495	0.18
496	0.18
497	0.18
498	0.17
499	0.15
500	0.15
501	0.15
502	0.17
503	0.14
504	0.14
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.15
509	0.14
510	0.11
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.1
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.09
522	0.08
523	0.1
524	0.1
525	0.12
526	0.14
527	0.18
528	0.2
529	0.22
530	0.28
531	0.32
532	0.37
533	0.41
534	0.44
535	0.48
536	0.53
537	0.59
538	0.63
539	0.67
540	0.69
541	0.68
542	0.72
543	0.68
544	0.67
545	0.6
546	0.57
547	0.49
548	0.44
549	0.37
550	0.29
551	0.26
552	0.19
553	0.16
554	0.08
555	0.08
556	0.07
557	0.1
558	0.1
559	0.11
560	0.13
561	0.14
562	0.14
563	0.14
564	0.13
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.07
569	0.06
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.04
575	0.05
576	0.05
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.06
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.08
587	0.09
588	0.11
589	0.11
590	0.12
591	0.14
592	0.14
593	0.16
594	0.15
595	0.15
596	0.14
597	0.13
598	0.13
599	0.13
600	0.19
601	0.18
602	0.21
603	0.21
604	0.23
605	0.23
606	0.23
607	0.23
608	0.17
609	0.18
610	0.2
611	0.19
612	0.17
613	0.21
614	0.19
615	0.17
616	0.18
617	0.16
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.05
626	0.07
627	0.06
628	0.08
629	0.08
630	0.11
631	0.18
632	0.18
633	0.19
634	0.19
635	0.18
636	0.21
637	0.23
638	0.2
639	0.16
640	0.15
641	0.15
642	0.15
643	0.14
644	0.1
645	0.09
646	0.09
647	0.1
648	0.11
649	0.11
650	0.11
651	0.11
652	0.12
653	0.13
654	0.16
655	0.2
656	0.24
657	0.24
658	0.23
659	0.25
660	0.24
661	0.22
662	0.19
663	0.16
664	0.15
665	0.14
666	0.15
667	0.13
668	0.13
669	0.13
670	0.12
671	0.11
672	0.07
673	0.08
674	0.07
675	0.08
676	0.07
677	0.07
678	0.09
679	0.08
680	0.09
681	0.08
682	0.08
683	0.1
684	0.13
685	0.15
686	0.15
687	0.18
688	0.2
689	0.21
690	0.23
691	0.26
692	0.28
693	0.31
694	0.36
695	0.34
696	0.34
697	0.33
698	0.32
699	0.29
700	0.27
701	0.23
702	0.2
703	0.18
704	0.17
705	0.17
706	0.17
707	0.14
708	0.12
709	0.11
710	0.09
711	0.09
712	0.11
713	0.12
714	0.11
715	0.11
716	0.13
717	0.15
718	0.22
719	0.29
720	0.32
721	0.35
722	0.38
723	0.4
724	0.42
725	0.45
726	0.4
727	0.38
728	0.42
729	0.39
730	0.36
731	0.34
732	0.3
733	0.24
734	0.23
735	0.17
736	0.08
737	0.08
738	0.08
739	0.1
740	0.09
741	0.09
742	0.09
743	0.09
744	0.1
745	0.12
746	0.14
747	0.16
748	0.18
749	0.19
750	0.19
751	0.19
752	0.21
753	0.28
754	0.3
755	0.31
756	0.33
757	0.33
758	0.36
759	0.37
760	0.34
761	0.24
762	0.18
763	0.14
764	0.11
765	0.1
766	0.07
767	0.07
768	0.06
769	0.07
770	0.07
771	0.06
772	0.07
773	0.07
774	0.07
775	0.09
776	0.12
777	0.12
778	0.12
779	0.12
780	0.11
781	0.1
782	0.1
783	0.08
784	0.05
785	0.05
786	0.05
787	0.04
788	0.05
789	0.04
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.04
794	0.05
795	0.04
796	0.04
797	0.04
798	0.04
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.08
809	0.09
810	0.09
811	0.09
812	0.11
813	0.11
814	0.14
815	0.13
816	0.13
817	0.12
818	0.14
819	0.15
820	0.14
821	0.15
822	0.12
823	0.14
824	0.12
825	0.13
826	0.1
827	0.1
828	0.11
829	0.1
830	0.1
831	0.09
832	0.09
833	0.1
834	0.11
835	0.1
836	0.11
837	0.11
838	0.11
839	0.12
840	0.12
841	0.09
842	0.08
843	0.08
844	0.06
845	0.07
846	0.07
847	0.06
848	0.06
849	0.07
850	0.06
851	0.07
852	0.07
853	0.09
854	0.09
855	0.1
856	0.11
857	0.11
858	0.12
859	0.14
860	0.19
861	0.18
862	0.19
863	0.21
864	0.21
865	0.2
866	0.2
867	0.2
868	0.15
869	0.18
870	0.19
871	0.22
872	0.27
873	0.31
874	0.37
875	0.43
876	0.47
877	0.48
878	0.53
879	0.53
880	0.55
881	0.58
882	0.54
883	0.46
884	0.44
885	0.37
886	0.32
887	0.28
888	0.21
889	0.12
890	0.1
891	0.1
892	0.08
893	0.08
894	0.07
895	0.05
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.07
901	0.08
902	0.08
903	0.08
904	0.08
905	0.1
906	0.12
907	0.12
908	0.11
909	0.11
910	0.14
911	0.16
912	0.19
913	0.22
914	0.22
915	0.24
916	0.26
917	0.27
918	0.29
919	0.29
920	0.29
921	0.26
922	0.25
923	0.24
924	0.22
925	0.2
926	0.15
927	0.14
928	0.1
929	0.08
930	0.06
931	0.05
932	0.04
933	0.04
934	0.06
935	0.06
936	0.06
937	0.07
938	0.07
939	0.07
940	0.1
941	0.15
942	0.15
943	0.15
944	0.15
945	0.16
946	0.16
947	0.17
948	0.16
949	0.14
950	0.14
951	0.15
952	0.15
953	0.15
954	0.15
955	0.14
956	0.12
957	0.1
958	0.08
959	0.08
960	0.07
961	0.07
962	0.07
963	0.06
964	0.08
965	0.1
966	0.1
967	0.12
968	0.13
969	0.13
970	0.16
971	0.23
972	0.26
973	0.29
974	0.35
975	0.37
976	0.37
977	0.4
978	0.38
979	0.4
980	0.46
981	0.45
982	0.42
983	0.41
984	0.42
985	0.41
986	0.43
987	0.36
988	0.25
989	0.21
990	0.18
991	0.16
992	0.13
993	0.11
994	0.07
995	0.06
996	0.06
997	0.06
998	0.06
999	0.05
1000	0.07
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.08
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.11
1007	0.1
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.13
1011	0.14
1012	0.14
1013	0.17
1014	0.23
1015	0.29
1016	0.37
1017	0.48
1018	0.52
1019	0.61
1020	0.64
1021	0.67
1022	0.66
1023	0.68
1024	0.63
1025	0.59
1026	0.56
1027	0.5
1028	0.46
1029	0.41
1030	0.38
1031	0.32
1032	0.36
1033	0.33
1034	0.32
1035	0.31
1036	0.38
1037	0.37
1038	0.33
1039	0.32
1040	0.24
1041	0.22
1042	0.18
1043	0.18
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.13
1047	0.13
1048	0.14
1049	0.13
1050	0.15
1051	0.13
1052	0.13
1053	0.13
1054	0.12
1055	0.14
1056	0.14
1057	0.18
1058	0.16
1059	0.16
1060	0.16
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.14
1064	0.15
1065	0.13
1066	0.13
1067	0.13
1068	0.13
1069	0.14
1070	0.14
1071	0.17
1072	0.16
1073	0.16
1074	0.2
1075	0.21
1076	0.23
1077	0.26
1078	0.25
1079	0.22
1080	0.2
1081	0.21
1082	0.17
1083	0.17
1084	0.15
1085	0.13
1086	0.12
1087	0.13
1088	0.14
1089	0.12
1090	0.12
1091	0.14
1092	0.14
1093	0.14
1094	0.15
1095	0.15
1096	0.17
1097	0.19
1098	0.21
1099	0.2
1100	0.2
1101	0.21
1102	0.21
1103	0.22
1104	0.2
1105	0.16
1106	0.14
1107	0.18
1108	0.17
1109	0.17
1110	0.19
1111	0.19
1112	0.2
1113	0.24
1114	0.31
1115	0.32
1116	0.4
1117	0.45
1118	0.5
1119	0.59
1120	0.66
1121	0.7
1122	0.71
1123	0.73
1124	0.74
1125	0.77
1126	0.74
1127	0.72
1128	0.75
1129	0.78
1130	0.8
1131	0.82
1132	0.83
1133	0.78
1134	0.8
1135	0.8
1136	0.78
1137	0.7
1138	0.67
1139	0.61
1140	0.62
1141	0.64
1142	0.59
1143	0.55
1144	0.54
1145	0.56
1146	0.5
1147	0.48
1148	0.41
1149	0.36
1150	0.33
1151	0.29
1152	0.23
1153	0.18
1154	0.16
1155	0.13
1156	0.09
1157	0.07
1158	0.06
1159	0.06
1160	0.08
1161	0.11
1162	0.13
1163	0.14
1164	0.13
1165	0.15
1166	0.17
1167	0.17
1168	0.16
1169	0.13

A0A4Y9YWS0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer